New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 2408436 = | 94 (1.010) | 6 (0.070) | 6/234 | NT | 6.6% | coding (172/1566 nt) | PP_2111 | aerotaxis receptor |
? | NC_002947 | 2408461 = | 83 (0.950) | coding (147/1566 nt) | PP_2111 | aerotaxis receptor |
Only 100 of 111 total aligned reads displayed.
CTGGTTGTTATCGAAAATGGGGGTGACATAGGCGTTGACCCAGTAATGGTCGCCGGACTTGCAGCGGTTCTTGACGATACCCATCCACGGCTGGCCCTGCTTGAGGGTTTGCCACATATG‑GGCAAACACGGCAGGCGGTACGTCGGGGTGGCGCACCAGGTTGTGCGGTGCGCCCGTCAGCTCCTCGCGGGTGAAACCACTGATTTCGATAAAGGCATCGTTGCAGTAGGTGATCACACCCTTGGCGTTGGTAGTGGAGATCAACCGCTGCTGGGCTGGGAAAGTCCGTTCTCTCTGG > NC_002947/2408287‑2408584 | cTGGTTGTTATCGAAAATGGGGGTGACATAGGCGTTGACCCAGTAATGGTCGCCGGACTTGCAGCGGTTCTTGACGATACCCATCCACGGCTGGCCCTGCTTGAGGGTTTGCCACATATG‑GGCAAACACGGCAGGCGGTACGTCGGGGTg > 1:365017/1‑150 (MQ=255) tGGTTGTTATCGAAAATGGGGGTGACATAGGCGTTGACCCAGTAATGGTCGCCGGACTTGCAGCGGTTCTTGACGATACCCATCCACGGCTGGCCCTGCTTGAGGGTTTGCCACATATG‑GGCAAACACGGCAGGCGGTACGTCGGGGTgg < 2:2130377/150‑1 (MQ=255) catgcgtaacaaccagccgattacccagagagaacggactttcccagcccagcagcggttgatctccactaccaacgccaagggtgtgatcacctactgcaacgatgcctttatcgaaatcagtggtttcacccgcgaggagctgacggg < 1:1318504‑M1/2‑1 (MQ=255) ttATCGAAAATGGGGGTGACATAGGCGTTGACCCAGTAATGGTCGCCGGACTTGCAGCGGTTCTTGACGATACCCATCCACGGCTGGCCCTGCTTGAGGGTTTGCCACATATG‑GGCAAACACGGCAGGCGGTACGTCGGGGTGGCGCAcc > 2:1795475/1‑150 (MQ=255) taacaaccagccgattacccagagagaacggactttcccagcccagcagcggttgatctccactaccaacgccaagggtgtgatcacctactgcaacgatgcctttatcgaaatcagtggtttcacccgcgaggagctgacgGGCGCAcc < 1:581969‑M1/8‑1 (MQ=255) tATCGAAAATGGGGGTGACATAGGCGTTGACCCAGTAATGGTCGCCGGACTTGCAGCGGTTCTTGACGATACCCATCCACGGCTGGCCCTGCTTGAGGGTTTGCCACATATG‑GGCAAACACGGCAGGCGGTACGTCGGGGTGGCGCACCa > 2:548825/1‑150 (MQ=255) aTCGAAAATGGGGGTGACATAGGCGTTGACCCAGTAATGGTCGCCGGACTTGCAGCGGTTCTTGACGATACCCATCCACGGCTGGCCCTGCTTGAGGGTTTGCCACATATG‑GGCAAACACGGCAGGCGGTACGTCGGGGTGGCGCACCAg < 2:1787751/150‑1 (MQ=255) aTCGAAAATGGGGGTGACATAGGCGTTGACCCAGTAATGGTCGCCGGACTTGCAGCGGTTCTTGACGATACCCATCCACGGCTGGCCCTGCTTGAGGGTTTGCCACATAAG‑GGCAAACACGGCAGGCGGTACGTCGGGGTGGCGCACCAg > 1:1535005/1‑150 (MQ=255) tctaaaaTGGGGGTGACATAGGCGTTGACCCAGTAATGGTCGCCGGACTTGCAGCGGTTCTTGACGATACCCATCCACGGCTGGCCCTGCTTGAGGGTTTGCCACATATG‑GGCAAACACGGCAGGCGGTACGTCGGGGTGGCGCACCAgg < 1:1328085/147‑1 (MQ=255) tCGAAAATGGGGGTGACATAGGCGTTGACCCAGTAATGGTCGCCGGACTTGCAGCGGTTCTTGACGATACCCATCCACGGCTGGCCCTGCTTGAGGGTTTGCCACATATG‑GGCAAACACGGCAGGCGGTACGTCGGGGTGGCGCACCAgg > 1:1727742/1‑150 (MQ=255) cGAAAATGGGGGTGACATAGGCGTTGACCCAGTAATGGTCGCCGGACTTGCAGCGGTTCTTGACGATACCCATCCACGGCTGGCCCTGCTTGAGGGTTTGCCACATATG‑GGCAAACACGGCAGGCGGTACGTCGGGGTGGCGCACCAGGt > 1:2333286/1‑150 (MQ=255) aaTGGGGGTGACATAGGCGTTGACCCAGTAATGGTCGCCGGACTTGCAGCGGTTCTTGACGATACCCATCCACGGCTGGCCCTGCTTGAGGGTTTGCCACATATG‑GGCAAACACGGCAGGTGGTACGTCGGGGTGGCGCACCAGGTtgtg < 1:196991/150‑1 (MQ=255) ggggTGACATAGGCGTTGACCCAGTAATGGTCGCCGGACTTGCAGCGGTTCTTGACGATACCCATCCACGGCTGGCCCTGCTTGAGGGTTTGCCACATATG‑GGCAAACACGGCAGGCGGTACGTCGGGGTGGCGCACCAGGTTgtgcggt < 2:304393/150‑1 (MQ=255) ggggTGACATAGGCGTTGACCCAGTAATGGTCGCCGGACTTGCAGCGGTTCTTGACGATACCCATCCACGGCTGGCCCTGCTTGAGGGTTTGCCACATATG‑GGCAAACACGGCAGGCGGTACGTCGGGGTGGCGCACCAGGTTgtgcggt < 1:681380/150‑1 (MQ=255) ggTGACATAGGCGTTGACCCAGTAATGGTCGCCGGACTTGCAGCGGTTCTTGACGATACCCATCCACGGCTGGCCCTGCTTGAGGGTTTGCCACATATG‑GGCAAACACGGCAGGCGGTACGTCGGGGTGGCGCACCAGGTTgtgcggtgc < 2:740851/150‑1 (MQ=255) gTGACATAGGCGTTGACCCAGTAATGGTCGCCGGACTTGCAGCGGTTCTTGACGATACCCATCCACGGCTGGCCCTGCTTGAGGGTTTGCCACATATG‑GGCAAACACGGCAGGCGGTACGTCGGGGTGGCGCACCAGGTTgtgcggtgcg > 1:1470921/1‑150 (MQ=255) gTGACATAGGCGTTGACCCAGTAATGGTCGCCGGACTTGCAGCGGTTCTTGACGATACCCATCCACGGCTGGCCCTGCTTGAGGGTTTGCCACATATG‑GGCAAACACGGCAGGCGGTACGTCGGGGTGGCGCACCAGGTTgtgcggtgcg > 1:1650943/1‑150 (MQ=255) tGACATAGGCGTTGACCCAGTAATGGTCGCCGGACTTGCAGCGGTTCTTGACGATACCCATCCACGGCTGGCCCTGCTTGAGGGTTTGCCACATATG‑GGCAAACACGGCAGGCGGTACGTCGGGGTGGCGCACCAGGTTGTGCGGTgcgc < 1:354048/150‑1 (MQ=255) 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aCCCAGTAATGGTCGCCGGACTTGCAGCGGTTCTTGACGATACCCATCCACGGCTGGCCCTGCTTGAGGGTTTGCCACATATG‑GGCAAACACGGCAGGCGGTACGTCGGGGTGGCGCACCAGGTTGTGCGGTgcgc > 1:1803835/1‑136 (MQ=255) aCCCAGTAATGGTCGCCGGACTTGCAGCGGTTCTTGACGATACCCATCCACGGCTGGCCCTGCTTGAGGGTTTGCCACATATG‑GGCAAACACGGCAGGCGGTACGTCGGGGTGGCGCACCAGGTTGTGCGGTgcgc < 2:1803835/136‑1 (MQ=255) cAGTAATGGTCGCCGGACTTGCAGCGGTTCTTGACGATACCCATCCACGGCTGGCCCTGCTTGAGGGTTTGCCACATATG‑GGCAAACACGGCAGGCGGTACGTCGGGGTGGCGCACCAGGTTGTGCGGTGCGCCCGTCAGCTCCTCGCgg < 1:450484/150‑1 (MQ=255) cAGTAATGGTCGCCGGACTTGCAGCGGTTCTTGACGATACCCATCCACGGCTGGCCCTGCTTGAGGGTTTGCCACATATG‑GGCAAACACGGCAGGCGGTACGTCGGGGTGGCGCACCAGGTTGTGCGGTGCGCCCGTCAGCTCCTCGCgg > 1:1189021/1‑150 (MQ=255) cAGTAATGGTCGCCGGACTTGCAGCGGTTCTTGACGATACCCATCCACGGCTGGCCCTGCTTGAGGGTTTGCCACATATG‑GGCAAACACGGCAGGCGGTACGTCGGGGTGGCGCACCAGGTTGTGCGGTGCGCCCGTCAGCTCCTCGCgg < 1:1100505/150‑1 (MQ=255) 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atggcagCCGGCCTTGGAGCAGTCCGTGACGATACCCATCCACGGCTGGCCCTGCTTGAGGGTTTGCCACATATG‑GGCAAACACGGCAGGCGGTACGTCGGGGTGGCGCACCAGGTTGTGCGGTGCGCCCGTCAGCTCCTCGCGGGTGaa < 2:1098118/144‑1 (MQ=37) tGGTCGCCGGACTTGCAGCGGTTCTTGACGATACCCATCCACGGCTGGCCCTGCTTGAGGGTTTGCCACATATG‑GGCAAACACGGCAGGCGGTACGTCGGGGTGGCGCACCAGGTTGTGCGGTGCGCCCGTCAGCTCCTCGCGGGTGaaa < 2:1836137/150‑1 (MQ=255) cagcccagcagcggttgatctccactaccaacgccaagggtgtgatcacctactgcaacgatgcctttatcgaaatcagtggtttcacccgcgaggagctgacgGGCGCACCAGGTTGTGCGGTGCGccc < 2:2334997‑M1/26‑1 (MQ=255) cagcccagcagcggttgatctccactaccaacgccaagggtgtgatcacctactgcaacgatgcctttatcgaaatcagtggtttcacccgcgaggagctgacgGGCGCACCAGGTTGTGCGGTGCGccc > 1:2334997‑M1/105‑130 (MQ=255) tCGCCGGACTTGCAGCGGTTCTTGACGATACCCATCCACGGCTGGCCCTGCTTGAGGGTTTGCCACATATG‑GGCAAACACGGCAGGCGGTACGTCGGGGTGGCGCACCAGGTTGTGCGGTGCGCCCGTCAGCTCCTCGCGGGTGAAACCa < 2:2404926/150‑1 (MQ=255) 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ctttatcgaaatcagtggtttcacccgcgaggagctgacgGGCGCACCAGGTTGTGCGGTgcgc > 1:1038859‑M1/41‑64 (MQ=255) cacaTATG‑GGCAAACACGGCAGGCGGTACGTCGGGGTGGCGCACCAGGTTGTGCGGTGCGCCCGTCAGCTCCTCGCGGGTGAAACCACTGATTTCGATAAAGGCATCGTTGCAGTAGGTGATCACACCCTTGGCGTTGGTAGTGGAGATc > 1:975790/1‑150 (MQ=255) atatG‑GGCAAACACGGCAGGCGGTACGTCGGGGTGGCGCACCAGGTTGTGCGGTGCGCCCGTCAGCTCCTCGCGGGTGAAACCACTGATTTCGATAAAGGCATCGTTGCAGTAGGTGATCACACCCTTGGCGTTGGTAGTGGAGATCAAc > 1:2407324/1‑150 (MQ=255) agatG‑GGCCAACACGGCAGGCGGTCCGTCGGCGTGGCGCACCAGGTTGTGCGGCGCGCCCGTCAGCTCCTCGCGGGTGAAACCACTGATTTCGATAAAGGCATCGTTGCAGTAGGTGATCACACCCTTGGCGTTGGTAGTGGAGATCAAc < 2:1706889/148‑1 (MQ=255) tG‑GGCAAACACGGCAGGCGGTACGTCGGGGTGGCGCACCAGGTTGTGCGGTGCGCCCGTCAGCTCCTCGCGGGTGAAACCACTGATTTCGATAAAGGCATCGTTGCAGTAGGTGATcaca > 2:1127384/1‑120 (MQ=255) tG‑GGCAAACACGGCAGGCGGTACGTCGGGGTGGCGCACCAGGTTGTGCGGTGCGCCCGTCAGCTCCTCGCGGGTGAAACCACTGATTTCGATAAAGGCATCGTTGCAGTAGGTGATcaca < 1:1127384/120‑1 (MQ=255) tG‑GGCAAACACGGCAGGCGGTACGTCGGGGTGGCGCACCAGGTTGTGCGGTGCGCCCGTCAGCTCCTCGCGGGTGAAACCACTGATTTCGATAAAGGCATCGTTGCAGTAGGTGATCACACCCTTGGCGTTGGTAGTGGAGATCAACCgc > 2:2074218/1‑150 (MQ=255) gCAAACACGGCAGGCGGTACGTCGGGGTGGCGCACCAGGTTGTGCGGTGCGCCCGTCAGCTCCTCGCGGGTGAAACCACTGATTTCGATAAAGGCATCGTTGCAGTAGGTGATCACACCCTTGGCGTTGGTAGTGGAGATCAACCgctgc < 2:2232106/150‑1 (MQ=255) cAAACACGGCAGGCGGTACGTCGGGGTGGCGCACCAGGTTGTGCGGTGCGCCCGTCAGCTCCTCGCGGGTGAAACCACTGATTTCGATAAAGGCATCGTTGCAGTAGGTGATCACACCCTTGGCGTTGGTAGTGGAGATCAACCgctgct < 1:548825/150‑1 (MQ=255) aaaCACGGCAGGCGGTACGTCGGGGTGGCGCACCAGGTTGTGCGGTGCGCCCGTCAGCTCCTCGCGGGTGAAACCACTGATTTCGATAAAGGCATCGTTGCAGTAGGTGATCACACCCTTGGCGTTGGTAGTGGAGATCAACCGctgctg < 1:2435874/150‑1 (MQ=255) aaaCACGGCAGGCGGTACGTCGGGGTGGCGCACCAGGTTGTGCGGTGCGCCCGTCAGCTCCTCGCGGGTGAAACCACTGATTTCGATAAAGGCATCGTTGCAGTAGGTGATCACACCCTTGGCGTTGGTAGTGGAGATCAACCGctgctg > 2:1351682/1‑150 (MQ=255) cacGGCAGGCGGTACGTCGGGGTGGCGCACCAGGTTGTGCGGTGCGCCCGTCAGCTCCTCGCGGGTGAAACCACTGATTTCGATAAAGGCATCGTTGCAGTAGGTGATCACACCCTTGGCGTTGGTAGTGGAGATCAACCGCTgctgggc < 2:1727742/150‑1 (MQ=255) cGGCAGGCGGTACGTCGGGGTGGCGCACCAGGTTGTGCGGTGCGCCCGTCAGCTCCTCGCGGGTGAAACCACTGATTTCGATAAAGGCATCGTTGCAGTAGGTGATCACACCCTTGGCGTTGGTAGTGGAGATCAACCGCTgctgggctg < 2:975790/150‑1 (MQ=255) ggCGGTACGTCGGGGTGGCGCACCAGGTTGTGCGGTGCGCCCGTCAGCTCCTCGCGGGTGAAACCACTGATTTCGATAAAGGCATCGTTGCAGTAGGTGATCACACCCTTGGCGTTGGTAGTGGAGATCAACCGCTGCTGGGCTGGGaaa < 1:2041146/150‑1 (MQ=255) ggCGGTACGTCGGGGTGGCGCACCAGGTTGTGCGGTGCGCCCGTCAGCTCCTCGCGGGTGAAACCACTGATTTCGATAAAGGCATCGTTGCAGTAGGTGATCACACCCTTGGCGTTGGTAGTGGAGATCAACCGCTGCTGGGCTGGGaaa < 1:1405767/150‑1 (MQ=255) ggCGGTACGTCGGGGTGGCGCACCAGGTTGTGCGGTGCGCCCGTCAGCTCCTCGCGGGTGAAACCACTGATTTCGATAAAGGCATCGTTGCAGTAGGTGATCACACCCTTGGCGTTGGTAGTGGAGATAAACCGCTGCCGGGCTGGGaaa < 2:990382/150‑1 (MQ=255) gCGGTACGTCGGGGTGGCGCACCAGGTTGTGCGGTGCGCCCGTCAGCTCCTCGCGGGTGAAACCACTGATTTCGATAAAGGCATCGTTGCAGTAGGTGATCACACCCTTGGCGTTGGTAGTGGAGATCAACCGCTGCTGGGCTGGGAAAg > 2:874270/1‑150 (MQ=255) gTACGTCGGGGTGGCGCACCAGGTTGTGCGGTGCGCCCGTCAGCTCCTCGCGGGTGAAACCACTGATTTCGATAAAGGCATCGTTGCAGTAGGTGATCACACCCTTGGCGTTGGTAGTGGAGATCAACCGCTGCTGGGCTGGGAAAGTcc < 2:1535005/150‑1 (MQ=255) cGTCGGGGTGGCGCACCAGGTTGTGCGGTGCGCCCGTCAGCTCCTCGCGGGTGAAACCACTGATTTCGATAAAGGCATCGTTGCAGTAGGTGATCACACCCTTGGCGTTGGTAGTGGAGATCAACCGCTGCTGGGCTGGGAAAGTCCGtt < 1:928998/150‑1 (MQ=255) gTCGGGGTGGCGCACCAGGTTGTGGGGTGTAGCCGTCAGCTCCTTGCGAGTGAAACCACTGATTTCGATAAATGCATCGTTGCAGTAGGTGATCACACCCTTGGCGTTGGTAGTGGAGATCAACCGCTGCTGGGCTGGGAAATTCCGTtc < 2:521685/150‑1 (MQ=255) gTCGGGGTGGCGCACCAGGTTGTGCGGTGCGCCCGTCAGCTCCTCGCGGGTGAAACGACTGATTTCGATAAAGGCATCGTTGCAGTAGGTGATCACACCGTTGGCGTTGGTAGTGGAGATCAACCGCTGCTAGGCTGGGAAAGTCCGTtc > 2:1261531/1‑150 (MQ=255) tGGCGCACCAGGTTGTGCGGTGCGCCCGTCAGCTCCTCGCGGGTGAAACCACTGATTTCGATAAAGGCATCGTTGCAGTAGGTGATCACACCCTTGGCGTTGGTAGTGGAGATCAACCGCTGCTGGGCTGGGAAAGTCCGTTCTCTCTgg < 1:330388/150‑1 (MQ=255) | CTGGTTGTTATCGAAAATGGGGGTGACATAGGCGTTGACCCAGTAATGGTCGCCGGACTTGCAGCGGTTCTTGACGATACCCATCCACGGCTGGCCCTGCTTGAGGGTTTGCCACATATG‑GGCAAACACGGCAGGCGGTACGTCGGGGTGGCGCACCAGGTTGTGCGGTGCGCCCGTCAGCTCCTCGCGGGTGAAACCACTGATTTCGATAAAGGCATCGTTGCAGTAGGTGATCACACCCTTGGCGTTGGTAGTGGAGATCAACCGCTGCTGGGCTGGGAAAGTCCGTTCTCTCTGG > NC_002947/2408287‑2408584 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |