New junction evidence | |||||||||||
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? | NC_002947 | = 5546982 | 91 (1.020) | coding (2120/2574 nt) | rnr | exoribonuclease R |
Only 100 of 118 total aligned reads displayed.
TTTTTCAGCAACCGGTGCGGCGCCACGCTGCTTGCGGCCGATCGGTGCGGCGAGGGTCTTTTCCGACACTTCGAAGTCGATCTTGCGCTCATCCAGATCAACACGCATGACCTTGACTTCGATGGTGTCGCCCAAGCGGAA‑GCTGCGACCGGTGCGCTCGCCGGCCAGGCGATGGTGTACCGGGTCGAAGTGGTAGTAGTCACCCGGCAACGCACTGACGTGCACCAAGCCCTCTACATAGATATCGGTCAGTTCGACGAACAGGCCGAAACCGGTCACCGCAGTGATCACACCCGGGA > NC_002947/5546801‑5547099 | tttttCAGCAACCGGTGCGGCGCCACGCTGCTTGCGGCCGATCGGTGCGGCGAGGGTCTTTTCCGACACTTCGAAGTCGATCTTGCGCTCATCCAGATCAACACGCATGACCTTGACTTCGATGGTGTCGCCCAAGCGGAA‑GCTGCGACC > 1:576159‑M1/1‑150 (MQ=255) tttCAGCAACCGGTGCGGCGCCACGCTGCTTGCGGCCGATCGGTGCGGCGAGGGTCTTTTCCGACACTTCGAAGTCGATTTTGCGCTCATCCAGATCAACACGCATGACCTTGACTTCGATGGTGTCGCCCAAGCGGAA‑GCTGCGACCgg > 2:1854205/1‑150 (MQ=255) aGCAACCGGTGCGGCGCCACGCTGCTTGCGGCCGATCGGTGCGGCGAGGGTCTTTTCCGACACTTCGAAGTCGATCTTGCGCTCATCCAGATCAACACGCATGACCTTGACTTCGATGGTGTCGCCCAAGCGGAA‑GCTGCGACCGGTgcg > 1:2408305/1‑150 (MQ=255) cAACCGGTGCGGCGCCACGCTGCTTGCGGCCGATCGGTGCGGCGAGGGTCTTTTCCGACACTTCGAAGTCGATCTTGCGCTCATCCAGATCAACACGCATGACCTTGACTTCGATGGTGTCGCCCAAGCGGAA‑GCTGCGACCGGTGCGCt > 1:1340941/1‑150 (MQ=255) aaCCGGTGCGGCGCCACGCTGCTTGCGGCCGATCGGTGCGGCGAGGGTCTTTTCCGACACTTCGAAGTCGATCTTGCGCTCATCCAGATCAACACGCATGACCTTGACTTCGATGGTGTCGCCCAAGCGGAA‑GCTGCGACCGGTGCGCTc < 1:230014/150‑1 (MQ=255) cACGCTGCTTGCGGCCGATCGGTGCGGCGAGGGTCTTTTCCGACACTTCGAAGTCGATCTTGCGCTCATCCAGATCAACACGCATGACCTTGACTTCGATGGTGTCGCCCAAGCGGAA‑GCTGCGACCGGTGCGCTCGCCGGCCAGGCGAt < 2:1259997/150‑1 (MQ=255) tgctTGCGGCCGATCGGTGCGGCGAGGGTCTTTTCCGACACTTCGAAGTCGATCTTGCGCTCATCCAGATCAACACGCATGACCTTGACTTCGATGGTGTCGCCCAAGCGGAA‑GCTGCGACCGGTGCGCTCGCCGGCCa < 1:1796568/139‑1 (MQ=255) tgctTGCGGCCGATCGGTGCGGCGAGGGTCTTTTCCGACACTTCGAAGTCGATCTTGCGCTCATCCAGATCAACACGCATGACCTTGACTTCGATGGTGTCGCCCAAGCGGAA‑GCTGCGACCGGTGCGCTCGCCGGCCa > 2:1796568/1‑139 (MQ=255) ttGCGGCCGATCGGTGCGGCGAGGGTCTTTTCCGACACTTCGAAGTCGATCTTGCGCTCATCCAGATCAACACGCATGACCTTGACTTCGATGGTGTCGCCCAAGCGGAA‑GCTGCGACCGGTGCGCTCGCCGGCCAGGCGATGGTGTAcc < 1:283689/150‑1 (MQ=255) gCGGCCGATCGGTGCGGCGAGGGTCTTTTCCGACACTTCGAAGTCGATCTTGCGCTCATCCAGATCAACACGCATGACCTTGACTTCGATGGTGTCGCCCAAGCGGAA‑GCTGCGACCGGCGCGCTCGCCGGCCAGGCGATGGTGTACCGg > 1:317949‑M2/1‑149 (MQ=255) cGGCCGATCGGTGCGGCGAGGGTCTTTTCCGACACTTCCATGGCGATCTTGCGCTCATCCAGATCAACACGCATGACCTTGACTTCGATGGTGTCGCCCAAGCGGAA‑GCTGCGACCGGTGCGCTCGCCGGCCAGGCGATGGTGTACCGgg > 1:23930‑M2/1‑148 (MQ=255) ggCCGATCGGTGCGGCAAGGGTCTTTTCCGACACTTCGAAGTCGATCTTGCGCTCATCCAGATCAACACGCATGACCTTGACTTCGATGGTGTCGCCCAAGCGGAA‑GCTGCGACCGGTGCGCTCGCCGGCCAGGCGATGGTGTACCGggt > 2:130734‑M2/1‑147 (MQ=255) gTGCGGCGAGGGTCTTTTCCGACACTTCGAAGTCGATCTTGCGCTCATCCAGATCAACACGCATGACCTTGACTTCGACGGTGTCGCCCCAGCGGAACGCT‑CTGCCTGTACGCCCGCCGGCCAGGCGATGGTGTACCGGGTCGAAGTGgt < 1:648060/150‑1 (MQ=255) tGCGGCGAGGGTCTTTTCCGACACTTCGAAGTCGATCTTGCGCTCATCAAGGTCAACACGCATGACCTTGACTTCGATGGTGTCGCCCAAGCGGAA‑GCTGCGACCGGTGCGCTCGCCGGCCAGGCGATGGTGTACCGGGTCGAAGTGgta < 1:145127/150‑1 (MQ=255) gcggcgAGGGTCTTTTCCGACACTTCGAAGTCGATCTTGCGCTCATCCAGATCAACACGCATGACCTTGACTTCGATGGTGTCGCCCAAGCGGAA‑GCTGCGACCGGTGCGCTCGCCGGCCAGGCGATGGTGTACCGGGTCGAAGTGgtag < 2:1477704/150‑1 (MQ=255) ggTCTTTTCCGACACTTCGAAGTCGATCTTGCGCTCATCCAGATCAACACGCATGACCTTGACTTCGATGGTGTCGCCCAAGCGGAA‑GCTGCGACCGGTGCGCTCGCCGGCCAGGCGATGGTGTCCCGGGTCGAAGTGGTAGTAGTCAcc > 1:528567/1‑150 (MQ=255) ggTCTTTTCCGACACTTCGAAGTCGATCTTGCGCTCATCCAGATCAACACGCATGACCTTGACTTCGATGGTGTCGCCCAAGCGGAA‑GCTGCGACCGGTGCGCTCGCCGGCCAGGCGATGGTGTACCGggt > 2:1786940‑M2/1‑128 (MQ=255) ggTCTTTTCCGACACTTCGAAGTCGATCTTGCGCTCATCCAGATCAACACGCATGACCTTGACTTCGATGGTGTCGCCCAAGCGGAA‑GCTGCGACCGGTGCGCTCGCCGGCCAGGCGATGGTGTACCGggt < 1:1786940‑M2/131‑4 (MQ=255) ttttCCGACACTTCGAAGTCGATCTTGCGCTCATCCAGATCAACACGCATGACCTTGACTTCGATGGTGTCGCCCAAGCGGAA‑GCTGCGACCGGTGCGCTCGCCGGCCAGGCGATGGTGTACCGGGTCGAAGTGGTAGTAGTCACCCGGc > 1:857358/1‑150 (MQ=255) tCCGACACTTCGAAGTCGATCTTGCGCTCATCCAGATCAACACGCATGACCTTGACTTCGATGGTGTCGCCCAAGCGGAA‑GCTGCGACCcggtacaccatcgcctggccggcgagcgcaccggtcg < 1:381340‑M1/126‑38 (MQ=255) tCCGACACTTCGAAGTCGATCTTGCGCTCATCCAGATCAACACGCATGACCTTGACTTCGATGGTGTCGCCCAAGCGGAA‑GCTGCGACCcggtacaccatcgcctggccggcgagcgcaccggtcg > 2:381340‑M1/1‑89 (MQ=255) gACACTTCGAAGTCGATCTTGCGCTCATCCAGATCAACACGCATGACCTTGACTTCGATGGTGTCGCCCAAGCGGAA‑GCTGCGACCgg < 1:1510843/88‑1 (MQ=255) gACACTTCGAAGTCGATCTTGCGCTCATCCAGATCAACACGCATGACCTTGACTTCGATGGTGTCGCCCAAGCGGAA‑GCTGCGACCgg > 2:1510843/1‑88 (MQ=255) ttCGAAGTCGATCTTGCGCTCATCCAGATCAACACGCATGACCTTGACTTCGATGGTGTCGCCCAAGCGGAA‑GCTGCGACCGGTGCGCTCGCCGGCCAGGCGATg > 2:263836/1‑105 (MQ=255) ttCGAAGTCGATCTTGCGCTCATCCAGATCAACACGCATGACCTTGACTTCGATGGTGTCGCCCAAGCGGAA‑GCTGCGA‑Ccggtacaccatcgcctggccggcgagc < 2:2052487‑M1/107‑28 (MQ=255) ttCGAAGTCGATCTTGCGCTCATCCAGATCAACACGCATGACCTTGACTTCGATGGTGTCGCCCAAGCGGAA‑GCTGCGA‑Ccggtacaccatcgcctggccggcgagc > 1:2052487‑M1/1‑80 (MQ=255) cGAAGTCGATCTTGCGCTCATCCAGATCAACACGCATGACCTTGACTTCGATGGTGTCGCCCAAGCGGAA‑GCTGCGACCGGTGCGCTCGCCGGCCAGGCGATGGTGTACCGGGTCGAAGTGGTAGTAGTCACCCGGCAACGCACTGACGt < 2:773280/150‑1 (MQ=255) gAAGTCGATCTTGCGCTCATCCAGATCAACACGCATGACCTTGACTTCGATGGTGTCGCCCAAGCGGAA‑GCTGCGACCGGTGCGCTCGCCGGCCAGGCGATGGTGTACCGGGTCGAAGTGGTAGTAGTCACCCGGCAACGCACTGACGTg < 2:2416744/150‑1 (MQ=255) aGTCGATCTTGCGCTCATCCAGATCAACACGCATGACCTTGACTTCGATGGTGTCGCCCAAGCGGAA‑GCTGCGACCGGTGCGCTCGCCGGCCAGGCGATGGTGTACCGGGTCGAAGTGGTAGTAGTCACCCGGCAACGCACTGACGNGCa < 2:1508797/150‑1 (MQ=255) gTCGATCTTGCGCTCATCCAGATCAACACGCATGACCTTGACTTCGATGGTGTCGCCCAAGCGGAA‑GCTGCGACCGGTGCGCTCGCCGGCCAGGCGATGGTGTACCGGGTCGAAGTGgtagta > 1:328334/1‑123 (MQ=255) gTCGATCTTGCGCTCATCCAGATCAACACGCATGACCTTGACTTCGATGGTGTCGCCCAAGCGGAA‑GCTGCGACCGGTGCGCTCGCCGGCCAGGCGATGGTGTACCGGGTCGAAGTGgtagta < 2:328334/123‑1 (MQ=255) 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aa‑GCTGCGACCGGTGCGCTCGCCGGCCAGGCGATGGTGTACCGGGTCGAAGTGGTAGTAGTCACCCGGCAACGCACTGACGTGCACCAAGCCCTCTACATAGATATCGGTCAGTTCGACGAACAGGCCGAAACCGGTCACCGCAGTGATc < 1:1533232/150‑1 (MQ=255) tGCGACCGGTGCGCTCGCCGGCCAGGCGATGGTGTACCGGGTCGAAGTGGTAGTAGTCACCCGGCAACGCACTGACGTGCACCAAGCCCTCTACATAGATATCGGTCAGTTCGACGAACAGGCCGAAACCGGTCACCGCAGTGATCacac > 1:2213553/1‑150 (MQ=255) tGCGACCGGTGCGCTCGCCGGCCAGGCGATGGTGTACCGGGGCGAAGTGATAGTGGTCACCCGGCAACGCACTGACGTGCACCAAGCCCTCTACATAGATATCGGTCAGTTCGACGAACAGGCCGAAACCGGTCACCGCAGTGATCacac > 1:1238065/1‑150 (MQ=255) gCGACCGGTGCGCTCGCCGGCCAGGCGATGGTGTACCGggtcgcagcttccgcttgggcgacaccatcgaagtcaaggtcatgcgtgttgatctgga > 1:1658409‑M2/1‑38 (MQ=255) cGACCcggtacaccatcgcctggccggcgagcgcaccggtcgcagcttccgcttgggcgacaccatcgaagtcaaggtcatgcgtgttgatctggatgagcgcaagatcgacttcgaagtgtcggaaaagaccctcgccgcaccgatcgg < 1:1187655‑M1/150‑146 (MQ=255) cGACCcggtacaccatcgcctggccggcgagcgcaccggtcgcagcttccgcttgggcgacaccatcgaagtcaaggtcatgcgtgttgatct > 2:595181‑M1/1‑5 (MQ=255) cGACCcggtacaccatcgcctggccggcgagcgcaccggtcgcagcttccgcttgggcgacaccatcgaagtcaaggtcatgcgtgttgatct < 1:595181‑M1/93‑89 (MQ=255) cGACCGGTGCGCTCGCCGGCCAGGCGATGGTGTACCGggtcgcagcttccgcttgggcgacaccatcgaagtcaaggtcatgcgtgttgatctggatgagcgcaagatcgacttcgaagtgtcgga > 2:381340‑M2/1‑37 (MQ=255) cGACCGGTGCGCTCGCCGGCCAGGCGATGGTGTACCGggtcgcagcttccgcttgggcgacaccatcgaagtcaaggtcatgcgtgttgatctggatgagcgcaagatcgacttcgaagtgtcgga < 1:381340‑M2/126‑90 (MQ=255) aCCcggtacaccatcgcctggccggcgagcgcaccggtcgcagcttccgcttgggcgacaccatcgaagtcaaggtcatgcgtgttgatctggatgagcgcaagatcgacttcgaagtgtcggaaaagacccttgccgcaccgatcggcc > 2:130734‑M1/1‑3 (MQ=255) aCCcggtacaccatcgcctggccggcgagcgcaccggtcgcagcttccgcttgggcgacaccatcgaagtcaaggtcatgcgtgttgatctggatgagcgcaagatcgacttcgaagtgtcggaaaagacc < 1:1786940‑M1/131‑129 (MQ=255) aCCcggtacaccatcgcctggccggcgagcgcaccggtcgcagcttccgcttgggcgacaccatcgaagtcaaggtcatgcgtgttgatctggatgagcgcaagatcgacttcgaagtgtcggaaaagacc > 2:1786940‑M1/1‑3 (MQ=255) cccggtacaccatcgcctggccggcgagcgcaccggtcgcagcttccgcttgggcgacaccatcgaagtcaaggtcatgcgtgttgatctggatgagcgcaagatcgccatggaagtgtcggaaaagaccctcgccgcaccgatcggccg > 1:23930‑M1/1‑2 (MQ=255) ccggtacaccatcgcctggccggcgagcgcgccggtcgcagcttccgcttgggcgacaccatcgaagtcaaggtcatgcgtgttgatctggatgagcgcaagatcgacttcgaagtgtcggaaaagaccctcgccgcaccgatcggccgc > 1:317949‑M1/1‑1 (MQ=255) cGGTGCGCTCGCCGGCCAGGCGATGGTGTACCGGGTCGAAGTGGTAGTAGTCACCCGGCAACGCACTGACGTGCACCAAGCCCTCTACATAGATATCGAACAGGTCGACGAACAGGCCGAAACCGGTCACCGCAGTGATCCCACCCGGGa > 1:144659/1‑150 (MQ=255) | TTTTTCAGCAACCGGTGCGGCGCCACGCTGCTTGCGGCCGATCGGTGCGGCGAGGGTCTTTTCCGACACTTCGAAGTCGATCTTGCGCTCATCCAGATCAACACGCATGACCTTGACTTCGATGGTGTCGCCCAAGCGGAA‑GCTGCGACCGGTGCGCTCGCCGGCCAGGCGATGGTGTACCGGGTCGAAGTGGTAGTAGTCACCCGGCAACGCACTGACGTGCACCAAGCCCTCTACATAGATATCGGTCAGTTCGACGAACAGGCCGAAACCGGTCACCGCAGTGATCACACCCGGGA > NC_002947/5546801‑5547099 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |