New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 582803 = | 108 (1.160) | 6 (0.070) | 5/242 | NT | 5.5% | coding (666/1923 nt) | selB | selenocysteyl‑tRNA‑specific translation elongation factor |
? | NC_002947 | 582824 = | 100 (1.110) | coding (687/1923 nt) | selB | selenocysteyl‑tRNA‑specific translation elongation factor |
Only 100 of 136 total aligned reads displayed.
CTGGCCGTCGACCGTGCGTTTGCGGTTACCGGCGCCGGTGTGGTGGTCACCGGCACGGCACTGGCCGGGCGGGTCAGTGCGGGTGATACGTTGTTGCTGGGCAAGGCCGGCAAGGTGGTGCGCGTGCGTGGTCTGCATGCGCAGAACCAGGCCGCGTTGGTGGCAGAAGCAGGCCAACGGGTGGCGCTGAACATCGCTGCCGAGCGCCTGGCCGTGGAGCAGGTGCACCGGGGCGACTGGCTGGTGCCCGAATGGTTGCATGCGCCCAGTGTTCGGGTGGATATCGAGCTGTACCTGTT > NC_002947/582675‑582973 | cTGGCCGTCGACCGTGCGTTTGCGGTTACCGGCGCCGGTGTGGTGGTCACCGGCACGGCACTGGCCGGGCGGGTCAGTGCGGGTGATACGTTGTTGCTGGGCAAGGCCGGCAAGGTGGTGCGCGTGCGTGGTCTGCATGCGCAGAACCAg < 1:2084372/150‑1 (MQ=255) tGGCCGTCGACCGTGCGTTTGCGGTTACCGGCGCCGGTGTGGTGGTCACCGGCACGGCACTGGCCGGGCGGGTCAGTGCGGGTGATACGTTGTTGCTGGGCAAGGCCGGCAAGGTGGTGCGCGTGCGTGGTCTGCATGCGCAGAACCAgg < 1:1540762/150‑1 (MQ=255) aCCGTGCGTTTGCGGTTACCGGCGCCGGTGTGGTGGTCACCGGCACGGCACTGGCCGGGCGGGTCAGTGCGGGTGATCCACAGCCGCGTGGCAAGGCCGGCAAGGTGGTGCGCGTGCGTGGTCCGCACGAGCAGAATCAGGCCGCGtttg > 1:146760/1‑148 (MQ=255) ccGTGCGTTTGCGGTTACCGGCGCCGGTGTGGTGGTCACCGGCACGGCACTGGCCGGGCGGGTCAGTGCGGGTGATACGTTGTTGCTGGGCAAGGCCGGCAAGGTGGTGCGCGTGCGTGGTCTGCATGCGCAGAACCAGGCCGCGTtggt < 2:1152751/150‑1 (MQ=255) gTGCGTTTTCGGTTACCGGCGCCGGTGTGGTGGTCACCGGCACGGCACTGGCCGGGCGGGTCAGTGCGGGTGATACGTTGTTGCTGGGCAAGGCCGGCAAGGTGGTGCGCGTGCGTGGTCTGCATGCGCAGAACCAGGCCGCGTtggtgg < 2:78224/150‑1 (MQ=255) gTGCGTTTGCGGTTACCGGCGCCGGTGTGGTGGTCACCGGCACGGCACTGGCCAGGCGGGTCAGTGCGGGTGATCTCTAATTGCTGGGCAAGGGCGGATGTGGTATCCTCTGGCCGTGTCTGCATGCGCAGAACCAGGCCGCGTtggtgg < 1:1862847/150‑1 (MQ=255) gCGTTCGCGGTCACCGGCGCCGGTGTGGTGTGCACCGGCACGGCACTGGCCGGGCGGGTCAGTGCGGGTGATACGTTGTTGCTGGGCAAGGCCGGCAAGGTGGTGCGCGTGCGTGGTCTGCATGCGCAGAACCAGGCCGCGTTGGTGGCa < 1:526854/150‑1 (MQ=255) gTTTGCGGTTACCGGCGCCGGTGTGGTGGTCACCGGCACGGCACTGGCCGGGCGGGTCAGTGCGGGTGATACGTTGTTGCTGGGCAAGGCCGGCCAGGTGGCGCGCTTGCGTGGTCTGCATGCGCAGAACCAGGCCGCGTTGGTGGCAGa < 2:929457/150‑1 (MQ=255) gTTTGCGGTTACCGGCGCCGGTGTGGTGGTCACCGGCACGGCACTGGCCGGGCGGGTCAGTGCGGGTGATACGTTGTTGCTGGGCAAGGCCGGCAAGGTGGTGCGCGTGCGTGGTCTGCATGCGCAGAACCAg < 2:945052/133‑1 (MQ=255) gTTTGCGGTTACCGGCGCCGGTGTGGTGGTCACCGGCACGGCACTGGCCGGGCGGGTCAGTGCGGGTGATACGTTGTTGCTGGGCAAGGCCGGCAAGGTGGTGCGCGTGCGTGGTCTGCATGCGCAGAACCAg > 1:945052/1‑133 (MQ=255) tagCGGTTACCGGCGCCGGTGTGGTGGTAATCGGCACGGCACTGGCCGGGCGGGTCAGTGCGGGTGATACGTTGTTGCTGGGCAAGGCCGGCAAGGTGGTGCGCGTGCGTGGTCTGCATGCGCAGAACCAGGCCGCGTTGGTGGCAGAAg < 1:2342473/148‑1 (MQ=255) gCGGTTACCGGCGCCGGTGTGGTGGTCACCGGCACGGCACTGGCCGGGCGGGTCAGTGCGGGTGATACGTTGTTGCTGGGCAAGGCCGGCAAGGTGGTGCGCGTGCGTGGTCTGCATGCGCAGAACCAGGCCGCGTTGGTGGCAGAAGCa < 1:1101202/150‑1 (MQ=255) cGGTTACCGGCGCCGGTGTGGTGGTCACCGGCACGGCACTGGCCGGGCGGGTCAGTGCGGGTGATACGTTGTTGCTGGGCAAGGCCGGCAAGGTGGTGCGCGTGCGTGGTCTGCATGCGCAGAACCAGGCCGCGTTGGTGGCAGAAGCAg < 2:1947733/150‑1 (MQ=255) ggTTACCGGCGCCGGTGTGGTGGTCACCGGCACGGCACTGGCCGGGCGGGTCAGTGCGGGTGATACGTTGTTGCTGGGCAAGGCCGGCAAGGTGGTGCGCGTGCGTGGTCTGCATGCGCAGAACCAGGCCGCGTTGGTGGCAGAAGCAgg < 2:657817/150‑1 (MQ=255) gtgtGGTGGTCACCGGCACGGCACTGGCCGGGCGGGTCAGTGCGGGTGATACGTTGTTGCTGGGCAAGGCCGGCAAGGTGGTGCGCGTGCGTGGTCTGCATGCGCAGAACCAGGCCGCGTTGGTGGCAGAAGCAGGCCAACGGGTGgcgc > 1:563866/1‑150 (MQ=255) tgtgGTGGTCACCGGCACGGCACTGGCCGGGCGGGTCAGTGCGGGTGATACGTTGTTGCTGGGCAAGGCCGGCAAGGTGGTGCGCGTGCGTGGTCTGCATGCGCAGAACCAGGCCGCGTTGGTGGCAGAAGCAGGCCAACGGGTGGCGCt > 2:793477/1‑150 (MQ=255) gtggtCACCGGCACGGCACTGGCCGGGCGGGTCAGTGCGGGTGATACGTTGTTGCTGGGCAAGGCCGGCAAGGTGGTGCGCGTGCGTGGTCTGCATGCGCAGAACCAGGCCGCGTtggtgg < 2:1813373/121‑1 (MQ=255) gtggtCACCGGCACGGCACTGGCCGGGCGGGTCAGTGCGGGTGATACGTTGTTGCTGGGCAAGGCCGGCAAGGTGGTGCGCGTGCGTGGTCTGCATGCGCAGAACCAGGCCGCGTtggtgg > 1:1813373/1‑121 (MQ=255) gtggtCACCGGCACGGCACTGGCCGGGCGGGTCAGTGCGGGTGATACGTTGTTGCTGGGCAAGGCCGGCAAGGTGGTGCGCGTGCGTGGTCTGCATGCGCAGAACCAGGCCGCGTtgg < 1:2319222/118‑1 (MQ=255) 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gtgGTCTGCATGCGCAGAACCAGGCCGCGTTGGTGGCAGAAGCAGGCCAACGGGTGGCGCTGAACATCGCTGCCGAGCGCCTGGCCGTGGAGCAGGTGCACCGGGGCGACTGGCTGGTGCCCGAATGGTTGCATGCGCCCAGTGTTCggg < 2:2062480/150‑1 (MQ=255) ctggttctgcgcatgcagaccaGGCCGCGTTGGTGGCAGAAGCAGGCCAACGGGTGGCGCTGaa > 1:22359‑M2/23‑64 (MQ=255) TGGTCTGCATGCGCAGAACCAGGCCGCGTTGGTGGCAGAAGCAGGCCAACGGGTGGCGCTGAACATCGCTGCCGAGCGCCTGGCCGTGGAGCAGGTGCACCGGGGCGACTGGCTGGTGCCCGAATGGTTGCATGCGCCCAGTGTTCGGGt > 1:1203263‑M1/1‑150 (MQ=255) TGGTCTGCATGCGCAGAACCAGGCCGCGTTGGTGGCAGAAGCAGGCCAACGGGTGGCGCTGAACATCGCTGCCGAGCGCCTGGCCGTGGAGCAGGTGCACCGGGGCGACTGGCTGGTGCCCGAATGGTTGCATGCGCCCAGTGTTCGGGt > 1:5086‑M1/1‑150 (MQ=255) GGTCTGCATGCGCAGAACCAGGCCGCGTTGGTGGCAGAAGCAGGCCAACGGGTGGCGCTGAACATCGCTGCCGAGCGCCTGGCCGTGGAGCAGGTGCACCGGGGCGACTGGCTGGTGCCCGAATGGTTGCATGCGCCCAGTGTTCGGGTg > 1:35483‑M1/1‑150 (MQ=255) TCTGCATGCGCAGAACCAGGCCGCGTTGGTGGCAGAAGCAGGCCAACGGGTGGCGCTGAACATCGCTGCCGAGCGCCTGGCCGTGGAGCAGGTGCACCGGGGCGACTGGCTGGTGCCCGAATGGTTGCATGCGCCCAGTGTTCGGGTGGa < 2:1427598‑M1/150‑1 (MQ=255) cTGCATGCGCAGAACCAGGCCGCGTTGGTGGCAGAAGCAGGCCAACGGGTGGCGCTGAACATCGCTGCCGAGCGCCTGGCCGTGGAGCAGGTGCACCGGGGCGACTGGCTGGTGCCCGAATGGTTGCATGCGCCCAGTGTTCGGGTGGat < 2:1784023/150‑1 (MQ=255) tGCATGCGCAGAACCAGGCCGCGTTGGTGGCAGAAGCAGGCCAACGGGTGGCGCTGAACATCGCTGCCGAGCGCCTGGCCGTGGAGCAGGTGCACCGGGGCGACTGGCTGGTGCCCGAATGGTTGCATGCGCCCAGTGTTCGGGTGGata > 1:402826/1‑150 (MQ=255) cATGCGCAGAACCAGGCCGCGTTGGTGGCAGAAGCAGGCCAACGGGTGGCGCTGAACATCGCTGCCGAGCGCCTGGCCGTGGAGCAGGTGCACCGGGGCGACTGGCTGGTGCCCGAATGGTTGCATGCGCCCAGTGTTCGGGTGGATATc < 1:2052309/150‑1 (MQ=255) cATGCGCAGAACCAGGCCGCGTTGGTGGCAGAAGCAGGCCAACGGGTGGCGCTGAACATCGCTGCCGAGCGCCTGGCCGTGGAGCAGGTGCACCGGGGCGACTGGCTGGTGCCCGAATGGTTGCATGCGCCCAGTGTTCGGGTGGATATc < 2:1029957/150‑1 (MQ=255) cATGCGCAGAACCAGGCCGCGTTGGTGGCAGAAGCAGGCCAACGGGTGGCGCTGAACATCGCTGCCGAGCGCCTGGCCGTGGAGCAGGTGCACCGGGGCGACTGGCTGGTGCCCGAATGGTTGCATGCGCCCAGTGTTCGGGTGGATATc < 2:580395/150‑1 (MQ=255) tGCGCAGAACCAGGCCGCGTTGGTGGCAGAAGCAGGCCAACGGGTGGCGCTGAACATCGCTGCCGAGCGCCTGGCCGTGGAGCAGGTGCACCGGGGCGACTGGCTGGTGCCCGAATGGTTGCATGCGCCCAGTGTTCGGGTGGATATCGa > 1:1581664/1‑150 (MQ=255) tGCGCAGAACCAGGCCGCGTTGGTGGCAGAAGCAGGCCAACGGGTGGCGCTGAACATCGCTGCCGAGCGCCTGGCCGTGGAGCAGGTGCACCGGGGCGACTGGCTGGTGCCCGAATGGTTGCATGCGCCCAGTGTTCGGGTGGATATCGa < 1:1018284/150‑1 (MQ=255) gcgcAGAACCAGGCCGCGTTGGTGGCAGAAGCAGGCCAACGGGTGGCGCTGAACATCGCTGCCGAGCGCCTGGCCGTGGAGCAGGTGCACCGGGGCGACTGGCTGGTGCCCGAATGGTTGCATGCGCCCAGTGTTCGGGTGGATATCGAg > 1:1468392/1‑150 (MQ=255) gcAGAACCAGGCCGCGTTGGTGGCAGAAGCAGGCCAACGGGTGGCGCTGAACATCGCTGCCGAGCGCCTGGCCGTGGAGCAGGTGCACCGGGGCGACTGGCTGGTGccc < 1:2425224/109‑1 (MQ=255) gcAGAACCAGGCCGCGTTGGTGGCAGAAGCAGGCCAACGGGTGGCGCTGAACATCGCTGCCGAGCGCCTGGCCGTGGAGCAGGTGCACCGGGGCGACTGGCTGGTGccc > 2:2425224/1‑109 (MQ=255) gcAGAACCAGGCCGCGTTGGTGGCAGAAGCAGGCCAACGGGTGGCGCTGAACATCGCTGCCGAGCGCCTGGCCGTGGAGCAGGTGCACCGGGGCGACTGGCTGGTGCCCGAATGGtt > 2:96967/1‑117 (MQ=255) gcAGAACCAGGCCGCGTTGGTGGCAGAAGCAGGCCAACGGGTGGCGCTGAACATCGCTGCCGAGCGCCTGGCCGTGGAGCAGGTGCACCGGGGCGACTGGCTGGTGCCCGAATGGtt < 1:96967/117‑1 (MQ=255) gcAGAACCAGGCCGCGTTGGTGGCAGAAGCAGGCCAACGGGTGGCGCTGAACATCGCTGCCGAGCGCCTGGCCGTGGAGCAGGTGCACCGGGGCGACTGGCTGGTGCCCGAATGGTTGCATGCGCCCAGTGTTCGGGTGGATATCGAGCt > 1:1597463/1‑150 (MQ=255) gcAGAACCAGGCCGCGTTGGTGGCAGAAGCAGGCCAACGGGTGGCGCTGAACATCGCTGCCGAGCGCCTGGCCGTGGAGCAGGTGCACCGGGGCGACTGGCTGGTGCCCGAATGGTTGCATGCGCCCAGTGTTCGGGTGGATATCGAGCt > 2:495510/1‑150 (MQ=255) aaCCAGGCCGCGTTGGTGGCAGAAGCAGGCCAACGGGTGGCGCTGAACATCGCTGCCGAGCGCCTGGCCGTGGAGCAGGTGCACCGGGGCGACTGGCTGGTGCCCGAATGGTTGCATGCGCCCAGTGTTCGGGTGGATATCGAGCTGTAc > 2:1769430/1‑150 (MQ=255) ccaGGCCGCGTTGGTGGCAGAAGCAGGCCAACGGGTGGCGCTGAACATCGCTGCCGAGCGCCTGGCCGTGGAGCAGGTGCACCGGGGCGACTGGCTGGTGCCCGAATGGTTGCATGCGCCCAGTGTTCGGGTGGATATCGAGCTGTACCt < 1:495510‑M2/147‑1 (MQ=255) ccaGGCCGCGTTGGTGGCAGAAGCAGGCCAACGGGTGGCGCTGAACATCGCTGCCGAGCGCCTGGCCGTGGAGCAGGTGCACCGGGGCGACTGGCTGGTGCCCGAATGGTTGCATGCGCCCAGTGTTCGGGTGGATATCGAGCTGTACCt < 2:1486518‑M2/147‑1 (MQ=255) aGGCCGCGTTGGTGGCAGAAGCAGGCCAACGGGTGGCGTTGAACATCGCTGCCGAGCGCCTGGCCGTGGAGCAGGTGCACCGGGGCGACTGGCTGGTGCCCGAATGGTTGCATGCGCCCAGTGTTCGGGTGGATATCGAGCTGTACCTGt > 1:2232389‑M2/2‑150 (MQ=255) ggCCGCGTTGGTGGCAGAAGCAGGCCAACGGGTGGCGCTGAACATCGCTGCCGAGCGCCGGGCCGTGGAGCAGGTGCACCGGGGCGACTGGCTGGTGCCCGAATGGTTGCATGCGCCCAGTGTTCGGGTGGGTATCGAGCTGTACCTGtt > 2:722765/1‑150 (MQ=255) | CTGGCCGTCGACCGTGCGTTTGCGGTTACCGGCGCCGGTGTGGTGGTCACCGGCACGGCACTGGCCGGGCGGGTCAGTGCGGGTGATACGTTGTTGCTGGGCAAGGCCGGCAAGGTGGTGCGCGTGCGTGGTCTGCATGCGCAGAACCAGGCCGCGTTGGTGGCAGAAGCAGGCCAACGGGTGGCGCTGAACATCGCTGCCGAGCGCCTGGCCGTGGAGCAGGTGCACCGGGGCGACTGGCTGGTGCCCGAATGGTTGCATGCGCCCAGTGTTCGGGTGGATATCGAGCTGTACCTGTT > NC_002947/582675‑582973 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |