New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1976257 = | 82 (1.370) | 7 (0.130) | 7/212 | NT | 8.9% | intergenic (+42/‑123) | pheA/PP_1770 | bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase/3‑phosphoshikimate 1‑carboxyvinyltransferase |
? | NC_002947 | 1976305 = | 70 (1.320) | intergenic (+90/‑75) | pheA/PP_1770 | bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase/3‑phosphoshikimate 1‑carboxyvinyltransferase |
Only 100 of 108 total aligned reads displayed.
TTCGTCGGCCACCACCGCGACCCGCTGATCAAGGCGGTGCTCGAGCAGATCAGCCAGGAGGCTGTGGCGCTGAAGGTGCTGGGCTCTTATCCGAAGGCGGTGCTTTGATTCAGGGGCCTTGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCATGTGATGCCGATCTCTGTGGGAGCGGGCTAGCCCGCGAAGGGCCGCGCCGCGGCCCCAATGGCCCTCACAGGCTACCTAGATTTCTGAACAGGGTTCGCACCAGTGGTAAATGCAGCAAAAACCAAACCC > NC_002947/1976108‑1976406 | ttCGTCGGCCACCACCGCGACCCGCTGATCAAGGCGGTGCTCGAGCAGATCAGCCAGGAGGCTGTGGCGCTGAAGGTGCTGGGCTCTTATCCGAAGGCGGTGCTTTGATTCAGGGGCCTTGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGCGGGCATg > 1:923212/1‑150 (MQ=255) aggcctagaccgaccacgaccaggcggtcgatgatgggcgcgggtttggtttttgctgcatttaccactggtgcgaaccctgttcagaaatctaggtagcctgtgagggccattggggccgcggcgcggcccttcgcgggctaGCCCGCt < 2:795798‑M1/7‑1 (MQ=255) gCCACCACCGCGACCCGCTGATCAAGGCGGTGCTCGAGCAGATCAGCCAGGAGGCTGTGGCGCTGAAGGTGCTGGGCTCTTATCCGAAGGCGGTGCTTTGATTCAGGGGCCTTGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGTGGGCATGCCCGCTc > 1:1609919/1‑150 (MQ=255) gCCACCACCGCGACCCGCTGATCAAGGCGGTGCTCGAGCAGATCAGCCAGGAGGCTGTGGCGCTGAAGGTGCTGGGCTCTTATCCGAAGGCGGTGCTTTGATTCAGGGGCCTTGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTc < 1:1095090/150‑1 (MQ=255) gCCACCACCGCGACCCGCTGATCAAGGCGGTGCTCGAGCAGATCAGCCAGGAGGCTGTGGCGCTGAAGGTGCTGGGCTCTTATCCGAAGGCGGTGCTTTGATTCAGGGGCCTTGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTc > 1:1520568/1‑150 (MQ=255) gcctagaccgaccacgaccaggcggtcgatgatgggcgcgggtttggtttttgctgcatttacctctggtgcgaaccctgttcagaaatctaggtagcctgtgagggccattggggccgcggcgcggcccttcgcgggctaGCCCGCTcc > 2:463622‑M1/142‑150 (MQ=255) ctagaccgaccacgaccaggcggtcgatgatgggcgcgggtttggtttttgctgcatttaccactggtgcgaaccctgttcagaaatctaggtagcctgtgagggccattggggccgcggcgcggcccttcgcgggctagcccgcgaagg > 2:1184051‑M1/140‑145 (MQ=255) tagaccgaccacgaccaggcggtcgatgatgggcgcgggtttggtttttgctgcatttaccactggtgcgaaccctgttcagaaatctaggtagcctgtgagggccattggggccgcggcgcggcccttcgcgggctagcccgcgaaggg > 1:389236‑M1/139‑144 (MQ=255) tagaccgaccacgaccaggcggtcgatgatgggcgcgggtttggtttttgctgcatttaccactggtgcgaaccctgttcagaaatctaggtagcctgtgagggccattggggccgcggcgcggcccttcgcgggctaGCCCGCTCCcac < 1:1128802‑M1/12‑1 (MQ=255) caccGCGACCCGCTGATCAAGGCGGTGCTCGAGCAGATCAGCCAGGAGGCTGTGGCGCTGAAGGTGCTGGGCTCTTATCCGAAGGCGGTGCTTTGATTCAGGGGCCTTGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGCGGGTATTCCCGCTTCcaca > 2:669290/1‑150 (MQ=255) caccGCGACCCGCTGATCAAGGCGGTGCTCGAGCAGATCAGCCAGGAGGCTGTGGCGCTGAAGGTGCTGGGCTCTTATCCGAAGGCGGTGCTTTGATTCAGGGGCCTTGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCcaca > 1:1567065/1‑150 (MQ=255) gaccgaccacgaccaggcggtcgatgatgggcgcgggtttggtttttgctgcatttaccactggtgcgaaccctgttcagaaatctaggtagcctgtgagggccattggggccgcggcgcggcccttcgcgggctaGCCCGCTCCCACAg < 2:1259911‑M1/14‑1 (MQ=255) gcgACCCGCTGATCAAGGCGGTGCTCGAGCAGATCAGCCAGGAGGCTGTGGCGCTGAAGGTGCTGGGCTCTTATCCGAAGGCGGTGCTTTGATTCAGGGGCCTTGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGa < 1:438036/150‑1 (MQ=255) cccGCTGATCAAGGCGGTGCTCGAGCAGATCAGCCAGGAGGCTGTGGCGCTGAAGGTGCTGGGCTCTTATCCGAAGGCGGTGCTTTGATTCAGGGGGCTTGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGt > 1:1571494/1‑144 (MQ=255) cccGCTGATCAAGGCGGTGCTCGAGCAGATCAGCCAGGAGGCTGTGGCGCTGAAGGTGCTGGGCTCTTATCCGAAGGCGGTGCTTTGATTCAGGGGCCTTGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCTCTCCCACAGt < 2:1571494/144‑1 (MQ=255) ccGCTGATCAAGGCGGTGCTCGAGCAGATCAGCCAGGAGGCTGTGGCTCTGAAGGTGCTGGGCTCTTATCCGAAGGCGGTGCTTTGATTCAGGGGCCTTGGGTCTGCCATGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCAtg > 2:1118801/1‑150 (MQ=255) cGCTGATCAAGGCGGTGCTCGAGCAGATCAGCCAGGAGGCTGTGGCGCTGAAGGTGCTGGGCTCTTATCCGAAGGCGGTGCTTTGATTCAGGGGCCTTGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCAtgt > 1:32247/1‑150 (MQ=255) cGCTGATCAAGGCGGTGCTCGAGCAGATCAGCCAGGAGGCTGTGGCGCTGAAGGTGCTGGGCTCTTATCCGAAGGCGGTGATTTGATTCAGGGGCCTTGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCAtgt > 1:880726/1‑150 (MQ=255) gCTGATCAAGGCGGTGCTCGAGCAGATCAGCCAGGAGGCTGTGGCGCTGAAGGTGCTGGGCTCTTATCCGAAGGCGGTGCTTTGATTCAGGGGCCTTGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGCAGGAATGCCCGCTCCCACAGTAAGCAtgtt > 2:40387/1‑149 (MQ=255) tGATCAAGGCGGTGCTCGAGCAGATCAGCCAGGAGGCTGTGGCGCTGAAGGTGCTGGGCTCTTATCCGAAGGCGGTGCTTTGATTCAGGGGCCTTGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCATGTGAt < 2:1520568/150‑1 (MQ=255) gATCAAGGCGGTGCTCGAGCAGATCAGCCAGGAGGCTGTGGCGCTGAAGGTGCTGGGCTCTTATCCGAAGGCGGTGCTTTGATTCAGGGGCCTTGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCATGTGATg < 1:188662/150‑1 (MQ=255) tGCTCGAGCAGATCAGCCAGGAGGCTGTGGCGCTGAAGGTGCTGGGCTCTTATCCGAAGGCGGTGCTTTGATTCAGGGGCCTTGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCATGTGATGCCGATCTCtgt < 1:669290/150‑1 (MQ=255) tGCTCGAGCAGATCAGCCAGGAGGCTGTGGCGCTGAAGGTGCTGGGCTCTTATCCGAAGGCGGTGCTTTGATTCAGGGGCCTTGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCATGTGATGCCGATCTCtgt < 2:1244680/150‑1 (MQ=255) gCTCGAGCAGATCAGCCAGGAGGCTGTGGCGCTGAAGGTGCTGGGCTCTTATCCGAAGGCGGTGCTTTGATTCAGGGGCCTTGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCATGTGATGCCGATCTCtgtg < 2:443563/150‑1 (MQ=255) gCTCGAGCAGATCAGCCAGGAGGCTGTGGCGCTGAAGGTGCTGGGCTCTTATCCGAAGGCGGTGCTTTGATTCAGGGGCCTTGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCATGTGATGCCGATCTCtgtg < 1:710256/150‑1 (MQ=255) tCGAGCAGATCAGCCAGGAGGCTGTGGCGCTGAAGGTGCTGGGCTCTTATCCGAAGGCGGTGCTTTGATTCAGGGGCCTTGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCATGTGATGCCGATCTCTGTggg > 1:183072/1‑150 (MQ=255) aGATCAGCCAGGAGGCTGTGGCGCTGAAGGTGCTGGGCTCTTATCCGAAGGCGGTGCTTTGATTCAGGGGCCTTGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCATGTGATGCCGATCTCTGTGGGAGCggg < 1:1381429/150‑1 (MQ=255) tCAGCCAGGAGGCTGTGGCGCTGAAGGTGCTGGGCTCTTATCCGAAGGCGGTGCTTTGATTCAGGGGCCTTGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCATGTGATGCCGATCTCTGTGGGAGCGGGCTa > 1:404269/1‑150 (MQ=255) gtttggtttttgctgcatttaccactggtgcgaaccctgttcagaaatctaggtagcctgtgagggccattggggccgcggcgcggcccttcgcgggctaGc < 2:349559‑M1/2‑1 (MQ=255) gtttggtttttgctgcatttaccactggtgcgaaccctgttcagaaatctaggtagcctgtgagggccattggggccgcggcgcggcccttcgcgggctaGc > 1:349559‑M1/101‑102 (MQ=255) aGCCAGGAGGCTGTGGCGCTGAAGGTGCTGGGCTCTTATCCGAAGGCGGTGCTTTGATTCAGGGGCCTTGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCATGTGATGCCGATCTCTGTGGGAGCgg > 1:761235/1‑144 (MQ=255) aGCCAGGAGGCTGTGGCGCTGAAGGTGCTGGGCTCTTATCCGAAGGCGGTGCTTTGATTCAGGGGCCTTGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCATGTGATGCCGATCTCTGTGGGAGCgg < 2:761235/144‑1 (MQ=255) tttttgctgcatttaccactggtgcgaaccctgttcagaaatctaggtagcctgtgagggccattggggccgcggcgcagcccttcgcgggcatGCCCGCTCCCACAGTGAGCATGTGATGCCGATCTCTGTGGGAGCGGGCTAGCCcgc < 1:75121‑M1/56‑1 (MQ=255) gaggCTGTGGCGCTGAAGGTGCTGGGCTCTTATCCGAAGGCGGTGCTTTGATTCAGGGGCCTTGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGCGGGCATg < 2:1592072/93‑1 (MQ=255) gaggCTGTGGCGCTGAAGGTGCTGGGCTCTTATCCGAAGGCGGTGCTTTGATTCAGGGGCCTTGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGCGGGCATg > 1:1592072/1‑93 (MQ=255) ttgctgcatttaccactggtgcgaaccctgttcagaaatctaggtagcctgtgagggccattggggccgcggcgcagcccttcgcgggcatGCCCGCTCCCACAGTGAGCATGTGATGCCGATCTCTGTGGGAGCGGGCTAGCCCGCGaa > 2:75121‑M1/92‑150 (MQ=255) ggCTGTGGCGCTGAAGGTGCTGGGCTCTTATCCGAAGGCGGTGCTTTGATTCAGGGGCCTTGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCATGTGATGCCGATCTCTGTGGGAGCGGGCTAGCCCGCGAAg < 2:1567065/150‑1 (MQ=255) tgcatttaccactggtgcgaaccctgttcagaaatctaggtagcctgtgagggccattggggccgcggcgcggcccttcgcgggctag < 2:1416235‑M1/1‑1 (MQ=255) tgcatttaccactggtgcgaaccctgttcagaaatctaggtagcctgtgagggccattggggccgcggcgcggcccttcgcgggctag > 1:1416235‑M1/88‑88 (MQ=255) gtgGCGCTGAAGGTGCTGGGCTCTTATCCGAAGGCGGTGCTTTGATTCAGGGGCCTTGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCATGTGATGCCGATCTCTGTGGGAGCGGGCTAGCCCGCGAAGGgcc > 1:376933/1‑150 (MQ=255) tgGCGCTGAAGGTGCTGGGCTCTTATCCGAAGGCGGTGCTTTGATTCAGGGGCCTTGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCGGCTCCcaca > 2:49899/1‑98 (MQ=255) tgGCGCTGAAGGTGCTGGGCTCTTATCCGAAGGCGGTGCTTTGATTCAGGGGCCTTGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCcaca < 1:49899/98‑1 (MQ=255) ggTGCTGGGCTCTTATCCGAAGGCGGTGCTTTGATTCAGGGGCCTTGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCATGTGATGCCGATCTCTGTGGGAGCGGGCTAGCCCGCGAAGGGCCGCGCCGCGGcc > 2:647451/1‑150 (MQ=255) gTGCTGGGCTCTTATCCGAAGGCGGTGCTTTGATTCAGGGGCCTTGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCATGTGATGCCGATCTCTGTGTGAGCGGGCTAGCCCGCGAAGGGCCGCGGCGCGGccc < 2:145280/150‑1 (MQ=255) gTGCTGGGCTCTTATCCGAAGGCGGTGCTTTGATTCAGGGGCCGTGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCATGTGATGCCGATCTCTGTGGGAGCGGGCTAGCCCGCGAAGGGCCGCGCCGCGGccc > 2:1191121/1‑150 (MQ=255) gCTGGGCTCTTATCCGAAGGCGGTGCTTTGATTCAGGGGCCTGGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCATGTGATGCCGATCTCTGTGGGAGCGGGCTAGCCCGCGAAGGGCCGCGGCGCGGccctt < 1:254772/150‑3 (MQ=255) gggCTCTTATCCGAAGGCGGTGCTTTGATTCAGGGGCCTTGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCATGTGATGCCGATCTCTGTGGGAGCGGGCTAGCCCGCGAAGGGCCGCGCCGCGGCCCCAATg < 1:1037415/150‑1 (MQ=255) gggCTCTTATCCGAAGGCGGTGCTTTGATTCAGGGGCCTTGGGGCCGCCTTGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCATGTGATGCCGATCTCTGTGGGAGCGGGCTAGCCCGCGAAGGGCCGCGCCGCGGCCCCAATg < 1:928643/150‑1 (MQ=255) gCTCTTATCCGAAGGCGGTGCTTTGATTCAGGGGCCTTGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCATGTGATGCCGATCTCTGTGGGAGCGGGCTAGCCCGCGAAGGGCCGCGCCGCGGCCCCAATGGc < 2:771112/150‑1 (MQ=255) tctTATCCGAAGGCGGTGCTTTGATTCAGGGGCCTTGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCATGTGATGCCGATCTCTGTGGGAGCGGGc < 1:585796/113‑1 (MQ=255) tctTATCCGAAGGCGGTGCTTTGATTCAGGGGCCTTGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCATGTGATGCCGATCTCTGTGGGAGCGGGc > 2:585796/1‑113 (MQ=255) ctgttcagaaatctaggtagcctgtgagggccattggggccgcggcgcggcccttcgcgggcatGCCCGCTCCCACAGTGAGCATGTGATGCCGATCTCTGTGGGAGCGGGCTAGCCCGCGAAgg > 2:923268‑M1/65‑125 (MQ=255) ctgttcagaaatctaggtagcctgtgagggccattggggccgcggcgcggcccttcgcgggcatGCCCGCTCCCACAGTGAGCATGTGATGCCGATCTCTGTGGGAGCGGGCTAGCCCGCGAAgg < 1:923268‑M1/61‑1 (MQ=255) tgttcagaaatctaggtagcctgtgagggccattggggccgcggcgcggcccttcgcgggctaGCCCGCTCCca > 2:40306‑M1/64‑74 (MQ=255) tgttcagaaatctaggtagcctgtgagggccattggggccgcggcgcggcccttcgcgggctaGCCCGCTCCca < 1:40306‑M1/11‑1 (MQ=255) tATCCGAAGGCGGTGCTTTGATTCAGGGGCCTTGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCATGTGATGCCGATCTCTGTGGGAGCGGGCTAGCCCGCGAAGGGCCGCGCCGCGGCCCCAATGGCCCTca > 1:1541509/1‑150 (MQ=255) aTCCGAAGGCGGTGCTTTGATTCAGGGGCCTTGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCATGTGATGCCGATCTCTGTGGGAGCGGGCTAGCCCGCGAAGGGCCGCGCCGCGGCCCCAATGGCCCTcac > 2:1539855/1‑150 (MQ=255) aTCCGAAGGCGGTGCTTTGATTCAGGGGCCTTGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCATGTGATGCCGATCTCTGTGGGAGCGGGCTAGCCCGCGAAGGGCCGCGCCGCGGCCCCAATGGCCCTcac > 2:1539266/1‑150 (MQ=255) aTCCGAAGGCGGTGCTTTGATTCAGGGGCCTTGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCATGCGATGCCGATCTCTGTGGGAGCGGGCTAGCCCGCGAAGGGCCGCGCCGCGGCCCCAATGGCCCTcac < 1:1039876/150‑1 (MQ=255) 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ttCAGGGGCCTTGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCATGTGATGCCGATCTTTGTGGGAGCGGGCTAGCCCGCGAAGGGCCGCGCCGCGGCCCCAATGGCCCTCACAGGCTACCTATATTTCTGat < 2:628061/150‑2 (MQ=255) aGGGGCCTTGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCATGTGATGCCGATCTCTGTGGGAGCGGGCTAGCCCGCGAAGGGCCGCGCCGCGGCCCCAATGGCCCTCACAGGCTACCTAGATTTCTGAACAg > 1:319149/1‑150 (MQ=255) aGGGGCCTTGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCATGTGATGCCGATCTCTGTGGGAGCGGGCTAGCCCGCGAAGGGCCGCGCCGCGGCCCCAATGGCCCTCACAGGCTACCTAGATTTCTGAACAg < 1:647451/150‑1 (MQ=255) ggggCCTTGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCATGTGATGCCGATCTCTGTGGGAGCggg < 2:1111284/84‑1 (MQ=255) ggggCCTTGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCATGTGATGCCGATCTCTGTGGGAGCggg > 1:1111284/1‑84 (MQ=255) ggggCCTTGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCATGTGATGCCGATCTCTGTGGGAGCGGGCTAGCCCGCGAAGGGCCGCGCCGCGGCCCCAATGGCCCTcaca < 2:162956/127‑1 (MQ=255) ggggCCTTGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCATGTGATGCCGATCTCTGTGGGAGCGGGCTAGCCCGCGAAGGGCCGCGCCGCGGCCCCAATGGCCCTCACAGGCTACCTAGATTTCTGAACAgg < 2:1044176/150‑1 (MQ=255) ggggCCTTGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCATGTGATGCCGATCTCTGTGGGAGCCGGCTAGCCCGCGAAGGGCCGCGCCGCGGCCCCAATGGCCCTcacc > 1:162956/1‑126 (MQ=255) cTTGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCATGTGATGCCGATCTCTGTGGGAGCGGGCTAGCCCGCGAAGGGCCGCGCCGCGGCCCCAATGGCCCTCACAGGCTACCTAGATTTCTGAACAGGGTTCg < 2:807102/150‑1 (MQ=255) ggggCTACCTTGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCGCACAGTGAGCATGTGATGCCGATCTCTGTGGGAGCGGGCTAGCCCGCGAAGGGCCGCGCCGCGGCCCCAATGGCCCTCACAGGCTACCTAGATTTCTGAACAGGGTTCGCAc > 2:643772/1‑150 (MQ=255) gCTGCCTTGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCATGTGATGCCGATCTCTGTGGGAGCGGGCTAGCCCGCGAAGGGCCGCGCCGCGGCCCCAATGGCCCTCACAGGCTACCTAGATTTCTGAACAGGGTTCGCACCAg > 2:1310566/1‑150 (MQ=255) cTTGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCTCTCCCACAGTGAGCATGTGATGCCGATCTCTGTGGGAGCGGGCTAGCCCGCGAAGGGCCGCGCCGCGGCCCCAATGGCCCTCACAGGCTACCTAGATTTCTGaa > 2:369356/1‑130 (MQ=255) cTTGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCTCTCCCACAGTGAGCATGTGATGCCGATCTCTGTGGGAGCGGGCTAGCCCGCGAAGGGCCGCGCCGCGGCCCCAATGGCCCTCACAGGCTACCTAGATTTCTGaa < 1:369356/130‑1 (MQ=255) tGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCATGTGATGCCGATCTCTGTGGGAGCGGGCTAGCCCGCGAAGGGCCGCGCCGCGGCCCCAATGGCCCTCACAGGCTACCTATATTTCTGAACAGGGTTCGCACCAGTGGTaaa < 1:1118801/150‑1 (MQ=255) gCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCATGTGATGCCGATCTCTGTGGGAGCGGGCTAGCCCGCGAAGGGCCGCGCCGCGGCCCCAATGGCCCTCACAGGCTACCTAGATTTCTGAACAGGGTTCGCACCAGTGGTAAAt < 1:525898/150‑1 (MQ=255) gCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCATGTGATGCCGATCTCTGTGGGAGCGGGCTAGCCCGCGAAGGGCCGCGCCGCGGCCCCAATGGCCCTCACAGGCTACCTAGATTTCTGAACAGGGTTCGCACCAGTGGTAAAt < 1:720064/150‑1 (MQ=255) gCCCTTTGCGGGCATTCCCGCTCCCACAGTGAGCATGTGATGCCGATCTCTGTGGGAGCGGGCTAGCCCGCGAAGGGCCGCGCCGCGGCCCCAATGGCCCTCACAGGCTACCTAGATTTCTGAACAGGGTTCGCACCAGTGGTAAATgca < 1:685319/150‑1 (MQ=255) cTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCATGTGATGCCGCTCTGTGTGGGAGCGGGCTAGCCCGCGAAGGGCCGCGCCGCGGCCCCAATGGCCCTCACAGGCTACCTAGATTTCTGAACAGGGTTCGCACCCTTGGTAGATgctgta > 2:422164/1‑146 (MQ=255) ttCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCATGTGATGCCGATCTCTGTGGGAGCGGGCTAGCCCGCGAAGGGCCGCGCCGCGGCCCCAATGGCCCTCACAGGCTACCTAGATTTCTGAACAGGGTTCGCACCAGTGGTAAATGCAGCaa > 1:318561/1‑150 (MQ=255) gcgGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCATGTGATGCCGATCTCTGTGGGAGCGGGCTAGCCCGCGAAGGGCCGCGCCGCGGCCCCAATGGCCCTCACAGGCTACCTAGATTTCTGAACAGGGTTCGCACCAGTGGTAAATGCAGCaaaaa > 1:577753/1‑150 (MQ=255) gCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCATGTGATGCCGATCTCTGTGGGAGCGGGCTAGCCCGCGAAGGGCCGCGCCGCGGCCCCAATGGCCCTCACAGGCTACCTAGATTTCTGAACAGGGTTCGCACCAGTGGTAAATGCAGCAAaaaccaa > 2:776403/1‑150 (MQ=255) GCCCGCTCCCACAGTGAGCATGTGATGCCGATCTCTGTGGGAGCGGGCTAGCCCGCGAAGGGCCGCGCCGCGGCCCCAATGGCCCTcaca < 1:1194908‑M1/90‑1 (MQ=255) GCCCGCTCCCACAGTGAGCATGTGATGCCGATCTCTGTGGGAGCGGGCTAGCCCGCGAAGGGCCGCGCCGCGGCCCCAATGGCCCTcaca > 2:1194908‑M1/1‑90 (MQ=255) GCCCGCTCCCACAGTGAGCATGTGATGCCGATCTCTGTGGGAGCGGGCTAGCCCGCGAAGGGCCGCGCCGCGGCCCCAATGGCCCTCACAGGCTACCTAGATTTCTGAACAGGGTTCGCACCAGTGGTAAATGCAGCAAAAACCAAAccc < 1:886792‑M1/150‑1 (MQ=255) | TTCGTCGGCCACCACCGCGACCCGCTGATCAAGGCGGTGCTCGAGCAGATCAGCCAGGAGGCTGTGGCGCTGAAGGTGCTGGGCTCTTATCCGAAGGCGGTGCTTTGATTCAGGGGCCTTGGGGCTGCCTTGCAGCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTGAGCATGTGATGCCGATCTCTGTGGGAGCGGGCTAGCCCGCGAAGGGCCGCGCCGCGGCCCCAATGGCCCTCACAGGCTACCTAGATTTCTGAACAGGGTTCGCACCAGTGGTAAATGCAGCAAAAACCAAACCC > NC_002947/1976108‑1976406 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |