New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 709189 = | 38 (0.880) | 5 (0.120) | 5/238 | NT | 12.1% | intergenic (+49/‑70) | murJ/ribF | lipid II flippase/bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase |
? | NC_002947 | 709216 = | 37 (0.910) | intergenic (+76/‑43) | murJ/ribF | lipid II flippase/bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase |
TTGGCTGCCTGTACCTGTGTGGCTTCCGGCCCCGGCATTTCGCTCGCAAGGCCTTGCACTGAGGCTTTTGGCGGGTCAGGCGTCGGTTTTTCGCATTCCACGCCGCCCTTGGGCGCTGCTGCCTGTCACCAGCGCCCGGGTGTGGTTATAATCGGCCACTTTATGAGCAAGAAGCGCGTTATGCAGCTGGTTCGAGGTCTTCACAACCTGCGCCCCGAGCACCGGGGCTGTGTCGCCACCATTGGCAACTTCGACGGGGTTCACCGCGGCCACCAGGCAATCCTG > NC_002947/709079‑709363 | ttGGCTGCCTGTACCTGTGTGGCTTCCGGCCCCGGCATTTCGCTCGCAAGGCCTTGCACTGAGGCTTTTGGCGGGTCAGGCGTCGGTTTTTCGCATTCCACGCCGCCCTTGGGCGCTGCTGCCTGTCACCAGCGCCCGGGTGTGGTtata > 1:200417/1‑150 (MQ=255) gCTGCCTGTACCTGTGTGGCTTCCGGCCCCGGCATTTCGCTCGCAAGGCCTTGCACTGAGGCTTTTGGCGGGTCAGGCGTCGGTTTTTCGCATTCCACGCCGCCCTTGGGCGCTGCTGCCTGTCACCAGCGCCCGGGTGTGGTTATAATc < 2:232188/150‑1 (MQ=255) gCTGCCTGTACCTGTGTGGCTTCCGGCCCCGGCATTTCGCTCGCAAGGCCTTGCACTGAGGCTTTTGGCGGGTCAGGCGTCGGTTTTTCGCATTCCACGCCGCCCTTGGGCGCTGCTGCCTGTCACCAGCGCCCGGGTGTGGTTATAATc < 2:232075/150‑1 (MQ=255) gCTGCCTGTACCTGTGTGGCTTCCGGCCCCGGCATTTCGCTCGCAAGGCCTTGCACTGAGGCTTTTGGCGGGTCAGGCGTCGGTTTTTCGCATTCCACGCCGCCCTTGGGCGCTGCTGCCTGTCACCAGCGCCCGGGTGTGGTTATAATc < 2:492168/150‑1 (MQ=255) cTGCCTGTACCTGTGTGGCTTCCGGCCCCGGCATTTCGCTCGCAAGGCCTTGCACTGAGGCTTTTGGCGGGTCAGGCGTCGGTTTTTCGCATTCCACGCCGCCCTTGGGCGCTGCTGCCTGTCACCAGCGCCCGGGTGTGGTTATAATCg < 2:258548/150‑1 (MQ=255) cTGCCTGTACCTGTGTGGCTTCCGGCCCCGGCATTTCGCTCGCAAGGCCTTGCACTGAGGCTTTTGGCGGGTCAGGCGTCGGTTTTTCGCATTCCACGCCGCCCTTGGGCGCTGCTGCCTGTCACCAGCGCCCGGGTGTGGTTATAATCg > 2:1104026/1‑150 (MQ=255) tGCCTGTACCTGTGTGGCTTCCGGCCCCGGCATTTCGCTCGCAAGGCCTTGCACTGAGGCTTTTGGCGGGTCAGGCGTCGGTTTTTCGCATTCCACGCCGCCCTTGGGCGCTGCTGCCTGTCACCAGCGCCCGGGTGTGGTtata < 1:1023999/145‑1 (MQ=255) tGCCTGTACCTGTGTGGCTTCCGGCCCCGGCATTTCGCTCGCAAGGCCTTGCACTGAGGCTTTTGGCGGGTCAGGCGTCGGTTTTTCGCATTCCACGCCGCCCTTGGGCGCTGCTGCCTGTCACCAGCGCCCGGGTGTGGTtata > 2:1023999/1‑145 (MQ=255) gcgacacagccccggtgctcggggcgcaggttgtgaagacctcgaaccagctgcataacgcgcttcttgctcataaagtggccgattataaccacacccgggcgctgctgcctgtcaccagcgcccGGGTGTGGt > 1:87377‑M2/127‑135 (MQ=255) gcgacacagccccggtgctcggggcgcaggttgtgaagacctcgaaccagctgcataacgcgcttcttgctcataaagtggccgattataaccacacccgggcgctgctgcctgtcaccagcgcccGGGTGTGGt < 2:87377‑M2/9‑1 (MQ=255) cTGTGTGGCTTCCGGCCCCGGCATTTCGCTCGCAAGGCCTTGCACTGAGGCTTTTGGCGGGTCAGGCGTCGGTTTTTCGCATTCCACGCCGCCCTTGGGCGCTGCTGCCTGTCACCAGCGCCCGGGTGTGGTTATAATCGGCCACTTTAt > 2:686717/1‑150 (MQ=255) cTGTGTGGCTTCCGGCCCCGGCATTTCGCTCGCAAGGCCTTGCACTGAGGCTTTTGGCGGGTCAGGCGTCGGTTTTTCGCATTCCACGCCGCCCTTGGGCGCTGCTGCCTGTCACCAGCGCCCGGGTGTGGTTATAATCGGCCACTTTAt < 1:464480/150‑1 (MQ=255) tgtgtgGCTTCCGGCCCCGGCATTTCGCTCGCAAGGCCTTGCACTGAGGCTTTTGGCGGGTCAGGCGTCGGTTTTTCGCATTCCACGCCGCCCTTGGGCGCTGCTGCCTGTCACCAGCGCCCGGGTGTGGTTATAATCGGCCACTTTATg > 2:1075888/1‑150 (MQ=255) tgtgGCTTCCGGCCCCGGCATTTCGCTCGCAAGGCCTTGCACTGAGGCTTTTGGCGGGTCAGGCGTCGGTTTTTCGCATTCCACGCCACAGCACACGTCTGCTGCCTGTCACCAGCGCCCGGGTGTGGTTATAATCGGCCACTTTATGAg > 1:852044/1‑150 (MQ=255) ggCTTCCGGCCCCGGCATTTCGCTCGCAAGGCCTTGCACTGAGGCTTTTGGCGGGTCAGGCGTCGGTTTTTCGCATTCCACGCCGCCCTTGGGCGCTGCTGCCTGTCACCAGCGCCCGGGTGTGGTTATAATCGGCCACTTTATGAGCaa > 1:909244/1‑150 (MQ=255) cTTCCGGCCCCGGCATTTCGCTCGCAAGGCCTTGCACTGAGGCTTTTGGCGGGTCAGGCGTCGGTTTTTCGCATTCCACGCCGCCCTTGGGCGCTGCTGCCTGTCACCAGCGCCCGGGTGTGGTTCTAATCGGCCACTTTATGAGCaaga > 2:119031/1‑150 (MQ=255) ttCCGGCCCCGGCATTTCGCTCGCAAGGCCTTGCACTGAGGCTTTTGGCGGGTCAGGCGTCGGTTTTTCGCATTCCACGCCGCCCTTGGGCGCTGCTGCCTGTCACCAGCGCCCGGGTGTGGTTATAATCGGCCACTTTATGAGCaagaa > 1:554778/1‑150 (MQ=255) gCCCCGGCCTTTCGCGCGCAAGGCCTTGCACTGAGGCTTTTGGCGGGTCAGGCGTCGGTTTTCTTTGAGCGTCTCCGCCCTTGGGCGCTGCTGCTTGTCAAAAGCGCGGAGGTGGGGGTATAATCGGCCACTTTATGAGCAAGAAGcgcg < 1:810114/150‑1 (MQ=255) cccGGCATTTCGCTCGCAAGGCCTTGCACTGAGGCTTTTGGCGGGTCAGGCGTCGGTTTTTCGCATTCCACGCCGCCCTTGGGCGCTGCTGCCTGTCACCAGCGCCCGGGTGTGGTTATAATCGGCCACTTTATGAGCAAGAAGCGCGtt < 1:297641/150‑1 (MQ=255) cccGGCATTTCGCTCGCAAGGCCTTGCACTGAGGCTTTTGGCGGGTCAGGCGTCGGTTTTTCGCATTCCACGCCGCCCTTGGGCGCTGCTGCCTGTCACCAGCGCCCGGGTGTGGTTATAATCGGCCACTTTATGAGCAAGAAGCGCGtt > 1:434773/1‑150 (MQ=255) aTTTCGCTCGCGTTGCCTTGCACTGAGGCTTTTGGCGGGTCAGGCGTCGGGTTTTTGCATTCCACGCCGCCCTTGGGCGCTGGTGCTTGTCACCAGCGCCCGGGTGTGGTTATAATCGGCCACTTTATGAGCAAGAAGCGCGTTATGCAg < 1:498623/150‑1 (MQ=255) cgctcgcAAGGCCTTGCACTGAGGCTTTTGGCGGGTCAGGCGTCGGTTTTTCGCATTCCACGCCGCCCTTGGGCGCTGCTGCCTGTCACCAGCGCCCGGGTGTGGTTATAATCGGCCACTTTATGAGCAAGAAGCGCGTTATGCAGCTgg < 1:555494/150‑1 (MQ=255) tcgcAAGGCCTTGCACTGAGGCTTTTGGCGGGTCAGGCGTCGGTTTTTCGCATTCCACGCCGCCCTTGGGCGCTGCTGCCTGTCACCAGCGCCCGGGTGTGGTTATAATCGGCCACTTTATGAGCAAGAAGCGCGTTATGCAGCTGGTTc > 1:541470/1‑150 (MQ=255) cAAGGCCTTGCACTGAGGCTTTTGGCGGGTCAGGCGTCGGTTTTTCGCATTCCACGCCGCCCTTGGGCGCTGCTGCCTGTCACCAGCGCCCGGGTGTGGTTATAATCGGCCACTTTATGAGCAAGAAGCGCGTTATGCAGCTGGTTCGAg > 1:934861/1‑150 (MQ=255) ggCCTTGCACTGAGGCTTTTGGCGGGTCAGGCGTCGGTTTTTCGCATTCCACGCCGCCCTTGGGCGCTGCTGCCTGTCACCAGCGCCCGGGTGTGGTTATAATCGGCCACTTTATGAGCAAGAAGCGCGTTATGCAGCTGGTTCGAGGTc > 1:150544/1‑150 (MQ=255) ccTTGCACTGAGGCTTTTGGCGGGTCAGGCGTCGGTTTTTCGCATTCCACGCCGCCCTTGGGCGCTGCTGCCTGTCACCAGCGCCCGGGTGTGGTTATAATCGGCCACTTTATGAGCAAGAAGCGCGTTATGCAGCTGGTTCGAGGTCtt < 2:434773/150‑1 (MQ=255) tcgaaccagctgcataacgcgcttcttgctcataaagtggccgattataaccacacccgggcgctgctgcctgtcaccagcgcccGGGTGTGGTTATAATc > 2:145953‑M2/86‑101 (MQ=255) tcgaaccagctgcataacgcgcttcttgctcataaagtggccgattataaccacacccgggcgctgctgcctgtcaccagcgcccGGGTGTGGTTATAATc < 1:145953‑M2/16‑1 (MQ=255) ttGCACTGAGGCTTTTGGCGGGTCAGGCGTCGGTTTTTCGCATTCCACGCCGCCCTTGGGCGCTGCTGCCTGTCACCAGCGCCCGGGTGTGGTTATAATCGGCCACTTTATGAGCAAGAAGCGCGTTATGCAGCTGGTTCGAGGTCTTca < 2:957838/150‑1 (MQ=255) ttGCACTGAGGCTTTTGGCGGGTCAGGCGTCGGTTTTTCGCATTCCACGCCGCCCTTGGGCGCTGCTGCCTGTCACCAGCGCCCGGGTGTGGTTATAATCGGCCACTTTATGAGCAAGAAGCGCGTTATGCAGCTGGTTCGAGGTCTTca < 2:540494/150‑1 (MQ=255) aCTGAGGCTTTTGGCGGGTCAGGCGTCGGTTTTTCGCATTCCACGCCGCCCTTGGGCGCTGCTGCCTGTCACCAGCGCCCGGGTGTGGTTATAATCGGCCACTTTATGAGCAAGAAGCGCGTTATGCAGCTGGTTCGAGGTCTTCACAAc < 2:909244/150‑1 (MQ=255) gCTTTTGGCGGGTCAGGCGTCGGTTTTTCGCATTCCACGCCGCCCTTGGGCGCTGCTGCCTGTCACCAGCGCCCGGGTGTGGTTATAATCGGCCACTTTATGAGCAAGAAGCGCGTTATGCAGCTGGTTCGAGGTCTTCACAACCTgcgc > 1:239751/1‑150 (MQ=255) ttttGGCGGGTCAGGCGTCGGTTTTTCGCATTCCACGCCGCCCTTGGGCGCTGCTGCCTGTCACCAGCGCCCGGGTGTGGTTATAATCGGCCACTTTATGAGCAAGAAGCGCGTTATGCAGCTGGTTCGAGGTCTTCACAACCTGCGccc > 1:1110823/1‑150 (MQ=255) gTCGGTTTTTCGCATTCCACGCCGCCCTTGGGCGCTGCTGCCTGTCACCAGCGCCCGGGTGTGGTTATAATCGGCCACTTTATGAGCAAGAAGCGCGTTATGCAGCTGGTTCGAGGTCTTCACAACCTGCGCCCCGAGCACCGGGGCtgt < 2:92095/150‑1 (MQ=255) ggTTTTTCGCATTCCACGCCGCCCTTGGGCGCTGCTGCCTGTCACCAGCGCCCGGGTGTGGTTATAATCGGCCACTTTATGAGc < 1:149419/84‑1 (MQ=255) ggTTTTTCGCATTCCACGCCGCCCTTGGGCGCTGCTGCCTGTCACCAGCGCCCGGGTGTGGTTATAATCGGCCACTTTATGAGc > 2:149419/1‑84 (MQ=255) ggTTTTTCGCATTCCACGCCGCCCTTGGGCGCTGCTGCCTGTCACCAGCGCCCGGGTGTGGTTATAATCGGCCACTTTATGAGCAAGAAGCGCGTTATGCAGCTGGTTCGAGGTCTTCACAACCTGCGCCCCGAGCACCGGGGCTGTGTc > 1:373072/1‑150 (MQ=255) ttCGCATTCCACGCCGCCCTTGGGCGCTGCTGCCTGTCACCAGCGCCCGGGTGTGGTTATAATCGGCCACTTTATGAGCAAGAAGCGCGTTATGCAGCTGGTTCGAGGTCTTCACAACCTGCGCCCCGAGCACCGGGGCTGTGTCGccac < 1:372655/150‑1 (MQ=255) gattataaccacacccGGGCGCTGGTGACAGGCAGCAGCGCCCGGGTGTGGTTATAATCGGCCACTTTATGAGCAAGAAGCGCGTTATGCAGCTGGTTCGa < 1:145953‑M1/85‑1 (MQ=255) gattataaccacacccGGGCGCTGGTGACAGGCAGCAGCGCCCGGGTGTGGTTATAATCGGCCACTTTATGAGCAAGAAGCGCGTTATGCAGCTGGTTCGa > 2:145953‑M1/17‑101 (MQ=255) accacacccGGGCGCTGGTGACAGGCAGCAGCGCCCGGGTGTGGTTATAATCGGCCACTTTATGAGCAAGAAGCGCGTTATGCAGCTGGTTCGAGGTCTTCACAACCTGCGCCCCGAGCACCGGGGCTGTGTCGc < 2:87377‑M1/126‑1 (MQ=255) accacacccGGGCGCTGGTGACAGGCAGCAGCGCCCGGGTGTGGTTATAATCGGCCACTTTATGAGCAAGAAGCGCGTTATGCAGCTGGTTCGAGGTCTTCACAACCTGCGCCCCGAGCACCGGGGCTGTGTCGc > 1:87377‑M1/10‑135 (MQ=255) gccCTTGGGCGCTGCTGCCTGTCACCAGCGCCCGGGTGTGGTTATAATCGGCCACTTTATGAGCAAGAAGCGCGTTATGCAGCTGGTTCGAGGTCTTCACAACCTGCGCCCCGAGCACCGGGGCTGTGTCGCCACCATTGGCAACTTCGa < 1:1075888/150‑1 (MQ=255) cccTTGGGCGCTGCTGCCTGTCACCAGCGCCCGGGTGTGGTTATAATCGGCCACTTTATGAGCAAGAAGCGCGTTATGCAGCTGGTTCGAGGTCTTCACAACCTGCGCCCCGAGCACCGGGGCTGTGTCGCCACCATTGGCAACTTCGAc > 2:144588/1‑150 (MQ=255) GGGCGCTGCTGCCTGTCACCAGCGCCCGGGTGTGGTTATAATCGGCCACTTTATGAGCAAGAAGCGCGTTATGCAGCTGGTTCGAGGTCTTCACAACCTGCGCCCCGAGCACCGGGGCTGTGTCGCCACCAtt > 1:589084‑M1/1‑133 (MQ=255) GGGCGCTGCTGCCTGTCACCAGCGCCCGGGTGTGGTTATAATCGGCCACTTTATGAGCAAGAAGCGCGTTATGCAGCTGGTTCGAGGTCTTCACAACCTGCGCCCCGAGCACCGGGGCTGTGTCGCCACCAtt < 2:589084‑M1/133‑1 (MQ=255) GCGCTGCTGCCTGTCACCAGCGCCCGGGTGTGGTTATAATCGGCCACTTTATGAGCAAGAAGCGCGTTATGCAGCTGGTTCGAGGTCTTCACAACCTGCGCCCCGAGCACCGGGGCTGTGTCGCCACCATTGGCAACTTCgacgggggtg < 1:1084579‑M1/150‑4 (MQ=255) GCGCTGCTGCCTGTCACCAGCGCCCGGGTGTGGTTATAATCGGCCACTTTATGAGCAAGAAGCGCGTTATGCAGCTGGTTCGAGGTCTTCACAACCTGCGCCCCGAGCACCGGGGCTGTGTCGCCACCATTGGCAACTTCGACGGGGTTc < 1:34817‑M1/150‑1 (MQ=255) gcCTGTCACCAGCGCCCGGGTGTGGTTATAATCGGCCACTTTATGAGCAAGAAGCGCGTTATGCAGCTGGTTCGAGGTCTTCACAACCTGCGCCCCGAGCACCGGGGCTGTGTCGCCACCATTGGCAACTTCGACGGGGTTCACCGCGGc > 1:363593/1‑150 (MQ=255) aggcagcagcgcccAGGTGTGGTTATAATCGGCCACTTTATGAGCAAGAAGCGCGTTATGCAGCTGGTTCGAGGTCTTCACAACCTGCGCCCCGAGCACCGGGGCTGTGTCGCCACCATTGGCAACTTCGACGGGTTTCACCGCGGccac > 2:256672‑M2/15‑150 (MQ=255) gTCACCAGCGCCCGGGTGTGGTTATAATCGGCCACTTTATGAGCAAGAAGCGCGTTATGCAGCTGGTTCGAGGTCTTCACAACCTGCGCCCCGAGCACCGGGGCTGTGTCGCCACCATTGGCAACTTCGACGGGGTTCACCGCGGccacc > 1:117206/1‑150 (MQ=255) agcgcccGGGTGTGGTTATAATCGGCCACTTTATGAGCAAGAAGCGCGTTATGCAGCTGGTTCGAGGTCTTCACAACCTGCGCCCCGAGCACCgggg < 2:258928‑M2/90‑1 (MQ=255) agcgcccGGGTGTGGTTATAATCGGCCACTTTATGAGCAAGAAGCGCGTTATGCAGCTGGTTCGAGGTCTTCACAACCTGCGCCCCGAGCACCgggg > 1:258928‑M2/8‑97 (MQ=255) agcgcccGGGTGTGGTTATAATCGGCCACTTTATGAGCAAGAAGCGCGTTATGCAGCTGGTTCGAGGTCTTCACAACCTGCGCCCCGAGCACCGGGGCTGTGTCGCCACCATTGGCAACTTCGACGGGGTTCACCGCGGCCACCAGGCaa < 2:373072‑M2/143‑1 (MQ=255) ccGGGTGTGGTTATAATCGGCCACTTTATGAGCAAGAAGCGCGTTATGCAGCTGGTTCGAGGTCTTCACAACCTGCGCCCCGAGCACCGGGGCTGTGTCGCCACCATTGGCAACTTCGACGGGGTTCACCGCGGCCACCAGGCCATCCTg > 1:148221‑M2/3‑150 (MQ=255) | TTGGCTGCCTGTACCTGTGTGGCTTCCGGCCCCGGCATTTCGCTCGCAAGGCCTTGCACTGAGGCTTTTGGCGGGTCAGGCGTCGGTTTTTCGCATTCCACGCCGCCCTTGGGCGCTGCTGCCTGTCACCAGCGCCCGGGTGTGGTTATAATCGGCCACTTTATGAGCAAGAAGCGCGTTATGCAGCTGGTTCGAGGTCTTCACAACCTGCGCCCCGAGCACCGGGGCTGTGTCGCCACCATTGGCAACTTCGACGGGGTTCACCGCGGCCACCAGGCAATCCTG > NC_002947/709079‑709363 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |