| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 2733754 = | 244 (0.850) | 7 (0.030) | 7/146 | NT | 2.8% | intergenic (+67/+62) | cocE/panD | Cocaine esterase/Aspartate 1‑decarboxylase |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 2733788 = | 259 (0.990) | intergenic (+101/+28) | cocE/panD | Cocaine esterase/Aspartate 1‑decarboxylase | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 410 total aligned reads displayed.
TAATCATTCCTATCGTTAATTGATATGCAGCAATTACGGTCGCTTTTGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTCAT > USA300TCH1516_ALE/2733665‑2733844 | tAATCATTCCTATCGTTAATTGATATGCAGCAATTACGGTCGCTTTTGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGC > 2:2604025‑M1/1‑91 (MQ=255)tAATCATTCCTATCGTTAATTGATATGCAGCAATTACGGTCGCTTTTGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGC > 1:405293‑M1/1‑91 (MQ=255)gaatgaagataatgtcattattgaaatgattcatgaaaaagaaaatacgatagtgttataaaattaaatagccatcaataataaaaaggGc < 1:389718‑M1/2‑1 (MQ=255) aatgaagataatgtcattattgaaatgattcatgaaaaagaaaatacgatagtgttataaaattaaatagccatcaataataaaaaggGcc > 1:215825‑M1/89‑91 (MQ=255) aatgaagataatgtcattattgaaatgattcatgaaaaagaaaatacgatagtgttataaaattaaatagcaaaaaataataaaaaggGcc > 2:890695‑M1/89‑91 (MQ=255) aaTCATTCCTATCGTTAATTGATATGCAGCAATTACGGTCGCTTTTGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCC < 1:3237028‑M1/91‑1 (MQ=255) atgaagataatgtcattattgaaatgattcatgaaaaagaaaatacgatagtgttataaaattaaatagccatcaataataaaaaggGCca > 2:5488822‑M1/88‑91 (MQ=255) aTCATTCCTATCGTTAATTGATATGCAGCAATTACGGTCGCTTTTGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCA > 1:1905877‑M1/1‑91 (MQ=255) aTCATTCCTATCGTTAATTGATATGCAGCAATTACGGTCGCTTTTGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCA > 1:2180719‑M1/1‑91 (MQ=255) tgaagataatgtcattattgaaatgattcatgaaaaagaaaatacgatagtgttataaaattaaatagccatcaataataaaaaggGCcac < 1:2291737‑M1/5‑1 (MQ=255) gaagataatgtcattattgaaatgattcatgaaaaagaaaatacgatagtgttataaaattaaatagccatcaataataaaaaggGCcaca > 1:4831356‑M1/86‑91 (MQ=255) cATTCCTATCGTTAATTGATATGCAGCAATTACGGTCGCTTTTGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACA > 1:2086405‑M1/1‑91 (MQ=255) aagataatgtcattattgaaatgattcatgaaaaagaaaatacgatagtgttataaaattaaatagccatcaataataaaaaggGCCacac > 2:815724‑M1/85‑91 (MQ=255) aagataatgtcattattgaaatgattcatgaaaaagaaaatacgatagtgttataaaattaaatagccatcaataataaaaaggGCCacac < 2:5074210‑M1/7‑1 (MQ=255) aagataatgtcattattgaaatgattcatgaaaaagaaaatacgatagtgttataaaattaaatagccatcaataataaaaaggGCCacac < 1:2565605‑M1/7‑1 (MQ=255) aagataatgtcattattgaaatgattcatgaaaaagaaaatacgatagtcttataaaattaaatagccatcaataataagaaggGCCacac < 2:5628473‑M1/7‑1 (MQ=255) tCCTATCGTTAATTGATATGCAGCAATTACGGTCGCTTTTGATTAAAAGTGACATAGTGGTAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGc < 1:5505351/91‑1 (MQ=255) tCCTATCGTTAATTGATATGCAGCAATTACGGTCGCTTTTGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGc > 1:4919393/1‑91 (MQ=255) ccTATCGTTAATTGATATGCAGCAATTACGGTCGCTTTTGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCt > 2:3229453/1‑91 (MQ=255) cTATCGTTAATTGATATGCAGCAATTACGGTCGCTTTTGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCtt < 2:5574164/91‑1 (MQ=255) aTCGTTAATTGATATGCAGCAATTACGGTCGCTTTTGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTgg < 2:4769239/91‑1 (MQ=255) aTCGTTAATTGATATGCAGCAATTACGGTCGCTTTTGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTgg < 1:1348028/91‑1 (MQ=255) aTCGTTAATTGATATGCAGCAATTACGGTCGCTTTTGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTgg > 1:3384275/1‑91 (MQ=255) gTTAATTGATATGCAGCAATTACGGTCGCTTTTGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTTTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAAt > 1:4351886/1‑91 (MQ=255) tAATTGATATGCAGCAATTACGGTCGCTTTTGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACcttggtttaag < 2:4461108‑M1/91‑12 (MQ=255) aTTGATATGCAGCAATTACGGTCGCTTTTGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACAAGCTTGGAATCTTa > 2:3512188/1‑91 (MQ=255) gATATGCAGCAATTACGGTCGCTTTTGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACcttggtttaagattcc < 1:1656652‑M1/91‑17 (MQ=255) atatGCAGCAATTACGGTCGCTTTTGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACCCGCTTGGAATCTTAAAcc < 2:2847229/91‑1 (MQ=255) tatGCAGCAATTACGGTCGCTTTTGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCa < 2:3648483/91‑1 (MQ=255) tatGCAGCAATTACGGTCGCTTTTGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCa > 2:2500942/1‑91 (MQ=255) attcatgaaaaagaaaatacgatagtgttataaaattaaatagccatcaataatagaaaggGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGgtg > 1:3990382‑M1/62‑91 (MQ=255) caATTACGGTCGCTTTTGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACcttggtttaagattccaagcgtgtg < 1:1185414‑M1/91‑26 (MQ=255) aaTTACGGTCGCTTTTGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGgtgtgg < 2:4132171‑M2/91‑7 (MQ=255) aaTTACGGTCGCTTTTGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGgtgtgg > 1:5134908‑M2/1‑85 (MQ=255) aTTACGGTCGCTTTTGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGgtgtggc < 2:2956704‑M2/91‑8 (MQ=255) aTTACGGTCGCTTTTGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGgtgtggc > 1:4105369‑M2/1‑84 (MQ=255) aTTACGGTCGCTTTTGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGgtgtggc > 1:563671‑M2/1‑84 (MQ=255) aaaaagaaaatacgatagtgttataaaattaaatagccatcaataataaaaaggGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCt > 1:5445355‑M1/55‑91 (MQ=255) cGGTCGCTTTTGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCtt > 1:419391/1‑91 (MQ=255) cGGTCGCTTTTGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCtt > 1:4589504/1‑91 (MQ=255) gTCGCTTTTGATTAAAAGTGACATGGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCtttt < 2:4066067/91‑1 (MQ=255) tCGCTTTTGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCttttt < 1:145412/91‑1 (MQ=255) gCTTTTGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTttat < 2:3375967/91‑1 (MQ=255) cTTTTGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTttatt < 2:4138510/91‑1 (MQ=255) ttGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTattatt < 2:1661965/91‑1 (MQ=255) tGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTg > 1:5371563/1‑91 (MQ=255) tGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTg < 2:730088/91‑1 (MQ=255) gATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGa > 1:2615998/1‑91 (MQ=255) gATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGa < 2:755887/91‑1 (MQ=255) aTTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGAt > 2:5137352/1‑91 (MQ=255) aTTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGAt > 2:2007892/1‑91 (MQ=255) ttAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATg < 2:396783/91‑1 (MQ=255) tAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATgg > 2:1471480/1‑91 (MQ=255) aaaGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCt > 1:3747733/1‑91 (MQ=255) aaGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTa < 1:5259464/91‑1 (MQ=255) aaGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTa < 1:3310781/91‑1 (MQ=255) aaGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTa < 2:2719407/91‑1 (MQ=255) gTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTAtt < 2:911844/91‑1 (MQ=255) tGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTAttt < 1:1718782/91‑1 (MQ=255) aCATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTaa > 1:2693630/1‑91 (MQ=255) cATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGgtgtggctttctcttgttatacagtcctatcact < 2:1224171‑M2/91‑35 (MQ=255) cATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAAt < 1:1152086/91‑1 (MQ=255) cATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAAt < 2:1864834/91‑1 (MQ=255) aTAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAAtt > 2:2984835/1‑91 (MQ=255) tAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAAttt > 1:3496840/1‑91 (MQ=255) tAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAAttt > 2:2281454/1‑91 (MQ=255) aGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAAtttt > 2:3028654/1‑91 (MQ=255) gTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTta > 1:1503498/1‑91 (MQ=255) gTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTta < 1:2985342/91‑1 (MQ=255) tGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTtat < 1:1551979/91‑1 (MQ=255) tGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTtat < 1:939734/91‑1 (MQ=255) aTAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATaa < 1:1610829/91‑1 (MQ=255) aCTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTa < 2:643881/91‑1 (MQ=255) aCTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTa > 1:5040395/1‑91 (MQ=255) cTGTATAACAAGGGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTAt < 2:109367/91‑1 (MQ=255) tGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAGGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATc > 2:5209057/1‑91 (MQ=255) tataACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAGTCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTACTTACGTTTATAACACTATCGt > 2:4079185/1‑91 (MQ=255) ataACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTa > 1:4679331/1‑91 (MQ=255) taACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTAt < 1:817660/91‑1 (MQ=255) taACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTAt < 2:2070849/91‑1 (MQ=255) taACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTAt > 2:494589/1‑91 (MQ=255) aCAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTAttt < 2:2408644/91‑1 (MQ=255) aCAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTAttt > 2:2451903/1‑91 (MQ=255) aCAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTAttt > 1:648476/1‑91 (MQ=255) cAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACCCTATCGTAtttt > 2:4116971/1‑91 (MQ=255) cAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTAtttt < 1:312256/91‑1 (MQ=255) agaAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCttt > 1:3459842/1‑91 (MQ=255) agaAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCttt > 1:1949890/1‑91 (MQ=255) agaAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCttt > 1:2027119/1‑91 (MQ=255) agaAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCttt > 1:2445198/1‑91 (MQ=255) aagtgccacACcttggtttaagattccaatcgtgtggctttctcttgttatacagtcctatcactatgtcacttttaatcaaaagcgaccg < 2:432569‑M1/87‑81 (MQ=255) aaaGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCttttt > 1:2796925/1‑91 (MQ=255) aaGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTc < 2:1381799/91‑1 (MQ=255) aaGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTc > 2:4602779/1‑91 (MQ=255) aGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTCa > 2:3927756/1‑91 (MQ=255) aGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTCa < 2:3826749/91‑1 (MQ=255) aGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTCa > 1:4390173/1‑91 (MQ=255) gCCACACcttggtttaagattccaagcgtgtggctttctcttgttatacagtcctatcactatgtcacttttaatcaaaagcgaccgtaat > 1:2883036‑M1/1‑7 (MQ=255) GCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTCAt > 2:4265784‑M1/1‑91 (MQ=255) GCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTCAt > 1:1082869‑M1/1‑91 (MQ=255) | TAATCATTCCTATCGTTAATTGATATGCAGCAATTACGGTCGCTTTTGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTCAT > USA300TCH1516_ALE/2733665‑2733844 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |