New junction evidence | |||||||||||
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seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1231348 | 52 (1.200) | 3 (0.070) | 3/252 | NT | 5.9% | coding (1371/1545 nt) | glpD | aerobic glycerol‑3‑phosphate dehydrogenase |
? | NC_002947 | = 1231385 | 44 (1.020) | coding (1334/1545 nt) | glpD | aerobic glycerol‑3‑phosphate dehydrogenase |
TTGCGGGCTTGTTGCAGATACGCCTCCAGGGCCATCTGCTCCTGCGCGGTCAGCGACAGGCCCAGCTTGGTGCGACGCCAGATAATGTCAGCGGTTTGCTCTGCCCATTCCTCCTCCAGCAGGTAATCCACCTCGCGGGTGAACAGCCCGGCCCCGATAGCCTGCCCGAGGTCTTCGGGGCCGTGAACGCCATCGAGCAGCCGCCACACGCGGCTGCCGTAAGTGAGCACCCAGCGTTTGGCCAGGTCGACAGGCAACCAGCCGCAACGTGCCAGTACGGCATCGATCAGCGCCT > NC_002947/1231202‑1231496 | ttGCGGGCTTGTTGCAGATACGCCTCCAGGGCCATCTGCTCCTGCGCGGTCAGCGACAGGCCCAGCTTGGTGCGACGCCAGATAATGTCAGCGGTTTGCTCTGCCCATTCCTCCTCCAGCAGGTAATCCACCTCGCGGGTGAACAGCCCg < 1:764880/150‑1 (MQ=255) ggCTTGTTGCAGATACGCCTCCAGGGCCATCTGCTCCTGCGCGGTCAGCGACAGGCCCAGCTTGGTGCGACGCCAGATAATGTCAGCGGTTTGCTCTGCCCATTCCTCCTCCAGCAGGTAATCCACCTCGCGGGTGAACAGCCCGGcccc < 2:413241/150‑1 (MQ=255) ttgttgCAGATACGCCTCCAGGGCCATCTGCTCCTGCGCGGTCAGCGACAGGCCCAGCTTGGTGCGACGCCAGATAATGTCAGCGGTTTGCTCTGCCCATTCCTCCTCCAGCAGGTAATCCACCTCGCGGGTGAACAGCCCGGCCCCGAt < 2:690973/150‑1 (MQ=255) ttgCAGATACGCCTCCAGGGCCATCTGCTCCTGCGCGGTCAGCGACAGGCCCAGCTTGGTGCGACGCCAGATAATGTCAGCGGTTTGCTCTGCCCATTCCTCCTCCAGCAGGTAATCCACCTCGCGGGTGAACAGCCCGGCCCCGATAGc > 2:428797/1‑150 (MQ=255) tgCAGATACGCCTCCAGGGCCATCTGCTCCTGCGCGGTCAGCGACAGGCCCAGCTTGGTGCGACGCCAGATAATGTCAGCGGTTTGCACTGCCCATTCCTCCTCCAGCAGGTAATCCACCTCGCGGGTGAACAGCCCGGCCCCGATAGcc < 2:82298/150‑1 (MQ=255) aCGCCTCCAGGGCCATCTGCTCCTGCGCGGTCAGCGACAGGCCCAGCTTGGTGCGACGCCAGATAATGTCAGCGGTTTGCTCTGCCCATTCCTCCTCCAGCAGGTAATCCACCTCGCGGGTGAACAGCCCGGCCCCGATAGCCTGCCCGa < 1:924917/150‑1 (MQ=255) gCCTCCAGGGCCATCTGCTCCTGCGCGGTCAGCGACAGGCCCAGCTTGGTGCGACGCCAGATAATGTCAGCGGTTTGCTCTGCCCATTCCTCCTCCAGCAGGTAATCCACCTCGCGGGTGAACAGCCCGGCCCCGATAGCCTGCCCGAgg > 1:85356/1‑150 (MQ=255) cTCCAGGGCCATCTGCTCCTGCGCGGTCAGCGACAGGCCCAGCTTGGAGCGACCCCGGATAATGTCAGCGGTTTGCTCTGCCCATTCCTCCTCCAGCAGGTAAGCCACCTCGCGGGTGAACAGCCCGGCCCCGGTAGCCTGccctgtggc > 2:709560/1‑144 (MQ=255) gCCATCTGCTCCTGCGCGGTCAGCGACAGGCCCAGCTTGGTGCGACGCCAGATAATGTCAGCGGTTTGCTCTGCCCATTCCTCCTCCAGCAGGTAATCCACCTCGCGGGTGAACAGCCCGGCCCCGATAGCCTGCCCGAGGTCTTCgggg > 2:946015/1‑150 (MQ=255) cATCTGCTCCTGCGCGGTCAGCGACAGGCCCAGCTTGGTGCGACGCCAGATAATGTCAGCGGTTTGCTCTGCCCATTCCTCCTCCAGCAGGTAATCCACCTCGCGGGTGAACAGCCCGGCCCCGATAGCCTGCCCGAGGTCTTCGGGGcc > 2:813477/1‑150 (MQ=255) cATCTGCTCCTGCGCGGTCAGCGACAGGCCCAGCTTGGTGCGACGCCAGATAATGTCAGCGGTTTGCTCTGCCCATTCCTCCTCCAGCAGGTAATCCACCTCGCGGGTGAACAGCCCGGCCCCGATAGCCTGCCCGAGGTCTTCGGGGcc < 1:51967/150‑1 (MQ=255) aTCTGCTCCTGCGCGGTCAGCGACAGGCCCAGCTTGGTGCGACGCCAGATAATGTCAGCGGTTTGCTCTGCCCATTCCTCCTCCAGCAGGTAATCCACCTCGCGGGTGAACAGCCCGGCCCCGATAGCCTGCCCGAGGTCTTCGGGGCCg < 2:176177/150‑1 (MQ=255) tGCTCCTGCGCGGTCAGCGACAGGCCCAGCTTGGTGCGACGCCAGATAATGTCAGCGGTTTGCTCTGCCCATTCCTCCTCCAGCAGGTAATCCACCTCGCGGGTGAACAGCCCGGCCCCGATAGCCTGCCCGAGGTCTTCGGGGCCGTGa > 1:211718/1‑150 (MQ=255) cTCCTGCGCGGTCAGCGACAGGCCCAGCTTGGTGCGACGCCAGATAATGTCAGCGGTTTGCTCTGCCCATTCCTCCTCCAGCAGGTAATCCACCTCGCGGGTGAACAGCCCGGCCCCGATAGCCTGCCCGAGGTCTTCGGGGCCGTGAAc < 1:381015/150‑1 (MQ=255) cTCCTGCGCGGTCAGCGACAGGCCCAGCTTGGTGCGACGCCAGATAATGTCAGCGGTTTGCTCTGCCCATTCCTCCTCCAGCAGGTAATCCACCTCGCGGGTGAACAGCCCGGCCCCGATAGCCTGCCCGAGGTCTTCGGGGCCGTGAAc < 1:1076701/150‑1 (MQ=255) cgcgGTCAGCGACAGGCCCAGCTTGGTGCGACGCCAGATAATGTCAGCGGTTTGCTCTGCCCATTCCTCCTCCAGCAGGTAATCCACCTCGCGGGTGAACAGCCCGGCCCCGATAGCCTGCCCGAGGTCTTCGGGGCCGTGAACGCCATc < 2:211718/150‑1 (MQ=255) cgGTCAGCGACAGGCCCAGCTTGGTGCGACGCCAGATAATGTCAGCGGTTTGCTCTGCCCATTCCTCCTCCAGCAGGTAATCCACCTCGCGGGTGAACAGCCCGGCCCCGATAGCCTGCCCGAGGTCTTCGGGGCCGTGAACGCCATCGa < 1:813477/150‑1 (MQ=255) ggTCAGCGACAGGCCCAGCTTGGTGCGACGCCAGATAATGTCAGCGGTTTGCTCTGCCCATTCCTCCTCCAGCAGGTAATCCACCTCGCGGGTGAACAGCCCGGCCCCGATAGCCTGCCCGAGGTCTTCGGGGCCATGAACTCCATCGag < 1:1019221/150‑1 (MQ=255) tCAGCGACAGGCCCAGCTTGGTGCGACGCCAGATAATGTCAGCGGTTTGCTCTTCCCATTCCTCCTCCAGCAGGTAATCCACCTCGCGGGTGAACAGCCCGGCCCCGATAGCCTGCCCGAGGTCTTCGGGGCCGTGAACGCCATCGagca > 1:308194/1‑150 (MQ=255) aGCGACAGGCCCAGCTTGGTGCGACGCCAGATAATGTCAGCGGTTTGCTCTGCCCATTCCTCCTCCAGCAGGTAATCCACCTCGCGGGTGAACAGCCCGGCCCCGATAGCCTGCCCGAGGTCTTCGGGGCCGTGAACGCCATCGagcagc > 1:873568/1‑150 (MQ=255) gCGACAGGCCCAGCTTGGTGCGACGCCAGATAATGTCAGCGGTTTGCTCTGCCCATTCCTCCTCCAGCAGGTAATCCACCTCGCGGGTGAACAGCacggccccgaagacctcgggcaggctatcggggccgggctgttcacccgcgaggt < 1:840030‑M1/150‑56 (MQ=255) aCAGGCCCAGCTTGGTGCGACGCCAGATAATGTCAGCGGTTTGCTCTGCCCATTCCTCCTCCAGCAGGTAATCCACCTCGCGGGTGAACAGCCCGGCCCCGATAGCCTGCCCGAg > 2:565074/1‑115 (MQ=255) aCAGGCCCAGCTTGGTGCGACGCCAGATAATGTCAGCGGTTTGCTCTGCCCATTCCTCCTCCAGCAGGTAATCCACCTCGCGGGTGAACAGCCCGGCCCCGATAGCCTGCCCGAg < 1:565074/115‑1 (MQ=255) aCAGGCCCAGCTTGGTGCGACGCCAGATAATGTCAGCGGTGTGCTCTGGCCATGACTCCTCCAGCAGGTAATCCACCTCGCGGGTGAACAGCCCGGACCCGATAGCCTGCCCGCGGGCTTCGGGGCCGTGAACACGAACGAGCAgccgcc > 2:529705/1‑150 (MQ=255) gCCCAGCTTGGTGCGACGCCAGATAATGTCAGCGGTTTGCTCTGCCCATTCCTCCTCCAGCAGGTAATCCACCTCGCGGGTGAACAGCCCGGCCCCGATAGCCTGCCCGAGGTCTTCGGGGCCGTGAACGCCATCGAGCAGCCGCCacac > 1:44089/1‑150 (MQ=255) aGCTTGGTGCGACGCCAGATAATGTCAGCGGTTTGCTCTGCCCATTCCTCCTCCAGCAGGTAATCCACCTCGCGGGTGAACAGCCCGGCCCCGATAGCCTGCCCGAGGTCTTCGGGGCCGTGAACGCCATCGAGCAGCCGCCACACGCgg < 1:48536/150‑1 (MQ=255) gCTTGGTGCGACGCCAGATAATGTCAGCGGTTTGCTCTGCCCATTCCTCCTCCAGCAGGTAATCCACCTCGCGGGTGAACAGCCCGGCCCCGATAGCCTGCCCGAGGTCTTCGGGGCCGTGAACGCCATCGAGCAGCCGCCACACGCGGc > 1:83070/1‑150 (MQ=255) ggTGCGACGCCAGATAATGTCAGCGGTTTGCTCTGCCCATTCCTCCTCCAGCAGGTAATCCACCTCGCGGGTGAACAGCCCGGCCCCGATAGCCTGCCCGAGGTCTTCGGGGCCGTGAACGCCATCGAGCAGCCGCCACACGCGGCTGcc < 2:424165/150‑1 (MQ=255) gCGACGCCAGATAATGTCAGCGGTTTGCTCTGCCCATTCCTCCTCCAGCAGGTAATCCACCTCGCGGGTGAACAGCCCGGCCCCGATAGCCTGCCCGAGGTCTTCGGGGCCGTGAACGCCATCGAGCAGCCGCCACACGCGGCTGCCGTa > 1:483047/1‑150 (MQ=255) gCCAGATAATGTCAGCGGTTTGCTCTGCCCATTCCTCCTCCAGCAGGTAATCCACCTCGCGGGTGAACAGCCCGGCCCCGATAGCCTGCCCGAGGTCTTCGGGGCCGTGAACGCCATCGAGCAGCCGCCACACGCGGCTGCCGTAAGTGa > 2:78981/1‑150 (MQ=255) ccAGATAATGTCAGCGGTTTGCTCTGCCCATTCCTCCTCCAGCAGGTAATCCACCTCGCGGGTGAACAGCCCGGCCCCGATAGCCTGCCCGAGGTCTTCGGGGCCGTGAACGCCATCGAGCACCCGCCACACGCGGCTGCAGTAAGTGAg > 2:145988/1‑150 (MQ=255) aGCGGTTTGCTCTGCCCATTCCTCCTCCAGCAGGTAATCCACCTCGCGGGTGAACAGCCCGGCCCCGATAGCCTGCCCGAGGTCTTCGGGGCCGTGAACGCCATCGAGCAGCCGCCACACGCGGCTGCCGTAAGTGAGCACCCAGCGttt < 2:873568/150‑1 (MQ=255) gCGGTTTGCTCTGCCCATTCCTCCTCCAGCAGGTAATCCACCTCGCGGGTGAACAGCCCGGCCCCGATAGCCTGCCCGAGGTCTTCGGGGCCGTGAACGCCATCGAGCAGCCGCCACACGCGGCTGCCGTAAGTGAGCACCCAGCGTTTg < 1:946015/150‑1 (MQ=255) ttGCTCTGCCCATTCCTCCTCCAGCAGGTAATCCACCTCGCGGGTGAACAGCCCGGCCCCGATAGCCTGCCCGAGGTCTTCGGGGCCGTGAACGCCATCGAGCAGCCGCCACACGCGGCTGCCGTAAGTGAGCACCCAGCGTTTGGCCAg < 1:886277/150‑1 (MQ=255) tctGCCCATTCCTCCTCCAGCAGGTAATCCACCTCGCGGGTGAACAGCCCGGCCCCGATAGCCTGCCCGAGGTCTTCGGGGCCGTGAACGCCATCGAGCAGCCGCCACACGCGGCTGCCGTAAGTGAGCACCCAGCGTTTGGCCAGGTCg > 2:286674/1‑150 (MQ=255) gCCCATTCCTCCTCCAGCAGGTAATCCACCTCGCGGGTGAACAGCCCGGCCCCGATAGCCTGCCCGAGGTCTTCGGGGCCGTGAACGCCATCGAGCAGCCGCCACACGCGGCTGCCGTAAGTGAGCACCCAGCGTTTGGCCAGGTCGACa > 2:466211/1‑150 (MQ=255) gCCCATTCCCCCTCCAGCAGGTAATCCACCTCGCGGGTGAACAGCCCGGCCCCGATAGCCTGCCCGAGGTCTTCGGGGCCGTGAACGCCATCGAGCAGCCGCCACACGCGGCTGCCGTAAGTGAGCACCCAGCGTTTGTCCAGGTCGACa < 2:831836/150‑1 (MQ=255) cccATTCCTCCTCCAGCAGGTAATCCACCTCGCGGGTGAACAGCCCGGCCCCGATAGCCTGCCCGAGGTCTTCGGGGCCGTGAACGCCATCGAGCAGCCGCCACACGCGGCTGCCGTAAGTGAGCACCCAGCGTTTGGCCAGGTCGACAg > 2:447295/1‑150 (MQ=255) cccATTCCTCCTCCAGCAGGTAATCCACCTCGCGGGTGAACAGCCCGGCCCCGATAGCCTGCCCGAGGTCTTCGGGGCCGTGAACGCCATCGAGCAGCCGCCACACGAGGCTGCCGTAAGTGAGCACCCAGCGTTTGGCCAGGTGGACAg > 1:325383/1‑150 (MQ=255) aTTCCTCCTCCAGCAGGTAATCCACCTCGCGGGTGAACAGCCCGGCCCCGATAGCCTGCCCGAGGTCTTCGGGGCCGTGAACGCCATCGAGCAGCCGGAACACGCTGCTGCCGTAAGTGAGCACCCAGCGTTTGGCCAGGTCGACAGGCa > 2:309381/1‑150 (MQ=255) ctccAGCAGGTAATCCACCTCGCGGGTGAACAGCCCGGCCCCGATAGCCTGCCCGAGGTCTTCGGGGCCGTGAACGCCATCGAGCAGCCGCCACACGCGGCTGCCGTAAGTGAGCACCCAGCGTTTGGCCAGGTCGACAGGCAACCAGcc < 1:1099042/150‑1 (MQ=255) ctccAGCAGGTAATCCACCTCGCGGGTGAACAGCCCGGCCCCGATAGCCTGCCCGAGGTCTTCGGGGCCGTGAACGCCATCGAGCAGCCGCCACACGCGGCTGCCGTAAGTGAGCACCCAGCGTTTGGCCAGGTCGACAGGCAACCAGcc < 1:286674/150‑1 (MQ=255) ctccAGCAGGTAATCCACCTCGCGGGTGAACAGCCCGGCCCCGATAGCCTGCCCGAGGTCTTCGGGGCCGTGAACGCCATCGAGCAGCCGCCACACGCGGCTGCCGTAAGTGAGCACCCAGCGTTTGGCCAGGTCGACAGGCAACCAGcc > 1:658060/1‑150 (MQ=255) tccAGCAGGTAATCCACCTCGCGGGTGAACAGCCCGGCCCCGATAGCCTGCCCGAGGTCTTCGGGGCCGTGAACGCCATCGAGCAGCCGCCACACGCGGCTGCCGTAAGTGAGCACCCAGCGTTTGGCCAGGTCGACAGGCAACCAGCCg > 1:654830/1‑150 (MQ=255) cagcagGTAATCCACCTCGCGGGTGAACAGCCCGGCCCCGATAGCCTGCCCGAGGTCTTCGGGGCCGTGAACGCCATCGAGCAGCCGCCACACGCGGCTGCCGTAAGTGAGCACCCAGCGTTTGGCCa < 2:1040004/128‑1 (MQ=255) cagcagGTAATCCACCTCGCGGGTGAACAGCCCGGCCCCGATAGCCTGCCCGAGGTCTTCGGGGCCGTGAACGCCATCGACCAGCCGCCACACGCGGCTGCCGTAAGTGAGCACCCAGCGTTTGGCCa > 1:1040004/1‑128 (MQ=255) gcagGTAATCCACCTCGCGGGTGAACAGCCCGGCCCCGATAGCCTGCCCGAGGTCTTCGGGGCCGTGAACGCCATCGAGCAGCCGCCACACGCGGCTGCCGTAAGTGAGCACCCAGCGTTTGGCCAGGTCGACAGGCAACCAGCCGCAAc > 2:706781/1‑150 (MQ=255) cagGTAATCCACCTCGCGGGTGAACAGCCCGGCCCCGATAGCCTGCCCGAGGTCTTCGGGGCCGTGAACGCCATCGa > 1:227334/1‑77 (MQ=255) cagGTAATCCACCTCGCGGGTGAACAGCCCGGCCCCGATAGCCTGCCCGAGGTCTTCGGGGCCGTGAACGCCATCGa < 2:227334/77‑1 (MQ=255) agGTAATCCACCTCGCGGGTGAACAGCCCGGCCCCGATAGCCTGCCCGAGGTCTTCGGGGCCGTGAACGCCATCGAGCAGCCGCCACACGCGGCTGCCGTAAGTGAGCACCCAGCGTTTGGCCAGGTCGACAGGCAACCAGCCGCAACGt < 1:447295/150‑1 (MQ=255) ccACCTCGCGGGTGAACAGCacggccccgaagacctcgggcaggctatcggg > 1:6846‑M1/1‑20 (MQ=255) ccACCTCGCGGGTGAACAGCacggccccgaagacctcgggcaggctatcggg < 2:6846‑M1/52‑33 (MQ=255) aCCTCGCGGGTGAACAGCCCGGCCCCGATAGCCTGCCCGAGGTCTTCGGGGCCGTgctgttcacccgcgaggtggattacctgctggaggaggaatgggcagagcaaaccgctgacattatctggcgtcgcaccaagctgggcctgtcgc < 1:840030‑M2/150‑96 (MQ=255) cTCGCGGGTGAACAGCCCGGCCCCGATAGCCTGCCCGAg > 2:718573/1‑39 (MQ=255) cTCGCGGGTGAACAGCCCGGCCCCGATAGCCTGCCCGAg < 1:718573/39‑1 (MQ=255) tCGCGGGTGAACAGCCCGGCCCCGATAGCCTACCCGAGGTCTTAGGGGCCGTGAACGCCATCGAGCAGAAGACACACGCGGCTGCAGTAAGTGAGAACCCAGCGTTTGGAAAGGTCGAAAGGCAACCAGCCGAAACGTGACAGTACggga > 2:1077046/1‑148 (MQ=255) gAACAGCCCGGCCCCGATAGCCTGCCCGAGGTCTTCGGGGCCGTGAAAGATAAACAGCAGCCGCCACACGCGGCTGCCGTAAGTGAGCACCCAGCGTTTGGCCAGGTCGACAGGCAACCAGCCGCAACGTGCCAGTACGGCATCGATCAg > 1:630468/1‑150 (MQ=255) cAGCCCGGACCCGATAGCCTGCCCGAGGTCTTCGGGGCCGTGAACGCCATCGAGCAGCCGCCACACGCGGCTGCCGTAAGTGAGCACCCAGCGTTTGGAAAGGTCGACAGGCAACCAGCCGCAACGTGCCAGTACGGCATCGATCAgcgc < 2:432160/150‑1 (MQ=255) gCCCGGCCCTGGCCGCGTGTCCGAGGTCTTCGGGGCCGTGAACGCCATCGAGCAGCCGCCACACGCGGCTGCCGTAAGTGAGCACCCAGCGTTTGGCCAGGTCGACAGGCAACCAGCCGCAACGTGCCAGTACGGCATCAATCAGCGCCt < 2:308194/150‑1 (MQ=255) gCCCGGCCCCGATAGCCTGCCCGAGGTCTTCGGGGCCGTGAACGCCATCGAGCAGCCGCCACACGCGGCTGCCGTAAGTGAGCACCCAGCGTTTGGCCAGGTCGACAGGCAACCAGCCGCAACGTGCCAGTACGGCATCGATCAGCGCCt < 1:797897/150‑1 (MQ=255) gCCCGGCCCCGATAGCCTGCCCGAGGTCTTCGGGGCCGTGAACGCCATCGAGCAGCCGCCACACGCGGCTGCCGTAAGTGAGCACCCAGCGTTTGGCCAGGTCGACAGGCAACCAGCCGCAACGTGCCAGTACGGCATCGATCAGCGCCt > 2:925450/1‑150 (MQ=255) | TTGCGGGCTTGTTGCAGATACGCCTCCAGGGCCATCTGCTCCTGCGCGGTCAGCGACAGGCCCAGCTTGGTGCGACGCCAGATAATGTCAGCGGTTTGCTCTGCCCATTCCTCCTCCAGCAGGTAATCCACCTCGCGGGTGAACAGCCCGGCCCCGATAGCCTGCCCGAGGTCTTCGGGGCCGTGAACGCCATCGAGCAGCCGCCACACGCGGCTGCCGTAAGTGAGCACCCAGCGTTTGGCCAGGTCGACAGGCAACCAGCCGCAACGTGCCAGTACGGCATCGATCAGCGCCT > NC_002947/1231202‑1231496 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |