| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 805359 = | 275 (0.960) | 12 (0.050) | 7/126 | NT | 6.2% | intergenic (‑284/+57) | dtpT/queF | Di‑/tripeptide transporter/NADPH‑dependent 7‑cyano‑7‑deazaguanine reductase |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 805402 = | 146 (0.650) | intergenic (‑327/+14) | dtpT/queF | Di‑/tripeptide transporter/NADPH‑dependent 7‑cyano‑7‑deazaguanine reductase | |||||
Only 100 of 117 total aligned reads displayed.
ATCGTTTGATGAATCATGATTTATATCCCGAAAAAATAGATAATCGTTAAATGTATCATTTAATAAACACACCAATAAGTTGATTTTCCTAACTTATTGGTGTGTTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < USA300TCH1516_ALE/805465‑805359‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aacttattggtgtgtttATTAAATGATACATTTAACGATTATCTATTTTTTCGGGATATAAATCATGATTCATCAAACGATGCTCAGCCATTTTTTCATATTTAGAA > USA300TCH1516_ALE/805402‑805491 taGTTTGATGAATCATGATAAATAAAAAAAAAAAATAGATAATCGTTAAATGTATCATTTAATAAACACACCAATAAGTTGATTTTCCTAA < 2:67799/89‑1 TCGTTTGATGAATCATGATTTATATCCCGAAAAAATAGATAATCGTTAAATGTATCATTTAATAAACACACCAATAAGTTGATTTTCCTAA < 2:1318042/91‑1 TCGTTTGATGAATCATGATTTATATCCCGAAAAAATAGATAATCGTTAAATGTATCATTTAATAAACACACCAATAAGTTGATTTTCCTAA > 1:959818/1‑91 TCGTTTGATGAATCATGATTTATATCCCGAAAAAATAGATAATCGTTAAATGTATCATTTAATAAACACACCAATAAGTTGATTTTCCTAA < 2:1446720/91‑1 TCGTTTGATGAATCATGATTTATATCCCGAAAAAATAGATAATCGTTAAATGTATCATTTAATAAACACACCAATAAGTTGATTTTCCTAA < 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USA300TCH1516_ALE/805402‑805491 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |