New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | = 941373 | 117 (1.250) | 6 (0.070) | 6/244 | NT | 5.4% | coding (4252/18933 nt) | PP_0806 | surface adhesion protein |
? | NC_002947 | = 941406 | 98 (1.080) | coding (4219/18933 nt) | PP_0806 | surface adhesion protein |
Only 100 of 143 total aligned reads displayed.
GCCCGGTTCGGCACGGCCGGTGACCACGCTGCCGTCGGCATTGATCACCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATATCCGGTGCGGTGATTTGGGTGGGCAGCGAGGAAACACCGCCGTCATCAATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGAGGCGGGTCGAGGGTTACGGTGAAGCTGCCGTCGGGGCCAGCCACCACAGTGCCAACCAGCGTGCCGTTGGCGTCATGTACTTCCACACGGGTGCCGGCAGGTGCGGTACCGCTGATGCTGCTGCCGTCTTCGGCGA > NC_002947/941224‑941522 | ccGGTTCGGCACGGCCGGTGACCACGCTGCCGTCGGCATTGATCACCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATATCCGGTGCGGTGATTTGGGTGGGCAGCGAGGAAACACCGCCGTCATCAATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGc > 1:2068123/1‑150 (MQ=32) ccGGTTCGGCACGGCCGGTGACCACGCTGCCGTCGGCATTGATCACCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGACGGTGATATCCGGTGCGGTGATTTGGGTGGGCAGCGAGGAAACACCGCCGTCATCAATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGc > 2:1376879/1‑150 (MQ=17) ggTTCGGCACGGCCGGTGACCACGCTGCCGTCGGCATTGATCACCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATATCCGGTGCGGTGATTTGGGTGGGCAGCGAGGAAACACCGCCGTCATCAATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCg > 1:1844564/1‑150 (MQ=32) ttCGGCACGGCCGGTGACCACGCTGCCGTCGGCATTGATCACCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATATCCGGTGCGGTGATTTGGGTGGGCAGCGAGGAAACACCGCCGTCATCAATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGtt < 1:1531061/150‑1 (MQ=32) tCGGCACGGCCGGTGACCACGCTGCCGTCGGCATTGATCACCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATATCCGGTGCGGTGATTTGGGTGGGCAGCGAGGAAACACCGCCGTCATCAATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTg < 1:2005668/150‑1 (MQ=32) gCACGGCCGGTGACCACGCTGCCGTCGGCATTGATCACCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATATCCGGTGCGGTGATTTGGGTGGGCAGCGAGGAAACACCGCCGTCATCAATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGcc > 1:287698/1‑150 (MQ=33) cACGGCCGGTGACCACGCTGCCGTCGGCATTGATCACCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATATCCGGTGCGGTGATTTGGGTGGGCAGCGAGGAAACACCGCCGTCATCAATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCt < 1:519383/150‑1 (MQ=33) aCGGCCGGTGACCACGCTGCCGTCGGCATTGATAACTGGTTCGGTGGGTGCGGGAGGGGCGGAGATATCCGTTGCGGTGATTTGGGTGGGCAGCGAGGAAACACCGCCGTCATCAATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTg > 1:647427/1‑150 (MQ=11) cGGCCGGTGACCACGCTGCCGTCGGTATTGATCACCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATATCCGGTGCGGTGATTTGGGTGGGCAGCGAGGAAACACCGCCGTCATCAATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGa < 2:2258019/150‑1 (MQ=18) ccGGTGACCACGCTGCCGTCGGCATTGATCACCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATATCCGGTGCGGTGATTTGGGTGGGCAGCGAGGAAACACCGCCGTCATCAATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCGGAGGc < 1:1511421/150‑1 (MQ=18) gTGACCACGCTGCCGTCGGCATTGATCACCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATATCCGGTGCGGTGATTTGGGTGGGCAGCGAGGAAACACCGCCGTCATCAATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGAGGCggg > 1:323055/1‑150 (MQ=38) tGACCACGCTGCCGTCGGCATTGATCACCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATATCCGGTGCGGTGATTTGGGTGGGCAGCGAGGAAACACCGCCGTCATCAATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGAGGCGGGt < 2:341823/150‑1 (MQ=39) gACCACGCTGCCGTCGGCATTGATCACCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATATCCGGTGCGGTGATTTGGGTGGGCAGCGAGGAAACACCGCCGTCATCAATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGAGGCGGGTc < 1:1953636/150‑1 (MQ=39) 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acCGCCGTCATCAATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGAGGCGGGTCGAGGGTTACGGTGAAGCTGCCGTCGGGGCCAGCCACCACAGTGCCAACCAGCGTGCCGTTGGCGTCATGTACTTCCACACGGGTGGCGGCAgg > 1:1084959/1‑150 (MQ=255) acCGCCGTCATCAATGGCCACCACGCCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTCCCGCCGGTCGAGGGTTACGGTGAAGCTGCCGTCGGGGCCAGCCACCACAGTGCCAACCAGCGTGCCGTTGGCGTCATGTACTTCCACACGGGTGCCGGCAgg > 1:436072/1‑150 (MQ=17) cgccgTCATCAATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGAGGCGGGTCGAGGGTTACGGTGAAGCTGCCGTCGGGGCCAGCCACCACAGTGCCAACCAGCGTGCCGTTGGCGTCATGTACTTCCACACGGGTGCCGGCAGGTg < 1:1941347/150‑1 (MQ=255) gccgTCATCAATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGAGGCGGGTCGAGGGTTACGGTGAAGCTGCCGTCGGGGCCAGCCACCACAGTGCCAACCAGCGTGCCGTTGGCGTCATGTACTTCCACACGGGTGCCGGCAGGTGc < 1:2224987/150‑1 (MQ=255) gccgTCATCAATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGAGGCGGGTCGAGGGTTACGGTGAAGCTGCCGTCGGGGCCAGCCACCACAGTGCCAACCAGCGTGCCGTTGGCGTCATGTACTTCCACACGGGTGCCGGCAGGTGc > 2:2272134/1‑150 (MQ=255) ccgTCATCAATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGAGGCGGGTCGAGGGTTACGGTGAAGCTGCCGTCGGGGCCAGCCACCACAGTGCCAACCAGCGTGCCGTTGGCGTCATGTACTTCCACACgg > 1:440921/1‑135 (MQ=255) ccgTCATCAATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGAGGCGGGTCGAGGGTTACGGTGAAGCTGCCGTCGGGGCCAGCCACCACAGTGCCAACCAGCGTGCCGTTGGCGTCATGTACTTCCACACgg < 2:440921/135‑1 (MQ=255) ccgTCATCAATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGAGGCGGGTCGAGGGTTACGGTGAAGCTGCCGTCGGGGCCAGCCACCACAGTGCCAACCAGCGTGCCGTTGGCGTCATGTACTTCCACACGGGTGCCGGCAGGTGCg < 1:496101/150‑1 (MQ=255) catcaATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGAGGCGGGTCGAGGGTTACGGTGAAGCTGCCGTCGGGGCCAGCCACCACAGTGCCAACCAGCGTGCCGTTGGCGTCATGTACTTCCACACGGGTGCCGGCAGGTGCGGTAc < 2:1437262/150‑1 (MQ=255) atcaATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGAGGCGGGTCGAGGGTTACGGTGAAGCTGCCGTCGGGGCCAGCCACCACAGTGCCAACCAGCGTGCCGTTGGCGTCATGTACTTCCACCCGGTTGCCGGCAGGTGCGGTAcc > 2:686185/1‑150 (MQ=255) caATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGAGGCGGGTCGAGGGTTACGGTGAAGCTGCCGTCGGGGCCAGCCACCACAGTGCCAACCAGCGTGCCGTTGGCGTCATGTACTTCCACACGGGTGCCGGCAGGTGCGGTANCGc < 2:1510138/150‑1 (MQ=255) caccacGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGAGGCGGGTCGAGGGTTACGGTGAAGCTGCCGTCGGGGCCAGCCACCACAGTGCCAACCAGCGTGCCGTTGGCGTCATGTACTTCCACACGGGTGCCGGCAGGTGCGGTACCGCTGAtgct > 1:2005886/1‑150 (MQ=255) ccAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGAGGCGGGTCGAGGGTTACGGTGAAGCTGCCGTCGGGGCCAGCCACCACAGTGCCAACCAGCGTGCCGTTGGCGTCATGTACTTCCACACGGGTGCCGGCAGGTGCGGTAc < 1:442860/132‑1 (MQ=255) ccAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGAGGCGGGTCGAGGGTTACGGTGAAGCTGCCGTCGGGGCCAGCCACCACAGTGCCAACCAGCGTGCCGTTGGCGTCATGTACTTCCACACGGGTGCCGGCAGGTGCGGTAc > 2:442860/1‑132 (MQ=255) agcagTTCGCCGTTGGCCTGAGGCGGGTCGCGGGTTACGGTGAAGCTGCCGTCGGGGCCAGCCACCACAGTGCCAACCAGCGTGCCGTTGGCGTCATGTACTTCCACACGGGTGCCGGCAGGTGCGGTACCGCTGATGCTGCTGCCGTCt < 2:273820/150‑1 (MQ=255) cagTTCGCCGTTGGCCTGAGGCGGGTCGAGGGTTACGGTGAAGCTGCCGTCGGGGCCAGCCACCACAGTGCCAACCAGCGTGCCGTTGGCGTCATGTACTTCCACACGGGTGCCGGCAGGTGCGGTACCGCTGATGCTGCTGCCGTCTTc < 2:1568753/150‑1 (MQ=255) gTTCGCCGTTGGTCTGGGCCGGGTCGAGGGTGACGGCgaactgctggacgtggtggccattgatgacggcggtgtttcctcgctgcccacccaaatcaccgcaccggatatcaccgcccctgccgcaccgac < 1:1326039‑M2/132‑96 (MQ=255) ttCaccgtaaccctcgacccgcctcaggccaacggcgaactgctggacgtggtggccattgatgacggcggtgtttcctcgctgcccacccaaatcaccgcaccggatatcaccgcccctgccgcaccgaccgaactggtgatcaatgcc > 2:287698‑M1/1‑3 (MQ=255) ttCGCCGTTGGCCTGAGGCGGGTCGAGGGTTACGGTgaactgctggacgtggtggccattgatgacggcggtgtttcct > 2:2147145‑M2/1‑36 (MQ=255) ttCGCCGTTGGCCTGAGGCGGGTCGAGGGTTACGGTGAAGCTGCCGTCGGGGCCAGCCACCACAGTGCCAACCAGCGTGCCGTTGGCGTCATGTACTTCCACACGGGTGCCGGCAGGTGCGGTACCGCTGATGCTGCTGCCGTCTTCGGc < 2:1996833/150‑1 (MQ=255) ttCGCCGGTGGCCTGAGGCGGGTCGAGGGTTACGGTGAAGCTGCCGTCGGGGCCAGCCACCACAGTGCCAACCAGCGTGCCGTTGGCGTCATGTACTTCCACACGGGTGCCGGCAGGTGCGGTACCGCTGATGCTGCTGCCGTCTTCGGc < 2:703904/150‑1 (MQ=255) tCaccgtaaccctcgacccgcctcaggccaacggcgaactgctggacgtggtggccattgatgacggcggtgtttcctcgctgcccacccaaatcaccgcaccggatatcaccgcccctgccgcaccgaccgaactggtgatcaatgccg > 1:1249140‑M1/1‑2 (MQ=255) caccgtaaccctcgacccgcctcaggccaacggcgaactgctggacgtggtggccattgatgacggcggtgtttcctcgctgcccacccaaatcaccgcaccggatatcaccgcccctgccgcaccgaccgaactggtgatcaatgccga < 2:2061797‑M1/150‑150 (MQ=255) | GCCCGGTTCGGCACGGCCGGTGACCACGCTGCCGTCGGCATTGATCACCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATATCCGGTGCGGTGATTTGGGTGGGCAGCGAGGAAACACCGCCGTCATCAATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGAGGCGGGTCGAGGGTTACGGTGAAGCTGCCGTCGGGGCCAGCCACCACAGTGCCAACCAGCGTGCCGTTGGCGTCATGTACTTCCACACGGGTGCCGGCAGGTGCGGTACCGCTGATGCTGCTGCCGTCTTCGGCGA > NC_002947/941224‑941522 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |