| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 2733760 | 268 (0.930) | 12 (0.050) | 9/146 | NT | 4.6% | intergenic (+73/+56) | cocE/panD | Cocaine esterase/Aspartate 1‑decarboxylase |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 2733780 | 259 (0.990) | intergenic (+93/+36) | cocE/panD | Cocaine esterase/Aspartate 1‑decarboxylase | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 413 total aligned reads displayed.
ATTCCTATCGTTAATTGATATGCAGCAATTACGGTCGCTTTTGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTCATGAATCA > USA300TCH1516_ALE/2733670‑2733850 | aagataatgtcattattgaaatgattcatgaaaaagaaaatacgatagtgttataaaattaaatagccatcaataataaaaaggGCCacac > 1:2650343‑M1/85‑91 (MQ=255)aTTCCTATCGTTAATTGATATGCAGCAATTACGGTCGCTTTTGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACAC < 2:5281871‑M1/91‑1 (MQ=255) tCCTATCGTTAATTGATATGCAGCAATTACGGTCGCTTTTGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGc > 1:3449415/1‑91 (MQ=255) tCCTATCGTTAATTGATATGCAGCAATTACGGTCGCTTTTGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGc > 1:5447272/1‑91 (MQ=255) ccTATCGTTAATTGATATGCAGCAATTACGGTCGCTTTTGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCt < 2:791325/91‑1 (MQ=255) tATCGTTAATTGATATGCAGCAATTACGGTCGCTTTTGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTg < 1:3781326/91‑1 (MQ=255) aTCGTTAATTGATATGCAGCAATTACGGTCGCTTTTGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTgg < 2:4769239/91‑1 (MQ=255) aTCGTTAATTGATATGCAGCAATTACGGTCGCTTTTGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTgg > 2:3189448/1‑91 (MQ=255) aTCGTTAATTGATATGCAGCAATTACGGTCGCTTTTGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTgg < 1:1699468/91‑1 (MQ=255) tAATTGATATGCAGCAATTACGGTCGCTTTTGATTAAACGTGACATAGTGATAGGACTGTATAAAAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCt > 2:5580960/1‑91 (MQ=255) tAATTGATATGCAGCAATTACGGTCGCTTTTGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACcttggtttaag < 2:4461108‑M1/91‑12 (MQ=255) aTTGATATGCAGCAATTACGGTCGCTTTTGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTa < 1:2793720/91‑1 (MQ=255) ttGATATGCAGCAATTACGGTCGCTTTTGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTaa < 1:4377405/91‑1 (MQ=255) tGATATGCAGCAATTACGGTCGCTTTTGATTAATAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACcttggtttaagattc < 2:4117648‑M1/91‑16 (MQ=255) gATATGCAGCAATTACGGTCGCTTTTGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAAc < 2:2411063/91‑1 (MQ=255) atatGCAGCAATTACGGTCGCTTTTGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAAcc < 1:1468178/91‑1 (MQ=255) tatGCAGCAATTACGGTCGCTTTTGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCa > 2:2500942/1‑91 (MQ=255) tatGCAGCAATTACGGTCGCTTTTGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCa > 1:566116/1‑91 (MQ=255) caATTACGGTCGCTTTTGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACcttggtttaagattccaagcgtgtg < 1:1185414‑M1/91‑26 (MQ=255) caATTACGGTCGCTTTTGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGgtgtg > 1:4981053‑M2/1‑86 (MQ=255) aaTTACGGTCGCTTTTGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGgtgtgg < 1:1969596‑M2/91‑7 (MQ=255) aaTTACGGTCGCTTTTGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGgtgtgg > 2:5629085‑M2/1‑85 (MQ=255) aaTTACGGTCGCTTTTGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGgtgtgg < 1:1448881‑M2/91‑7 (MQ=255) aaTTACGGTCGCTTTTGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGgtgtgg < 2:4132171‑M2/91‑7 (MQ=255) aTTACGGTCGCTTTTGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGgtgtggc > 1:4105369‑M2/1‑84 (MQ=255) aCGGTCGCTTTTGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCt > 2:5124489/1‑91 (MQ=255) cGGTCGCTTTTGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCtt > 1:2842218/1‑91 (MQ=255) cGGTCGCTTTTGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCtt > 1:4589504/1‑91 (MQ=255) ggTCGCTTTTGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACTAAGGTGTGGCCCttt > 2:2123477/1‑91 (MQ=255) ggTCGCTTTTGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCttt < 1:1155869/91‑1 (MQ=255) tCGCTTTTGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCttttt > 1:2202079/1‑91 (MQ=255) cGCTTTTGATTAAAAGGGACATAGTGAGAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCGAGGTGTGGCCCTTTtta < 1:2088329/91‑1 (MQ=255) cTTTTGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTttatt < 2:4138510/91‑1 (MQ=255) cTTTTGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTttatt < 1:2031724/91‑1 (MQ=255) ttttGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTttatta < 1:4850271/91‑1 (MQ=255) tttGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCACGGTGTGGCCCTTTTtattat > 2:2840053/1‑91 (MQ=255) ttAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGAGTGGCCCTTTTTATTATTGATg < 2:4303670/91‑1 (MQ=255) tAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGATAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATgg > 1:3997638/1‑91 (MQ=255) aaaaGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGc > 2:4922995/1‑91 (MQ=255) aaaGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCt > 1:3380968/1‑91 (MQ=255) aaGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTa > 1:3955599/1‑91 (MQ=255) gTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTAtt < 1:4195569/91‑1 (MQ=255) aCATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTaa < 1:330547/91‑1 (MQ=255) aCATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTaa > 2:406632/1‑91 (MQ=255) aCATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTaa > 1:2693630/1‑91 (MQ=255) aCATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTaa > 1:1583569/1‑91 (MQ=255) cATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAAt < 2:1864651/91‑1 (MQ=255) tAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAAttt > 2:2281454/1‑91 (MQ=255) aGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACcttggtttaagattccaagcgtgtggctttctcttgttatacagtcctatcactatg < 2:1224171‑M1/91‑58 (MQ=255) aGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAAtttt > 2:3028654/1‑91 (MQ=255) aGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAAtttt > 2:903774/1‑91 (MQ=255) aGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAAtttt > 1:55627/1‑91 (MQ=255) gTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTta < 1:2985391/91‑1 (MQ=255) tGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTtat < 1:939734/91‑1 (MQ=255) aTAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCC‑TTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAac < 1:3156274/91‑1 (MQ=255) ggACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAacac < 1:638196/91‑1 (MQ=255) gACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACt < 2:1989808/91‑1 (MQ=255) cTGTATAACAAGGGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTAt < 2:109367/91‑1 (MQ=255) cTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCGAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTAt > 2:3787551/1‑91 (MQ=255) tGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATc < 1:2919253/91‑1 (MQ=255) ataACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTa > 1:4679331/1‑91 (MQ=255) taACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTAt > 1:1781604/1‑91 (MQ=255) aaCAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTAtt < 1:1633361/91‑1 (MQ=255) aCAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTAttt > 2:2451903/1‑91 (MQ=255) aCAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTAttt < 2:2693445/91‑1 (MQ=255) aCAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTAttt > 1:795063/1‑91 (MQ=255) cAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATTGTAtttt < 2:4013760/91‑1 (MQ=255) cAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTAtttt < 1:1266342/91‑1 (MQ=255) agaAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCttt > 1:150984/1‑91 (MQ=255) agaAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCttt < 2:4081435/91‑1 (MQ=255) agaAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCttt > 1:2445198/1‑91 (MQ=255) gaAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCtttt > 1:5381135/1‑91 (MQ=255) aaaGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGgtgtggctttctcttgttatacagtcctatcactatgtcacttttaatcaaaagcgaccgt < 1:3494787‑M2/91‑62 (MQ=255) aaGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAATACTATCGTATTTTCTTTTTc > 2:3272170/1‑91 (MQ=255) aaGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTc < 2:1381799/91‑1 (MQ=255) aaGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTc > 2:4602779/1‑91 (MQ=255) aaGCCACACGCGTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTCATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTACtttttt > 2:715767/1‑90 (MQ=255) aGCCACTCGCTTGGAATCTTAAACCATGGTGTTGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTCa < 2:3576454/91‑1 (MQ=255) aGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTCa > 1:1927728/1‑91 (MQ=255) aGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTCa > 2:1511240/1‑91 (MQ=255) aGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTCa < 2:3898369/91‑1 (MQ=255) gCCACACcttggtttaagattccaagcgtgtggctttctcttgttatacagtcctatcactatgtcacttttaatcaaaagcgaccgtaat < 2:2956704‑M1/91‑85 (MQ=255) GCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTCAt > 2:2979842‑M1/1‑91 (MQ=255) GCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTCAt > 1:2567258‑M1/1‑91 (MQ=255) GCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTCAt > 2:847046‑M1/1‑91 (MQ=255) GCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTCAt < 1:5321173‑M1/91‑1 (MQ=255) GCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTCAt > 1:1082869‑M1/1‑91 (MQ=255) ccACACcttggtttaagattccaagcgtgtggctttctcttgttatacagtcctatcactatgtcacttttaatcaaaagcgaccgtaatt > 2:741263‑M1/1‑6 (MQ=255) ccACACcttggtttaagattccaagcgtgtggctttctcttgttatacagtcctatcactatgtcacttttaatcaaaagcgaccgtaatt > 1:5134908‑M1/1‑6 (MQ=255) ccACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGgtgtggctttctcttgttatacagtcctatcactatgtcacttttaatcaaaagcgaccgtaatt < 2:3943505‑M2/91‑66 (MQ=255) CCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTCATg < 2:162016‑M1/91‑1 (MQ=255) CCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTCATg < 1:3729503‑M1/91‑1 (MQ=255) cacaCcttggtttaagattccaagcgtgtggctttctcttgttatacagtcctatcactatgtcacttttaatcaaaagcgaccgtaattg > 2:5186946‑M1/1‑5 (MQ=255) cacaCcttggtttaagattccaagcgtgtggctttctcttgttatacagtcctatcactatgtcacttttaatcaaaagcgaccgtaattg < 1:4391338‑M1/91‑87 (MQ=255) ACACGCTTGGATTCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTGAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTCATGaa > 2:2578596‑M1/1‑91 (MQ=255) ACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTCATGaa > 2:5042402‑M1/1‑91 (MQ=255) ACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTCATGaa < 2:3478329‑M1/91‑1 (MQ=255) accttggtttaagattccaagcgtgtggctttctcttgttatacagtcctatcactatgtcacttttaatcaaaagcgaccgtaattgctg < 1:496826‑M1/91‑90 (MQ=255) ACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTCATGAATc > 1:5201298‑M1/1‑91 (MQ=255) CGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTCATGAATCa < 2:2029508‑M1/91‑1 (MQ=255) | ATTCCTATCGTTAATTGATATGCAGCAATTACGGTCGCTTTTGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTCATGAATCA > USA300TCH1516_ALE/2733670‑2733850 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |