| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | = 1789697 | 108 (1.160) | 9 (0.100) | 8/236 | NT | 8.0% | coding (373/816 nt) | cdsA | CTP:phosphatidate cytidyltransferase |
| ? | NC_002947 | = 1789716 | 104 (1.180) | coding (392/816 nt) | cdsA | CTP:phosphatidate cytidyltransferase | |||||
Only 100 of 153 total aligned reads displayed.
GGCGCCCTGGGTGCTGGGCGCTGCCGTGATCTGGTGGGGGCTGGCCACCTGGCTGGTGCTTACCTACCCGCGCAGCAGCGACCTGTGGGCCAGTGCGGCCTGTCGGTTGTTGATCGGCCTGCTGGTGTTGCTGCCGGCCTGGCAAGGGCTGGTGCTGCTCAAGCACTGGCCCTTGGGCAACTGGCTGATCCTGTCGGTCATGGTGCTGGTGTGGGCCGCCGACATCGGTGCGTACTTCTCTGGCCGGGCATTCGGCAAGCGCAAGCTGGCTCCGCAGGTCAGCCCAGGCAAGAGCTGG > NC_002947/1789549‑1789846 | ggCGCCCTGGGTGCTGGGCGCTGCCGTGATCTGGTGGGGGCTGGCCACCTGGCTGGTGCTTACCTACCCGCGCAGCAGCGACCTGTGGGCCAGTGCGGCCTGTCGGTTGTTGATCGGCCTGCTGGTGTTGCTGCCGGCCTGGCAAGGGCt < 1:1399686/150‑1 (MQ=255) gcCCTGGGTGCTGGGCGCTGCCGTGATCTGGTGGGGGCTGGCCACCTGGCTGGTGCTTACCTACCCGCGCAGCAGCGACCTGTGGGCCAGTGCGGCCTGTCGGTTGTTGATCGGCCTGCTGGTGTTGCTGCCGGCCTGGCAAGGGCTGGt > 2:1780581/1‑150 (MQ=255) gggTGCTGGGCGCTGCCGTGATCTGGTGGGGGCTGGCCACCTGGCTGGTGCTTACCTACCCGCGCAGCAGCGACCTGTGGGCCAGTGCGGCCTGTCGGTTGTTGATCGGCCTGCTGGTGTTGCTGCCGGCCTGGCAAGGGCTGGtgctgc > 2:1336088/1‑150 (MQ=255) gTGCTGGGCGCTGCCGTGATCTGGTGGGGGCTGGCCACCTGGCTGGTGCTTACCTACCCGCGCAGCAGCGACCTGTGGGCCAGTGCGGCCTGTCGGTTGTTGATCGGCCTGCTGGTGTTGCTGCCGGCCTGGCAAGGGCcagtgcttgag > 2:1889122‑M1/1‑139 (MQ=255) tGCTGGGCGCTGCCGTGATCTGGTGGGGGCTGGCCACCTGGCTGGTGCTTACCTACCCGCGCAGCAGCGACCTGTGGGCCAGTGCGGCCTGTCGGTTGTTGATCGGCCTGCTGGTGTTGCTGCCGGCCTGGCAAGGGCTGGTGCTGCTCa > 1:1440457/1‑150 (MQ=255) cTGGGCGCTGCCGTGATCTGGTGGGGGCTGGCCACCTGGCTGGTGCTTACCTACCCGCGCAGCAGCGACCTGTGGGCCAGTGCGGCCTGTCGGTTGTTGATCGGCCTGCTGGTGTTGCTGCCGGCCTGGCAAGGGCTGGTGCTGCTCAAg < 1:352912/150‑1 (MQ=255) tGGGCGCTGCCGTGATCTGGTGGGGGCTGGCCACCTGGCTGGTGCTTACCTACCCGCGCAGCAGCGACCTGTGGGCCAGTGCGGCCTGTCGGTTGTTGATCGGCCTGCTGGTGTTGCTGCCGGCCTGGCAAGGGCTGGTGCTGCTCAAGc < 1:1791378/150‑1 (MQ=255) gggCGCTGCCGTGATCTGGTGGGGGCTGGCCACCTGGCTGGTGCTTACCTACCCGCGCAGCAGCGACCTGTGGGCCAGTGCGGCCTGTCGGTTGTTGATCGGCCTGCTGGTGTTGCTGCCGGCCTGGCAAGGGCTGGTGCTGCTCAAGCa < 2:1994124/150‑1 (MQ=255) gcgcTGCCGTGATCTGGTGGGGGCTGGCCACCTGGCTGGTGCTTACCTACCCGCGCAGCAGCGACCTGTGGGCCAGTGCGGCCTGTCGGTTGTTGATCGGCCTGCTGGTGTTGCTGCCGGCCTGGCAAGGGCTGGTGCTGCTCAAGCACt < 1:1416848/150‑1 (MQ=255) gTGATCTGGTGGGGGCTGGCCCCCTGGCTGGTGCTTACCTACCCGCGCAGCAGCGACCTGTGGGCCAGTGCGGCCTGTCGGTTGTTGATCGGCCTGCTGGTGTTGCTGCCGGCCTGGCAAGGGCTGGTGCTGCTCAAGCACTGgccattc > 1:1264923‑M2/1‑143 (MQ=255) gTGATCTGGTGGGGGCTGGCCACCTGGCTGGTGCTTACCTACCCGCGCAGCAGCGACCTGTGGGCCAGTGCGGCCTGTCGGTTGTTGATCGGCCTGCTGGTGTTGCTGCCGGCCTGGCAAGGGCTGGTGCTGCTCAAGCACTGgcccttg > 1:1504147‑M2/1‑143 (MQ=255) tGATCTGGTGGGGGCTGGCCACCTGGCTGGTGCTTACCTACCCGCGCAGCAGCGACCTGTGGGCCAGTGCGGCCTGTCGGTTGTTGATCGGCCTGCTGGTGTTGCTGCCGGCCTGGCAAGGGCTGGTGCTGCTCAAGCACTGGCCCTTgg < 1:1630906/150‑1 (MQ=255) tGATCTGGTGGGGGCTGGCCACCTGGCTGGTGCTTACCTACCCGCGCAGCAGCGACCTGTGGGCCAGTGCGGCCTGTCGGTTGTTGATCGGCCTGCTGGTGTTGCTGCCGGCCTGGCAAGGGATGGTGCTGCTCAAGCACTGGCCCTTgg < 1:53945/150‑1 (MQ=255) tCTGGTGGGGGCTGGCCACCTGGCTGGTGCTTACCTACCCGCGCAGCAGCGACCTGTGGGCCAGTGCGGCCTGTCGGTTGTTGATCGGCCTGCTGGTGTTGCTGCCGGCCTGGCAAGGGCcagtgcttgagcagcaccagcccttgccag < 1:1889122‑M1/150‑31 (MQ=255) tggtggGGGCTGGCCACCTGGCTGGTGCTTACCTACCCGCGCAGCAGCGACCTGTGGGCCAGTGCGGCCTGTCGGTTGTTGATCGGCCTGCTGGTGTTGCTGCCGGCCTGGCAAGGGCTGGTGCTGCTCAAGCACTGGCCCTTGGGCAAc < 2:1531498/150‑1 (MQ=255) cTGGCCACCTGGCTGGTGCTTACCTTCCCGCGCAGCAGCGACCTGTGGGCCAGTGCGGCCTGTCGGTTGTTGATCGGCCTGCTGGTGTTGCTGCCGGCCTGGCAAGGGCTGGTGCTGCTCAAGCACTGGCACTTGGGCAACTGGCTGATc < 2:597724/150‑1 (MQ=255) tGGCCACCTGGCTGGTGCTTACCTACCCGCGCAGCAGCGACCTGTGGGCCAGTGCGGCCTGTCGGTTGTTGATCGGCCTGCTGGTGTTGCTGCCGGCCTGGCAAGGGCTGGTGCTGCTCAAGCACTGGCCCTTGGGCAACTGGc < 1:654577/144‑1 (MQ=255) tGGCCACCTGGCTGGTGCTTACCTACCCGCGCAGCAGCGACCTGTGGGCCAGTGCGGCCTGTCGGTTGTTGATCGGCCTGCTGGTGTTGCTGCCGGCCTGGCAAGGGCTGGTGCTGCTCAAGCACTGGCCCTTGGGCAACTGGc < 1:653988/144‑1 (MQ=255) 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ccTAGCAAGGGCTGGTGCTGCTCAAGCACTGGCCCTTGGGCAACTGGCTGATCCTGTCGGTCATGGTGCTGGTGTGGGCCGCCGACATCGGTGCGTACTTCTCTGGCCGGGCATTCGGCCAGCGCAAGCTGGCTCCGCAGGTCAGCCCAg < 2:1407222/150‑1 (MQ=255) cTGGCAAGGGCTGGTGCTGCTCAAGCACTGgcccttgccaggccggcagcaacaccagcaggccgatcaacaaccgacaggccgcactggcccacaggtcgctgctgcgcgggtaggtaagcaccagccaggtggccagcccccaccaga < 1:1889122‑M2/150‑121 (MQ=255) cTGGCAAGGGCTGGTGCTGCTCAAGCACTGgcccttgccaggccggcagcaacaccagcaggccgatcaacaaccgacaggccgcactg < 1:1162826‑M2/89‑60 (MQ=255) cTGGCAAGGGCTGGTGCTGCTCAAGCACTGGCCCTTGGGCAACTGGCTGATCCTGTCGGTCATGGTGCTGGTGTGGGCCGCCGACATCGGTGCGTACTTCTCTGGCCGGGCATTCGGCAAGCGCAAGCTGGCTCCGCAGGTCAGCCCAgg < 2:2226354/150‑1 (MQ=255) cTGGCAAGGGCTGGTGCTGCTCAAGCACTGGCCCTTGGGCAACTGGCTGATCCTGTCGGTCATGGTGCTGGTGTGGGCCGCCGACATCGGTGCGTACTTCTCTGGCCGGGCATTCGGCAAGCGCAAGCTGGCTCCGCAGGTCAGCCCAgg > 1:424024/1‑150 (MQ=255) atGGCAAGGGCTGGTGCTGCTCAAGCACTGGCCCTTGGGCAACTGGCTGATCCTGTCGGTCATGGTGCTGGTGTGGGCCGCCGACATCGGTGCGTACTTCTCTGGCCGGGCATTCGGCAAGCGCAAGCTGGCTCCGCAGGTCAGCCCAgg > 1:1049415/2‑150 (MQ=255) tGGCAAGGGCTGGTGCTGCTCAAGCACTGgcccttgccaggccggcagcaacaccagcaggccgatcaacaaccgacaggccgcactggcccacaggtcgctgctgcgcgggtaggtaagcacca < 2:2238881‑M2/125‑97 (MQ=255) aaGGGCcagtgcttgagcagcaccagcccttgccaggccggcagcaacaccagcaggccgatcaacaaccgacaggccgcactggcccacaggtcgctgctgcgcgggtaggtaagcaccagccaggtggccagcccccaccagatcacg > 2:2422912‑M1/1‑6 (MQ=255) aaGGGCcagtgcttgagcagcaccagcccttgccaggccggcagcaacaccagcaggccgatcaacaaccgacaggccgcactggcccacaggtcgctgctgcgcgggtaggtaagcaccagccaggtggccagcccccaccagatcacg > 1:372165‑M1/1‑6 (MQ=255) aaGGGCcagtgcttgagcagcaccagcccttgccaggccggcagcaacaccagcaggccgatcaacaaccgacaggccgcactggcccacaggtcgctgctgcgcgggagacatagcaccagccaggtggccagcccccaccagatcacg > 1:23709‑M1/1‑6 (MQ=255) aaGGGCTGGTGCTGCTCAAGCACTGgcccttgccaggccggcagcaacaccagcaggccgatcaacaaccgacaggccgcactggcccacaggtcgctgctgcgcgggtaggtaagcaccagccaggtggccagcccccaccagatcacg < 1:659549‑M2/150‑126 (MQ=255) aaGGGCTGGTGCTGCTCAAGCACTGGCCCTTGGGCAACTGGCTGATCCTGTCGGTCATGGTGCTGGTGTGGGCCGTCGACATCGGTGCGTACTTCTCTGGCCGGGCATTCGGCAAGCGCAAGCTGGCTCCGCAGGTCAGCCCAGGCAaga < 1:1329012/150‑1 (MQ=255) aaGGGCTGGTGCTGCTCAAGCACTGGCCCTTGGGCAACTGGCTGATCCTGTCGGTCATGGTGCTGGTGTGGGCCGCCGACATCGGTGCGTACTTCTCTGGCCGGGCATTCGGCAAGCGCAAGCTGGCTCCGCAGGTCAGCCCAGGCAaga > 2:812808/1‑150 (MQ=255) aaGGGCTGGTGCTGCTCAAGCACTGGCCCTTGGGCAACTGGCTGATCCTGTCGGTCATGGTGCTGGTGTAGGCCGCCGACATCGGt < 2:2364998/86‑1 (MQ=255) aaGGGCTGGTGCTGCTCAAGCACTGGCCCTTGGGCAACTGGCTGATCCTGTCGGTCATGGTGCTGGTGTAGGCCGCCGACATCGGt > 1:2364998/1‑86 (MQ=255) gggCcagtgcttgagcagcaccagcccttgccaggccggcagcaacaccagcaggccgatcaacaaccgacaggccgcactggcccacaggtcgctgctgcgcgggtaggtaagcaccagccaggtggccagcccccaccagatcacggc < 1:1531498‑M1/150‑147 (MQ=255) ggCTGGTGCTGCTCAAGCACTGgcccttgccaggccggcagcaacaccagcaggccgatcaacaaccgacaggccgcactggcccacaggtcgctgctgcgcgggtaggt < 1:454904‑M2/110‑89 (MQ=255) gCcagtgcttgagcagcaccagcccttgccaggccggcagcaacaccagcaggccgatcaacaaccgacaggccgcactggcccacaggtcgctgctgcgcgggtaggtaagcaccagccaggtggccagcccccaccagatcacggcag > 2:1966447‑M1/1‑2 (MQ=255) gCTGGTGCTGCTCAAGCACTGGCCCTTGGGCAACTGGCTGATCCTGTCGGTCATGGTGCTGGTGTGGGCCGCCGACATCGGTGCGTACTTCTCTGGCCGGGCATTCGGCAAGCGCAAGCTGGCTCCGCAGGTCAGCCCAGGCAAGAGCTg > 1:2350938/1‑150 (MQ=255) ccagtgcttgagcagcaccagcccttgccaggccggcagcaacaccagcaggccgatcaacaaccgacaggccgcactggcccacaggtcgctggtgcgcgggtaggtaagcaccagccaggtggccagcccccaccagatcacggcagc < 2:1285327‑M1/150‑150 (MQ=255) cTGGTGCTGCTCAAGCACTGGCCCTTGGGCAACTGGCTGATCCTGTCgg > 2:2357174/1‑49 (MQ=255) | GGCGCCCTGGGTGCTGGGCGCTGCCGTGATCTGGTGGGGGCTGGCCACCTGGCTGGTGCTTACCTACCCGCGCAGCAGCGACCTGTGGGCCAGTGCGGCCTGTCGGTTGTTGATCGGCCTGCTGGTGTTGCTGCCGGCCTGGCAAGGGCTGGTGCTGCTCAAGCACTGGCCCTTGGGCAACTGGCTGATCCTGTCGGTCATGGTGCTGGTGTGGGCCGCCGACATCGGTGCGTACTTCTCTGGCCGGGCATTCGGCAAGCGCAAGCTGGCTCCGCAGGTCAGCCCAGGCAAGAGCTGG > NC_002947/1789549‑1789846 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |