| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 5533648 = | 94 (1.010) | 5 (0.050) | 5/244 | NT | 5.2% | coding (875/1137 nt) | PP_4867 | BraC‑like branched‑chain amino acid ABC transporter substrate‑binding protein |
| ? | NC_002947 | 5533682 = | 92 (1.010) | coding (841/1137 nt) | PP_4867 | BraC‑like branched‑chain amino acid ABC transporter substrate‑binding protein | |||||
Only 100 of 109 total aligned reads displayed.
TCCTCGCCCTTGTTCGACTTCGCGCCATTGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAGCGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATG‑TACACGCCGTCAACGTATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCAGTTCGTCGGTGACGATGCCATCATCGGACATGAACTTGACGTCCTTCAGGCCTTGCTCGCGCAGCTGGCGTACCAGCGGGCC > NC_002947/5533534‑5533823 | tCCTCGCCCTTGTTCGACTTCGCGCCATTGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAGCGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCGTCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCg < 1:2410708/150‑1 (MQ=255)tCCTCGCCCTTGTTCGACTTCGCGCCATTGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAGCGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTc < 1:1124176/149‑1 (MQ=255) aggcctgaaggacgtcaagttcatgtccgatgatggcatcgtcaccgacgaattggtgtctaccgccggcggcgcgcaatacgttgacggcgtgtgcatgaccttcggtgccgACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCgg > 2:2340840‑M1/114‑150 (MQ=255) tCGCCCTTGTTCGACTTCGCGCCATTGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAGCGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCCCGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCGGCAGTCGCGGGTCGGCa > 1:526115/1‑150 (MQ=255) cGCCCTTGTTCGACTTCGCGCCATTGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAGCGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCAc < 1:1791568/150‑1 (MQ=255) gCCCTTGTTCGACTTCGCGCCATTGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAGCGAAGTGTAAGCGTACAGGGTGCTGGCGGCGATTTCTGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCAcc > 1:1486105/1‑150 (MQ=255) ccTTGTTCGACTTCGCGCCATTGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAGCGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGa > 2:859002/1‑150 (MQ=255) ttGTTCGACTTCGCGCCATTGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAGCGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCTCCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAg < 1:1488809/150‑1 (MQ=255) gTTCGACTTCGCGCCATTGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAGCGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGt > 1:796792/1‑150 (MQ=255) tCGACTTCGCGCCATTGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAGCGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCa < 1:1858488/150‑1 (MQ=255) ctaCTACGCCCCATTGAAAGCGGCAGCCACAGCCTGCATCGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGtacc < 1:1902078/148‑4 (MQ=255) cGACTTCGCGCCATTGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAGCGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCAt < 1:999012/150‑1 (MQ=255) gACTTCGCGCCATTGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAGCGAAGCGTAGGCGTACAGGGGGTAGCCCTCAGGTTGGGTGCGGGCCTTGCCGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTAATg > 1:650871/1‑150 (MQ=255) cTTCGCGCCATTGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAGCGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATG‑Ta < 2:277142/150‑1 (MQ=255) ttCGCGCCATTGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAGCGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATG‑Tac > 1:1020014/1‑150 (MQ=255) tGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAGCGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATG‑TACACGCCGTCaa < 1:550208/150‑1 (MQ=255) atgatggcatcgtcaccgacgaactggtgtctaccgccggcggcgcgcaatacgttgacggcgtgtacatgaccttcggtgccgACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCg > 2:1951563‑M1/85‑120 (MQ=255) aaaGCGGCAGCCAGAGCCTGCAGCGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATG‑TACACGCCGTCAACg > 2:1128684/1‑150 (MQ=255) aaGCGGCAGCCAGAGCCTGCAGCGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCCTG‑TACACGCCGTCAACGt > 1:387581/1‑150 (MQ=255) aaGCGGCAGCCAGAGCCTGCAGCGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATG‑TACACGCCGTCAACGt > 1:1412441/1‑150 (MQ=255) aGCGGCCGCCAGAGCCTGCAGCGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCCCCGAAGGTCATG‑TACACGCCGTCAACGTa < 1:1166134/150‑1 (MQ=255) ggCAGCCAGAGCCTGCAGCGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCNGGTCGGCACCGAAGGTCATG‑TACACGCCGTCAACGTATTg < 1:2298525/150‑1 (MQ=255) ggCAGCCAGAGCCTGCAGCGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATG‑TACACGCCGTCAACGTATTg < 1:2298649/150‑1 (MQ=255) gCCAGAGCCTGCAGCGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATG‑TACACGCCGTCAACGTATTgcgcg > 1:378849/1‑150 (MQ=255) cAGAGCCTGCAGCGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACCCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATG‑TACACGCCGTCAACGTATTGCGcgcc > 2:2192458/1‑150 (MQ=255) cAGAGCCTGCAGCGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTACCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATG‑TACACGCCGTCAACGTATTGCGcgcc > 1:872776/1‑150 (MQ=255) gagCCTGCAGCGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATG‑TACACGCCGTCAACGTATTGCGcgccgc > 2:432321/1‑150 (MQ=255) tGCAGCGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATG‑TACACGCCGTCAACGTATTGCGCGCCGCcggcg < 1:1756373/150‑1 (MQ=255) aGCGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATG‑TACACGCCGTCAACGTATTGCGCGCCGCCGGCNGTa < 2:1497786/150‑1 (MQ=255) cGACGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATG‑TACACGCCGTCAACGTATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGa < 2:1402535/150‑1 (MQ=255) aaGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATG‑TACACGCCGTCAACGTa > 1:1985177/1‑127 (MQ=255) aaGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATG‑TACACGCCGTCAACGTa < 2:1985177/127‑1 (MQ=255) aaGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATG‑TACACGCCGTCAACGTATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGaca > 2:812930/1‑150 (MQ=255) aGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATG‑TACACGCCGTCAACGTATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGacac < 1:812930/150‑1 (MQ=255) cGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATG‑TACACGCCGTCAACGTATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCa < 2:387581/150‑1 (MQ=255) tAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCAAAGGTCATG‑TACACGCCGTCAACGTATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCAGt > 1:880222/1‑150 (MQ=255) ggCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATG‑TACACGCCGTCAACGTATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCAGTtc < 2:1486105/150‑1 (MQ=255) gTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATG‑TACACGCCGTCAACGTATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCAGTtcgtc < 1:235593/150‑1 (MQ=255) gTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATG‑TACACGCCGTCAACGTATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCAGTtcgtc > 2:1609687/1‑150 (MQ=255) aGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATG‑TACACGCCGTCAACGTATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCAGTTCGTCGGTg > 2:1543879/1‑150 (MQ=255) gtAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATG‑TACACGCCGTCAACGCATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCAGtt < 1:2244718/137‑1 (MQ=255) gtAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATG‑TACACGCCGTCAACGCATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCAGtt > 2:2244718/1‑137 (MQ=255) tAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGACCTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATG‑TACACGCCGTCAACGTATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCAGTTCGTCGGTGACGATg < 2:1703548/150‑1 (MQ=255) cccTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATG‑TACACGCCGTCAACGTATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCAGTTCGTCGGTGACGATGCca > 2:1345623/1‑150 (MQ=255) cccTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATG‑TACACGCCGTCAACGTATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCAGTTCGTCGGTGACGATGCca < 1:2226207/150‑1 (MQ=255) cTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATG‑TACACGCCGTCAACGTATTg < 2:1143091/105‑1 (MQ=255) cTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATG‑TACACGCCGTCAACGTATTg > 1:1143091/1‑105 (MQ=255) tCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATG‑TACACGCCGTCAACGTATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCAGTTCGTCGGTGACGATGCcatca > 1:965011/1‑150 (MQ=255) tCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATG‑TACACGCCGTCAACGTATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCAGTTCGTCGGTGACGATGCcatca > 2:711259/1‑150 (MQ=255) aGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATG‑TACACGCCGTCAACGTAGTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCAGTTCGTCGGTGACGATGCCatcatc > 2:1260998/1‑150 (MQ=255) gTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATG‑TACACGCCGTCAACGTATTgcgcg > 1:1490514/1‑104 (MQ=255) gTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATG‑TACACGCCGTCAACGTATTgcgcg < 2:1490514/104‑1 (MQ=255) gTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATG‑TACACGCCGTCAACGTATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCAGTTCGTCGGTGACGATGCCATCATCgg > 2:2083895/1‑150 (MQ=255) ttCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATG‑TACACGCCGTCAACGTATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCAGTTCGTCGGTGACGATGCCATCATCGGa > 2:557193/1‑150 (MQ=255) tCGGTGCCGGCCTTGCGGAACCCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATG‑TACACGCCGTCAACGTATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCAGTTCGTCGGTGACGATGCCATCATCGGAc < 1:2192458/150‑1 (MQ=255) ccTTGCGGAACCCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGAATTTAA‑GCCACGTTTTACGCCGTCAACGTATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCAGTTCGTCGGTGACGATGCCATCATCGGACATGAACTTGa < 1:1749897/150‑1 (MQ=255) 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ggAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATG‑TACACGCCGTCAACGTATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCAGTTCGTCGGTGACGATGCCATCATCGGACAt > 2:1410780/1‑136 (MQ=255) ggAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATG‑TACACGCCGTCAACGTATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCAGTTCGTCGGTGACGATGCCATCATCGGACAt < 1:1410780/136‑1 (MQ=255) aaCTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATG‑TACACGCCGTCAACGTATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCAGTTCGTCGGTGACGATGACACTTTCGGACATGAACTTGACGTCCTTc < 1:1640366/150‑1 (MQ=255) aCTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATG‑TACACGCCGTCAACGTATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCAGTTCGTCGGTGACGATGCCATCATCGGACATGAACTTGACGTCCTTCa < 2:1020014/150‑1 (MQ=255) ctcctcCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATG‑TACACGCCGTCAACGTATTGCGCTCCGCCGGCGGTAGACACCAGTTCGTCGGTGACGATGCCATCATCGGACATGAAATTGACGTACTTCAg > 1:712443/1‑150 (MQ=255) tcctccACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATG‑TACACGCCGTCAACGTATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGacac > 1:2004333/1‑98 (MQ=255) 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ccgacccgcgcctgctgccagacagcaaggcggtggtCGGCACCGAAGGTCATG‑CACACGCCGTCAACGTATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCAATTCGTCGGTGACGATGCCATCATCGGACATGAACTTGACGTCCTTCAGGCCt > 2:2340840‑M2/38‑150 (MQ=255) cgacccgcgcctgctgccagacagcaaggcggtggtCGGCACCGAAGGTCATG‑TACACGCCGTCAACGTATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCAGTTCGTCGGTGACGATGCcatcat < 1:1951563‑M2/84‑1 (MQ=255) cgacccgcgcctgctgccagacagcaaggcggtggtCGGCACCGAAGGTCATG‑TACACGCCGTCAACGTATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCAGTTCGTCGGTGACGATGCcatcat > 2:1951563‑M2/37‑120 (MQ=255) ccaccaCCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATG‑TACACGCCGTCAACGTATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCAGTTCGTCGGTGACGATGCCATCATCGGACATGAACTTGACGTCCTTCAGGCCtt < 1:1609687/150‑1 (MQ=255) caccacCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATG‑TACACGCCGTCAACGTATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCAGTTCGTCGGTGACGATGCCATCATCGGACATGAACtt < 2:1640725/132‑1 (MQ=255) caccacCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATG‑TACACGCCGTCAACGTATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCAGTTCGTCGGTGACGATGCCATCATCGGACATGAACtt > 1:1640725/1‑132 (MQ=255) ccgcgcctgctgccagacagcaaggcgcgggtCGGCACCGAAGGTCATG‑TACACGCCGTCAACGTATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCAGTTCGTCGGTGACGATGCCATCATCGGACATGAACTTGACGTCCTTCAGGCCTTGCTc > 2:1643529‑M2/33‑150 (MQ=255) CACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATG‑TACACGTCGTCAACGTATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCAGTTCGTCGGTGCCGATGCCATCATCGGACATGAACTTGACGTCCTTCAGGCCTTGCTc < 2:584841‑M1/150‑1 (MQ=255) CACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATG‑TACACGCCGTCAACGTATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCAGTTCGTCGGTGACGATGCCATCATCGGACATGAACTTGACGTCCTTCAGGCCTTGCTc < 1:328354‑M1/150‑1 (MQ=255) CACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATG‑TACACGCCGTCAACGTATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCAGTTCGTCGGTGACGATGCCATCATCGGACATGAAATTGACGTCCTTCAGGCCTTGCTc < 2:2325920‑M1/150‑1 (MQ=255) ccTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATG‑TACACGCCGTCAACGTATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCAGTTCGTCGGTGACGATGCCATCATCGGACATGAACTTGACGTCCTTCAGGCCTTGCTCGCGCa > 1:957990/1‑150 (MQ=255) ctgctgccagacagcaaggcgcgggtCGGCACCGAAGGTCATG‑TACACGCCGTCAACGTATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCAGTTCGTCGGTGACGATGCCATCATCGGACATGAACTTGACGTCCTTCAGGCCTTGCTCGCGCAg > 2:1030479‑M2/27‑150 (MQ=255) cTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATG‑TACACGCCGTCAACGTATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCAGTtcgtc > 1:1378601/1‑89 (MQ=255) cTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATG‑TACACGCCGTCAACGTATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCAGTtcgtc < 2:1378601/89‑1 (MQ=255) tGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATG‑TACACGCCGTCAACGTATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCAGTTCGTCGGTGACGATGCCATCATCGGACATGAACTTGACGTCCTTCAGGCCTTGCTCGCGCAGCTGGc > 2:1654535/1‑150 (MQ=255) tGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATG‑TACACGCCGTCAACGTATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCAGTTCGTCGGTGACGATGCCATCATCGGACATGAACTTGACGTCCTTCAGGCCTTGCTCGCGCAGCTGGc > 2:55223/1‑150 (MQ=255) cTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATG‑TACACGCCGTCAACGTATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCAGTTCGTCGGTGACGATGCCATCATCGGACATGAACTTGACGTCCTTCAGGCCTTGCTCGCGCAGCTGGCGTa < 1:711259/150‑1 (MQ=255) tGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATG‑TACACGCCGTCAACGTATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCAGTTCGTCGGTGACGATGCCATCATCGGACATGAACTTGACGTCCTTCAGGCCTTGCTCGCGCAGCTGGCGTAc > 1:783498/1‑150 (MQ=255) agcagGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATG‑TACACGCCGTCAACGTATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCAGTTCGTCGGTGACGATGCCATCATCGGACATGAACTTGACGTCCTTCAGGCCTTGCTcg > 2:1651007/1‑132 (MQ=255) agcagGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATG‑TACACGCCGTCAACGTATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCAGTTCGTCGGTGACGATGCCATCATCGGACATGAACTTGACGTCCTTCAGGCCTTGCTcg < 1:1651007/132‑1 (MQ=255) agcagGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATG‑TACACGCCGTCAACGTATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCAGTTCGTCGGTGACGATGCCATCATCGGACATGAACTTGACGTCCTTCAGGCCTTGCTCGCGCAGCTGGCGTACCAGc > 1:5174/1‑150 (MQ=255) agcagGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATG‑CACCGGCCGTCAACGTATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCAGTTCGTCGGTGACGATGCCATCATCGGACATGAACTTGACGTCCTTCAGGCCTTGCTCGCGCAGCTGGCGTACCAGc < 2:189122/150‑1 (MQ=255) gcagGCGCGGGTCGGCACCAAAGGTCATG‑TACACGCCGTCAACGTATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCAGTTCGTCGGTGACGATGCCATCATCGGACATGAACTTGACGTCCTTCAGGCCTTGCTCGCGCAGCTGGCGTACCAGCg < 2:880222/150‑1 (MQ=255) cagGCGCGCGTCGGCACTGAAGGTCATG‑TACACGCCGTCAACGTATTGCGCGCCGCCGGCTGTAGACACCAGTTCGTCGTTGACGATGCCATCATCGGACATGAACTTGACGTCCTTCAGCCCTTGCTCGCGTAGCTGGCGTACCAGCgt < 2:650871/150‑2 (MQ=255) agGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATG‑TACACGCCGTCAACGTATTGCGCGCCGCCGGCGGTATACACCAGTTCGTCGGTGACGa < 1:2203147/85‑1 (MQ=255) agGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATG‑TACACGCCGTCAACGTATTGCGCGCCGCCGGCGGTATACACCAGTTCGTCGGTGACGa > 2:2203147/1‑85 (MQ=255) ggCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATG‑TACACGCCGTCAACGTATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCAGTTCGTCGGTGACGATGCCATCATCGGACATGAACTTGACGTCCTTCAGGCCtt < 2:722213/123‑1 (MQ=255) | TCCTCGCCCTTGTTCGACTTCGCGCCATTGAAAGCGGCAGCCAGAGCCTGCAGCGAAGCGTAGGCGTACAGGGTGTAGCCCTCAGGTTCGGTGCCGGCCTTGCGGAACTCCTCCACCACCGCCTTGCTGTCTGGCAGCAGGCGCGGGTCGGCACCGAAGGTCATG‑TACACGCCGTCAACGTATTGCGCGCCGCCGGCGGTAGACACCAGTTCGTCGGTGACGATGCCATCATCGGACATGAACTTGACGTCCTTCAGGCCTTGCTCGCGCAGCTGGCGTACCAGCGGGCC > NC_002947/5533534‑5533823 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |