| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_002947 | 1,738,046 | Δ39,415 bp | [yffB]–PP_5476 | 59 genes [yffB], PP_1532, PP_1533, PP_1534, PP_1535, PP_1536, PP_1537, PP_5472, PP_1538, PP_1539, PP_1540, PP_1541, PP_1542, PP_1543, PP_1544, PP_1545, PP_1546, PP_5473, PP_5474, PP_1548, PP_5744, PP_1549, PP_1550, PP_1551, PP_1552, PP_1553, PP_1554, PP_1555, PP_1556, PP_1557, PP_1558, PP_1559, PP_1560, PP_1561, PP_1562, PP_1563, PP_1564, PP_1565, PP_1566, PP_1567, PP_1568, PP_1569, PP_1570, PP_1571, PP_1572, PP_1573, PP_1574, PP_1575, PP_1576, PP_1577, PP_1578, PP_5475, PP_1579, PP_1580, PP_1581, PP_1582, PP_1583, PP_1584, PP_5476 |
|
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_002947 | 1738046 | 1777460 | 39415 | 68 [0] | [2] 69 | [yffB]–PP_5476 | [yffB],PP_1532,PP_1533,PP_1534,PP_1535,PP_1536,PP_1537,PP_5472,PP_1538,PP_1539,PP_1540,PP_1541,PP_1542,PP_1543,PP_1544,PP_1545,PP_1546,PP_5473,PP_5474,PP_1548,PP_5744,PP_1549,PP_1550,PP_1551,PP_1552,PP_1553,PP_1554,PP_1555,PP_1556,PP_1557,PP_1558,PP_1559,PP_1560,PP_1561,PP_1562,PP_1563,PP_1564,PP_1565,PP_1566,PP_1567,PP_1568,PP_1569,PP_1570,PP_1571,PP_1572,PP_1573,PP_1574,PP_1575,PP_1576,PP_1577,PP_1578,PP_5475,PP_1579,PP_1580,PP_1581,PP_1582,PP_1583,PP_1584,PP_5476 |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 1738045 | 0 (0.000) | 56 (0.880) | 48/228 | 0.3 | 98.2% | coding (16/348 nt) | yffB | glutathione‑dependent thiol reductase |
| ? | NC_002947 | 1777461 = | 2 (0.030) | intergenic (+153/+139) | PP_5476/PP_1585 | hypothetical protein/antidote protein | |||||
GCACGGTTGAGGATGACTTCCCAGCCGTGTTCGTCGCACCAGCGGTTCAGGCTGTCACGGTCGATGCCTTGGGTTTTGTAATCATGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/1737885‑1738045‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑caggctttgatgccgtaGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCTCGCGGCGCCACGCCCGTGGCGCCCCTGTTTATTGATCAGGATGTGTTCAAGCG > NC_002947/1777461‑1777606 GCACGGTTGAGGATGACTTCCCAGCCGTGTTCGTCGCACCAGCGGTTCAGGCTGTCACGGTCGATGCCTTGGGTTTTGTAATCATGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCT > 2:1424391/1‑150 CACGGTTGAGGATGACTTCCCAGCCGTGTTCGTCGCACCAGCGGTTCAGGCTGTCACGGTCGATGCCTTGGGTTTTGTAATCATGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTT < 1:640974/150‑1 GGTTGAGGATGACTTCCCAGCCGTGTTCGTCGCACCAGCGGTTCAGGCTGTCACGGTCGATGCCTTGGGTTTTGTAATCATGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGA < 2:143161/150‑1 GGTTGAGGATGACTTCCCAGCCGTGTTCGTCGCACCAGCGGTTCAGGCTGTCACGGTCGATGCCTTGGGTTTTGTAAGCATGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTAGGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGA < 1:38872/150‑1 TTGAGGATGACTTCCCAGCCGTGTTCGTCGCACCAGCGGTTCAGGCTGTCACGGTCGATGCCTTGGGTTTTGTAATCATGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATG < 1:134578/150‑1 GGATGACTTCCCAGCCGTGTTCGTCGCACCAGCGGTTCAGGCTGTCACGGTCGATGCCTTGGGTTTTGTAATCATGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGT > 2:1213636/1‑150 GATGACTTCCCAGCCGTGTTCGTCGCACCAGCGGTTCAGGCTGTCACGGTCGATGCCTTGGGTTTTGTAATCATGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTA > 2:937456/1‑150 CTTCCCAGCCGTGTTCGTCACACCAGCGGTTCAGGCTGTCACGGTCGATGCCTTGGGTTTTGTAATCATGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAGAGCG > 2:1241115/1‑150 TTCCCAGCCGTGTTCGTCGCACCAGCGGTTCAGGCTGTCACGGTCGATGCCTTGGGTTTTGTAATCATGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAGAGagt > 1:1677275/1‑147 TTCCCAGCCGTGTTCGTCGCACCAGCGGTTCAGGCTGTCACGGTCGATGCCTTGGGTTTTGTAATCATGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGT > 2:1782937/1‑150 TTCCCAGCCGTGTTCGTCGCACCAGCGGTTCAGGCTGTCACGGTCGATGCCTTGGGTTTTGTAATCATGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGT > 2:1035548/1‑150 TTCCCAGCCGTGTTCGTCGCACCAGCGGTTCAGGCTGTCACGGTCGATGCCTTGGGTTTTGTAATCATGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGT < 2:1254685/150‑1 TCCCAGCCGTGTTCGTCGCACCAGCGGTTCAGGCTGTCACGGTCGATGCCTTGGGTTTTGTAATCATGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTG < 1:1213636/150‑1 CCCAGCCGTGTTCGTCGCACCAGCGGTTCAGGCTGTCACGGTCGATGCCTTGGGTTTTGTAATCATGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCATTTTTCATGGTGGCACAGGCTTGGATGCCGTAGAGCGTGT > 2:1404399/1‑150 CAGCCGTGTTCGTCGCACCAGCGGTTCAGGCTGTCACGGTCGATGCCTTGGGTTTTGTAATCATGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAG < 2:1818231/150‑1 CAGCCGTGTTCGTCGCACCAGCGGTTCAGGCTGTCACGGTCGATGCCTTGGGTTTTGTAATCATGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGT > 1:1497661/1‑139 CAGCCGTGTTCGTCGCACCAGCGGTTCAGGCTGTCACGGTCGATGCCTTGGGTTTTGTAATCATGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGT < 2:1497661/139‑1 AGCCGTGTTCGTCGCACCAGCGGTTCAGGCTGTCACGGTCGATGCCTTGGGTTTTGTAATCATGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGG < 2:941988/150‑1 CCGTGTTCGTCGCACCAGCGGTTCAGGCTGTCACGGTCGATGCCTTGGGTTTTGTAATCATGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTACGTC > 2:467826/1‑150 TGTTCGTCGCACCAGCGGTTCAGGCTGTCACGGTCGATGCCTTGGGTTTTGTAATCATGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATT < 1:1424391/150‑1 TCGTCGCACCAGCGGTTCAGGCTGTCACGGTCGATGCCTTGGGTTTTGTAATCATGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTG < 1:1550599/150‑1 TCGCACCAGCGGTTCAGGCTGTCACGGTCGATGCCTTGGGTTTTGTAATCATGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTAC > 1:1570051/1‑150 CCAGCGGTTCAGGCTGTCACGGTCGATGCCTTGGGTTTTGTAATCATGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGG > 1:625079/1‑150 CCAGCGGTTCAGGCTGTCACGGTCGATGCCTTGGGTTTTGTAATCATGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGG < 2:1570051/150‑1 CAGCGGTTCAGGCTGTCACGGTCGATGCCTTGGGTTTTGTAATCATGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGG < 1:210944/150‑1 GTTCAGGCTGTCACGGTCGATGCCTTGGGTTTTGTAATCAAGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGC > 1:1765130/1‑150 TCAGGCTGTCACGGTCGATGCCTTGGGTTTTGTAATCATGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAA < 2:1139404/150‑1 AGGCTGTCACGGTCGATGCCTTGGGTTTTGTAATCATGGACCTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGT < 1:937456/150‑1 GGCTGTCACGGTCGATGCCGTGGGTTTTGTAATCATGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTGTGATGCCGTGGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTA > 2:673562/1‑150 GCTGTCACGGTCGATGCCTTGGGTTTTGTAATCATGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGG < 2:1749201/139‑1 GCTGTCACGGTCGATGCCTTGGGTTTTGTAATCATGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGG > 1:1749201/1‑139 ACGGTCGATGCCTTGGGTTTTGTAATCCTGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATG > 1:1301161/1‑100 ACGGTCGATGCCTTGGGTTTTGTAATCATGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATG < 2:1301161/100‑1 ATGCCTTGGGTTTTGTAATCATGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCC < 2:253268/150‑1 TTGGGTTTTGTAATCATGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTT > 1:948136/1‑150 TTGGGTTTTGTAATCATGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGT < 2:891521/113‑1 TTGGGTTTTGTAATCATGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTGCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGT > 1:891521/1‑113 GGGTTTTGTAATCATGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGG < 2:183927/78‑1 GGGTTTTGTAATCATGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGG > 1:183927/1‑78 TTTTGTAATCATGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGAT < 1:1241115/150‑1 ATCATGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACA < 2:1091640/104‑1 ATCATGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACA > 1:1091640/1‑104 ATGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGA > 2:1000180/1‑139 ATGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGA < 1:1000180/139‑1 AATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCG < 1:969467/146‑1 AATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCG > 2:969467/1‑146 GTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCT < 1:1783256/58‑1 GTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCT > 2:1783256/1‑58 TAGGCGATGGATTTGTCTTAGACCTAGGTACGAGGTTGTTTCTTTATGTCATAGGCGTTGATGCCGTATAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCG < 2:945939/150‑1 GATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAAC > 1:473556/1‑150 TTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCT > 2:711549/1‑150 TTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCT < 2:1765130/150‑1 TTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCT > 2:1321727/1‑150 TTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTGGAGCGTTGAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGAACCAATCTCGCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCTCGCTGC > 2:439965/1‑150 GAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCTCGCGGCGCC < 1:397094/150‑1 GCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGG < 2:1838766/119‑1 GCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGG > 1:1838766/1‑119 CCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCTCGCGGCGCCACG > 2:34526/1‑150 AGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCTCGCGGC < 2:1541987/142‑1 AGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCTCGCGGC > 1:1541987/1‑142 ACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCTCGCGGCGCCACGCCCGTG < 1:1099216/150‑1 GCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCTCGCGGCGCCACGCCCGTGGCGC > 1:190214/1‑150 CTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCTCGCGGCGCCACGCCCGTGGCGCCC < 2:473556/150‑1 GGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCTCGCGGCGCCACGCCCGTGGCGCCCCTGTTTATT > 1:920617/1‑150 GTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCTCGCGGCGCCACGCCCGTGGCGCCCCTGTTTATTG < 1:1273524/150‑1 TGTCACAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCTCGCGGCGCCACGCCCGTGGCGCCCCTGTTTATTGA > 2:258395/1‑150 CACAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCTCGCGGCGCCACGCCCGTGGCGCCCCTGTTTATTGATCA < 1:1782937/150‑1 ACAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTGCGTTTTTAGATGTCAGTCGCGGGAGTATGCGGGAACGATCCTCGCCGCGCCACGCCCGTGGCGCCCCTGTTTATTGATCAG > 1:873043/1‑150 ACAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCTCGCGGCGCCACGCCCGTGGCGCCCCTGTTTATTGATCAG > 2:1771195/1‑150 ACAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCTCGCGGCGCCACGCCCGTGGCGCCC < 1:996682/135‑1 ACAGGCATTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCTCGCGGCGCCACGCCCGTGGCGCCC > 2:996682/1‑135 AGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCTCGCGGCGCCACGCCCGTGGCGCCCCTGTTTATTGATCAGGA < 1:235019/150‑1 GGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCTCGCGGCGCCACGCCCGTGGCGCCCGTGTTTATTGATCAGGAT < 2:948136/150‑1 GGCTTTGATGCCGTAGAGAGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCTCGCGGCGCCACGCCCGTGGCGCCCCTGTTTATTGATCAGGAT < 2:1677275/150‑1 CTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCCGTAGCGGGATTATGCCAATACGTCCCGGACGGCTCCACGCCCGTGGCGCCCCTGTTTATTGATCAGGATGT < 1:34526/150‑1 CTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCTCGCGGCGCCACGCCCGTGGCGCCCCTGTTTATTGATCAGGATGT > 1:922608/1‑150 TTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCTCGCGGCGCCACGCCCGTGGCGCCCCTGTTTATTGATCAGGATGTGT < 2:190214/150‑1 GATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCTCGCGGCGCC > 2:265483/1‑111 GATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCTCGCGGCGCC < 1:265483/111‑1 CCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCTCGCGGCGCCACGCCCGTGGCGCCCCTGTTTATTGATCAGGA > 1:1393750/1‑139 CCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCTCGCGGCGCCACGCCCGTGGCGCCCCTGTTTATTGATCAGGA < 2:1393750/139‑1 CGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCTCGCGGCGCCACGCCCGTGGCGCCCCTGTTTATTGATCAGGATGTGTTCAAGCG < 1:711549/150‑1 GCACGGTTGAGGATGACTTCCCAGCCGTGTTCGTCGCACCAGCGGTTCAGGCTGTCACGGTCGATGCCTTGGGTTTTGTAATCATGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/1737885‑1738045‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑caggctttgatgccgtaGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCTCGCGGCGCCACGCCCGTGGCGCCCCTGTTTATTGATCAGGATGTGTTCAAGCG > NC_002947/1777461‑1777606 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |