New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | = 941373 | 117 (1.250) | 6 (0.070) | 6/244 | NT | 5.4% | coding (4252/18933 nt) | PP_0806 | surface adhesion protein |
? | NC_002947 | = 941406 | 98 (1.080) | coding (4219/18933 nt) | PP_0806 | surface adhesion protein |
Only 100 of 117 total aligned reads displayed.
TCGGCATTGATCACCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATATCCGGTGCGGTGATTTGGGTGGGCAGCGAGGAAACACCGCCGTCATCAATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGAGGCGGGTCGAGGGTTACGGTGAAGCTGCCGTCGGGGCCAGCCACCACAGTGCCAACCAGCGTGCCGTTGGCGTCATGTACTTCCACACGGGTGCCGGCAGGTGCGGTACCGCTGATGCTGCTGCCGTCTTCGGCGAATACCAGGTCGCTGGGGCTGGCGGGCGCAGTGG > NC_002947/941258‑941555 | cGGCATTGATCACCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATATCCGGTGCGGTGATTTGGGTGGGCAGCGAGGAAACACCGCCGTCATCAATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGAGGCGGGTCGAGGGTTACGGTga > 1:1249140‑M2/1‑148 (MQ=255) gCATTGATCACCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATATCCGGTGCGGTGATTTGGGTGGGCAGCGAGGAAACACCGCCGTCATCAATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGAGGCGGGTCGAGGGTTACGGTGAAg < 2:2068123/150‑1 (MQ=255) aTTGATCACCAGTTCGGTCGGTGCGGAAGGGGCGGCGCTAGGTGGTTGGGTTATTTGGGTGGGCAGCGAGGAAACACCGCCGTCATCAATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGAGGCGGGTCGAGGGTTACGGTGAAGCt < 1:1982001/150‑1 (MQ=14) ttGATCACCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATATACGGTGCGGTGATTTGGGTGGGCAGCGAGGAAACACCGCCGTCATCAATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGAGGCGGGTCGAGGGTTACGGTGAAGCTg < 2:1461351/150‑1 (MQ=255) aTCACCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATATCCGGTGCGGTGATTTGGGTGGGCAGCGAGGAAACACCGCCGCCATCAATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGAGGCGGGTCGAGGGTTACGGTGAAGCTGCCg > 2:196920/1‑150 (MQ=255) tCACCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATATCCGGTGCGGTGATTTGGGTGGGCAGCGAGGAAACACCGCCGTCATCAATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGAGGCGGGTCGAGGGTTACGGTGAAGCTGCCGt > 1:1996833/1‑150 (MQ=255) aCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATATCCGGTGCGGTGATTTGGGTGGGCAGCGAGGAAACACCGCCGTCATCAATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGAGGCGGGTCGAGGGTTACGGTGAAGCTGCCGTCg < 2:1743551/150‑1 (MQ=255) aCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATATCCGGTGCGGTGATTTGGGTGGGCAGCGAGGAAACACCGCCGTCATCAATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGAGGCGGGTCGAGGGTTACGGTGAAGCTGCCGTCg > 2:1335625/1‑150 (MQ=255) ccAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATATCCGGTGCGGTGATTTGGGTGGGCAGCGAGGAAACACCGCCGTCATCAATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGAGGCGGGTCGAGGGTTACGGTGAAGCTGCCGTCgg < 1:1062846/150‑1 (MQ=255) cAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATATCCGGTGCGGTGATTTGGGTGGGCAGCGAGGAAACACCGCCGTCATCAATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGAGGCGGGTCGAGGGTTACGGTGAAGCTGCCGTCggg < 2:1724906/150‑1 (MQ=255) cAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATATCCGGTGCGGTGATTTGGGTGGGCAGCGAGGAAACACCGCCGTCATCAATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGAGGCGGGTCGAGGGTTACGGTGAAGCTGCCGTCggg < 1:389181/150‑1 (MQ=255) cAGTTCGGTCCGTGCGGCAGGGGCGTTGACATCCGTTCAGGTGATGTGCTCGGGTATTTATGAACATCACCCGTTATTAATCTCCCTCACGGCCAGCAGTTCGCCTTCTACCTAAGGCGGGTCGAGGGTTACGGTGAAGCTGTGGTCgag < 2:1071768/150‑3 (MQ=255) ttCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATATCCGGTGCGGTGATTTGGGTGGGCAGCGAGGAAACACCGCCGTCATCAATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGAGGCGGGTCGAGGGTTACGGTGAAGCTGCCGTCGGGgcc > 1:1787876/1‑150 (MQ=255) tcggtcggTGCGGCAGGGGCGGTGATATCCGGTGCGGTGATTTGGGTGGGCAGCGAGGAAACACCGCCGTCATCAATGGCCACCACGTCCAGCAGTCTGCCGTTGGCAAGCAGCGGGTCGAGGGTTACGGTGAAGCTGCCGTCGGGgcca < 1:300213/150‑1 (MQ=14) gtcggtGCGGCAGGGGCGGTTATATCCGGTGCGGTGATTTGGGTGGGCAGCGAGGAAACACCGCCGTCATCAATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGAGGCGGGTCGAGGGTTACGGTGAAGCTGCCGTCGGGgccagcc > 2:1535930/1‑150 (MQ=255) gtGCGGCAGGGGCGGTGATATCCGGTGCGGTGATTTGGGTGGGCAGCGAGGAAACACCGCCGTCATCAATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGAGGCGGGTCGAGGGTTACGGTGAAGCTGCCGTCGGGGCCAGccacca < 1:2061797/150‑1 (MQ=255) cGGCAGGGGCGGTGATATCCGGTGCGGTGATTTGGGTGGGCAGCGAGGAAACACCGCCGTCATCAATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGAGGCGGGTCGAGGGTTACGGTGAAGCTGCCGTCGGGGCCAGCTACCACAg < 2:90291/150‑1 (MQ=255) ggCAGGGGCGGTGATATCCGGTGCGGTGATTTGGGTGGGCAGCGNGGAANCACCGCCGTCATCAATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGAGGCGGGTCGAGGGTTACGGTGAAACTGCCGTCGGGGGCAGCCACCACAGt > 1:194381/1‑150 (MQ=255) 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ttCGCCGTTGGCCTGAGGCGGGTCGAGGGTTACGGTGAAGCTGCCGTCGGGGCCAGCCACCACAGTGCCAACCAGCGTGCCGTTGGCGTCATGTACTTCCACACGGGTGCCGGCAGGTGCGGTACCGCTGATGCTGCTGCCGTCTTCGGc < 1:1535930/150‑1 (MQ=255) ttCGCCGTTGGCCTGAGGCGGGTCGAGGGTTACGGTGAAGCTGCCGTCGGGGCCAGCCACCACAGTGCCAACCAGCGTGCCGTTGGCGTCATGTACTTCCACACGGGTGCCGGCAGGTGCGGTACCGCTGATGCTGCTGCCGTCTTCGGc < 2:1996833/150‑1 (MQ=255) ccGTTGGCCTGAGGCGGGTCGAGGGTTACGGTGAAGCTGCCGTCGGGGCCAGCCACCACAGTGCCAACCAGCGTGCCGTTGGCGTCATGTACTTCCACACGGGTGCCGGCAGGTGCGGTACCGCTGATGCTGCTGCCGTCTTCGGCGAAt > 1:1398207/1‑150 (MQ=255) ccGTTGGCCTGAGGCGGGTCGAGGGTTACGGTGAAGCTGCCGTCGGGGCCAGCCACCACAGTGCCAACCAGCGTGCCGTTGGCGTCATGTACTTCCACACGGGTGCCGGCAGGTGCGGTACCGCTGATGCTGCTGCCGTCTTCGGCGAAt < 1:1069473/150‑1 (MQ=255) ttGGCCTGAGGCGGGTCGAGGGTTACGGTGAAGCTGCCGTCGGGGCCAGCCACCACAGTGCCAACCAGCGTGCCGTTGGCGTCATGTACTTCCACACGGGTGCCGGCAGGTGCgg < 2:1933158/115‑1 (MQ=255) ttGGCCTGAGGCGGGTCGAGGGTTACGGTGAAGCTGCCGTCGGGGCCAGCCACCACAGTGCCAACCAGCGTGCCGTTGGCGTCATGTACTTCCACACGGGTGCCGGCAGGTGCgg > 1:1933158/1‑115 (MQ=255) tGGCCTGAGGCGGGTCGAGGGTTACGGTGAAGCTGCCGTCGGGGCCAGCCACCACAGTGCCAACCAGCGTGCCGTTGGCGTCATGTACTTCCACACGGGTGCCGGCAGGTGCGGTACCGCTGATGCTGCTGCCGTCTTCGGCGAATACCa < 1:2305871/150‑1 (MQ=255) cTGAGGCGGGTCGAGGGTTACGGTGAAGCTGCCGTCGGGGCCAGCCACCACAGTGCCAACCAGCGTGCCGTTGGCGTCATGTACTTCCACACGGGTGCCGGCAGGTGCGGTACCGCTGGTGCTGCTGCCGTCTTCGGCGAATACCAGGTc > 2:2339923/1‑150 (MQ=255) cTGAGGCGGGTCGAGGGTTACGGTGAAGCTGCCGTCGGGGCCAGCCACCACAGTGCCAACCAGCGTGCCGTTGGCGTCATGTACTTCCACACGGGTGCCGGCAGGTGCGGTACCGCTGATGCTGCTGCCGTCTTCGGCGAATAc < 2:774953/144‑1 (MQ=255) cTGAGGCGGGTCGAGGGTTACGGTGAAGCTGCCGTCGGGGCCAGCCACCACAGTGCCAACCAGCGTGCCGTTGGCGTCATGTACTTCCACACGGGTGCCGGCAGGTGCGGTACCGCTGATGCTGCTGCCGTCTTCGGCGAATAc > 1:774953/1‑144 (MQ=255) gCGGGTCGAGGGTTACGGTGAAGCTGCCGTCGGGGCCAGCCACCACAGTGCCAACCAGCGTGCCGTTGGCGTCATGTACTTCCACACGGGTGCCGGCAGGTGCGGTACCGCTGATGCTGCTGCCGTCTTCGGCGAATACCAGGTCGCTgg > 2:1183551/1‑150 (MQ=255) gggTCGAGGGTTACGGTGAAGCTGCCGACGTGGCCAGCCACGTAAGTGCCAACCAGCGTGCAGGTGGCGTCAAGTTGTTCAACAAGGGTGCCGGAAGGTGCGGTACCGCTGACGCTGCTGCCGTCTTCGGCGTATACCAGGTCGCTgggg < 2:820680/150‑1 (MQ=255) gTCGAGGGTTACGGTGAAGCTGCCGTCGGGGCCAGCCACCACAGTGCCAACCAGCGTGCCGTTGGCGTCATGTACTTCCACACGGGTGCCGGCAGGTGCGGTACCGCTGATGCTGCTGCCGTCTTCGGCGAATACCAGGTCGCTGGGGCt > 1:2286286/1‑150 (MQ=255) gggTTACGGTGAAGCTGCCGTCGGGGCCAGCCACCACAGTGCCAACCAGCGTGCCGTTGGCGTCATGTACTTCCACACGGGTGCCGGCAGGTGCGGTACCGCTGATGCTGCTGCCGTCTTCGGCGAATACCAGGTCGCTGGGGCTggcgg < 2:1821830/150‑1 (MQ=255) gggTTACGGTGAAGCTGACGTCGGGGCCAGCCACCACAGTGCCAACCAGCGTGCCGTTGGCGTCATGTACTTCCACACGGGTGCCGGCAGGTGCGGTACCGCTGATGCTGCTGCCGTCTTGGGCGAATACCAGGTCGCTGGGGCTggcgg > 1:799311/1‑150 (MQ=255) gTTACGGTGAAGCTGCCGTCGGGGCCAGCCACCACAGTGCCAACCAGCGTGCCGTTGGCGTCATGTACTTCCACACGGGTGCCGGCAGGTGCGGTACCGCTGATGCTGCTGCCGTCTTCGGCGAATACCAGGTCGCTGGGGCTggcgggc < 1:2272134/150‑1 (MQ=255) ttACGGTGAAGCTGCCGTCGGGGCCAGCCACCACAGTGCCAACCAGCGTGCCGTTGGCGTCATGTACTTCCACACGGGTGCCGGCAGGTGCGGTACCGCTGATGCTGCTGCCGTCGGCGGCGAATACCAGGTCGCTGGGGCTggccggcg > 2:2230238/1‑150 (MQ=255) cGGTGAAACTGCCGTCGGGGCCAGCCACCACAGTGCCAACCAGCGTGCCGTTGGCGTCATGTACTTCCACACGGGTGCCGGCAGGTGCGGTACCGCTGATGCTGCTGCCGTCTTCGGCGAATACCAGGTCGCTGGGGCTGGCGGGCGCAg < 2:615132/150‑1 (MQ=255) gTGAAGCTGCCGTCGGGGCCAGCCACCACAGTGCCAACCAGCGTGCCGTTGGCGTCATGTACTTCCACACGGGTGCCGGCAGGTGCGGTACCGCTGATGCTGCTGCCGTCTTCGGCGAATACCAGGTCGCTGGGGCTGGCGGGCGCAgtg < 1:2247966/150‑1 (MQ=255) tGAAGCTGCCGTCGGGGCCAGCCACCACAGTGCCAACCAGCGTGCCGTTGGCGTCATGTACTTCCACACGGGTGCCGGCAGGTGCGGTACCGCTGATGCTGCTGCCGTCTTCgg < 1:630293/114‑1 (MQ=255) tGAAGCTGCCGTCGGGGCCAGCCACCACAGTGCCAACCAGCGTGCCGTTGGCGTCATGTACTTCCACACGGGTGCCGGCAGGTGCGGTACCGCTGATGCTGCTGCCGTCTTCgg > 2:630293/1‑114 (MQ=255) tGAAGCTGCCGTCGGGGCCAGCCACCACAGTGCCAACCAGCGTGCCGTTGGCGTCATGTACTTCCACACGGATGCCGGCAGGTGCGGTACCGCTGATGCTGCTGCCGTCTTCGGCGAATACCAGGTCGCTGGGGCTGACGGGCGCAgtgg > 2:1328977/1‑150 (MQ=255) | TCGGCATTGATCACCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATATCCGGTGCGGTGATTTGGGTGGGCAGCGAGGAAACACCGCCGTCATCAATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGAGGCGGGTCGAGGGTTACGGTGAAGCTGCCGTCGGGGCCAGCCACCACAGTGCCAACCAGCGTGCCGTTGGCGTCATGTACTTCCACACGGGTGCCGGCAGGTGCGGTACCGCTGATGCTGCTGCCGTCTTCGGCGAATACCAGGTCGCTGGGGCTGGCGGGCGCAGTGG > NC_002947/941258‑941555 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |