| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_002947 | 1,738,046 | Δ39,415 bp | [yffB]–PP_5476 | 59 genes [yffB], PP_1532, PP_1533, PP_1534, PP_1535, PP_1536, PP_1537, PP_5472, PP_1538, PP_1539, PP_1540, PP_1541, PP_1542, PP_1543, PP_1544, PP_1545, PP_1546, PP_5473, PP_5474, PP_1548, PP_5744, PP_1549, PP_1550, PP_1551, PP_1552, PP_1553, PP_1554, PP_1555, PP_1556, PP_1557, PP_1558, PP_1559, PP_1560, PP_1561, PP_1562, PP_1563, PP_1564, PP_1565, PP_1566, PP_1567, PP_1568, PP_1569, PP_1570, PP_1571, PP_1572, PP_1573, PP_1574, PP_1575, PP_1576, PP_1577, PP_1578, PP_5475, PP_1579, PP_1580, PP_1581, PP_1582, PP_1583, PP_1584, PP_5476 |
|
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_002947 | 1738046 | 1777460 | 39415 | 68 [0] | [2] 69 | [yffB]–PP_5476 | [yffB],PP_1532,PP_1533,PP_1534,PP_1535,PP_1536,PP_1537,PP_5472,PP_1538,PP_1539,PP_1540,PP_1541,PP_1542,PP_1543,PP_1544,PP_1545,PP_1546,PP_5473,PP_5474,PP_1548,PP_5744,PP_1549,PP_1550,PP_1551,PP_1552,PP_1553,PP_1554,PP_1555,PP_1556,PP_1557,PP_1558,PP_1559,PP_1560,PP_1561,PP_1562,PP_1563,PP_1564,PP_1565,PP_1566,PP_1567,PP_1568,PP_1569,PP_1570,PP_1571,PP_1572,PP_1573,PP_1574,PP_1575,PP_1576,PP_1577,PP_1578,PP_5475,PP_1579,PP_1580,PP_1581,PP_1582,PP_1583,PP_1584,PP_5476 |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 1738045 | 0 (0.000) | 56 (0.880) | 48/228 | 0.3 | 98.2% | coding (16/348 nt) | yffB | glutathione‑dependent thiol reductase |
| ? | NC_002947 | 1777461 = | 2 (0.030) | intergenic (+153/+139) | PP_5476/PP_1585 | hypothetical protein/antidote protein | |||||
GATGACTTCCCAGCCGTGTTCGTCGCACCAGCGGTTCAGGCTGTCACGGTCGATGCCTTGGGTTTTGTAATCATGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAAAGAGTGTAAGTCATTGAATTTAAAGGGGCTGGGATTACTCCCCAAAACCTCCCCAATATCTCCCAAAAATTAGTCGCAGGATTATGCGACATCGATCCACTCAGCGCCACGGCTGTCACGGTATAGATCGGTCATCTTGGCCGAA > NC_002947/1737896‑1738191 | gATGACTTCCCAGCCGTGTTCGTCGCACCAGCGGTTCAGGCTGTCACGGTCGATGCCTTGGGTTTTGTAATCATGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTA > 2:937456‑M1/1‑150 (MQ=255) cTTCCCAGCCGTGTTCGTCACACCAGCGGTTCAGGCTGTCACGGTCGATGCCTTGGGTTTTGTAATCATGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAgagcg > 2:1241115‑M1/1‑145 (MQ=255) ttCCCAGCCGTGTTCGTCGCACCAGCGGTTCAGGCTGTCACGGTCGATGCCTTGGGTTTTGTAATCATGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAgagcgt > 2:1035548‑M1/1‑144 (MQ=255) ttCCCAGCCGTGTTCGTCGCACCAGCGGTTCAGGCTGTCACGGTCGATGCCTTGGGTTTTGTAATCATGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAgagcgt < 2:1254685‑M1/150‑7 (MQ=255) ttCCCAGCCGTGTTCGTCGCACCAGCGGTTCAGGCTGTCACGGTCGATGCCTTGGGTTTTGTAATCATGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAgagcgt > 2:1782937‑M1/1‑144 (MQ=255) ttCCCAGCCGTGTTCGTCGCACCAGCGGTTCAGGCTGTCACGGTCGATGCCTTGGGTTTTGTAATCATGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAgagagt > 1:1677275‑M1/1‑144 (MQ=255) tCCCAGCCGTGTTCGTCGCACCAGCGGTTCAGGCTGTCACGGTCGATGCCTTGGGTTTTGTAATCATGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAgagcgtg < 1:1213636‑M1/150‑8 (MQ=255) cccAGCCGTGTTCGTCGCACCAGCGGTTCAGGCTGTCACGGTCGATGCCTTGGGTTTTGTAATCATGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCATTTTTCATGGTGGCACAGGCTTGGATGCCGTAgagcgtgt > 2:1404399‑M1/1‑142 (MQ=255) cAGCCGTGTTCGTCGCACCAGCGGTTCAGGCTGTCACGGTCGATGCCTTGGGTTTTGTAATCATGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAgagcgtgtag < 2:1818231‑M1/150‑11 (MQ=255) aGCCGTGTTCGTCGCACCAGCGGTTCAGGCTGTCACGGTCGATGCCTTGGGTTTTGTAATCATGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAgagcgtgtagg < 2:941988‑M1/150‑12 (MQ=255) ccGTGTTCGTCGCACCAGCGGTTCAGGCTGTCACGGTCGATGCCTTGGGTTTTGTAATCATGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAgagcgtgtacgtc > 2:467826‑M1/1‑137 (MQ=255) tgtTCGTCGCACCAGCGGTTCAGGCTGTCACGGTCGATGCCTTGGGTTTTGTAATCATGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAgagcgtgtaggtcatt < 1:1424391‑M1/150‑17 (MQ=255) tcgtcgCACCAGCGGTTCAGGCTGTCACGGTCGATGCCTTGGGTTTTGTAATCATGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAgagcgtgtaggtcattgtg < 1:1550599‑M1/150‑20 (MQ=255) tcgCACCAGCGGTTCAGGCTGTCACGGTCGATGCCTTGGGTTTTGTAATCATGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAgagcgtgtaggtcattgtgtac > 1:1570051‑M1/1‑128 (MQ=255) ccAGCGGTTCAGGCTGTCACGGTCGATGCCTTGGGTTTTGTAATCATGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAgagcgtgtaggtcattgtgtacattgg > 1:625079‑M1/1‑123 (MQ=255) ccAGCGGTTCAGGCTGTCACGGTCGATGCCTTGGGTTTTGTAATCATGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAgagcgtgtaggtcattgtgtacattgg < 2:1570051‑M1/150‑28 (MQ=255) cAGCGGTTCAGGCTGTCACGGTCGATGCCTTGGGTTTTGTAATCATGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAgagcgtgtaggtcattgtgtacattggg < 1:210944‑M1/150‑29 (MQ=255) gTTCAGGCTGTCACGGTCGATGCCTTGGGTTTTGTAATCAAGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAgagcgtgtaggtcattgtgtacattggggttgc > 1:1765130‑M1/1‑117 (MQ=255) tCAGGCTGTCACGGTCGATGCCTTGGGTTTTGTAATCATGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAgagcgtgtaggtcattgtgtacattggggttgcaa < 2:1139404‑M1/150‑36 (MQ=255) aGGCTGTCACGGTCGATGCCTTGGGTTTTGTAATCATGGACCTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAgagcgtgtaggtcattgtgtacattggggttgcaagt < 1:937456‑M1/150‑38 (MQ=255) ggCTGTCACGGTCGATGCCGTGGGTTTTGTAATCATGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTGTGATGCCGTGgagcgtgtaggtcattgtgtacattggggttgcaagta > 2:673562‑M1/1‑112 (MQ=255) gCTGTCACGGTCGATGCCTTGGGTTTTGTAATCATGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAgagcgtgtaggtcattgtgtacattggg < 2:1749201‑M1/139‑29 (MQ=255) gCTGTCACGGTCGATGCCTTGGGTTTTGTAATCATGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAgagcgtgtaggtcattgtgtacattggg > 1:1749201‑M1/1‑111 (MQ=255) aTGCCTTGGGTTTTGTAATCATGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAgagcgtgtaggtcattgtgtacattggggttgcaagtagccccaatctctcc < 2:253268‑M1/150‑53 (MQ=255) ttGGGTTTTGTAATCATGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAgagcgtgtaggtcattgtgtacattggggttgcaagtagccccaatctctccgtttt > 1:948136‑M1/1‑93 (MQ=255) ttGGGTTTTGTAATCATGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAgagcgtgtaggtcattgtgt < 2:891521‑M1/113‑21 (MQ=255) ttGGGTTTTGTAATCATGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTGCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAgagcgtgtaggtcattgtgt > 1:891521‑M1/1‑93 (MQ=255) ttttGTAATCATGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAgagcgtgtaggtcattgtgtacattggggttgcaagtagccccaatctctccgtttttcgat < 1:1241115‑M1/150‑63 (MQ=255) aTCATGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAgagcgtgtaggtcattgtgtaca < 2:1091640‑M1/104‑24 (MQ=255) aTCATGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAgagcgtgtaggtcattgtgtaca > 1:1091640‑M1/1‑81 (MQ=255) aTGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAgagcgtgtaggtcattgtgtacattggggttgcaagtagccccaatctctccgtttttcga > 2:1000180‑M1/1‑78 (MQ=255) aTGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAgagcgtgtaggtcattgtgtacattggggttgcaagtagccccaatctctccgtttttcga < 1:1000180‑M1/139‑62 (MQ=255) aaTTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAgagcgtgtaggtcattgtgtacattggggttgcaagtagccccaatctctccgtttttcgatgtcagtcgcg < 1:969467‑M1/146‑73 (MQ=255) aaTTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAgagcgtgtaggtcattgtgtacattggggttgcaagtagccccaatctctccgtttttcgatgtcagtcgcg > 2:969467‑M1/1‑74 (MQ=255) tAGGCGATGGATTTGTCTTAGACCTAGGTACGAGGTTGTTTCTTTATGTCATAGGCGTTGATGCCGTAtagcgtgtaggtcattgtgtacattggggttgcaagtagccccaatctctccgtttttcgatgtcagtcgcgggattatgcg < 2:945939‑M1/150‑83 (MQ=255) gATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAgagcgtgtaggtcattgtgtacattggggttgcaagtagccccaatctctccgtttttcgatgtcagtcgcgggattatgcgggaac > 1:473556‑M1/1‑63 (MQ=255) tttGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAgagcgtgtaggtcattgtgtacattggggttgcaagtagccccaatctctccgtttttcgatgtcagtcgcgggattatgcgggaacgatcct > 2:711549‑M1/1‑57 (MQ=255) tttGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAgagcgtgtaggtcattgtgtacattggggttgcaagtagccccaatctctccgtttttcgatgtcagtcgcgggattatgcgggaacgatcct > 2:1321727‑M1/1‑57 (MQ=255) tttGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAgagcgtgtaggtcattgtgtacattggggttgcaagtagccccaatctctccgtttttcgatgtcagtcgcgggattatgcgggaacgatcct < 2:1765130‑M1/150‑94 (MQ=255) ttCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTGgagcgttgaggtcattgtgtacattggggttgcaagtagaaccaatctcgccgtttttcgatgtcagtcgcgggattatgcgggaacgatcctcgctgc > 2:439965‑M1/1‑51 (MQ=255) gAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAgagcgtgtaggtcattgtgtacattggggttgcaagtagccccaatctctccgtttttcgatgtcagtcgcgggattatgcgggaacgatcctcgcggcgcc < 1:397094‑M1/150‑103 (MQ=255) gCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAgagcgtgtaggtcattgtgtacattggggttgcaagtagccccaatctctccgtttttcgatgtcagtcgcgg > 1:1838766‑M1/1‑46 (MQ=255) gCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAgagcgtgtaggtcattgtgtacattggggttgcaagtagccccaatctctccgtttttcgatgtcagtcgcgg < 2:1838766‑M1/119‑74 (MQ=255) ccAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAgagcgtgtaggtcattgtgtacattggggttgcaagtagccccaatctctccgtttttcgatgtcagtcgcgggattatgcgggaacgatcctcgcggcgccacg > 2:34526‑M1/1‑45 (MQ=255) aGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAgagcgtgtaggtcattgtgtacattggggttgcaagtagccccaatctctccgtttttcgatgtcagtcgcgggattatgcgggaacgatcctcgcggc < 2:1541987‑M1/142‑100 (MQ=255) aGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAgagcgtgtaggtcattgtgtacattggggttgcaagtagccccaatctctccgtttttcgatgtcagtcgcgggattatgcgggaacgatcctcgcggc > 1:1541987‑M1/1‑43 (MQ=255) aCGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAgagcgtgtaggtcattgtgtacattggggttgcaagtagccccaatctctccgtttttcgatgtcagtcgcgggattatgcgggaacgatcctcgcggcgccacgcccgtg < 1:1099216‑M1/150‑112 (MQ=255) gcCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAgagcgtgtaggtcattgtgtacattggggttgcaagtagccccaatctctccgtttttcgatgtcagtcgcgggattatgcgggaacgatcctcgcggcgccacgcccgtggcgc > 1:190214‑M1/1‑35 (MQ=255) cTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAgagcgtgtaggtcattgtgtacattggggttgcaagtagccccaatctctccgtttttcgatgtcagtcgcgggattatgcgggaacgatcctcgcggcgccacgcccgtggcgccc < 2:473556‑M1/150‑118 (MQ=255) ggTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAgagcgtgtaggtcattgtgtacattggggttgcaagtagccccaatctctccgtttttcgatgtcagtcgcgggattatgcgggaacgatcctcgcggcgccacgcccgtggcgcccctgtttatt > 1:920617‑M1/1‑24 (MQ=255) gtgtCACAGGCTTTGATGCCGTAgagcgtgtaggtcattgtgtacattggggttgcaagtagccccaatctctccgtttttcgatgtcagtcgcgggattatgcgggaacgatcctcgcggcgccacgcccgtggcgcccctgtttattg < 1:1273524‑M1/150‑128 (MQ=255) tgtCACAGGCTTTGATGCCGTAgagcgtgtaggtcattgtgtacattggggttgcaagtagccccaatctctccgtttttcgatgtcagtcgcgggattatgcgggaacgatcctcgcggcgccacgcccgtggcgcccctgtttattga > 2:258395‑M1/1‑22 (MQ=255) cacaGGCTTTGATGCCGTAgagcgtgtaggtcattgtgtacattggggttgcaagtagccccaatctctccgtttttcgatgtcagtcgcgggattatgcgggaacgatcctcgcggcgccacgcccgtggcgcccctgtttattgatca < 1:1782937‑M1/150‑132 (MQ=255) acaGGCTTTGATGCCGTAgagcgtgtaggtcattgtgtacattggggttgcaagtagccccaatctctgcgtttttagatgtcagtcgcgggagtatgcgggaacgatcctcgccgcgccacgcccgtggcgcccctgtttattgatcag > 1:873043‑M1/1‑18 (MQ=255) acaGGCTTTGATGCCGTAgagcgtgtaggtcattgtgtacattggggttgcaagtagccccaatctctccgtttttcgatgtcagtcgcgggattatgcgggaacgatcctcgcggcgccacgcccgtggcgcccctgtttattgatcag > 2:1771195‑M1/1‑18 (MQ=255) acaGGCTTTGATGCCGTAgagcgtgtaggtcattgtgtacattggggttgcaagtagccccaatctctccgtttttcgatgtcagtcgcgggattatgcgggaacgatcctcgcggcgccacgcccgtggcgccc < 1:996682‑M1/135‑118 (MQ=255) acaGGCATTGATGCCGTAgagcgtgtaggtcattgtgtacattggggttgcaagtagccccaatctctccgtttttcgatgtcagtcgcgggattatgcgggaacgatcctcgcggcgccacgcccgtggcgccc > 2:996682‑M1/1‑18 (MQ=255) aGGCTTTGATGCCGTAgagcgtgtaggtcattgtgtacattggggttgcaagtagccccaatctctccgtttttcgatgtcagtcgcgggattatgcgggaacgatcctcgcggcgccacgcccgtggcgcccctgtttattgatcagga < 1:235019‑M1/150‑135 (MQ=255) ggCTTTGATGCCGTAgagcgtgtaggtcattgtgtacattggggttgcaagtagccccaatctctccgtttttcgatgtcagtcgcgggattatgcgggaacgatcctcgcggcgccacgcccgtggcgcccgtgtttattgatcaggat < 2:948136‑M1/150‑136 (MQ=255) ggCTTTGATGCCGTAgagagtgtaggtcattgtgtacattggggttgcaagtagccccaatctctccgtttttcgatgtcagtcgcgggattatgcgggaacgatcctcgcggcgccacgcccgtggcgcccctgtttattgatcaggat < 2:1677275‑M1/150‑136 (MQ=255) cTTTGATGCCGTAgagcgtgtaggtcattgtgtacattggggttgcaagtagccccaatctctccgtttttcgatgtccgtagcgggattatgccaatacgtcccggacggctccacgcccgtggcgcccctgtttattgatcaggatgt < 1:34526‑M1/150‑138 (MQ=255) cTTTGATGCCGTAgagcgtgtaggtcattgtgtacattggggttgcaagtagccccaatctctccgtttttcgatgtcagtcgcgggattatgcgggaacgatcctcgcggcgccacgcccgtggcgcccctgtttattgatcaggatgt > 1:922608‑M1/1‑13 (MQ=255) ttGATGCCGTAgagcgtgtaggtcattgtgtacattggggttgcaagtagccccaatctctccgtttttcgatgtcagtcgcgggattatgcgggaacgatcctcgcggcgccacgcccgtggcgcccctgtttattgatcaggatgtgt < 2:190214‑M1/150‑140 (MQ=255) gATGCCGTAgagcgtgtaggtcattgtgtacattggggttgcaagtagccccaatctctccgtttttcgatgtcagtcgcgggattatgcgggaacgatcctcgcggcgcc > 2:265483‑M1/1‑9 (MQ=255) gATGCCGTAgagcgtgtaggtcattgtgtacattggggttgcaagtagccccaatctctccgtttttcgatgtcagtcgcgggattatgcgggaacgatcctcgcggcgcc < 1:265483‑M1/111‑103 (MQ=255) ccGTAgagcgtgtaggtcattgtgtacattggggttgcaagtagccccaatctctccgtttttcgatgtcagtcgcgggattatgcgggaacgatcctcgcggcgccacgcccgtggcgcccctgtttattgatcagga < 2:1393750‑M1/139‑135 (MQ=255) ccGTAgagcgtgtaggtcattgtgtacattggggttgcaagtagccccaatctctccgtttttcgatgtcagtcgcgggattatgcgggaacgatcctcgcggcgccacgcccgtggcgcccctgtttattgatcagga > 1:1393750‑M1/1‑5 (MQ=255) cGTAgagcgtgtaggtcattgtgtacattggggttgcaagtagccccaatctctccgtttttcgatgtcagtcgcgggattatgcgggaacgatcctcgcggcgccacgcccgtggcgcccctgtttattgatcaggatgtgttcaagcg < 1:711549‑M1/150‑147 (MQ=255) | GATGACTTCCCAGCCGTGTTCGTCGCACCAGCGGTTCAGGCTGTCACGGTCGATGCCTTGGGTTTTGTAATCATGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAAAGAGTGTAAGTCATTGAATTTAAAGGGGCTGGGATTACTCCCCAAAACCTCCCCAATATCTCCCAAAAATTAGTCGCAGGATTATGCGACATCGATCCACTCAGCGCCACGGCTGTCACGGTATAGATCGGTCATCTTGGCCGAA > NC_002947/1737896‑1738191 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |