New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 582803 = | 108 (1.160) | 6 (0.070) | 5/242 | NT | 5.5% | coding (666/1923 nt) | selB | selenocysteyl‑tRNA‑specific translation elongation factor |
? | NC_002947 | 582824 = | 100 (1.110) | coding (687/1923 nt) | selB | selenocysteyl‑tRNA‑specific translation elongation factor |
Only 100 of 131 total aligned reads displayed.
GTGTCGTCGGTGGTTTTCGCCTGGCCGTCGACCGTGCGTTTGCGGTTACCGGCGCCGGTGTGGTGGTCACCGGCACGGCACTGGCCGGGCGGGTCAGTGCGGGTGATACGTTGTTGCTGGGCAAGGCCGGCAAGGTGGTGCGCGTGCGTGGTCTGCATGCGCAGAACCAGGCCGCGTTGGTGGCAGAAGCAGGCCAACGGGTGGCGCTGAACATCGCTGCCGAGCGCCTGGCCGTGGAGCAGGTGCACCGGGGCGACTGGCTGGTGCCCGAATGGTTGCATGCGCCCAGTGTTCGGGT > NC_002947/582655‑582952 | gtgtCGTCGGTGGTTTTCGCCTGGCCGTCGACCGTGCGTTTGCGGTTACCGGCGCCGGTGTGGTGGTCACCGGCACGGCACTGGCCGGGCGGGTCAGTGCGGGTGATACGTTGTTGCTGGGCAAGGCCGGCAAGGTGGTGCGcgtgcgtg > 2:1332719/1‑150 (MQ=255) gtgtCGTCGGTGGTTTTCGCCTGGCCGTCGACCGTGCGTTTGCGGTTACCGGCGCCGGTGTGGTGGTCACCGGCACGGCACTGGCCGGGCGGGTCAGTGCGGGTGATACGTTGTTGCTGGGCAAGGCCGGCAAGGTGGTGCGcgtgcgtg < 2:1259571/150‑1 (MQ=255) aggtacagctcgatatccacccgaacactgggcgcatgcaaccattcgggcaccagccagtcgccccggtgcacctgctccacggccaggcgctcggcagcgatgttcagcgccacccgttggcctgcttctgccaccaacgcggccTgg < 2:1486518‑M1/3‑1 (MQ=255) tcgtcgGTGGTTTTCGCCTGGCCGTCGACCGTGCGTTTGCGGTTACCGGCGCCGGTGTGGTGGTCACCGGCACGGCACTGGCCGGGCGGGTCAGTGCGGGTGATACGTTGTTGCTGGGCAAGTCCGGCAAGGTGGTGCGCGTGCGTGGTc < 1:1765044/150‑1 (MQ=255) tcgtcgGTGGTTTTCGCCTGGCCGTCGACCGTGCGTTTGCGGTTACCGGCGCCGGTGTGGTGGTCACCGGCACGGCACTGGCCGGGCGGGTCAGTGCGGGTGATACGTTGTTGCTGGGCAAGGCCGGCAAGGTGGTGCGCGTGCGTGGTc < 1:2178288/150‑1 (MQ=255) tcgtcgGTGGTTTTCGCCTGGCCGTCGACCGTGCGTTTGCGGTTACCGGCGCCGGTGTGGTGGTCACCGGCACGGCACTGGCCGGGCGGGTCAGTGCGGGTGATACGTTGTTGCTGGGCAAGGCCGGCAAGGTGGTGCGCGTGCGTGGTc < 1:1643672/150‑1 (MQ=255) cgtcgGTGGTTTTCGCCTGGCCGCCGACCGTGCGTTTGCGGTTACCGGCGCCGGTGTGGTGGTCACCGGCACGGCACTGGCCGGGCGGGTCAGTGCGGGTGATACGTTGTTGCTGGGCAAGGCCGGCAAGGTGGTGCGCGTGCGTGGTCt < 1:360502/150‑1 (MQ=255) gtcgGTGGTTTTCGCCTGGCCGTCGACCGTGCGTTTGCGGTTACCGGCGCCGGTGTGGTGGTCACCGGCACGGCACTGGCCGGGCGGGTCAGTGCGGGTGATACGTTGTTGCTGGGCACGGACCTCAAGGTGGTGCGCGTGCGTGGTCTg > 1:603831/1‑150 (MQ=255) tcgGTGGTTTTCGCCTGGCCGTCGACCGTGCGTTTGCGGTTACCGGCGCCGGTGTGGTGGTCACCGGCACGGCACTGGCCGGGCGGGTCAGTGCTGGTGATACGTTGTTGCTGGGCAAGGCCGGCAAGGTGGTGCGCGTGCGTGGTCTGc < 1:503201/150‑1 (MQ=255) tggtTTTCGCCTGGCCGTCGACCGTGCGTTTGCGGTTACCGGCGCCGGTGTGGTGGTCACCGGCACGGCACTGGCCGGGCGGGTCAGTGCGGGTGATACGTTGTTGCTGGGCAAGGCCGGCAAGGTGGTGCGCGTGCGTGGTCTGCATgc < 1:566798/150‑1 (MQ=255) gtTTTCGCCTGGCCGTCGACCGTGCGTTTGCGGTTACCGGCGCCGGTGTGGTGGTCACCGGCACGGCACTGGCCGGGCGGGTCAGTGCGGGTGATACGTTGTTGCTGGGCAAGGCCGGCAAGGTGGTGCGCGTGCGTGGTCTGCATgcgc > 2:1028500/1‑150 (MQ=255) ccacccgaacactgggcgcatgcaaccattcgggcaccagccagtcgccccggtgcacctgctccacggccaggcgctcggcagcgatgttcagcgccacccgttggcctgcttctgccaccaacgcggccTGGTCTGCATGCGCAGAAc > 1:705183‑M1/132‑150 (MQ=255) gCCTGGCCGTCGACCGTGCGTTTGCGGTTACCGGCGCCGGTGTGGTGGTCACCGGCACGGCACTGGCCGGGCGGGTCAGTGCGGGTGATACGTTGTTGCTGGGCAAGGCCGGCAAGGTGGTGCGCGTGCGTGGTCTGCATGCGCAGAAcc > 2:2258081/1‑150 (MQ=255) ccTGGCCGTCGACCGTGCGTTTGCGGTTACCGGCGCCGGTGTGGTGGTCACCGGCACGGCACTGGCCGGGCGGGTCAGTGCGGGTGATACGTTGTTGCTGGGCAAGGCCGGCAAGGTGGTGCGCGTGCGTGGTCTGCATGCGCAGAACCa > 1:1834256/1‑150 (MQ=255) ccTGGCCGTCGACCGTGCGTTTGCGGTTACCGGCGCCGGTCGGGTGGTCACCGGCACGGCACTGGCCGGGCGGGTCAGTGCGGGTGATACGTTGTTGCTGGGCAAGGCCGGCAAGGTGGTGCGCGTGCGTGGTCTGCATGCGCAGAACCa < 1:623942/150‑1 (MQ=255) acccgaacactgggcgcatgcaaccattcgggcaccagccagtcgccccggtgcacctgctccacggccaggcgctcggcagcgatgttcagcgccacccgttggcctgcttctgccaccaacgcggccTGGTCTGCATGCGCAGAACCa > 1:1078249‑M1/130‑150 (MQ=255) cTGGCCGTCGACCGTGCGTTTGCGGTTACCGGCGCCGGTGTGGTGGTCACCGGCACGGCACTGGCCGGGCGGGTCAGTGCGGGTGATACGTTGTTGCTGGGCAAGGCCGGCAAGGTGGTGCGCGTGCGTGGTCTGCATGCGCAGAACCAg < 1:1595591/150‑1 (MQ=255) cTGGCCGTCGACCGTGCGTTTGCGGTTACCGGCGCCGGTGTGGTGGTCACCGGCACGGCACTGGCCGGGCGGGTCAGTGCGGGTGATACGTTGTTGCTGGGCAAGGCCGGCAAGGTGGTGCGCGTGCGTGGTCTGCATGCGCAGAACCAg < 1:2084372/150‑1 (MQ=255) 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ttgCTGGGCAAGGCCGGCAAGGTGGTGCGCGTGCGTGGTCTGCATGCGCAGAACCAGGCCGCGTTGGTGGCAGAAGCAGGCCAACGGGTGGCGCTGAACATCGCTGCCGAGCGCCTGGCCGTGGAGCAGGTGCACCGGGGCGActggctg < 1:2015037/150‑1 (MQ=255) gCTGGGCAAGGCCGGCAAGGTGGTGCGCGTGCGTGGTCTGCATGCGCAGAACCAGGCCGCGTTGGTGGCAGAAGCAGGCCAACGGGTGGCGCTGAACATCGCTGCCGAGCGCCTGGCCGTGGAGCAGGTGCACCGGGGCGACTGGCTGGt > 2:936725/1‑150 (MQ=255) cTGGGCAAGGCCGGCAAGGTGGTGCGCGTGCGTGGTCTGCATGCGCAGAACCAGGCCGCGTTGGTGGCAGAAGCAGGCCAACGGGTGGCGCTGAACATCGCTGCCGAGCGCCTGGCCGTGGAGCAGGTGCACCGGGGCGACTGGCTGGTg > 2:35483/1‑150 (MQ=255) ggCAAGGCCGGCAAGGTGGTGCGCGTGCGTGGTCTGCATGCGCAGAACCAGGCCGCGTTGGTGGCAGCAGCAGGCCAACGGGTGGCGCTGAACATCGCTGCCGAGCGCCTGGCCGTGGAGCAGGTGCACCGGGGCGACTGGCTGGTGccc < 2:1304800/150‑1 (MQ=255) aaGGCCGGCAAGGTGGTGCGCGTGCGTGGTCTGCATGCGCAGAACCAGGCCGCGTTGGTGGCAGAAGCAGGCCAACGGGTGGCGCTGAACATCGCTGCCGAGCGCCTGGCCGTGGAGCAGGTGCACCGGGGCGACTGGCTGGTGCCCGaa < 1:538828/150‑1 (MQ=255) aGGCCGGCAAGGTGGTGCGCGTGCGTGGTCTGCATGCGCAGAACCAGGCCGCGTTGGTGGCAGAAGCAGGCCAACGGGTGGCGCTGAACATCGCTGCCGAGCGCCTGGCCGTGGAGCAGGTGCACCGGGGCGACTGGCTGGTGCCCGAAt < 1:197196/150‑1 (MQ=255) ggCCGGCAAGGTGGTGCGCGTGCGTGGTCTGCATGCGCAGAACCAGGCCGCGTTGGTGGCAGAAGCAGGTCAACGGGTGGCGCTGAACATCGCTGCCGAGCGCCTGGCCGTGGAGCAGGTGCACCGGGGCGACTGGCTGGTGCCCGAATg > 2:1854337/1‑150 (MQ=255) gCCGGCAAGGTGGTGCGCGTGCGTGGTCTGCATGCGCAGAACCAGGCCGCGTTGGTGGCAGAAGCAGGCCAACGGGTGGCGCTGAACATCGCTGCCGAGCGCCTGGCCGTGGAGCAGGTGCACCGGGGCGACTGGCTGGTGCCCGAATgg < 2:2165057/150‑1 (MQ=255) ccGGCAAGGTGGTGCGCGTGCGTGGTCTGCATGCGCAGAACCAGGCCGCGTTGGTGGCAGAAGCAGGCCAACGGGTGGCGCTGAACATCGCTGCCGAGCGCCTGGCCGTGGAGCAGGTGCACCGGGGCGACTGGCTGGTGCCCGAATGGt > 2:1064385/1‑150 (MQ=255) ccGGCAAGGTGGTGCGCGTGCGTGGTCTGCATGCGCAGAACCAGGCCGCGTTGGTGGCAGAAGCAGGCCAACGGGTGGCGCTGAACATCGCTGCCGAGCGCCTGGCCGTGGAGCAGGTGCACCGGGGCGACTGGCTGGTGCCCGAATGGt < 2:146760/150‑1 (MQ=255) ggCAAGGTGGTGCGCGTGCGTGGTCTGCATGCGCAGAACCAGGCCGCGTTGGTGGCTGGAGCAGGCCAAAGGGGGGCTCTGAACATCGCTGCCGAGCGCCTGGCCGTGGAGCAGGTGCACCGGGGCGACTGGCTGGTGCCCGAATGGTTg > 1:1486518/1‑150 (MQ=255) ggCAAGGTGGTGCGCGTGCGTGGTCTGCATGCGCAGAACCAGGCCGCGTTGGTGGCAGAAGCAGGCCAACGGGTGGCGCTGAACATCGCTGCCGAGCGCCTGGCCGTGGAGCAGGTGCACCGGGGCGACTGGCTGGTGCCCGAATGGTTg > 1:1676825/1‑150 (MQ=255) gCAAGGTGGTGCGCGTGCGTGGTCTGCATGCGCAGAACCAGGCCGCGTTGGTGGCAGAAGCAGGCCAACGGGTGGCGCTGAACATCGCTGCCGAGCGCCTGGCCGTGGAGCAGGTGCACCGGGGCGACTGGCTGGTGCCCGAATGGTTGc > 2:2166133/1‑150 (MQ=255) aaGGTGGTGCGCGTGCGTGGTCTGCATGCGCAGAACCAGGCCGCGTTGGTGGCAGAAGCAGGCCAACGGGTGGCGCTGAACATCGCTGCCGAGCGCCTGGCCGTGGAGCAGGTGCACCGGGGCGACTGGCTGGTGCCCGAATGGTTGCAt < 1:1028500/150‑1 (MQ=255) aaGGTGGTGCGCGTGCGTGGTCTGCATGCGCAGAACCAGGCCGCGTTGGTGGCAGAAGCAGGCCAACGGGTGGCGCTGAACATCGCTGCCGAGCGCCTGGCCGTGGAGCAGGTGCACCGGGGCGACTGGCTGGTGCCCGAATGGTTGCAt > 1:2043605/1‑150 (MQ=255) ggtggtGCGCGTGCGTGGTCTGCATGCGCAGAACCAGGCCGCGTTGGTGGCAGAAGCAGGCCAACGGGTGGCGCTGAACATCGCTGCCGAGCGCCTGGCCGTGGAGCAGGTGCACCGGGGCGACTGGCTGGTGCCCGAATGGTTGCATgc < 1:216218/150‑1 (MQ=255) gcgcGTGCGTGTTCTGCATGCGCAGAACCAGGCCGCGTTGGTGGCAGAAGCAGGCCAACGGGTGGCGCTGAACATCGCTGCCGAGCGCCTGGCCGTGGAGCAGGTGCACCGGGGCGACTGGCTGGTGCCCGAATGGTTGCATGCGCCCAg > 2:594208/1‑150 (MQ=255) gcgcGTGCGTGGTCTGCATGCGCAGAACCAGGCCGCGTTGGTGGCAGAAGCAGGCCAACGGGTGGCGCTGAACATCGCTGCCGAGCGCCTGGCCGTGGAGCAGGTGCACCGGGGCGACTGGCTGGTGCCCGAATGGTTGCATGCGCCCAg > 2:1870678/1‑150 (MQ=255) gcgcGTGCGTGGTCTGCATGCGCAGAACCAGGCCGCGTTGGTGGCAGAAGCAGGCCAACGGGTGGCGCTGAACATCGCTGCCGAGCGCCTGGCCGTGGAGCAGGTGCACCGGGGCGACTGGCTGGTGCCCGAATGGTTGCATGCGCCCAg > 1:347096/1‑150 (MQ=255) gtgGTCTGCATGCGCAGAACCAGGCCGCGTTGGTGGCAGAAGCAGGCCAACGGGTGGCGCTGAACATCGCTGCCGAGCGCCTGGCCGTGGAGCAGGTGCACCGGGGCGACTGGCTGGTGCCCGAATGGTTGCATGCGCCCAGTGTTCggg < 2:2062480/150‑1 (MQ=255) TGGTCTGCATGCGCAGAACCAGGCCGCGTTGGTGGCAGAAGCAGGCCAACGGGTGGCGCTGAACATCGCTGCCGAGCGCCTGGCCGTGGAGCAGGTGCACCGGGGCGACTGGCTGGTGCCCGAATGGTTGCATGCGCCCAGTGTTCGGGt > 1:1203263‑M1/1‑150 (MQ=255) TGGTCTGCATGCGCAGAACCAGGCCGCGTTGGTGGCAGAAGCAGGCCAACGGGTGGCGCTGAACATCGCTGCCGAGCGCCTGGCCGTGGAGCAGGTGCACCGGGGCGACTGGCTGGTGCCCGAATGGTTGCATGCGCCCAGTGTTCGGGt > 1:5086‑M1/1‑150 (MQ=255) | GTGTCGTCGGTGGTTTTCGCCTGGCCGTCGACCGTGCGTTTGCGGTTACCGGCGCCGGTGTGGTGGTCACCGGCACGGCACTGGCCGGGCGGGTCAGTGCGGGTGATACGTTGTTGCTGGGCAAGGCCGGCAAGGTGGTGCGCGTGCGTGGTCTGCATGCGCAGAACCAGGCCGCGTTGGTGGCAGAAGCAGGCCAACGGGTGGCGCTGAACATCGCTGCCGAGCGCCTGGCCGTGGAGCAGGTGCACCGGGGCGACTGGCTGGTGCCCGAATGGTTGCATGCGCCCAGTGTTCGGGT > NC_002947/582655‑582952 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |