New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_002947 | = 5546982 | 91 (1.020) | coding (2120/2574 nt) | rnr | exoribonuclease R |
Only 100 of 116 total aligned reads displayed.
GCGGCCGATCGGTGCGGCGAGGGTCTTTTCCGACACTTCGAAGTCGATCTTGCGCTCATCCAGATCAACACGCATGACCTTGACTTCGATGGTGTCGCCCAAGCGGAAGCTGCGACCGGTGCGCTCGCCGGCCAGGCGATGGTGTACCGGGTCGAAGTGGTAGTAGTCACCCGGCAACGCACTGACGTGCACCAAGCCCTCTACATAGATATCGGTCAGTTCGACGAACAGGCCGAAACCGGTCACCGCAGTGATCACACCCGGGAAGGTCTCGCCCACGCGGTCTTTCATGAACTC > NC_002947/5546834‑5547130 | gCGGCCGATCGGTGCGGCGAGGGTCTTTTCCGACACTTCGAAGTCGATCTTGCGCTCATCCAGATCAACACGCATGACCTTGACTTCGATGGTGTCGCCCAAGCGGAAGCTGCGACCGGCGCGCTCGCCGGCCAGGCGATGGTGTACCGg > 1:317949‑M2/1‑149 (MQ=255) cGGCCGATCGGTGCGGCGAGGGTCTTTTCCGACACTTCCATGGCGATCTTGCGCTCATCCAGATCAACACGCATGACCTTGACTTCGATGGTGTCGCCCAAGCGGAAGCTGCGACCGGTGCGCTCGCCGGCCAGGCGATGGTGTACCGgg > 1:23930‑M2/1‑148 (MQ=255) ggCCGATCGGTGCGGCAAGGGTCTTTTCCGACACTTCGAAGTCGATCTTGCGCTCATCCAGATCAACACGCATGACCTTGACTTCGATGGTGTCGCCCAAGCGGAAGCTGCGACCGGTGCGCTCGCCGGCCAGGCGATGGTGTACCGggt > 2:130734‑M2/1‑147 (MQ=255) ccGATCGGTGCGGCGAGGGTCTTTTCCGACACTTCGAAGTCGATCTTGCGCTCATCCAGATCAACACGCATGACCTTGACTTCGATGGTGTCGCCCAAGCGGAAGCTGCGACCGGTGCGCTCGCCGGCCAGGCGATGGTGTACCGggtcg < 1:1187655‑M2/150‑6 (MQ=255) tGCGGCGAGGGTCTTTTCCGACACTTCGAAGTCGATCTTGCGCTCATCAAGGTCAACACGCATGACCTTGACTTCGATGGTGTCGCCCAAGCGGAAGCTGCGACCGGTGCGCTCGCCGGCCAGGCGATGGTGTACCGGGTCGAAGTGgta < 1:145127/150‑1 (MQ=255) gcggcgAGGGTCTTTTCCGACACTTCGAAGTCGATCTTGCGCTCATCCAGATCAACACGCATGACCTTGACTTCGATGGTGTCGCCCAAGCGGAAGCTGCGACCGGTGCGCTCGCCGGCCAGGCGATGGTGTACCGGGTCGAAGTGgtag < 2:1477704/150‑1 (MQ=255) ggTCTTTTCCGACACTTCGAAGTCGATCTTGCGCTCATCCAGATCAACACGCATGACCTTGACTTCGATGGTGTCGCCCAAGCGGAAGCTGCGACCGGTGCGCTCGCCGGCCAGGCGATGGTGTCCCGGGTCGAAGTGGTAGTAGTCAcc > 1:528567/1‑150 (MQ=255) ttttCCGACACTTCGAAGTCGATCTTGCGCTCATCCAGATCAACACGCATGACCTTGACTTCGATGGTGTCGCCCAAGCGGAAGCTGCGACCGGTGCGCTCGCCGGCCAGGCGATGGTGTACCGGGTCGAAGTGGTAGTAGTCACCCGGc > 1:857358/1‑150 (MQ=255) gACACTTCGAAGTCGATCTTGCGCTCATCCAGATCAACACGCATGACCTTGACTTCGATGGTGTCGCCCAAGCGGAAGCTGCGACCGGTGCGCTCGCCGGCCAGGCGATGGTGTACCGGGTCGAAGTGGTAGTAGTCACCCGGCAACGCa > 1:2321899/1‑150 (MQ=255) cGAAGTCGATCTTGCGCTCATCCAGATCAACACGCATGACCTTGACTTCGATGGTGTCGCCCAAGCGGAAGCTGCGACCGGTGCGCTCGCCGGCCAGGCGATGGTGTACCGGGTCGAAGTGGTAGTAGTCACCCGGCAACGCACTGACGt < 2:773280/150‑1 (MQ=255) gAAGTCGATCTTGCGCTCATCCAGATCAACACGCATGACCTTGACTTCGATGGTGTCGCCCAAGCGGAAGCTGCGACCGGTGCGCTCGCCGGCCAGGCGATGGTGTACCGGGTCGAAGTGGTAGTAGTCACCCGGCAACGCACTGACGTg < 2:2416744/150‑1 (MQ=255) aGTCGATCTTGCGCTCATCCAGATCAACACGCATGACCTTGACTTCGATGGTGTCGCCCAAGCGGAAGCTGCGACCGGTGCGCTCGCCGGCCAGGCGATGGTGTACCGGGTCGAAGTGGTAGTAGTCACCCGGCAACGCACTGACGNGCa < 2:1508797/150‑1 (MQ=255) gTCGATCTTGCGCTCATCCAGATCAACACGCATGACCTTGACTTCGATGGTGTCGCCCAAGCGGAAGCTGCGACCGGTGCGCTCGCCGGCCAGGCGATGGTGTACCGGGTCGAAGTGgtagta > 1:328334/1‑123 (MQ=255) gTCGATCTTGCGCTCATCCAGATCAACACGCATGACCTTGACTTCGATGGTGTCGCCCAAGCGGAAGCTGCGACCGGTGCGCTCGCCGGCCAGGCGATGGTGTACCGGGTCGAAGTGgtagta < 2:328334/123‑1 (MQ=255) gATCTTGCGCTCATCCAGATCAACACGCATGACCTTGACTTCGATGGTGTCGCCCAAGCGGAAGCTGCGACCGGTGCGCTCGCCGGCCAGGCGATGGTGTACCGGGTCGAAGTGGTAGTGGTCACCCGGCAACGCACTGACGTGCACCaa > 2:2133525/1‑150 (MQ=255) gATCTTGCGCTCATCCAGATCAACACGCATGACCTTGACTTCGATGGTGTCGCCCAAGCGGAAGCTGCGACCGGTGCGCTCGCCGGCCAGGCGATGGTGTACCGGGTCGAAGTGGTAGTAGTCACCCGGCAACGCACTGACGTGCACCaa > 1:244833/1‑150 (MQ=255) gATCTTGCGCTCATCCAGATCAACACGCATGACCTTGACTTCGATGGTGTCGCCCAAGCGGAAGCTGCGACCGGTGCGCTCGCCGGCCAGGCGATGGTGTACCGGGTCGAAGTGGTAGTAGTCACCCGGCAACGCACTGACGTGCACCaa > 1:732250/1‑150 (MQ=255) tCTTGCGCTCATCCAGATCAACACGCATGACCTTGACTTCGATGGTGTCGCCCAAGCGGAAGCTGCGACCGGTGCGCTCGCCGGCCAGGCGATGGTGTACCGGGTCGAAGTGGTAGTAGCAAGGCAGCAACGCACTGACGTGCACCAAGc > 1:1182328/1‑150 (MQ=255) cgtGCGCTCATCAAGATCAACACGCATGACCTTGACTTCGATGGTGTCGCCCAAGCGGAAGCTGCGACCGGTGCGCTCGCCGGCCAGGCGATGGTGGACCGGGTCGAAGTGGTAGTAGTCACCCGGCAACGCACTGACGTGCACCAAGcc < 2:295598/148‑1 (MQ=255) ttGCGCTCATCCAGATCAACACGCATGACCTTGACTTCGATGGTGTCGCCCAAGCGGAAGCTGCGACCGGTGCGCTCGCCGGCCAGGCGATGGTGTACCGGGTCGAAGTGGTAGTAGTCACCCGGCAACGCACTGACGTGCACCAAGccc > 2:1484738/1‑150 (MQ=255) gcTCATCCAGATCAACACGCATGACCTTGACTTCGATGGTGTCGCCCAAGCGGAAGCTGCGACCGGTGCGCTCGCCGGCCAGGCGATGGTGTACCGGGTCGAAGTGGTAGTAGTCACCCGGCAACGCACTGACGTGCACCAAGCCCTCTa > 2:1083310/1‑150 (MQ=255) tCATCCAGATCAACACGCATGACCTTGACTTCGATGGTGTCGCCCAAGCGGAAGCTGCGACCGGTGCGCTCGCCGGCCAGGCGATGGTGTACCGGGTCGAAGTGGTAGTAGTCACCCGGCAACGCACTGACGTGCACCAAGCCCTCTACa > 1:2134330/1‑150 (MQ=255) tCATCCAGATCAACACGCATGACCTTGACTTCGATGGTGTCGCCCAAGCGGAAGCTGCGACCGGTGCGCTCGCCGGCCAGGCGATGGTGTACCGGGTCGAAGTGGTAGTAGTCACCCGGCAACGCACTGACGTGCACCAAGCCCTCTACa < 2:1981896/150‑1 (MQ=255) tCCAGATCAACACGCATGACCTTGACTTCGATGGTGTCGCCCAAGCGGAAGCTGCGACCGGTGCGCTCGCCGGCCAGGCGATGGTGTACCGGGTCGaa < 2:195168/98‑1 (MQ=255) tCCAGATCAACACGCATGACCTTGACTTCGATGGTGTCGCCCAAGCGGAAGCTGCGACCGGTGCGCTCGCCGGCCAGGCGATGGTGTACCGGGTCGaa > 1:195168/1‑98 (MQ=255) tCCAGATCAACACGCATGACCTTGACTTCGATGGTGTCGCCCAAGCGGAAGCTGCGACCGGTGCGCTCGCCGGCCAGGCGATGGTGTACCGGGTCGAAGTGGTAGTAGTCACCCGGCAACGCACTGACGTGCACCAAGCCCTCTACATAg > 1:783489/1‑150 (MQ=255) ccAGATCAACACGCATGACCTTGACTTCGATGGTGTCGCCCAAGCGGAAGCTGCGACCGGTGCGCTCGCCGGCCAGGCGATGGTGTACCGGGTCGAAGTGGTAGTAGTCACCCGGCAACGCACTGACGTGCACCAAGCCCTCTACATAGa > 1:1627568/1‑150 (MQ=255) ccAGATCAACACGCATGACCTTGACTTCGATGGTGTCGCCCAAGCGGAAGCTGCGACCGGTGCGCTCGCCGGCCAGGCGATGGTGTACCGGGTCGAAGTGGTAGTAGTCACCCGGCAACGCACTGACGTGCACCAAGCCCTCTACATAGa > 2:1867121/1‑150 (MQ=255) aGATCAACACGCATGACCTTGACTTCGATGGTGTCGCCCAAGCGGAAGCTGCGACCGGTGCGCTCGCCGGCCAGGCGATGGTGTACCGggtcg < 1:595181‑M2/93‑6 (MQ=255) aGATCAACACGCATGACCTTGACTTCGATGGTGTCGCCCAAGCGGAAGCTGCGACCGGTGCGCTCGCCGGCCAGGCGATGGTGTACCGggtcg > 2:595181‑M2/1‑88 (MQ=255) gATCAACACGCATGACCTTGACTTCGATGGTGTCGCCCAAGCGGAAGCTGCGACCGGTGCGCTCGCCGGCCAGGCGATGGTGTACCGGGTCGAAGTGGTAGTAGTCACCCGGCAACGCACTGACGTGCACCAAGCCCTCTACATAGatat < 1:1083310/150‑1 (MQ=255) tCAACACGCACGACCTTGACTTCGATGGTGTCGCCCAAGCGGAAGCTGCGACCGGTGCGCTCGCCGGCCAGGCGATGGTGTACCGGGTCGAAGTGGTAGTAGTCACCCGGCAACGCACTGACGTGCACCAAGCCCTCTACATAGATATCg < 1:1091373/150‑1 (MQ=255) aaCACGCATGACCTTGACTTCGATGGTGTCGCCCAAGCGGAAGCTGCGACCGGTGCGCTCGCCGGCCAGGCGATGGTGTACCGGGTCGAAGTGGTAGTAGTCACCCGGCAACGCACTGACGTg < 1:1539349/123‑1 (MQ=255) aaCACGCATGACCTTGACTTCGATGGTGTCGCCCAAGCGGAAGCTGCGACCGGTGCGCTCGCCGGCCAGGCGATGGTGTACCGGGTCGAAGTGGTAGTAGTCACCCGGCAACGCACTGACGTg > 2:1539349/1‑123 (MQ=255) aaCACGCATGACCTTGACTTCGATGGTGTCGCCCAAGCGGAAGCTGCGACCGGTGCGCTCGCCGGCCAGGCGATGGTGTACCGGGTCGAAGTGGTAGTAGTCACCCGGCAACGCACTGACGTGCACCAAGCCCTCTACATAGATATCGGt > 1:176665/1‑150 (MQ=255) aaCACGCATGACCTTGACTTCGATGGTGTCGCCCAAGCGGAAGCTGCGACCGGTGCGCTCGCCGGCCAGGCGATGGTGTACCGGGTCGAAGTGGTAGTAGTCACCCGGCAACGCACTGACGTGCACCAAGCCCTCTACATAGATATCGGt < 1:511007/150‑1 (MQ=255) gCATGACCTTGACTTCGATGGTGTCGCCCAAGCGGAAGCTGCGACCGGTGCGCTCGCCGGCCAGGCGATGGTGTACCGGGTCGAAGTGGTAGTAGTCACCCGGCAACGCACTGACGTGCa > 1:854179/1‑120 (MQ=255) 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cTTGACTTCGATGGTGTCGCCCAAGCGGAAGCTGCGACCGGTGCGCTCGCCGGCCAGGCGATGGTGTACCGGGTCGAAGTGGTAGTAGTCACCCGGCAACGCACTGACGTGCACCAAGCCCTCTACATAGATATCGGTCAGTTCGACGaa > 1:2146234/1‑150 (MQ=255) ttGACTTCGATGGTGTCGCCCAAGCGGAAGCTGCGACCGGTGCGCTCGCCGGCCAGGCGATGGTGTACCGGGTCGAAGTGGTAGTAGTCACCCGGCAACGCACTGACGTGCACCAAg > 1:2192656/1‑117 (MQ=255) aCTTCGATGGTGTCGCCCAAGCGGAAGCTGCGACCGGTGCGCTCGCCGGCCAGGCGATGGTGTACCGGGTCGAAGTGGTAGTAGTCACCCGGCAACGCACTGAc < 2:1394218/104‑1 (MQ=255) aCTTCGATGGTGTCGCCCAAGCGGAAGCTGCGACCGGTGCGCTCGCCGGCCAGGCGATGGTGTACCGGGTCGAAGTGGTAGTAGTCACCCGGCAACGCACTGACGTGCACCAAGCCCTCTACATAGATATCGGTCAGTTCGACGAACAgg < 2:2321899/150‑1 (MQ=255) cTTCGATGGTGTCGCCCAAGCGGAAGCTGCGACCGGTGCGCTCGCCGGCCAGGCGATGGTGTACCGGGTCGAAGTGGTAGTAGTCACCCGGCAACGCACTGACGTGCACCAAGCCCTCTACATAGATATCGGTCAGTTCGACGAACAGGc < 2:2134330/150‑1 (MQ=255) ttCGATGGTGTCGCCCAAGCGGAAGCTGCGACCGGTGCGCTCGCCGGCCAGGCGATGGTGTACCGGGTCGAAGTg > 2:1317273/1‑75 (MQ=255) ttCGATGGTGTCGCCCAAGCGGAAGCTGCGACCGGTGCGCTCGCCGGCCAGGCGATGGTGTACCGGGTCGAAGTg < 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tCGCCGGCCAGGCGATGGTGTACCGGGTCGAAGTGGTAGTAGTCACCCGGCAACGCACTGACGTGCACCAAGCCCTCTACATAGat < 1:2382959/86‑1 (MQ=255) tCGCCGGCCAGGCGATGGTGTACCGGGTCGAAGTGGTAGTAGTCACCCGGCAACGCACTGACGTGCACCAAGCCCTCTACATAGat > 2:2382959/1‑86 (MQ=255) tCGCCGGCCAGGCGATGGTGTACCGGGTCGAAGTGGTAGTAGTCACCCGGCAACGCACTGACGTGCACCAAGCCCTCTACATAGATATCGGTCAGTTCGACGAACAGGCCGAAACCGGTCACCGCAGTGATCACACCCGGGAAGGTCTCg > 1:1284365/1‑150 (MQ=255) tCGCCGGCCAGGCGATGGTGTACCGGGTCGAAGTGGTAGTAGTCACCCGGCAACGCACTGACGTGCACCAAGCCCGGCACATAGATATCGGTCAGTTCGACCAACAGGCCGAAACCGGTCACCGCAGTGATCACACCCGGGAAGGTCTCg > 1:1115282/1‑150 (MQ=255) cGCCGGCCAGGCGATGGTGTACCGGGTCGAAGTGGTAGTAGTCACCCGGCAACGCACTGACGTGCACCAAGCCCTCTACATAGATATCGGTCAGTTCGACGAACAGGCCGAAACCGGTCACCGCAGTGATCACACCCGGGAAGGTCTCGc < 1:295684/150‑1 (MQ=255) gCCGGCCAGGCGATGGTGTACCGGGTCGAAGTGGTAGTAGTCACCCGGCAACGCACTGACGTGCACCAAGCCCTCTACATAGATATCGGTCAGTTCGACGAACAGGCCGAAACCGGTCACCGCAGTGATCACACCCGGGAAGGTCTCGcc > 1:2339175/1‑150 (MQ=255) ccGGCCAGGCGATGGTGTACCGGGTCGAAGTGGTAGTAGTCACCCGGCAACGCACTGACGTGCACCAAGCCCTCTACATAGATATCGGTCAGTTCGACGAACAGGCCGAAACCGGTCACCGCAGTGATCACACCCGGGAAGGTCTCGccc > 2:2330768/1‑150 (MQ=255) cGGCCAGGCGATGGTGTACCGGGTCGAAGTGGTAGTAGTCACCCGGCAACGCACTGACGTGCACCAAGCCCTCTACATAGATATCGGTCAGTTCGACGAACAGGCCGAAACCGGTCACCGCAGTGATCACACCCGGGAAGGTCTCGCCCa < 1:1432576/150‑1 (MQ=255) cAGGCGATGGTGTACCGGGTCGAAGTGGTAGTAGTCACCCGGCAACGCACTGACGTGCACCAAGCCCTCTACATAGATATCGGTCAGTTCGACGAACAGGCCGAAACCGGTCACCGCAGTGATCACACCCGGGAAGGTCTCGCCCAcgcg > 1:1009632/1‑150 (MQ=255) gATGGTGTACCGGGTCGAAGTGGTAGTAGTCACCCGGCAACGCACTGACGTGCACCAAGCCCTCTACATAGATATCGGTCAGTTCGACGAACAg < 2:116571/94‑1 (MQ=255) gtgtACCGGGTCGAAGTGGTAGTAGTCACCCGGCAACGCACTGACGTGCACCAAGCCCTCTACATAGATATCGGTCAGTTCGACGAACAGGCCGAAACCGGTCACCGCAGTGAt < 1:1138985/114‑1 (MQ=255) gtgtACCGGGTCGAAGTGGTAGTAGTCACCCGGCAACGCACTGACGTGCACCAAGCCCTCTACATAGATATCGGTCAGTTCGACGAACAGGCCGAAACCGGTCACCGCAGTGAt > 2:1138985/1‑114 (MQ=255) tACCGGGTCGAAGTGGTAGTAGTCACCCGGCAACGCACTGACGTGCACCAAGCCCTCTACATAGATATCGGTc < 2:1606773/73‑1 (MQ=255) tACCGGGTCGAAGTGGTAGTAGTCACCCGGCAACGCACTGACGTGCACCAAGCCCTCTACATAGATATCGGTc > 1:1606773/1‑73 (MQ=255) ccGGGTCGAAGTGGTAGTAGTCACCCGGCAACGCACTGACGTGCACCAAGCCCTCTACATAGATATCGGTCAGTTCGACGAACAGGCCGAAACCGGTCACCGCAGTGATCACACCCGGGAAGGTCTCGCCCACGCGGTCTTTCATGAACt > 1:800656/1‑150 (MQ=255) cGGGTCGAAGTGGTAGTAGTCACCCGGCAACGCACTGACGTGCACCAAGCCCTGGACATGCATATCGGTCAGTGCTACGAACAGGCCGAAACCGGTCACCGCAGTGATCGCACCCGGGAAGGTCTCGCCCACGCGGGCTTTCCTGAACTc > 1:535594/1‑150 (MQ=255) cGGGTCGAAGTGGTAGTAGTCACCCGGCAACGCACTGACGTGCACCAAGCCCTCTACATAGATATCGGTCAGTTCGACGAACAGGCCGAAACCGGTCACCGCAGTGATCACACCCGGGAAGGTCTCGCCCACGCGGTCTTTCATGAACTc > 1:1920272/1‑150 (MQ=255) cGGGTCGAAGTGGTAGTAGTCACCCGGCAACGCACTGACGTGCACCAAGCCCTCTACATAGATATCGGTCAGTTCGACGAACAGGCCGAAACCGGTCACCGCAGTGATCACACCCGGGAAGGTCTCGCCCACGCGGTCTTTCATGAACTc < 2:732250/150‑1 (MQ=255) cGGGTCGAAGTGGTAGTAGTCACCCGGCAACGCAATGACGTGCACCAAGCCCTCTACATAGATATCGGTCAGTTCGACGAACAGGCCGAAACCGGTCACCGCAGTGATCACACCCGGGAAGGTCTCGCCCACGCGGTCTTTCATGAACTc < 2:2408305/150‑1 (MQ=255) | GCGGCCGATCGGTGCGGCGAGGGTCTTTTCCGACACTTCGAAGTCGATCTTGCGCTCATCCAGATCAACACGCATGACCTTGACTTCGATGGTGTCGCCCAAGCGGAAGCTGCGACCGGTGCGCTCGCCGGCCAGGCGATGGTGTACCGGGTCGAAGTGGTAGTAGTCACCCGGCAACGCACTGACGTGCACCAAGCCCTCTACATAGATATCGGTCAGTTCGACGAACAGGCCGAAACCGGTCACCGCAGTGATCACACCCGGGAAGGTCTCGCCCACGCGGTCTTTCATGAACTC > NC_002947/5546834‑5547130 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |