| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 3941442 = | 153 (1.020) | 24 (0.280) +ATTCTTTATGCTTATTTCAGCGTCGGTTTGTCGGTTAAATG |
6/114 | 13.9 | 21.3% | intergenic (‑115/‑366) | yieP/rrsC | putative transcriptional regulator/16S ribosomal RNA of rrnC operon |
| ? | NC_000913 | 4035099 = | 152 (1.020) | coding (492/546 nt) | hemG | protoporphyrin oxidase, flavoprotein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 153 total aligned reads displayed.
TTTTTATTCCTCCTTAGTATGCCACCAGGAAGTGTGATTACGGTTGCAAAAACGGCAAATTGCTTGTTTTATGGCACATTAACGGGGCTTTTGCTGAAAAAATGCGCGGTCAGAAAATTATTTTAAATTTCCTCTTGTCAGGCCGGAATAACTCCCTATAATGCGCCACCACTGACACGGAACAACGGCAAACA > NC_000913/3941346‑3941539 | tttttATTCCTCCTTAGTATGCCACCAGGAAGTGTGATTACGGTTGCAAAAACGGCAAATTGCTTGTTTTATGGCACATTAACGGGGCTTTTGCTGaaa > 2:1368186/1‑99 (MQ=255)tttttATTCCTCCTTAGTATGCCACCAGGAAGTGTGATTACGGTTGCAAAAACGGCAAATTGCTTGTTTTATGGCACATTAACGGGGCTTTTGCTGaaa > 1:3303542/1‑99 (MQ=255)tttttATTCCTCCTTAGTATGCCACCAGGAAGTGTGATTACGGTTGCAAAAACGGCAAATTGCTTGTTTTATGGCACATTAACGGGGCTTTTGCTGaaa > 1:3047858/1‑99 (MQ=255)gtgttATTCCGCCTTAGTATGCCACCAGGAAGTGTGATTACGGTTGCAAAAACGGCAAATTGCTTGTTTTATGGCACATTAACGGGGCTTTTGCTGaaa < 2:2328428/96‑1 (MQ=255) ttttATTCCTCCTTAGTATGCCCCCAGGAAGTGTGATTACGGTTGCAAAAACGGCAAATTGCTTGTTTTATGGCACATTAACGGGGCTTTTGCTGaaaa > 2:2170530/1‑99 (MQ=255) ttATTCCTCCTTAGTATGCCACCAGGAAGTGTGATTACGGTTGCAAAAACGGCAAATTGCTTGTTTTATGGCACATTAACGGGGCTTTTGCTGaaaaaa > 1:1226492/1‑99 (MQ=255) tATTCCTCCTTAGTATGCCACCAGGAAGTGTGATTACGGTTGCAAAAACGGCAAATTGCTTGTTTTATGGCACATTAACGGGGCTTTTGCTGAAAAAAt < 2:1756286/99‑1 (MQ=255) ttCATCCTTAGTATGCGAGCAGGAAGAGTGATTACGGTTGCAAAAACGGCAGATTGCTTGTTTTATGGCATATTAACTTTGATTATGATAAAAAAATgc < 2:3092713/99‑1 (MQ=255) tcctccTTAGTATGCCACCAGGAAGTGTGATTACGGTTGCAAAAACGGCAAATTGCTTGTTTTATGGCACATTAACGGGGCTTTTGCTGAAAAAATgcg > 2:406224/1‑99 (MQ=255) cctcctTAGTATGCCACCAGGAAGTGTGATTACGGTTGCAAAAACGGCAAATTGCTTGTTTTATGGCACATTAACGGGGCTTTTGCTGAAAAAATgcgc < 1:837906/99‑1 (MQ=255) ctcctTAGTATGCCACCAGGAAGTGTGATTACGGTTGCAAAAACGGCAACTTGCTTGTTTTATGGCACATTAACGGGGCTTTTGCTGAAAAAATGtgcg > 2:2349355/1‑99 (MQ=255) ctcctTAGTATGCCACCAGGAAGTGTGATTACGGTTGCAAAAACGGCAAATTGCTTGTTTTATGGCACATTAACGGGGCTTTTGCTGAAAAAATGcgcg > 2:1721809/1‑99 (MQ=255) ctcctTAGTATGCCACCAGGAAGTGTGATTACGGTTGCAAAAACGGCAAATTGCTTGTTTTATGGCACATTAACGGGGCTTTTGCTGAAAAAATGcgcg < 1:2252897/99‑1 (MQ=255) tcctTAGTATGCCACCAGGAAGTGTGATTACGGTTGCAAAAACGGCAAATTGCTTGTTTTATGGCACATTAACGGGGCTTTTGCTGAAAAAATGCGCgg > 2:855996/1‑99 (MQ=255) tcctTAGTATGCCACCAGGAAGTGTGATTACGGTTGCAAAAACGGCAAATTGCTTGTTTTATGGCACATTAACGGGGCTTTTGCTGAAAAAATGCGCgg > 1:982139/1‑99 (MQ=255) cctTAGTATGCCACCAGGAAGTGTGATTACGGTTGCAAAAACGGCAAATTGCTTGTTTTATGGCACATTAACGGGGCTTTTGCTGAAAAAATGCGCGGt < 1:1268602/99‑1 (MQ=255) cctTAGTATGCCACCAGGAAGTGTGATTACGGTTGCAAAAACGGCAAATTGCTTGTTTTATGGCACATTAACGGGGCTTTTGCTGAAAAAATGCGCGGt < 1:1268603/99‑1 (MQ=255) cctTAGTATGCCACCAGGAAGTGTGATTACGGTTGCAAAAACGGCAAATTGCTTGTTTTATGGCACATTAACGGGGCTTTTGCTGAAAAAATGCGCGGt > 1:839473/1‑99 (MQ=255) ctgaGTATGCCACCAGGAAGTGTGATTACGGTTGCAAAAACGNCAAATTGCTTGTTTTATGGCACATTAACGGGGCTTTTGCTGAAAAAATGCGCGGtn < 2:2360799/96‑2 (MQ=255) ctTAGTATGCCACCAGGAAGTGTGATTACGGTTGCAAAAACGGCAAATTGCTTGTTTTATGGCACATTAACGGGGCTTTTGCTGAAAAAATGCGCGGTc > 2:3804004/1‑99 (MQ=255) ttAGTATGCCACCAGGAAGTGTGATTACGGTTGCAAAAACGGCAAATTGCTTGTTTTATGGCACATTAACGGGGCTTTTGCTGAAAAAATGCGCGGTCa > 1:3890392/1‑99 (MQ=255) aGTATGCCACCAGGAAGTGTGATTACGGTTGCAAAAACGGCAAATTGCTTGTTTTATGGCACATTAACGGGGCTTTTGCTGAAAAAATGCGCGGTCAGa < 1:2322694/99‑1 (MQ=255) gTATGCCACCAGGAAGTGTGATTACGGTTGCAAAAACGGCAAATTGCTTGTTTTATGGCACATTAACGGGGCTTTTGCTGAAAAAATGCGCGGTCAGaa > 1:2715905/1‑99 (MQ=255) tGCCACCAGGAAGTGTGATTACGGTTGCAAAAACGGCAAATTGCTTGTTTTATGGCACATTAACGGGGCTTTTGCTGAAAAAATGCGCGGTCAGAAAat < 2:532939/99‑1 (MQ=255) gCCACCAGGAAGTGTGATTACGGTTGCAAAAACGGCAAATTGCTTGTTTTATGGCACATTAACGGGAAAAAAAAAAAAAAAAGGCGCGGTCAGAAAatt < 2:3211323/99‑1 (MQ=255) ccaccaGGAAGTGTGATTACGGTTGCAAAAACGGCAAATTGCTTGTTTTATGGCACATTAACGGGGCTTTTGCTGAAAAAATGCGCGGTCAGAAAatta < 1:3019725/99‑1 (MQ=255) caccaGGAAGTGTGATTACGGTTGCAAAAACGGCAAATTGCTTGTTTTATGGCACATTAACGGGGCTTTTGCTGAAAAAATGCGCGGTCAGAAAattat < 1:3732906/99‑1 (MQ=255) caccaGGAAGTGTGATTACGGTTGCAAAAACGGCAAATTGCTTGTTTTATGGCACATTAACGGGGCTTTTGCTGAAAAAATGCGCGGTCAGAAAattat < 2:2133142/99‑1 (MQ=255) caccaGGAAGTGTGATTACGGTTGCAAAAACGGCAAATTGCTTGTTTTATGGCACATTAACGGGGCTTTTGCTGAAAAAATGCGCGGTCAGAAAattat > 2:1998161/1‑99 (MQ=255) accaGGAAGTGTGATTACGGTTGCAAAAACGGCAAATTGCTTGTTTTATGGCACATTAACGGGGCTTTTGCTGAAAAAATGCGCGGTCAGAAAattatt > 1:1132669/1‑99 (MQ=255) accaGGAAGTGTGATTACGGTTGCAAAAACGGCAAATTGCTTGTTTTATGGCACATTAACGGGGCTTTTGCTGAAAAAATGCGCGGTCAGAAAattatt < 2:1749634/99‑1 (MQ=255) accaGGAAGTGTGATTACGGTTGCAAAAACGGCAAATTGCTTGTTTTATGGCACATTAACGGGGCTTTTGCTGAAAAAATGCGCGGTCAGAAAattatt < 2:1668532/99‑1 (MQ=255) ccaGGAAGTGTGATTACGGTTGCAAAAACGGCAAATTGCTTGTTTTATGGCACATTAACGGGGCTTTTGCTGAAAAAATGCGCGGTCAGAAAATTAttt < 1:1261786/99‑1 (MQ=255) ggAAGTGTGATTACGGTTGCAAAAACGGCAAATTGCTTGTTTTATGGCACATTAACGGGGCTTTTGCTGAAAAAATGCGCGGTCAGAAAATTATTTTaa > 2:705574/1‑99 (MQ=255) gAAGTGTGATTACGGTTGCAAAAACGGCAAATTGCTTGTTTTATGGCACATTAACGGGGCTTTTGCTGAAAAAATGCGCGGTCAGAAAATTATTTTaaa < 1:1551415/99‑1 (MQ=255) gAAGTGTGATTACGGTTGCAAAAACGGCAAATTGCTTGTTTTATGGCACATTAACGGGGCTTTTGCTGAAAAAATGCGCGGTCAGAAAATTATTTTaaa < 1:2260961/99‑1 (MQ=255) aaGTGTGATTACGGTTGCAAAAACGGCAAATTGCTTGTTTTATGGCACATTAACGGGGCTTTTGCTGAAAAAATGCGCGGTCAGAAAATTATTTTAAAt < 1:406286/99‑1 (MQ=255) aaGTGTGATTACCGTTGCAAAAACGGCAAATTGCTTGTTTTATGGCACATTAACGGGGCTTTCGATGTAAAAATGAGCAGTCAGAAAATTATTTTaact < 2:731476/99‑3 (MQ=255) aaGGGTGATTACGGTGGCAAAAACGGCAAATTCCGTGTTTTATGGCACATTAACGGGGCTTTTGCTGAAAAAATGCGCGGTCAGAAAATTATTTTAAAt < 2:1893227/99‑1 (MQ=38) aGTGTGATTACGGTTGCAAAAACGGCAAATTGCTTGTTTTATGGCACATTAACGGGGCTTTTGCTGAAAAAATGCGCGGTCAGAAAATTATTTTAAAtt < 2:1478067/99‑1 (MQ=255) gtgtGATTACGGTTGCAAAAACGGCAAATTGCTTGTTTTATGGCACATTAACGGGGCTTTTGCTGAAAAAATGCGCGGTCAGAAAATTATTTTAAAttt > 1:3805058/1‑99 (MQ=255) tgtgATTACGGTTGCAAAAACGGCAAATTGCTTGTTTTATGGCACATTAACGGGGCTTTTGCTGAAAAAATGCGCGGTCATAAAATTATTTTAAATTTc > 1:3622470/1‑99 (MQ=255) tgtgATTACGGTTGCAAAAACGGCAAATTGCTTGTTTTATGGCACATTAACGGGGCTTTTGCTGAAAAAATGCGCGGTCAGAAAATTATTTTAAATTTc < 1:3262237/99‑1 (MQ=255) gATTACGGTTGCAAAAACGGCAAATTGCTTGTTTTATGGCACATTAACGGGGCTTTTGCTGAAAAAATGCGCGGTCAGAAAATTATTTTAAATTTCctc < 1:2752481/99‑1 (MQ=255) gATTACGGTTGCAAAAACGGCAAATTGCTTGTTTTATGGCACATTAACGGGGCTTTTGCTGAAAAAATGCGCGGTCAGAAAATTATTTTAAATTTCctc < 1:1066526/99‑1 (MQ=255) aTTACGGTTGCAAAAACGGCAAATTGCTTGTTTTATGGCACATTAACGGGGCTTTTGCTGAAAAAATGCGCGGTCAGAAAATTATTTTAAATTTCctct > 2:3262316/1‑99 (MQ=255) ttACGGTTGCAAAAACGGCAAATTGCTTGTTTTATGGCACATTAACGGGGCTTTTGCTGAAAAAATGCGCGGTCAGAAAATTATTTTAAATTTCCTCtt < 1:1753266/99‑1 (MQ=255) ttACGGTTGCAAAAACGGCAAATTGCTTGTTTTATGGCACATTAACGGGGCTTTTGCTGAAAAAATGCGCGGTCAGAAAATTATTTTAAATTTCCTCtt < 1:1335703/99‑1 (MQ=255) ggTTGCAAAAACGGCAAATTGCTTGTTTTATGGCACATTAACGGGGCTTTTGCTGAAAAAATGCGCGGTCAGAAAATTATTTTAAATTTCCTCTTGTCa > 1:2207492/1‑99 (MQ=255) ggTTGCAAAAACGGCAAATTGCTTGTTTTATGGCACATTAACGGGGCTTTTGCTGAAAAAATGCGCGGTCAGAAAATTATTTTAAATTTCCTCTTGTCa > 1:2079733/1‑99 (MQ=255) gTTGCAAAAACGGCAAATTGCTTGTTTTATTGCACATTAACGGGGCTTTTGCTGAAAAAATGCGCGGTCAGAAAATTATTTTAAATTTCCTCTTGTCAg < 1:74133/99‑1 (MQ=255) gTTGCAAAAACGGCAAATTGCTTGTTTTATGGCACATTAACGGGGCTTTTGCTGAAAAGATGGGCGGTGAGAAAATTATTTTAAATTTCCTCTTGTcgg > 2:822108/1‑97 (MQ=38) gTTGCAAAAACGGCAAATTGCTTGTTTTATGGCACATTAACGGGGCTTTTGCTGAAAAAATGCGCGGTCAGAAAATTATTTTAAATTTCCTCTTGTCAg > 2:382825/1‑99 (MQ=255) gTTGCAAAAACGGCAAATTGCTTGTTTTATGGCACATTAACGGGGCTTTTGCTGAAAAAATGCGCGGTCAGAAAATTATTTTAAATTTCCTCTTGTCAg < 1:882100/99‑1 (MQ=255) gCAAAAACGGCAAATTGCTTGTTTTATGGCACATTAACGGGGCTTTTGCTGAAAAAATGCGCGGTCAGAAAATTATTTTAAATTTCCTCTTGTCAGGcc < 1:1403799/99‑1 (MQ=255) aaaaaCGGCAAATTGCTTGTTTTATGGCACATTAACGGGGCTTTTGCTGAAAAAATGCGCGGTCAGAAAATTATTTTAAATTTCCTCTTGTCAGGCCgg > 2:2566457/1‑99 (MQ=255) aaaaCGGCAAATTGCTTGTTTTATGGCACATTAACGGGGCTTTTGCTGAAAAAATGCGCGGTCAGAAAATTATTTTAAATTTCCTCTTGTCAGGCCGGa < 1:1810711/99‑1 (MQ=255) aaCGGCAAATTGCTTGTTTTATGGCACATTAACGGGGCTTTTGCTGAAAAAATGCGCGGTCAGAAAATTATTTTAAATTTCCTCTTGTCAGGCCGGAAt < 1:1779254/99‑1 (MQ=255) cGGCAAATTGCTTGTTTTATGGCACATTAACGGGGCTTTTGCTGAAAAAATGCGCGGTCAGAAAATTATTTTAAATTTCCTCTTGTCAGGCCGGAATaa > 1:3963858/1‑99 (MQ=255) ggCAAATTGCGTGTTTTATGGCACATTAACGGGGCTTTTGCTGAAGAAATGCGCGGTCAGAAAATTATTTTAAATTTCCTCTTGTCAGGCCGGAATAAc > 2:3571600/1‑99 (MQ=255) gCAGATTGCTTGTTTTATGGCACATTAACGTGGTTTTTGCTGAAAAAATGCGCGGTTAGAAAATTATTTTAAATTTCCCCGTCTCAGGCCGGAATaaat < 2:1221331/99‑3 (MQ=21) aaaaGTGCTTGTTTTATGGCACATTAACGGGGCTTTTGCTGAAAAAATCCGCGGTCAGAAAATTATTTTAAATTTCCTCTTGTCAGGCCGGAATAACTc < 2:3483583/98‑1 (MQ=255) aaaTTGCTTGTTTTATGGCACATTAACGGGGCTTTTGCTGAAAAAATGCGCGGTCAGAAAATTATTTTAAATTTCCTCTTGTCAGGCCGGAATAACTcc < 2:3559191/99‑1 (MQ=255) aaaTTGCTTGTTTTATGGCACATTAACGGGGCTTTTGCTGAAAAAATGCGCGGTCAGAAAATTATTTTAAATTTCCTCTTGTCAGGCCGGAATAACTcc < 1:2307584/99‑1 (MQ=255) aaaTTGCTTGTTTTATGGCACATTAACGGGGCTTTTGCTGAAAAAATGCGCGGTCAGAAAATTATTTTAAATTTCCTCTTGTCAGGCCGGAATAACTcc > 1:1752408/1‑99 (MQ=255) aaaTTGCTTGTTTTATGGCACATTAACGGGGCTTTTGCTGAAAAAATGCGCGGTCAGAAAATTATTTTAAATTTCCTCTTGTCAGGCCGGAATAACTcc > 2:1428567/1‑99 (MQ=255) aTTGCTTGTTTTATGGCACATTAACGGGGCTTTTGCTGAAAAAATGCGCGGTCAGAAAATTATTTTAAATTTCCTCTTGTCAGGCCGGAATAACTCCCt > 1:1244205/1‑99 (MQ=255) ttGCTTGTTTTATGGCACATTAACGTGGCTTTTGCTGAAAAAATGGGCGGTCAGAAAATTATTTTAAATTTCCTCTTGTCAGGCCGGAATGACTCCCta < 2:3734697/99‑1 (MQ=255) tGCTTGTTTTATGGCACATTAACGGGGCTTTTGCTGAAAAAATGCGCGGTCAGAAAATTATTTTAAATTTCCTCTTGTCAGGCCGGAATAACTCCCtat < 1:11915/99‑1 (MQ=255) cTTGTTTTATGGCACATTAACGGGGCTTTTGCTGAAAAAATGCGCGGTCAGAAAATTATTTTAAATTTCCTCTTGTCAGGCCGGAATAACTCCCTATaa > 2:2822374/1‑99 (MQ=255) cTTGTTTTATGGCACATTAACGGGGCTTTTGCTGAAAAAATGCGCGGTCAGAAAATTATTTTAAATTTCCTCTTGTCAGGCCGGAATAACTCCCTATaa < 1:2469688/99‑1 (MQ=255) cTTGTTTTATGGCACATTAACGGGGCTTTTGCTGAAAAAATGCGCGGTCAGAAAATTATTTTAAATTTCCTCTTGTCAGGCCGGAATAACTCCCTATaa > 2:1245426/1‑99 (MQ=255) ttGTTTTATGGCACATTAACGGGGCTTTTGCTGAAAAAATGCGCGGTCAGAAAATTATTTTAAATTTCCTCTTGTCAGGCCGGAATAACTCCCTATAAt > 2:633528/1‑99 (MQ=255) tGTTTTATGGCACATTAACGGGGCTTTTGCTGAAAAAATGCGCGGTCAGAAAATTATTTTAAATTTCCTCTTGTCAGGCCGGAATAACTCCCTATAATg > 2:2606126/1‑99 (MQ=255) gTTTTATGGCACATTAACGGGGCTTTTGCTGAAAAAATGCGCGGTCAGAAAATTATTTTAAATTTCCTCTTGTCAGGCCGGAATAACTCCCTATAATgc < 1:2045498/99‑1 (MQ=255) aTGGCACATTAACGGGGCTTTTGCTGAAAAAATGCGCGGTCAGAAAATTATTTTAAATTTCCTCTTGTCAGGCCGGAATAACTCCCTATAATGCGccac < 1:11237/99‑1 (MQ=255) gCACATTAACGGGGCTTTTGCTGAAAAAATGCGCGGTCAGAAAATTATTTTAAATTTCCTCTTGTCAGGCCGGAATAACTCCCTATAATGCGCcaccac < 1:490292/99‑1 (MQ=255) gCACATTAACGGGGCTTTTGCTGAAAAAATGCGCGGTCAGAAAATTATTTTAAATTTCCTCTTGTCAGGCCGGAATAACTCCCTATAATGCGCcaccac > 2:1065926/1‑99 (MQ=255) acaTTAACGGGGCTTTTGCTGAAAAAATGCGCGGTCAGAAAATTATTTTAAATTTCCTCTTGTCAGGCCGGAATAACTCCCTATAATGCGCCACCACTg > 1:63192/1‑99 (MQ=255) aTTAACGGGGCTTTTGCTGAAAAAATGCGCGGTCAGAAAATTATTTTAAATTTCCTCTTGTCAGGCCGGAATAACTCCCTATAATGCGCCACCACTGac > 1:2764720/1‑99 (MQ=255) aTTAACGGGGCTTTTGCTGAAAAAATGCGCGGTCAGAAAATTATTTTAAATTTCCTCTTGTCAGGCCGGAATAACTCCCTATAATGCGCCACCACTGac < 2:307065/99‑1 (MQ=255) aTTAACGGGGCTTTTGCTGAAAAAATGCGCGGTCAGAAAATTATTTTAAATTTCCTCTTGTCAGGCCGGAATAACTCCCTATAATGCGCCACCACTGac > 1:1793083/1‑99 (MQ=255) aTTAACGGGGCTTTTGCTGAAAAAATGCGCGGTCAGAAAATTATTTTAAATTTCCTCTTGTCAGGCCGGAATAACTCCCTATAATGCGCCACCACTGac > 2:1417013/1‑99 (MQ=255) tAACGGGGCTTTTGCTGAAAAAATGCGCGGTCAGAAAATTATTTTAAATTTCCTCTTGTCAGGCCGGAATAACTCCCTATAATGCGCCACCACTGacac < 2:459714/99‑1 (MQ=255) aCGGGGCTTTTGCGGGAAAAATGCGCGGTCAGAAAATTATTTTAAATTTCCTCTTGTCAGGCCGGGATAACTCCCTATAATGCGCCGCCACTGACACgg > 2:1595735/1‑99 (MQ=14) ggggCTTTTGCTGAAAAAATGCGCGGTCCGAAAATTATTATAAATTTCCTCTTGTCAGGCCGGAATAACTCCCTACAATGCGCCACCACTGACACGGaa > 2:244595/1‑99 (MQ=255) ggggCTTTTGCTGAAAAAATGCGCGGTCAGAAAATTATTTTAAATTTCCTCTTGTCAGGCCGGAATAACTCCCTATAATGCGCCACCACTGACACGGaa < 1:350471/99‑1 (MQ=255) ggggCTTTTGCTGAAAAAATGCGCGGTCAGAAAATTATTTTAAATTTCCTCTTGTCAGGCCGGAATAACTCCCTATAATGCGCCACCACTGACACGGaa < 1:3545748/99‑1 (MQ=255) gggCTTTTGCTGAAAAAATGCGCGGTCAGAAAATTATTTTAAATTTCCTCTTGTCAGGCCGGAATAACTCCCTATAATGCGCCACCACTGACACGGaac > 2:341192/1‑99 (MQ=255) ggCTTTTGCTGAAAAAATGCGCGGTCAGAAAATTATTTTAAATTTCCTCTTGTCAGGCCGGAATAACTCCCTATAATGCGCCACCACTGACACGGaaca > 1:1170084/1‑99 (MQ=255) ttttGCTGAAAAAATGCGCGGTCAGAAAATTATTTTAAATTTCCTCTTGTCAGGCCGGAATAACTCCCTATAATGCGCCACCACTGACACGGAACAACg < 1:1883826/99‑1 (MQ=39) ttttGCTGAAAAAATGCGCGGTCAGAAAATTATTTTAAATTTCCTCTTGTCAGGCCGGAATAACTCCCTATAATGCGCCACCACTGACACGGAACAACg < 2:1365632/99‑1 (MQ=39) tttGCTGAAAAAATGCGCGGTCAGAAAATTATTTTAAATTTCCTCTTGTCAGGCCGGAATAACTCCCTATAATGCGCCACCACTGACACGGAACAACgg < 2:2777/99‑1 (MQ=38) ttGCTGAAAAAATGCGCGGTCAGAAAATTATTTTAAATTTCCTCTTGTCAGGCCGGAATAACTCCCTATAATGCGCCACCACTGACACGGAACAACGGc < 2:1987702/99‑1 (MQ=37) tGCTGAAAAAATGCGCGGTCAGAAAATTATTTTAAATTTCCTCTTGTCAGGCCGGAATAACTCCCTATAATGCGCCACCACTGACACGGAACAACGGCa < 1:1763738/99‑1 (MQ=35) gCTGAAAAAATGCGCGGTCAGAAAATTATTTTAAATTTCCTCTTGTCAGGCCGGAATAACTCCCTATAATGCGCCACCACTGACACGGAACAACGGCaa > 2:1486455/1‑99 (MQ=34) tGAAAACATGCGCGGTCAGATAATTATTTTAAATTTCCTCTTGTCAGGCCGGAATAACTCTCTATAATGCGCCACCCCTGACACGGAACACCTGCAAac > 2:1657547/1‑99 (MQ=11) tGAAAAAATGCGCGGTCAGAAAATTATTTTAAATTTCCTCTTGTCAGGCCGGAATAACTCCCTATAATGCGCCACCACTGACACGGAACAACGGCAAac > 1:562972/1‑99 (MQ=32) gAAAAAATGCGCGGTCAGAAAATTATTTTAAATTTCCTCTTGTCAGGCCGGAATAACTCCCTATAATGCGCCACCACTGACACGGAACAACGGCAAaca > 1:1340256/1‑99 (MQ=31) gAAAAAATGCGCGGTCAGAAAATTATTTTAAATTTCCTCTTGTCAGGCAGGAATAACTCCCTATAATGCGCCACCACTGACACGGAACAACGGCAAaca < 2:3421572/99‑1 (MQ=14) | TTTTTATTCCTCCTTAGTATGCCACCAGGAAGTGTGATTACGGTTGCAAAAACGGCAAATTGCTTGTTTTATGGCACATTAACGGGGCTTTTGCTGAAAAAATGCGCGGTCAGAAAATTATTTTAAATTTCCTCTTGTCAGGCCGGAATAACTCCCTATAATGCGCCACCACTGACACGGAACAACGGCAAACA > NC_000913/3941346‑3941539 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |