New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2408436 = | 94 (1.010) | 6 (0.070) | 6/234 | NT | 6.6% | coding (172/1566 nt) | PP_2111 | aerotaxis receptor |
? | NC_002947 | 2408461 = | 83 (0.950) | coding (147/1566 nt) | PP_2111 | aerotaxis receptor |
Only 100 of 108 total aligned reads displayed.
ATAGGCGTTGACCCAGTAATGGTCGCCGGACTTGCAGCGGTTCTTGACGATACCCATCCACGGCTGGCCCTGCTTGAGGGTTTGCCACATATG‑GGCAAACACGGCAGGCGGTACGTCGGGGTGGCGCACCAGGTTGTGCGGTGCGCCCGTCAGCTCCTCGCGGGTGAAACCACTGATTTCGATAAAGGCATCGTTGCAGTAGGTGATCACACCCTTGGCGTTGGTAGTGGAGATCAACCGCTGCTGGGCTGGGAAAGTCCGTTCTCTCTGGGTAATCGGCTGGTTGTTACGCATGGG > NC_002947/2408314‑2408610 | aTAGGCGTTGACCCAGTAATGGTCGCCGGACTTGCAGCGGTTCTTGCCGATACCCATCCACGGCTGGCCCTGCTTGAGGGTTTGCCACATATG‑GGCAAACACGGCAGGCGGTACGTCGGGGTGGCGCACCAGGTTGTGCGGTGCGCCCGt > 2:928998/1‑150 (MQ=255) aGGCGTTGACCCAGTAATGGTCGCCGGACTTGCAGCGGTTCTTGACGATACCCATCCACGGCTGGCCCTGCTTGAGGGTTTGCCACATATG‑GGCAAACACGGCAGGCGGTACGTCGGGGTGGCGCACCAGGTTGTGCGGTGCGCCCGTCa > 1:2404926/1‑150 (MQ=255) aGGCGTTGACCCAGTAATGGTCGCCGGACTTGCAGCGGTTCTTGACGATACCCATCCACGGCTGGCCCTGCTTGAGGGTTTGCCACATATG‑GGCAAACACGGCAGGCGGTACGTCGGGGTGGCGCACCAGGTTGTGCGGTGCGCCCGTCa > 2:450484/1‑150 (MQ=255) ttGACCCAGTAATGGTCGCCGGACTTGCAGCGGTTCTTGACGATACCCATCCACGGCTGGCCCTGCTTGAGGGTTTGCCACATATG‑GGCAAACACGGCAGGCGGTACGTCGGGGTGGCGCACCAGGTTGTGCGGTGCGCCCGTCAGctcc < 1:1367875/150‑1 (MQ=255) cAGTAATGGTCGCCGGACTTGCAGCGGTTCTTGACGATACCCATCCACGGCTGGCCCTGCTTGAGGGTTTGCCACATATG‑GGCAAACACGGCAGGCGGTACGTCGGGGTGGCGCACCAGGTTGTGCGGTGCGCCCGTCAGCTCCTCGCgg < 1:1100505/150‑1 (MQ=255) cAGTAATGGTCGCCGGACTTGCAGCGGTTCTTGACGATACCCATCCACGGCTGGCCCTGCTTGAGGGTTTGCCACATATG‑GGCAAACACGGCAGGCGGTACGTCGGGGTGGCGCACCAGGTTGTGCGGTGCGCCCGTCAGCTCCTCGCgg < 1:450484/150‑1 (MQ=255) cAGTAATGGTCGCCGGACTTGCAGCGGTTCTTGACGATACCCATCCACGGCTGGCCCTGCTTGAGGGTTTGCCACATATG‑GGCAAACACGGCAGGCGGTACGTCGGGGTGGCGCACCAGGTTGTGCGGTGCGCCCGTCAGCTCCTCGCgg > 1:1189021/1‑150 (MQ=255) gTAATGGTCGCCGGACTTGCAGCGGTTCTTGACGATACCCATCCACGGCTGGCCCTGCTTGAGGGTTTGCCACATATG‑GGCAAACACGGCAGGCGGTACGTCGGGGTGGCGCACCAGGTTGTGCTGTGCGCCCGTCAGCTCCTCGCGGGt < 2:2333286/150‑1 (MQ=255) gTAATGGTCGCCGGACTTGCAGCGGTTCTTGACGATACCCATCCACGGCTGGCCCTGCTTGAGGGTTTGCCACATATG‑GGCAAACACGGCAGGCGGTACGTCGGGGTGGCGCACCAGGTTGTGCGGTGCGCCCGTCAGCTCCTCGCGGGt < 2:173424/150‑1 (MQ=255) tAATGGTCGCCGGACTTGCAGCGGTTCTTGACGATACCCATCCACGGCTGGCCCTGCTTGAGGGTTTGCCACATATG‑GGCAAACACGGCAGGCGGTACGTCGGGGTGGCGCACCAGGTTGTGCGGTGCGCCCGTCAGCTCCTCGCGGGTg > 1:2024061/1‑150 (MQ=255) atggcagCCGGCCTTGGAGCAGTCCGTGACGATACCCATCCACGGCTGGCCCTGCTTGAGGGTTTGCCACATATG‑GGCAAACACGGCAGGCGGTACGTCGGGGTGGCGCACCAGGTTGTGCGGTGCGCCCGTCAGCTCCTCGCGGGTGaa < 2:1098118/144‑1 (MQ=37) tGGTCGCCGGACTTGCAGCGGTTCTTGACGATACCCATCCACGGCTGGCCCTGCTTGAGGGTTTGCCACATATG‑GGCAAACACGGCAGGCGGTACGTCGGGGTGGCGCACCAGGTTGTGCGGTGCGCCCGTCAGCTCCTCGCGGGTGaaa < 2:1836137/150‑1 (MQ=255) cagcccagcagcggttgatctccactaccaacgccaagggtgtgatcacctactgcaacgatgcctttatcgaaatcagtggtttcacccgcgaggagctgacgGGCGCACCAGGTTGTGCGGTGCGccc < 2:2334997‑M1/26‑1 (MQ=255) cagcccagcagcggttgatctccactaccaacgccaagggtgtgatcacctactgcaacgatgcctttatcgaaatcagtggtttcacccgcgaggagctgacgGGCGCACCAGGTTGTGCGGTGCGccc > 1:2334997‑M1/105‑130 (MQ=255) tCGCCGGACTTGCAGCGGTTCTTGACGATACCCATCCACGGCTGGCCCTGCTTGAGGGTTTGCCACATATG‑GGCAAACACGGCAGGCGGTACGTCGGGGTGGCGCACCAGGTTGTGCGGTGCGCCCGTCAGCTCCTCGCGGGTGAAACCa < 2:2404926/150‑1 (MQ=255) gCCGGACTTGCAGCGGTTCTTGACGATACCCATCCACGGCTGGCCCTGCTTGAGGGTTTGCCACATATG‑GGCAAACACGGCAGGCGGTACGTCGGGGTGGCGCACCAGGTTGTGCGGTGCGCCCGTCAGCTCCTCGCGGGTGAAACCACt > 2:1790517/1‑150 (MQ=255) ggACTTGCAGCGGTTCTTGACGATACCCATCCACGGCTGGCCCTGCTTGAGGGTTTGCCACATATG‑GGCAAACACGGCAGGCGGTACGTCGGGGTGGCGCACCAGGTTGTGCGGTGCGCCCGTCAGCTCCTCGCGGGTGAAACCACTGAt > 1:407812/1‑150 (MQ=255) ggACTTGCAGCGGTTCTTGACGATACCCATCCACGGCTGGCCCTGCTTGAGGGTTTGCCACATATG‑GGCAAACACGGCAGGCGGTACGTCGGGGTGGCGCACCAGGTTGTGCGGTGCGCCCGTCAGCTCCTCGCGGGTGAAACCACTGAt < 2:1470921/150‑1 (MQ=255) 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cACGGCTGGCCCTGCTTGAGGGTTTGCCACATATG‑GGCAAACACGGCAGGCGGTACGTCGGGGTGGCGCACCAGGTTGTGCGGTGCGCCCGTCAGCTCCTCGCGGGTGAAACCACTGATTTCGATAAAGGCATCGTTGCAGTAGGTGAtg < 2:365017/150‑2 (MQ=255) aCGACTGGCGCTGCTTGAACGGTTGCCACGTATG‑GGCAAACACGGCAGGAGGGACGGCGGGGTTGCGCACCAGGTTGTGCGGCCCGCCCGGCAGCTCCACGCGGGTGCAACCGAAGCTTTCGATCACGGCCTCCCTGCGGTAGGAGATca > 2:2432726/1‑150 (MQ=255) tcacctactgcaacgatgcctttatcgaaatcagtggtttcacccgcgaggagctgacgGGCGCACCAGGTTGTGCGGTGCGCCCGt < 2:692764‑M1/28‑1 (MQ=255) tcacctactgcaacgatgcctttatcgaaatcagtggtttcacccgcgaggagctgacgGGCGCACCAGGTTGTGCGGTGCGCCCGt > 1:692764‑M1/60‑87 (MQ=255) gCCCTGCTTGAGGGTTTGCCACATATG‑GGCAAACACGGCAGGCGGTACGTCGGGGTGGCGCACCAGGTTGTGCGGTGCGCCCGTCAGCTCCTCGCGGGTGAAACCACTGATTTCGATAAAGGCATCGTTGCAGTAGGTGATCACACCCtt < 2:277507/150‑1 (MQ=255) gCCCTGCTTGAGGGTTTGCCACATATG‑GGCAAACACGGCAGGCGGTACGTCGGGGTGGCGCACCAGGTTGTGCGGTGCGCCCGTCAGCTCCTCGCGGGTGAAACCACTGATTTCGATAAAGGCATCGTTGCAGTAGGTGATCACACCCtt > 1:1492125/1‑150 (MQ=255) 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ttGCCACATATG‑GGCAAACACGGCAGGCGGTACGTCGGGGTGGCGCACCAGGTTGTGCGGTGCGCCCGTCAGCTCCTCGCGGGTGAAACCACTGATTTCGATAAAGGCATCGTTGCAGTAGGTGATCACACCCTTGGCGTTGGTAGTGga < 2:1492251/150‑1 (MQ=255) ttGCCACATATG‑GGCAAACACGGCAGGCGGTACGTCGGGGTGGCGCACCAGGTTGTGCGGTGCGCCCGTCAGCTCCTCGCGGGTGAAACCACTGATTTCGATAAAGGCATCGTTGCAGTAGGTGATCACACCCTTGGCGTTGGTAGTGga < 2:1492125/150‑1 (MQ=255) gCCACATATG‑GGCAAACACGGCAGGCGGTACGTCGGGGTGGCGCACCAGGTTGTGCGGTGCGCCCGTCAGCTCCTCGCGGGTGAAACCACTGATTTCGATAAAGGCATCGTTGCAGTAGGTGATCACACCCTTGGCGTTGGTAGTGgaga < 1:1866792/150‑1 (MQ=255) gCCACATATG‑GGCAAACACGGCAGGCGGTACGTCGGGGTGGCGCACCAGGTTGTGCGGTGCGCCCGTCAGCTCCTCGCGGGTGAAACCACTGATTTCGATAAAGGCATCGTTGCAGTAGGTGATCACACCCTTGGCGTTGGTAGTGgaga < 2:1650943/150‑1 (MQ=255) cacaTATG‑GGCAAACACGGCAGGCGGTACGTCGGGGTGGCGCACCAGGTTGTGCGGTGCGCCCGTCAGCTCCTCGCGGGTGAAACCACTGATTTCGATAAAGGCATCGTTGCAGTAGGTGATCACACCCTTGGCGTTGGTAGTGGAGATc > 1:975790/1‑150 (MQ=255) 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gggcgcaccgcacaacctggtgcgccCGTCAGCTCCTCGCGGGTGAAACCACTGATTTCGATAAAGGCATCGTTGCAGTAGGTGATCACACCCTTGGCGTTGGTAGTGGAGATCAACCGCTgctgggctg > 1:2334997‑M2/27‑130 (MQ=255) gggcgcaccgcacaacctggtgcgccCGTCAGCTCCTCGCGGGTGAAACCACTGATTTCGATAAAGGCATCGTTGCAGTAGGTGATCACACCCTTGGCGTTGGTAGTGGAGATCAACCGCTgctgggctg < 2:2334997‑M2/104‑1 (MQ=255) gcgcaccgcacaacctggtgcgccCGTCAGCTCCTCGCGGGTGAAACCACTGATTTCGATAAAg > 1:1038859‑M2/25‑64 (MQ=255) GCGCACCAGGTTGTGCGGTGCGCCCGTCAGCTCCTCGCGGGTGAAACCACTGATTTCGATAAAGGCATCGTTGCAGTAGGTGATCACACCCTTGGCGTTGGTAGTGGAGATCAACCGCTGCTGGGCTGGGAAAGTCCGTTCTCTCTGGGt < 1:878059‑M1/150‑1 (MQ=255) GCACCAGGTTGTGCGGTGCGCCCGTCAGCTCCTCGCGGGTGAAACCACTGATTTCGATAAAGGCATCGTTGCAGTAGGTGATCACACCCTTGGCGTTGGTAGTGGAGATCAACCGCTGCTGGGCTGGGAAAGTCCGTTCTCTCTGGGTaa < 2:1154781‑M1/150‑1 (MQ=255) CCAGGTTGTGCGGTGCGCCCGTCAGCTCCTCGCGGGTGAAACCACTGATTTCGATAAAGGCATCGTTGCAGTAGGTGATCACACCCTTGGCGTTGGTAGTGga > 1:493185‑M1/1‑103 (MQ=255) CCAGGTTGTGCGGTGCGCCCGTCAGCTCCTCGCGGGTGAAACCACTGATTTCGATAAAGGCATCGTTGCAGTAGGTGATCACACCCTTGGCGTTGGTAGTGga < 2:493185‑M1/103‑1 (MQ=255) CAGGTTGTGCGGTGCGCCCGTCAGCTCCTCGCGGGTGAAACCACTGATTTCGATAAAGGCATCGTTGCAGTAGGTGATCACACCCTTGGCGTTGGTAGTGGAGATCAACCGCTGCTGGGCTGGGAAAGTCCGTTCTCTCTGGGTAATCgg < 1:964701‑M1/150‑1 (MQ=255) aGGTTGTGCGGTGCGCCCGTCAGCTCCTCGCGGGTGAAACCACTGATTTCGATAAAGGCATCGTTGCAGTAGGTGATCACACCCTTGGCGTTGGTAGTGGAGATCAACCGCTGCTGGGCTGGGAAAGTCCGTTCTCTCTGGGTAATCGGc < 2:407812/150‑1 (MQ=255) ggTTGTGCGGTGCGCCCGTCAGCTCCTCGCGGGTGAAACCACTGATTTCGATAAAGGCATCGTTGCAGTAGGTGATCACACCCTTGGCGTTgg > 2:1400794/1‑93 (MQ=255) ggTTGTGCGGTGCGCCCGTCAGCTCCTCGCGGGTGAAACCACTGATTTCGATAAAGGCATCGTTGCAGTAGGTGATCACACCCTTGGCGTTgg < 1:1400794/93‑1 (MQ=255) ggTTGTGCGGTGCGCCCGTCAGCTCCTCGCGGGTGAAACCACTGATTTCGATAAAGGCATCGTTGCAGTAGGTGATCACACCCTTGGCGTTGGTAGTGGAGATCAACCgctgct < 1:79832/114‑1 (MQ=255) ggTTGTGCGGTGCGCCCGTCAGCTCCTCGCGGGTGAAACCACTGATTTCGATAAAGGCATCGTTGCAGTAGGTGATCACACCCTTGGCGTTGGTAGTGGAGATCAACCgctgct > 2:79832/1‑114 (MQ=255) gTTGTGCGGTGCGCCCGTCAGCTCCTCGCGGGTGAAACCACTGATTTCGATAAAGGCATCGTTGCAGTAGGTGATCACACCCTTGGCGTTGGTAGTGGAGATCAACCGCTGCTGGGCTGGGAAAGTCCGTTCTCTCTgg > 1:1100488/1‑139 (MQ=255) gTTGTGCGGTGCGCCCGTCAGCTCCTCGCGGGTGAAACCACTGATTTCGATAAAGGCATCGTTGCAGTAGGTGATCACACCCTTGGCGTTGGTAGTGGAGATCAACCGCTGCTGGGCTGGGAAAGTCCGTTCTCTCTgg < 2:1100488/139‑1 (MQ=255) gTTGTGCGGTGCGCCCGTCAGCTCCTCGCGGGTGAAACCACTGATTTCGATAAAGGCATCGTTGCAGTAGGTGATCACACCCTTGGCGTTGGTAGTGGAGATCAACCGCTGCTGGGCTGGGAAAGTCCGTTCTCTCTGGGTAATCGGCTg < 1:1272957/150‑1 (MQ=255) gTTGTGCGGTGCGCCCGTCAGCTCCTCGCGGGTGAAACCACTGATTTCGATAAAGGCATCGTTGCAGTAGGTGATCACACCCTTGGCGTTGGTAGTGGAGATCAACCGCTGCTGGGCTGGGAAAGTCCGTTCTCTCTGGGTAATCGGCTg < 1:1795475/150‑1 (MQ=255) cggtgcgCCCGTCAGCTCCTCGCGGGTGAAACCACTGATTTCGATAAAGGCATCGTTGCAGTAGGTGATCACACCCTTGGCGTTGGTAGTGGAGATCAACCGCTGCTGGGCTGGGAAAGTCCGTTCTCTCTGGGTAATCGGCTGgttgtt < 1:1790517/150‑1 (MQ=255) cggtgcgCCCGTCAGCTCCTCGCGGGTGAAACCACTGATTTCGATAAAGGCATCGTTGCAGTAGGTGATCACACCCTTGGCGTTGGTAGTGGAGATCAACCGCTGCTGGGCTGGGAAAGTCCGTTCTCTCTGGGTAATCGGCTGgttgtt > 2:581969/1‑150 (MQ=255) ggtgcgccCGTCAGCTCCTCGCGGGTGAAACCACTGATTTCGATAAAGGCATCGTTGCAGTAGGTGATCACACCCTTGGCGTTGGTAGTGGAGATCAACCGCTGCTGGGCTGGGAAAGTCCGTTCTCTCTGGGTAATCGGCTGGTTGTTa < 1:581969‑M2/142‑1 (MQ=255) ccCGTCAGCTCCTCGCGGGTGAAACCACTGATTTCGATAAAGGCATCGTTGCAGTAGGTGATCACACCCTTGGCGTTGGTAGTGGAGATCAACCGCTGCTGGGCTGGGAAAGTCCGTTCTCTCTGGGTAATCGGCTGGTTGTTACGCATg < 1:1318504‑M2/148‑1 (MQ=255) cCGTCAGCTCCTCGCGGGTGAAACCACTGATTTCGATAAAGGCATCGTTGCAGTAGGTGATCACACCCTTGGCGTTGGTAGTGGAGATCAACCGCTgctgggctgg < 1:2258098‑M2/105‑1 (MQ=255) cGTCAGCTCCTCGCGGGTGAAACCACTGATTTCGATAAAGGCATCGTTGCAGTAGGTGATCACACCCTTGGCGTTGGTAGTGGAGATCAACCGCTGCTGGGCTGGGAAAGTCCGTTCTCTCTGGGTAATCGGCTGGTTGTTACGAATggg < 2:2241830/150‑1 (MQ=255) | ATAGGCGTTGACCCAGTAATGGTCGCCGGACTTGCAGCGGTTCTTGACGATACCCATCCACGGCTGGCCCTGCTTGAGGGTTTGCCACATATG‑GGCAAACACGGCAGGCGGTACGTCGGGGTGGCGCACCAGGTTGTGCGGTGCGCCCGTCAGCTCCTCGCGGGTGAAACCACTGATTTCGATAAAGGCATCGTTGCAGTAGGTGATCACACCCTTGGCGTTGGTAGTGGAGATCAACCGCTGCTGGGCTGGGAAAGTCCGTTCTCTCTGGGTAATCGGCTGGTTGTTACGCATGGG > NC_002947/2408314‑2408610 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |