New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | = 1789697 | 108 (1.160) | 9 (0.100) | 8/236 | NT | 8.0% | coding (373/816 nt) | cdsA | CTP:phosphatidate cytidyltransferase |
? | NC_002947 | = 1789716 | 104 (1.180) | coding (392/816 nt) | cdsA | CTP:phosphatidate cytidyltransferase |
Only 100 of 130 total aligned reads displayed.
GCTGCCGTGATCTGGTGGGGGCTGGCCACCTGGCTGGTGCT‑TACCTACCCGCGCAGCAGCGACCTGTGGGCCAGTGCGGCCTGTCGGTTGTTGATCGGCCTGCTGGTGTTGCTGCCGGCCTGGCAAGGGCTGGTGCTGCTCAAGCACTGGCCCTTGGGCAACTGGCTGATCCTGTCGGTCATGGTGCTGGTGTGGGCCGCCGACATCGGTGCGTACTTCTCTGGCCGGGCATTCGGCAAGCGCAAGCTGGCTCCGCAGGTCAGCCCAGGCAAGAGCTGGGAAGGCGTGTACGGTGG > NC_002947/1789568‑1789863 | gCTGCCGTGATCTGGTGGGGGCTGGCCACCTGGCTGGTGCT‑TACCTACCCGCGCACCAGCGACCTGTGGGCCAGTGCGGCCTGTCGGTTGTTGATCGGCCTGCTGGTGTTGCTGCCGGCCTGGCAAGGGCTGGTGCTGCTCAAGCACTGg < 2:1285327‑M2/150‑2 (MQ=255) cTGCCGTGATCTGGTGGGGGCTGGCCACCTGGCTGGTGCT‑TACCTACCCGCGCAGCAGCGACCTGTGGGCCAGTGCGGCCTGTCGGTTGTTGATCGGCCTGCTGGTGTTGCTGCCGGCCTGGCAAGGGCTGGTGCTGCTCAAGCACTGgc > 2:1966447‑M2/1‑148 (MQ=255) gCCGTGATCTGGTGGGGGCTGGCCACCTGGCTGGTGCT‑TACCTACCCGCGCAGCAGCGACCTGTGGGCCAGTGCGGCCTGTCGGTTGTTGATCGGCCTGCTGGTGTTGCTGCCGGCCTGGCAAGGGCTGGTGCTGCTCAAGCACTGgccc < 1:1531498‑M2/150‑5 (MQ=255) cGTGATCTGGTGGGGGCTGGCCACCTGGCTGGTGCTATGTCT‑CCCGCGCAGCAGCGACCTGTGGGCCAGTGCGGCCTGTCGGTTGTTGATCGGCCTGCTGGTGTTGCTGCCGGCCTGGCAAGGGCTGGTGCTGCTCAAGCACTGgccctt > 1:23709‑M2/1‑144 (MQ=255) cGTGATCTGGTGGGGGCTGGCCACCTGGCTGGTGCT‑TACCTACCCGCGCAGCAGCGACCTGTGGGCCAGTGCGGCCTGTCGGTTGTTGATCGGCCTGCTGGTGTTGCTGCCGGCCTGGCAAGGGCTGGTGCTGCTCAAGCACTGgccctt > 1:372165‑M2/1‑144 (MQ=255) cGTGATCTGGTGGGGGCTGGCCACCTGGCTGGTGCT‑TACCTACCCGCGCAGCAGCGACCTGTGGGCCAGTGCGGCCTGTCGGTTGTTGATCGGCCTGCTGGTGTTGCTGCCGGCCTGGCAAGGGCTGGTGCTGCTCAAGCACTGgccctt > 2:2422912‑M2/1‑144 (MQ=255) gTGATCTGGTGGGGGCTGGCCCCCTGGCTGGTGCT‑TACCTACCCGCGCAGCAGCGACCTGTGGGCCAGTGCGGCCTGTCGGTTGTTGATCGGCCTGCTGGTGTTGCTGCCGGCCTGGCAAGGGCTGGTGCTGCTCAAGCACTGgccattc > 1:1264923‑M2/1‑143 (MQ=255) tGATCTGGTGGGGGCTGGCCACCTGGCTGGTGCT‑TACCTACCCGCGCAGCAGCGACCTGTGGGCCAGTGCGGCCTGTCGGTTGTTGATCGGCCTGCTGGTGTTGCTGCCGGCCTGGCAAGGGCTGGTGCTGCTCAAGCACTGGCCCTTgg < 1:1630906/150‑1 (MQ=255) gggtCTGGTGGGGGCGGGCCACCTGGCTTGGGCT‑TGCCTAGCCGCGCAGCAGCGACCTGTGGGCCAGTGCGGCCTGTCGGTGGTTGATCGGCCGGCTGGTGTTGCTGCCGGCCTGGCAAGGGCTGGTGCTGCTCAAGCACTGGCCCTTgg < 2:897081/147‑1 (MQ=255) tggtggGGGCTGGCCACCTGGCTGGTGCT‑TACCTACCCGCGCAGCAGCGACCTGTGGGCCAGTGCGGCCTGTCGGTTGTTGATCGGCCTGCTGGTGTTGCTGCCGGCCTGGCAAGGGCTGGTGCTGCTCAAGCACTGGCCCTTGGGCAAc < 2:1531498/150‑1 (MQ=255) cTGGCCACCTGGCTGGTGCT‑TACCTTCCCGCGCAGCAGCGACCTGTGGGCCAGTGCGGCCTGTCGGTTGTTGATCGGCCTGCTGGTGTTGCTGCCGGCCTGGCAAGGGCTGGTGCTGCTCAAGCACTGGCACTTGGGCAACTGGCTGATc < 2:597724/150‑1 (MQ=255) tGGCCACCTGGCTGGTGCT‑TACCTACCCGCGCAGCAGCGACCTGTGGGCCAGTGCGGCCTGTCGGTTGTTGATCGGCCTGCTGGTGTTGCTGCCGGCCTGGCAAGGGCTGGTGCTGCTCAAGCACTGGCCCTTGGGCAACTGGc < 1:653988/144‑1 (MQ=255) tGGCCACCTGGCTGGTGCT‑TACCTACCCGCGCAGCAGCGACCTGTGGGCCAGTGCGGCCTGTCGGTTGTTGATCGGCCTGCTGGTGTTGCTGCCGGCCTGGCAAGGGCTGGTGCTGCTCAAGCACTGGCCCTTGGGCAACTGGc > 2:654577/1‑144 (MQ=255) tGGCCACCTGGCTGGTGCT‑TACCTACCCGCGCAGCAGCGACCTGTGGGCCAGTGCGGCCTGTCGGTTGTTGATCGGCCTGCTGGTGTTGCTGCCGGCCTGGCAAGGGCTGGTGCTGCTCAAGCACTGGCCCTTGGGCAACTGGc < 1:654577/144‑1 (MQ=255) ggCCACCTGGCTGGTGCT‑TACCTACCCGCGCAGCAGCGACCTGTGGGCCAGTGCGGCCTGTCGGTTGTTGATCGGCCTGCTGGTGTTGCTGCCGGCCTGGCAAGGGCTGGTGCTGCTCAAGCACTGGCCCTTGGGCAACTGGCTGATCCt < 1:1072278/150‑1 (MQ=255) ccACCTGGCTGGTGCT‑TACCTACCCGCGCAGCAGCGACCTGTGGGCCAGTGCGGCCTGTCGGTTGTTGATCGGCCTGCTGGTGTTGCTGCCGGCCTGGCAAGGGCTGGTGCTGCTCAAGCACTGGCCCTTGGGCAACTGGCTGATCCTGt > 2:2071142/1‑150 (MQ=255) ccACCTGGCTGGTGCT‑TACCTACCCGCGCAGCAGCGACCTGTGGGCCAGTGCGGCCTGTCGGTTGTTGATCGGCCTGCTGGTGTTGCTGCCGGCCTGGCAAGGGCTGGTGCTGCTCAAGCACTGGCCCTTGGGCAACTGGCTGATCCTGt > 2:417858/1‑150 (MQ=255) cACCTGGCTGGTGCT‑TACCTACCCGCGCAGCAGCGACCTGTGGGCCAGTGCGGCCTGTCGGTTGTTGATCGGCCTGCTGGTGTTGCTGCCGGCCTGGCAAGGGCTGGTGCTGCTCAAGCACTGGCCCTTGGGCAACTGGCTGATCCTGTc < 2:2415548/150‑1 (MQ=255) 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gcGACCTGTGGGCCAGTGCGGCCTGTCGGTTGTTGATCGGCCTGCTGGTGTTGCTGCCGGCCTGGCAAGGGATGGTGGTGCTCAAGCACTGGCCCTTGGGCAACTGTCTGATTCGGTCGGTCATGGTGCTGGTGTGGGCCGCCGACATCg > 1:1982595/1‑150 (MQ=255) gACCTGTGGGCCAGTGCGGCCTGTCGGTTGTTGATCGGCCTGCTGGTGTTGCTGCCGGCCTGGCAAGGGCTGGTGCTGCTCAAGCACTGGCCCTTGGGCAACTGGCTGATCCTGTCGGTCATGGTGCTGGTGTGGGCCGCCGACATCGGt < 1:1397583/150‑1 (MQ=255) gACCTGTGGGCCAGTGCGGCCTGTCGGTTGTTGAGCGGCCTGCTGGTGTTGCTGCCGGCCTGGCAAGGGCTGGTGCTGCTCAAGCACTGGCCCTTGGGCAACTGGCTGATCCTGTCGGTCATGGTGCTGGTGTGGGCCGCCGACATCGGt < 2:1153334/150‑1 (MQ=255) aCCTGTGGGCCAGTGCGGCCTGTCGGTTGTTGATCGGCCTGCTGGTGTTGCTGCCGGCCTGGCAAGGGCTGGTGCTGCTCAAGCACTGGCCCTTGGGCAACTGGCTGATCCTGTCGGTCATGGTGCTGGTGTgg > 1:784374/1‑134 (MQ=255) aCCTGTGGGCCAGTGCGGCCTGTCGGTTGTTGATCGGCCTGCTGGTGTTGCTGCCGGCCTGGCAAGGGCTGGTGCTGCTCAAGCACTGGCCCTTGGGCAACTGGCTGATCCTGTCGGTCATGGTGCTGGTGTgg < 2:784374/134‑1 (MQ=255) 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aaGGGCTGGTGCTGCTCAAGCACTGGCCCTTGGGCAACTGGCTGATCCTGTCGGTCATGGTGCTGGTGTGGGCCGTCGACATCGGTGCGTACTTCTCTGGCCGGGCATTCGGCAAGCGCAAGCTGGCTCCGCAGGTCAGCCCAGGCAaga < 1:1329012/150‑1 (MQ=255) aaGGGCTGGTGCTGCTCAAGCACTGGCCCTTGGGCAACTGGCTGATCCTGTCGGTCATGGTGCTGGTGTGGGCCGCCGACATCGGTGCGTACTTCTCTGGCCGGGCATTCGGCAAGCGCAAGCTGGCTCCGCAGGTCAGCCCAGGCAaga > 2:812808/1‑150 (MQ=255) aaGGGCTGGTGCTGCTCAAGCACTGGCCCTTGGGCAACTGGCTGATCCTGTCGGTCATGGTGCTGGTGTGGGCCGCCGACATCGGTGCGTACTTCTCTGGCCGGGCATTCGGCAAGCGCAAGCTGGCTCCGCAGGTCAGCCCAGGCAaga > 2:1688259/1‑150 (MQ=255) aaGGGCTGGTGCTGCTCAAGCACTGGCCCTTGGGCAACTGGCTGATCCTGTCGGTCATGGTGCTGGTGTGGGCCGCCGACATCGGTGCGTACTTCTCTGGCCGGGCATTCGGCAAGCGCAAGCTGGCTCCGCAGGTCAGCCCAGGCAaga > 2:1783553/1‑150 (MQ=255) aaGGGCTGGTGCTGCTCAAGCACTGGCCCTTGGGCAACTGGCTGATCCTGTCGGTCATGGTGCTGGTGTAGGCCGCCGACATCGGt < 2:2364998/86‑1 (MQ=255) aaGGGCTGGTGCTGCTCAAGCACTGGCCCTTGGGCAACTGGCTGATCCTGTCGGTCATGGTGCTGGTGTAGGCCGCCGACATCGGt > 1:2364998/1‑86 (MQ=255) aaGGGCTGGTGCTGCTCAAGCACTGGCCCTTGGGCAACTGGCAGATCCTGTCGGTCATGGTGCTGGTGTGGGCCGTCGACATCGGTGCGTACTTCTCTGGCCGGGCATTCGGCAAGCGCAAGCTGGCTCCGCAGGTCAGCCCAGGCAaga < 1:135320/150‑1 (MQ=255) ggCTGGTGCTGCTCAAGCACTGgcccttgccaggccggcagcaacaccagcaggccgatcaacaaccgacaggccgcactggcccacaggtcgctgctgcgcgggtaggt > 2:454904‑M2/1‑22 (MQ=255) ggCTGGTGCTGCTCAAGCACTGgcccttgccaggccggcagcaacaccagcaggccgatcaacaaccgacaggccgcactggcccacaggtcgctgctgcgcgggtaggt < 1:454904‑M2/110‑89 (MQ=255) ggCTGGTGCTGCTCAAGCACTGGCCCTTGGGCAACTGGCTGATCCTGTCGGTCATGGTGCTGGTGTGGGCCGCCGACATCGGTGCGTACTTCTCTGGCCGGGCATTCGGCAAGCGCAAGCTGGCTCCGCAGGTCAGCCCAGGCAAGAGCt < 2:244192/150‑1 (MQ=255) gCTGGTGATGTTCAAGCACTGGCCCTTGGGCAACTGGCTGATCCTGTCGGTCATGGTGCTGGTGTGGGCCGCCGACATCGGTGCGTACTTCTCTGGCCGGGCATTCGGCAAGCGCAAGCTGGCTCCGCAGGTCAGCCCAGGCAAGAGCTg < 1:1285327/150‑1 (MQ=255) cTGGTGCTGCTCAAGCACTGGCCCTTGGGCAACTGGCTGATCCTGTCgg < 1:2357174/49‑1 (MQ=255) tGGTGCTGCTCAAGCACTGGCCCTTGGGCAACTGGCTGATCCTGTCGGTCATGGTGCTGGTGTGGGCCGCCGACATCGGTGCGTACTTCTCTGGCCGGGCATTCGGCAAGCGCAAGCTGGCTCCGCAGGTCAGCCCAGGCAAGAGCTggg > 2:2377872/1‑150 (MQ=255) ggTGCTGCTCAAGCACTGGCCCTTGGGCAACTGGCTGATCCTGTCGGTCATGGTGCTGGTGTGGGCCGCCGACATCGGTGCGTACTTCTCTGGCCGGGCATTCGGCAAGCGCAAGCTGGCTCCGCCGGTCAGCCCAGGCAAGAGCTGGGa < 2:1626035/150‑1 (MQ=255) gTGCTGCTCAAGCACTGGCCCTTGGGCAACTGGCTGATCCTGTCGGTCATGGTGCTGGTGTGGGCCGCCGACATCGGTGCGTACTTCTCTGGCCGGGCATTCGGCAAGCGCAAGCTGGCTCCGCAGGTCAGCCCAGGCAAGAGCTGGGaa < 1:1163884/150‑1 (MQ=255) ctgctCAAGCACTGGCCCTTGGGCAACTGGCTGATCCTGTCGGTCATGGTGCTGGTGTGGGCCGCCGACATCGGTGCGTACTTCTCTGGCCGGGCATTCGGCAAGCGCAAGCTGGCTCCGCAGGTCAGCCCAGGCAAGAGCTGGGAAGGc < 1:2277846/150‑1 (MQ=255) ctgctCAAGCACTGGCCCTTGGGCAACTGGCTGATCCTGTCGGTCATGGTGCTGGTGTGGGCCGCCGACATCGGTGCGTACTTCTCTGGCCGGGCATTCGGCAAGCGCAAGCTGGCTCCGCAGGTCAGCCCAGGCAAGAGCTGGGAAGGc < 2:1940960/150‑1 (MQ=255) gcgcAAGCACTGGGCCTTGGGCAACTGGCTGATCCTGTCGGTCATGGTGCTGGTGTGGGCCGCCGACATCGGTGCGTACTTCTCTGGCCGGGCATTCGGCAAGCGCAAGCTGGCTCCGCAGGTCAGCCCAGGCAAGAGCTGGGAAGGCgt < 2:289833/147‑1 (MQ=255) ctCAAGCACTGgcccttgccaggccggcagcaacaccagcaggccgatcaacaaccgacaggccgcactggcccacaggtcgctgctgcgcgggtaggtaagcaccagccaggtggccagcccccaccagatcacggcagcgcccagcac > 2:1889122‑M2/1‑11 (MQ=255) aaGCACTGGCCCTTGGGCAACTGGCTGATCCTGTCGGTCATGGTGCTGGTGTGGGCCGCCGACATCGGTGCGTACTTCTCTGGCCGGGCATTCGGCAAGCGCAAGCTGGCTCCGCAgg > 1:2373803/1‑118 (MQ=255) aaGCACTGGCCCTTGGGCAACTGGCTGATCCTGTCGGTCATGGTGCTGGTGTGGGCCGCCGACATCGGTGCGTACTTCTCTGGCCGGGCATTCGGCAAGCGCAAGCTGGCTCCGCAgg < 2:2373803/118‑1 (MQ=255) aaGCACTGGCCCTTGGGCAACTGGCTGATCCTGTCGGTCATGGTGCTGGTGTGGGCCGCCGACATCGGTGCGTACTTCTCTGGCCGGGCATTCGGCAAGCGCAAGCTGGCTCCGCAGGTCAGCCCAGGCAAGAGCTGGGAAGGCGTGTAc > 1:1174032/1‑150 (MQ=255) aCTGGCCCTTGGGCAACTGGCTGACCCTGTCGGTCATGGTGCTGGTGTGGGCCGCCGACATCGGTGCGTACTTCTCTGGCCGGGCATTCGGCAAGCGCAAGCTGGCTCCGCAGGTCAGCCCAGGCAAGAGCTGGGAAGGCGTGTACggtg < 1:89601/150‑1 (MQ=255) | GCTGCCGTGATCTGGTGGGGGCTGGCCACCTGGCTGGTGCT‑TACCTACCCGCGCAGCAGCGACCTGTGGGCCAGTGCGGCCTGTCGGTTGTTGATCGGCCTGCTGGTGTTGCTGCCGGCCTGGCAAGGGCTGGTGCTGCTCAAGCACTGGCCCTTGGGCAACTGGCTGATCCTGTCGGTCATGGTGCTGGTGTGGGCCGCCGACATCGGTGCGTACTTCTCTGGCCGGGCATTCGGCAAGCGCAAGCTGGCTCCGCAGGTCAGCCCAGGCAAGAGCTGGGAAGGCGTGTACGGTGG > NC_002947/1789568‑1789863 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |