| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_002947 | = 5981478 | 79 (0.940) | coding (2067/5049 nt) | PP_5242 | GAF domain‑containing sensor histidine kinase | |||||
Only 100 of 120 total aligned reads displayed.
AGCCTTGATTGGCGCTGGCTTCCTGCAACCGGGCCAGAACGGCTTGGGCTTCACTCATGACCGGGTGATGGAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCAC‑CAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAACGCACGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCCCTGCGGGTTTGCAGCGGATGACTGCGAAGCGTTCCTGCAGCTTTTACGCGAAGCCGCATCATGCGCACGCGACGCGGGCACCTTCGA > NC_002947/5981331‑5981627 | ccTTGATTGGCGCTGGCTTCCTGCAACCGGGCCAGAACGGCTTGGGCTTCACTCATGACCGGGTGATGGAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCAC‑CAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTtggc < 1:2287517‑M2/150‑5 (MQ=255) cTTGATTGGCGCTGGCTTCCTGCAACCGGGCCAGAACGGCTTGGGCTTCACTCATGACCGGGTGATGGAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCAC‑CAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTtggcc < 2:2013960‑M2/150‑6 (MQ=255) cTTGATTGGCGCTGGCTTCCTGCAACCGGGCCAGAACGGCTTGGGCTTCACTCATGACCGGGTGATGGAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCAC‑CAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTtggcc < 1:314699‑M2/150‑6 (MQ=255) cTTGATTGGCGCTGGCTTCCTGCAACCGGGCCAGAACGGCTTGGGCTTCACTCATGACCGGGTGATGGAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCAC‑CAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTtggcc < 1:1447165‑M2/150‑6 (MQ=255) gcgcTGGCTTCCTGTAACCCGGCCAGAACGGCTTGGGCTTCACTCATGATCGGGTGATGGAGGCCGCTTATGCGCCCACGCCCGTGCAC‑CAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGaa < 1:1550978/150‑1 (MQ=255) gcgcTGGCTTCCTGCAACCGGGCCAGAACGGCTTGGGCTTCACTCATGACCGGGTGATGGAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCAC‑CAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGaa < 2:1857059/150‑1 (MQ=255) tGGCTTCCTGCAACCGGGCCAGAACGGCTTGGGCTTCACTCATGACCGGGTGATGGAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCAC‑CAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAACGcc > 1:2304563/1‑149 (MQ=255) ttCCTGCAACCGGGCCAGAACGGCTTGGGCTTCACTCATGACCGGGTGATGGAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCAC‑CAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAACGCACGAg > 1:225166/1‑150 (MQ=255) 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cAGGCTTGGCCAGGGCGAACGCACGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCCCTGCGGGTTTGCAGCGGATGACTGCGAAGCGTTCCTGCAGCTTTTACGCGAAGCCGCATCATGCGCACGCGACGCGGGCAcc < 1:181805/150‑1 (MQ=255) gCTTGGCCAGGGCGAACGCACGAGGTGTTGTTCGAGCTCGGCAGCCAGCTACAACGCGCCACCGCCTGCGGGTTTGCAGCGGATGACTGCGAAGCGTTCCTGCAGCTTTTACGCGAAGCCGCATCATGCGCACGCGACGCGGGCACCTTc > 1:648467/1‑150 (MQ=255) ttGGCCAGGGCGAACGCACGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCCCTGCGGGTTTGCAGCGGATGACTGCGAAGCGTTCCTGCAGCTTTTACGCGAAGCCGCATCATGCGCACGCGACGCGGGCACCTTCGa < 1:1808265/150‑1 (MQ=255) | AGCCTTGATTGGCGCTGGCTTCCTGCAACCGGGCCAGAACGGCTTGGGCTTCACTCATGACCGGGTGATGGAGGCCGCTTATGCACTCACGCCCGTGCAC‑CAGCGCGCCTCGCTGCATGCACGTATCGCCCTGGCCATGCGCCAGGCTTGGCCAGGGCGAACGCACGAGGTGTTGTTCGAGCTCGCCAGCCAGCTACAACGCGCCAGCCCCTGCGGGTTTGCAGCGGATGACTGCGAAGCGTTCCTGCAGCTTTTACGCGAAGCCGCATCATGCGCACGCGACGCGGGCACCTTCGA > NC_002947/5981331‑5981627 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |