New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 6050814 = | 104 (1.110) | 5 (0.060) | 5/238 | NT | 5.2% | coding (1620/2109 nt) | spoT | bifunctional (p)ppGpp synthase/hydrolase |
? | NC_002947 | 6050855 = | 84 (0.950) | coding (1661/2109 nt) | spoT | bifunctional (p)ppGpp synthase/hydrolase |
Only 100 of 109 total aligned reads displayed.
TCCCCCAGGAACGCATCCAGTCTATTCTCGCCGAGTACCGCCTGGAGCTCATAGAAGACCTGCTCGAAGACATCGGCCTGGGCAACCGCATGGCCTACGTGGTCGCG‑‑‑‑‑CGCCGCCTGCTGTCGGCCGAAGGCGAACAGCTGCCGGCGCCA‑GAAGGCCCACTGGCGATCCGCGGCACCGAAGGCCTGGTGCTCAGCTACGCCAAGTGCTGCACGCCGATCCCGGGTGACCCGATTGTCGGCCACCTGTCGGCCGGCAAGGGCATGGTCGTGCACCTGGAGAACTGCCGCAACATCAGT > NC_002947/6050708‑6051003 | tCCCCCAGGAACGCATCCAGTCTATTCTCGCCGAGTACCGCCTGGAGCTCATAGAAGACCTGCTCGAAGACATCGGCCTGGGCAACCGCATGGCCTACGTGGTCGCG‑‑‑‑‑CGCCGCCTGCTGTCGGCCGAAGGCGAACAGCTGCCGGCGCCA‑g > 1:2229104/1‑150 (MQ=255) ggccgacaggtggccgacaatcgggtcacccgggatcggcgtgcagcacttggcgtagctgagcaccaggccttcggtgccgcggatcgccagtgggccttctgG‑‑‑‑‑CGCCGCCTGCTGTCGGCCGAAGGCGAACAGCTGCCGGCGCCA‑Gaa > 2:208595‑M1/105‑150 (MQ=255) ccccAGGAACGCATCCAGTCTATTCTCGCCGAGTACCGCCTGGAGCTCATAGAAGACCTGCTCGAAGACATCGGCCTGGGCAACCGCATGGCCTACGTGGTCGCG‑‑‑‑‑CGCCGCCTGCTGTCGGCCGAAGGCGAACAGCTGCCGGCGCCA‑Gaa > 2:1793046/1‑150 (MQ=255) ccccAGGAACGCATCCAGTCTATTCTCGCCGAGTACCGCCTGGAGCTCATAGAAGACCTGCTCGAAGACATCGGCCTGGGCAACCGCATGGCCTACGTGGTCGCG‑‑‑‑‑CGCCGCCTGCTGTCGGCCGAAGGCGAACAGCTGCCGGCGCCA‑Gaa > 2:2233704/1‑150 (MQ=255) cccAGGAACGCATCCAGTCTATTCTCGCCGAGTACCGCCTGGAGCTCATAGAAGACCTGCTCGAAGACATCGGCCTGGGCAACCGCATGGCCTACGTGGTCGCG‑‑‑‑‑CGCCGCCTGCTGTCGGCCGAAGGCGAACAGCTGCCGGCGCCA‑GAAg > 2:958881/1‑150 (MQ=255) cccAGGAACGCATCCAGTCTATTCTCGCCGAGTACCGCCTGGAGCTCATAGAAGACCTGCTCGAAGACATCGGCCTGGGCAACCGCATGGCCTACGTGGTCGCG‑‑‑‑‑CGCCGCCTGCTGTCGGCCGAAGGCGAACAGCTGCCGGCGCCA‑GAAg < 1:1664959/150‑1 (MQ=255) cccAGGAACGCATCCAGTCTATTCTCGCCGAGTACCGCCTGGAGCTCATAGAAGACCTGCTCGAAGACATCGGCCTGGGCAACCGCATGGCCTACGTGGTCGCG‑‑‑‑‑CGCCGCCTGCTGTCGGCCGAAGGCGAACAGCTGCCGGCGCCA‑GAAg > 2:723929/1‑150 (MQ=255) ccAGGAACGCATCCAGTCTATTCTCGCCGAGTACCGCCTGGAGCTCATAGAAGACCTGCTCGAAGACATCGGCCTGGGCAACCGCATGGCCTACGTGGTCGCG‑‑‑‑‑CGCCGCCTGCTGTCGGCCGAAGGCGAACAGCTGCCGGCGCCA‑GAAgg > 1:870377/1‑150 (MQ=255) gAACGCATCCAGTCTATTCTCGCCGAGTACCGCCTGGAGCTCATAGAAGACCTGCTCGAAGACATCGGCCAGCTCAACGGCATGGCCTACGTGGTCGCG‑‑‑‑‑CGCCGCCTGCTGTCGGCCGAAGGCGAACAGCTGCCGGCGCCA‑GAAGGCCCa > 2:2300836/1‑150 (MQ=255) aaCGCATCCAGTCTATTCTCGCCGAGTACCGCCTGGAGCTCATAGAAGACCTGCTCGAAGACATCGGCCTGGGCAACCGCATGGCCTACGTGGTCGCG‑‑‑‑‑CGCCGCCTGCTGTCGGCCGAAGGCGAACAGCTGCCGGCGCCA‑GAAGGCCCAc > 1:1552571/1‑150 (MQ=255) gCATCCAGTCTATTCTCGCCGAGTACCGCCTGGAGCTCATAGAAGACCTGCTCGAAGACATCGGCCTGGGCAACCGCATGGCCTACGTGGTCGCG‑‑‑‑‑CGCCGCCTGCTGTCGGCCGAAGGCGAACAGCTGCCGGCGCCA‑GAAGGCCCACTgg < 2:580238/150‑1 (MQ=255) gCATCCAGTCTATTCTCGCCGAGTACCGCCTGGAGCTCATAGAAGACCTGCTCGAAGACATCGGCCTGGGCAACCGCATGGCCTACGTGGTCGCG‑‑‑‑‑AGCCGCCTGCTGTCGGCCGAAGGCGAACAGCTGCCGGCGCCA‑GAAGGCCCACTgg < 1:1189009/150‑1 (MQ=255) tCCAGTCTATTCTCGCCGAGTACCGCCTGGAGCTCATGGAAGACCTGCTCGAAGACATCGGCCTGGGCAACCGCATGGCCTACGTGGTCGCG‑‑‑‑‑CGCCGCCTGCTGTCGGCCGAAGGCGAACAGCTGCCGGCGCCA‑GAAGGCCCACTGGCGa < 1:723929/150‑1 (MQ=255) gacaatcgggtcacccgggatcggcgtgcagcacttggcgtagctgagcaccaggccttcggtgccgcggatcgccagtgggcctacgtgGTCGCGCGCCGCCTGCTGTCGGCCGAAGGCGAACAGCTGCCGGCGCCA‑GAAGGCCCNCTg > 2:1509562‑M1/91‑150 (MQ=255) ccAGTCTATTCTCGCCGAGTACCGCCTGGAGCTCATAGAAGACCTGCTCGAAGACATCGGCCTGGGCAACCGCATGGCCTACGTGGTCGCG‑‑‑‑‑CGCCGCCTGCTGTCGGCCGAAGGCGAACAGCTGCCGGCGCCA‑GAAGGCCCACTGGCGAt > 2:2247689/1‑150 (MQ=255) cAGTCTATTCTCGCCGAGTACCGCCTGGAGCTCATAGAAGACCTGCTCGAAGACATCGGCCTGGGCAACCGCATGGCCTACGTGGTCGCG‑‑‑‑‑CGCCGCCTGCTGTCGGCCGAAGGCGAACAGCTGCCGGCGCCA‑GAAGGCCCACTGGCGATc > 1:1119581/1‑150 (MQ=255) aGTCTATTCTCGCCGAGTACCGCCTGGAGCTCATAGAAGACCTGCTCGAAGACATCGGCCTGGGCAACCGCATGGCCTACGTGGTCGCG‑‑‑‑‑CGCCGCCTGCTGTCGGCCGAAGGCGAACAGCTGCCGGCGCCA‑GAAGGCCCACTGGCGATcc > 1:1128621/1‑150 (MQ=255) tCTATTCTCGCCGAGTACCGCCTGGAGCTCATAGAAGACCTGCTCGAAGACATCGGCCTGGGCAACCGCATGGCCTACGTGGTCGCG‑‑‑‑‑CGCCGCCTGCTGTCGGCCGAAGGCGAACAGCTGCCGGCGCCA‑GAAGGCCCACTGGCGATCcgc > 2:1060657/1‑150 (MQ=255) tATTCTCGCCGAGTACCGCCTGGAGCTCATAGAAGACCTGCTCGAAGACATCGGCCTGGGCAACCGCATGGCCTACGTGGTCGCG‑‑‑‑‑CGCCGCCTGCTGTCGGCCGAAGGCGAACAGCTGCCGGCGCCA‑GAAGGCCCACTGGCGATCCGCgg > 2:1706685/1‑150 (MQ=255) aTTCTCGCCGAGTACCGCCTGGAGCTCATAGAAGACCTGCTCGAAGACATCGGCCTGGGCAACCGCATGGCCTACGTGGTCGCG‑‑‑‑‑CGCCGCCTGCTGTCGGCCGAAGGCGAACAGCTGCCGGCGCCA‑GAAGGCCCACTGGCGATCCGCGGc > 1:387168/1‑150 (MQ=255) tctcGCCGAGTACCGCCTGGAGCTCATAGAAGACCTGCTCGAAGACATCGGCCTGGGCAACCGCATGGCCTACGTGGTCGCG‑‑‑‑‑CGCCGCCTGCTGTCGGCCGAAGGCGAACAGCTGCCGGCGCCA‑GAAGGCCCACTGGCGATCCGCGGCAc < 2:2424432/150‑1 (MQ=255) gTACCGCCTGGAGCTCATAGAAGACCTGCTCGAAGACATCGGCCTGGGCAACCGCATGGCCTACGTGGTCGCG‑‑‑‑‑CGCCGCCTGCTGTCGGCCGAAGGCGAACAGCTGCCGGCGCCA‑GAAGGCCCACTGGCGATCCGCGGCACCGAAGGCCt < 1:924606/150‑1 (MQ=255) tACCGCCTGGAGCTCATAGAAGACCTGCTCGAAGACATCGGCCTGGGCAACCGCATGGCCTACGTGGTCGCG‑‑‑‑‑CGCCGCCTGCTGTCGGCCGAAGGCGAACAGCTGCCGGCGCCA‑GAAGGCCCACTGGCGATCCGCGGCACCGAAGGCCTg > 2:957430/1‑150 (MQ=255) aCCGCCTGGAGCTCATAGAAGACCTGCTCGAAGACATCGGCCTGGGCAACCGCATGGCCTACGTGGTCGCG‑‑‑‑‑CGCCGCCTGCTGTCGGCCGAAGGCGAACAGCTGCCGGCGCCA‑GAAGGCCCACTGGCGATCCGCGGCACCGAAGGCCTgg < 1:482744/150‑1 (MQ=255) aCCGCCTGGAGCTCATAGAAGACCTGCTCGAAGACATCGGCCTGGGCAACCGCATGGCCTACGTGGTCGCG‑‑‑‑‑CGCCGCCTGCTGTCGGCCGAAGGCGAACAGCTGCCGGCGCCA‑GAAGGCCCACTGGCGATCCGCGGCACCGAAGGCCTgg < 1:2247689/150‑1 (MQ=255) cTGGAGCTCATAGAAGACCTGCTCGAAGACATCGGCCTGGGCAACCGCATGGCCTACGTGGTCGCG‑‑‑‑‑CGCCGCCTGCTGTCGGCCGAAGGCGAACAGCTGCCGGCGCCA‑GAAGGCCCACTGGCGATCCGCGGCACCGAAGGCCTGGTGCTc > 2:763004/1‑150 (MQ=255) tGGAGCTCATAGAAGACCTGCTCGAAGACATCGGCCTGGGCAACCGCATGGCCTACGTGGTCGCG‑‑‑‑‑CGCCGCCTGCTGTCGGCCGAAGGCGAACAGCTGCCGGCGCCA‑GAAGGCCCACTGGCGATCCGCGGCACCGAAGGCCTGGTGCTCa < 1:1063250/150‑1 (MQ=255) cATAGAAGGCCTGCTCGAAGACATCGGCCTGGGCATCTGCATGGCCTACGTGGTCGCG‑‑‑‑‑CGCCGCCTGCTGTCGGCCGAAGGCGAACAGCTGCCGGCGCCA‑GAAGGCCCACTGGCGATCCGCGGCACCGAAGGCCTGGTGCTCAGCTACGc < 2:1145542/150‑1 (MQ=255) aTAGAAGACCTGCTCGAAGACATCGGCCTGGGCAACCGCATGGCCTACGTGGTCGCG‑‑‑‑‑CGCCGCCTGCTGTCGGCCGAAGGCGAACAGCTGCCGGCGCCA‑GAAGGCCCACTGGCGATCCGCGGCAc > 2:711277/1‑125 (MQ=255) aTAGAAGACCTGCTCGAAGACATCGGCCTGGGCAACCGCATGGCCTACGTGGTCGCG‑‑‑‑‑CGCCGCCTGCTGTCGGCCGAAGGCGAACAGCTGCCGGCGCCA‑GAAGGCCCACTGGCGATCCGCGGCAc < 1:711277/125‑1 (MQ=255) aTAGAAGACCTGCTCGAAGACATCGGCCTGGGCAACCGCATGGCCTACGTGGTCGCG‑‑‑‑‑CGCCGCCTGCTGTCGGCCGAAGGCGAACAGCTGCCGGCGCCA‑GAAGGCCCACTGGCGATCCGCGGCACCGAAGGCCTGGTGCt > 1:2212865/1‑140 (MQ=255) aTAGAAGACCTGCTCGAAGACATCGGCCTGGGCAACCGCATGGCCTACGTGGTCGCG‑‑‑‑‑CGCCGCCTGCTGTCGGCCGAAGGCGAACAGCTGCCGGCGCCA‑GAAGGCCCACTGGCGATCCGCGGCACCGAAGGCCTGGTGCTCAGCTACGcc > 1:385808/1‑150 (MQ=255) agaagaCCTGCTCGAAGACATCGGCCTGGGCAACCGCATGGCCTACGTGGTCGCG‑‑‑‑‑CGCCGCCTGCTGTCGGCCGAAGGCGAACAGCTGCCGGCGCCA‑GAAGGCCCACTGGCGATCCGCGGCACCGAAGGCCTGGTGCTCAGCTACGCCaa > 1:2165154/1‑150 (MQ=255) gaagaCCTGCTCGAAGACATCGGCCTGGGCAACCGCATGGCCTACGTGGTCGCG‑‑‑‑‑CGCCGCCTGCTGTCGGCCGAAGGCGAACAGCTGCCGGCGCCA‑GAAGGCCCACTGGCGATCCGCGGCACCGAAGGCCTGGTGCTCAGCTACGCCAAg < 1:1328884/150‑1 (MQ=255) aagaCCTGCTCGAAGACATCGGCCTGGGCAACCGCATGGCCTACGTGGTCGCG‑‑‑‑‑CGCCGCCTGCTGTCGGCCGAAGGCGAACAGCTGCCGGCGCCA‑GAAGGCCCACTGGCGATCCGCGGCACCGAAGGCCTGGTGCTCAGCTACGCCAAGt > 2:2272918/1‑150 (MQ=255) gAAGACATCGGCCTGGGCAACCGCATGGCCTACGTGGTCGCG‑‑‑‑‑CGCCGCCTGCTGTCGGCCGAAGGCGAACAGCTGCCGGCGCCA‑GAAGGCCCACTGGCGa > 1:137157/1‑100 (MQ=255) gAAGACATCGGCCTGGGCAACCGCATGGCCTACGTGGTCGCG‑‑‑‑‑CGCCGCCTGCTGTCGGCCGAAGGCGAACAGCTGCCGGCGCCA‑GAAGGCCCACTGGCGa < 2:137157/100‑1 (MQ=255) gAAGACATCGGCCTGGGCAACCGCATGGCCTACGTGGTCGCG‑‑‑‑‑CGCCGCCTGCTGTCGGCCGAAGGCGAACAGCTGCCGGCGCCA‑GAAGGCCCACTGGCGATCCGCGGCACCGAAGGCCTGGTGCTCAGCTACGCCAAGTGCTGCACGCCg > 1:507750/1‑150 (MQ=255) aGACATCGGCCTGGGCAACCGCATGGCCTACGTGGTCGCG‑‑‑‑‑CGCCGCCTGCTGTCGGCCGAAGGCGAACAGCTGCCGGCGCCA‑GAAGGCCCACTGGCGATCCGCGGCCCCTAAGGCCTGGTGCTCAGCTACGCCAAGTGCTGCACGCCGAt < 1:958881/150‑1 (MQ=255) 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tCGGCCTGGGCAACCGCATGGCCTACGTGGTCGCG‑‑‑‑‑CGCCGCCTGCTGTCGGCCGAAGGCGAACAGCTGCCGGCGCCA‑GAAGGCCCACTGGCGATCCGCGGCACCGAAGGCCTGGTGCTCAGCTACGCCAAGTGCTGCACGCCGATCCCgg < 2:2165154/150‑1 (MQ=255) tGGGCAACCGCATGGCCTACGTGGTCGCG‑‑‑‑‑CGCCGCCTGCTGTCGGCCGAAGGCGAACAGCTGCCGGCGCCA‑GAAGGCCCACTGGCGATCCGCGGCACCGAAGGCCTGGTGCTCAGCTACGCCAAGTGCTGCACGCCGATCCCGGGTGAcc < 2:387168/150‑1 (MQ=255) gtgCAACCGCATGGACTCCGTGGTCGCG‑‑‑‑‑CGGTGGCCGCTGGCGGCCGAACGCGAACAGCTGCCGGCGCCA‑GAAGGCCCACTGGCGATCCGCGGCACCGAAGGCCTGGTGCTCAGCTACGCCAAGTGCTGCACGCCGATCCCGGGTGAccc < 2:1841354/148‑1 (MQ=255) gCAACCGCATGGCCTACGTGGTCGCG‑‑‑‑‑CGCCGCCTGGTGTCGGCCGAAGGCGAACAGCTGCCGGCGCCA‑GAAGGCCCACTGGCGATCCGCGGCACCGAAGGCCTGGTGCTCAGCTACGCCGAGTGCTGCACGCCGATCCCGGGTGACCCGa > 2:1277976/1‑150 (MQ=255) cAACCGCATGGCCTACGTGGTCGCG‑‑‑‑‑CGCCGCCTGCTGTCGGCCGAAGGCGAACAGCTGCCGGCGCCA‑GAAGGCCCACTGGCGATCCGCGGCACCGAAGGCCTGGTGCTCAGCTACGCCAAGTGCTGCACGCCGATCCCGGGTGACCCGAt < 2:1119581/150‑1 (MQ=255) cAACCGCATGGCCTACGTGGTCGCG‑‑‑‑‑CGCCGCCTGCTGTCGGCCGAAGGCGAACAGCTGCCGGCGCCA‑GAAGGCCCACTGGCGATCCGCGGCACCGAAGGCCTGGTGCTCAGCTACGCCAAGTGCTGCACGCCGATCCCGGGTGACCCGAt < 1:363420/150‑1 (MQ=255) aaCCGCATGGCCTACGTGGTCGCG‑‑‑‑‑CGCCGCCTGCTGTCGGCCGAAGGCGAACAGCTGCCGGCGCCA‑GAAGGCCCACTGGCGATCCGCGGCACCGAAGGCCTGGTGCTCAGCTACGCCAAGTGCTGCACGCCGATCCCGGGTGACCCGAtt < 1:991807/150‑1 (MQ=255) aaCCGCATGGCCTACGTGGTCGCG‑‑‑‑‑CGCCGCCTGCTGTCGGCCGAAGGCGAACAGCTGCCGGCGCCA‑GAAGGCCCACTGGCGATCCGCGGCACCGAAGGCCTGGTGCTCAGCTACGCCAAGTGCTGCACGCCGATCCCGGGTGACCCGAtt > 2:2266115/1‑150 (MQ=255) ccGNATGGCCTACGTGGTCGCG‑‑‑‑‑CGCCGCCTGCTGTCGGCCGAAGGCGAACAGCTGCCGGCGCCA‑GAAGGCCCACTGGCGATCCGCGGCACCGAAGGCCTGGTGCTCAGCTACGCCAAGTGCTGCACGCCGATCCCGGGTGACCCGATTGt > 2:1498558/1‑150 (MQ=255) ccGCATGGCCTACGTGGTCGCG‑‑‑‑‑CGCCGCCTGCTGTCGGCCGAAGGCGAACAGCTGCCGGCGCCA‑GAAGGCCCACTGGCGATCCGCGGCACCGAAGGCCTGGTGCTCAGCTACGCCAAGTGCTGCACGCCGATCCCGGGTGACCCGATTGt < 1:986771/150‑1 (MQ=255) 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cagctgttcgccttcggccgacagcaggcggcgcgcgacCACGTAGGCCCACTGGCGATCCGCGGCACCGAAGGCCTGGTGCTCAGCTACGCCAAGTGCTGCACGCCGATCCCGGGTGACCCGATTGTCGGCCACCTGTCGGCCGGCAAg < 1:1509562‑M2/111‑1 (MQ=255) GCCGCCTGCTGTCGGCCGAAGGCGAACAGCTGCCGGCGCCA‑GAAGGCCCACTGGCGATCCGCGGCACCGAAGGCCTGGTGCTCAGCTACGCCAAGtgctg > 1:1682325‑M1/1‑100 (MQ=255) GCCGCCTGCTGTCGGCCGAAGGCGAACAGCTGCCGGCGCCA‑GAAGGCCCACTGGCGATCCGCGGCACCGAAGGCCTGGTGCTCAGCTACGCCAAGtgctg < 2:1682325‑M1/100‑1 (MQ=255) GCCGCCTGCTGTCGGCCGAAGGCGAACAGCTGCCGGCGCCA‑GAAGGCCCACTGGCGATCCGCGGCACCGAAGGCCTGGTGCTCAGCTACGCCAAGTGCTGCACGCCGATCCCGGGTGACCCGATTGTCGGCCACCTGTCGGCCGGCAAgg > 1:763004‑M1/1‑150 (MQ=255) ccggcagctgttcgccttcggccgacagcaggcggcgcCA‑GAAGGCCCACTGGCGATCCGCGGCACCGAAGGCCTGGTGCTCAGCTACGCCAAGTGCTGCACGCCGa < 1:1700667‑M2/69‑1 (MQ=255) ccggcagctgttcgccttcggccgacagcaggcggcgcCA‑GAAGGCCCACTGGCGATCCGCGGCACCGAAGGCCTGGTGCTCAGCTACGCCAAGTGCTGCACGCCGa > 2:1700667‑M2/39‑107 (MQ=255) CGCCTGCTGTCGGCCGAAGGCGAACAGCTGCCGGCGCCA‑GAAGGCCCACTGGCGATCCGCGGCACCGAAGGCCTGGTGCTCAGCTACGCCAAGTGCTGCACGCCGATCCCGGGTGACCCGATTGTCGGCCACCTGTCGGCCGGCAAGGGc < 1:2212437‑M1/150‑1 (MQ=255) CGCCTGCTGTCGGCCGAAGGCGAACAGCTGCCGGCGCCA‑GAAGGCCCACTGGCGATCCGCGGCACCGAAGGCCTGGTGCTCAGCTACGCCAAGTGCTGCACGCCGATCCCGGGTGACCCGATTGTCGGCCACCTGTCGGCCGGCAAGGGc < 1:1286104‑M1/150‑1 (MQ=255) CGCCTGCTGTCGGCCGAAGGCGAACAGCTGCCGGCGCCA‑GAAGGCCCACTGGCGATCCGCGGCACCGAAGGCCTGGTGCTCAGCTACGCCAAGTGCTGCACGCCGATCCCGGGTGACCCGATTGTCGGCCACCTGTCGGCCGGCAAGGGc > 2:507750‑M1/1‑150 (MQ=255) ctgctgTCGGCTGAAGGCGAACAGCGGCCGGCGCCA‑GAAGGCCCACTGGCGATCCGCGGCACCGAAGGCCTGGTGCTCAGCTACGCCAAGTGCTGCACGCCGATCCCGGGTGACCCGATTGTCGGCCACCTGTCGGCCGGCAAGGGCATg < 2:616639/150‑1 (MQ=255) ctgTCGGCCGAAGGCGAACAGCTGCCGGCGCCA‑GAAGGCCCACTGGCGATCCGCGGCACCGAAGGCCTGGTGCTCAGCTACGCCAAGTGCTGCACGCCGATCCCGGGTGACCCGATTGTCGGCCACCTGTCGGCCGGCAAGGGCATGGTc > 2:1138819/1‑150 (MQ=255) ctgTCGGCCGAAGGCGAACAGCTGCCGGCGCCA‑GAAGCCCCACTGGCGATCCGCGGCACCGAAGGCCTGGTGCTCAGCTACGCCAAGTGCTGCACGCCGATCCCGGGTGACCCGATTGTCGGCCACCTGTCGGCCGGCAAGGGCATGGTc < 1:1706685/150‑1 (MQ=255) tCGGCCGAAGGCGAACAGCTGCCGGCGCCA‑GAAGGCCCACTGGCGATCCGCGGCACCGAAGGCCTGGTGCTCAGCTACGCCAAGTGCGGCACGCCGATCCCGGGTGACCCGATTGTCGGCCACCTGTCGGCCGGCAAGGGCATGGTCGTg < 1:251900/150‑1 (MQ=255) ggCNGAAGGCGAACAGCTGCCGGCGCCA‑GAAGGCCCACTGGCGATCCGCGGCACCGAAGGCCTGGTGCTCAGCTACGCCAAGTGCTGCACGCCGATCCCGGGTGACCCGATTGTCGGCCACCTGTCGGCCGGCAATGGCATGGTCGTGCa > 2:1501785/1‑150 (MQ=255) ggCCGAAGGCGAACAGCTGCCGGCGCCA‑GAAGGCCCACTGGCGATCCGCGGCACCGAAGGCCTGGTGCTCAGCTACGCCAAGTGCTGCACGCCGATCCCCGGTGACCCGACTGTCGGCCACCTGACGGCCTGCAAGGGCATGGTCGTGcc > 2:515819/1‑149 (MQ=255) gCCGAAGGCGAACAGCTGCCGGCGCCA‑GAAGGCCCACTGGCGATCCGCGGCACCGAAGGCCTGGTGCTCAGCTACGCCAAGTGCTGCACGCCGATCCCGGGTGACCCGATTGTCGGCCAGCTGTCGGCCGGCAACGGCATGGTCGTGCAc < 1:2300836/150‑1 (MQ=255) cGAAGGCGAACAGCTGCCGGCGCCA‑GAAGGCCCACTGGCGATCCGCGGCACCGAAGGCCTGGTGCTCAGCTACGCCAAGTGCTGCACGCCGATCCCGGGTGACCCGATTGTCGGCCACCTGTCGGCCGGCAAGGGCATGGTCGTGCACCt > 2:1368795/1‑150 (MQ=255) gAAGGCGAACAGCTGCCGGCGCCA‑GAAGGCCCACTGGCGATCCGCGGCACCGAAGGCCTGGTGCTCAGCTACGCCAAGTGCTGCACGCCGATCCCGGGTGACCCGATTGTCGGCCACCTGTCGGCCGGCAAGGGCATGGTCGTGCACCTg < 1:507736/150‑1 (MQ=255) aGGCGAACAGCTGCCGGCGCCA‑GAAGGCCCACTGGCGATCCGCGGCACCGAAGGCCTGGTGCTCAGCTACGCCAAGTGCTGCACGCCGATCCCGGGTGACCCGATTGTCGGCCACCTGTCGGCCGGCAAGGGCATGGTCGTGCACCTGga < 2:1818071/150‑1 (MQ=255) aGGCGAACAGCTGCCGGCGCCA‑GAAGGCCCACTGGCGATCCGCGGCACCGAAGGCCTGGTGCTCAGCTACGCCAAGTGCTGCACGCCGATCCCGGGTGACCCGATTGTCGGCCACCTGTCGGCCGGCAAGGACATGGTCGTGCACCTGga < 2:335166/150‑1 (MQ=255) aGGCGAACAGCTGCCGGCGCCA‑GAAGGCCCACTGGCGATCCGCGGAACCGAATTCCTGGTGCTCAGCTACGCCAAGTGCTGCACGCCGATCCCGGGTGACCCGATTGTCGGCCACCTGTCGGCCGGCAAGGGCATGGTCGTGCACCTGga > 1:1879234/1‑150 (MQ=255) gAACAGCTGCCGGCGCCA‑GAAGGCCCACTGGCGATCCGCGGCACCGAAGGCCTGGTGCTCAGCTACGCCAAGTGCTGCACGCCGATCCCGGGTGACCCGATTGTCGGCCACCTGTCGGCCGGCAAGGGCATGGTCGTGCACCTGGAGAAc > 1:506832/1‑150 (MQ=255) gAACAGCTGCCGGCGCCA‑GAAGGCCCACTGGCGATCCGCGGCACCGAAGGCCTGGTGCTCAGCTACGCCAAGTGATGCACGCCGATCCCGTGTGACCCGATTGTCTGCCACCTGTCGGCCGTCATGGGGATGGTCGTGCACCGGGACAAc > 2:1084647/1‑150 (MQ=255) aaCAGCTGCCGGCGCCA‑GAAGGCCCACTGGCGATCCGCGGCACCGAAGGCCTGGTGCTCAGCTACGCCAAGTGCTGCACGCCGATCCCGGGTGACCCGATTGTCGGCCACCTGTCGGCCGGCAAGGGCATGGTCGTGCACCTGGAGAACt > 1:1517341/1‑150 (MQ=255) aGCTGCCGGCGCCA‑GAAGGCCCACTGGCGATCCGCGGCACCGAAGGCCTGGTGCTCAGCTACGCCAAGTGCTGCACGCCGATCCCGGGTGACCCGATTGTCTGCCACCTGTCGGCCGGCAAGGGCATGGTCGTGCACCTGGAGAACTGcc < 1:2272918/150‑1 (MQ=255) aGCTGCCGGCGCCA‑GAAGGCCCACTGGCGATCCGCGGCACCGAAGGCCAGGTGCTCAGCTACGCCAAGTGCTGCACGCCGATCCCGGGTGACCCGATTGTCGGCCACCTGTCGGCCGGCAAGGGCATGGTCGTGCACCTGGAGAACTGcc > 2:332750/1‑150 (MQ=255) ccGGCGCCA‑GAAGGCCCACTGGCGATCCGCGTCACCGAAGGCCTGGTGCTCAGCTACGCCAAGTGCTGCACGCCGATCCCGGGTGACCCGATTGTCGGCCACCTGTCGGCCGGCAAGGGCATGGTCGTGCACCTGGAGAACTGCCGCAAc < 1:840173/150‑1 (MQ=255) cgcCA‑GAAGGCCCACTGGCGATCCGCGGCACCGAAGGCCTGGTGCTCAGCTACGCCAAGTGCTGCACGCCGATCCCGGGTGACCCGATTGTCGGCCACCTGTCGGCCGGCAAGGGCATGGTCGTGCACCTGGAGAACTGCCGCAACATCa < 1:1180481‑M2/147‑1 (MQ=255) cCA‑GAAGGCCCACTGGCGATCCGCGGCACCGAAGGCCTGGTGCTCAGCTACGCCAAGTGCTGCACGCCGATCCCGGGTGACCCGATTGTCGGCCACCTGTCGGCCGGCAAGGGCATGGTCGTGCACCTGGAGAACTGCCGCAACATCAGt < 1:1287949‑M2/149‑1 (MQ=255) | TCCCCCAGGAACGCATCCAGTCTATTCTCGCCGAGTACCGCCTGGAGCTCATAGAAGACCTGCTCGAAGACATCGGCCTGGGCAACCGCATGGCCTACGTGGTCGCG‑‑‑‑‑CGCCGCCTGCTGTCGGCCGAAGGCGAACAGCTGCCGGCGCCA‑GAAGGCCCACTGGCGATCCGCGGCACCGAAGGCCTGGTGCTCAGCTACGCCAAGTGCTGCACGCCGATCCCGGGTGACCCGATTGTCGGCCACCTGTCGGCCGGCAAGGGCATGGTCGTGCACCTGGAGAACTGCCGCAACATCAGT > NC_002947/6050708‑6051003 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |