| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 2733760 | 268 (0.930) | 12 (0.050) | 9/146 | NT | 4.6% | intergenic (+73/+56) | cocE/panD | Cocaine esterase/Aspartate 1‑decarboxylase |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 2733780 | 259 (0.990) | intergenic (+93/+36) | cocE/panD | Cocaine esterase/Aspartate 1‑decarboxylase | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 379 total aligned reads displayed.
GCAGCAATTACGGTCGCTTTTGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTCATGAATCATTTCAATAATGACATTATCT > USA300TCH1516_ALE/2733691‑2733870 | agcaATTACGGTCGCTTTTGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGgtg < 1:2178073‑M2/91‑4 (MQ=255) caATTACGGTCGCTTTTGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGgtgtg < 1:4391338‑M2/91‑6 (MQ=255) aaTTACGGTCGCTTTTGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGgtgtgg < 1:847489‑M2/91‑7 (MQ=255) ttACGGTCGCTTTTGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGcc < 1:3327301/91‑1 (MQ=255) aCGGTCGCTTTTGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCt > 2:5124489/1‑91 (MQ=255) aCGGTCGCTTTTGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCt > 2:2487103/1‑91 (MQ=255) cGGTCGCTTTTGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCtt > 1:419391/1‑91 (MQ=255) cGGTCGCTTTTGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCtt > 1:2842218/1‑91 (MQ=255) ggTCGCTTTTGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCttt > 2:3450842/1‑91 (MQ=255) ggTCGCTTTTGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCttt < 1:1155869/91‑1 (MQ=255) gTCGCTTTTGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCtttt > 1:5135986/1‑91 (MQ=255) gTCGCTTTTGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCtttt < 2:697780/91‑1 (MQ=255) tCGCTTTTGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCttttt < 1:145412/91‑1 (MQ=255) cTTTTGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTttatt < 1:2031724/91‑1 (MQ=255) cTTTTGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTttatt < 1:2676723/91‑1 (MQ=255) ttttGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTttatta < 1:4850271/91‑1 (MQ=255) tGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTg < 2:730088/91‑1 (MQ=255) tGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTg < 2:4975993/91‑1 (MQ=255) aTTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGAt > 2:2007913/1‑91 (MQ=255) ttAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGAGTGGCCCTTTTTATTATTGATg < 2:4303670/91‑1 (MQ=255) tAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGATAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATgg > 1:3997638/1‑91 (MQ=255) aaGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTa > 1:3955599/1‑91 (MQ=255) aaGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTa < 1:5259464/91‑1 (MQ=255) aaGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTa > 2:4741571/1‑91 (MQ=255) aGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCttt > 1:2588945/1‑89 (MQ=255) gTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTAtt < 1:437560/91‑1 (MQ=255) gACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTa < 2:5604616/91‑1 (MQ=255) aCATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTaa > 2:406632/1‑91 (MQ=255) cATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAAt < 2:1864651/91‑1 (MQ=255) aTAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAAtt > 2:797490/1‑91 (MQ=255) tAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAAttt > 2:3179169/1‑91 (MQ=255) aGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAAtttt > 2:3028654/1‑91 (MQ=255) gTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTta > 2:855661/1‑91 (MQ=255) tGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTtat < 1:1551979/91‑1 (MQ=255) tGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTtat < 1:4583307/91‑1 (MQ=255) aGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAaca > 2:1345174/1‑91 (MQ=255) ggACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAacac < 1:638196/91‑1 (MQ=255) gACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACt < 2:1989808/91‑1 (MQ=255) aCTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTa < 2:1077929/91‑1 (MQ=255) tGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAGGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATc > 2:5209057/1‑91 (MQ=255) tGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATc > 1:951737/1‑91 (MQ=255) tataACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGCTGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGt > 2:4135313/1‑91 (MQ=255) ataACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTa > 1:4679331/1‑91 (MQ=255) taACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTAt < 1:2246801/91‑1 (MQ=255) taACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTAt > 1:1781604/1‑91 (MQ=255) aaCAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTAtt < 1:3793920/91‑1 (MQ=255) aaCAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTAtt > 2:4150734/1‑91 (MQ=255) aaCAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTAtt < 1:1633361/91‑1 (MQ=255) aCAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTAttt < 2:2053825/91‑1 (MQ=255) aCAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTAttt < 2:2693445/91‑1 (MQ=255) cAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTAtttt < 1:1266342/91‑1 (MQ=255) cAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTAtttt > 1:1892834/1‑91 (MQ=255) cAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTAtttt > 1:3285654/1‑91 (MQ=255) agagAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCt < 2:4040545/91‑1 (MQ=255) agaAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCttt > 1:3459842/1‑91 (MQ=255) agaAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCttt < 2:4081435/91‑1 (MQ=255) agaAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCttt > 1:2445198/1‑91 (MQ=255) agaAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCttt > 2:1197662/1‑91 (MQ=255) agaAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCttt > 1:1950138/1‑91 (MQ=255) aaGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAATACTATCGTATTTTCTTTTTc > 2:3272170/1‑91 (MQ=255) aGCCACTCGCTTGGAATCTTAAACCATGGTGTTGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTCa < 2:3576454/91‑1 (MQ=255) aGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTCa > 2:1511240/1‑91 (MQ=255) aGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTCa > 2:439648/1‑91 (MQ=255) aGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTCa > 2:3927756/1‑91 (MQ=255) GCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTCAt < 1:5321173‑M1/91‑1 (MQ=255) GCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTCAt > 2:2979842‑M1/1‑91 (MQ=255) GCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTCAt < 2:2335930‑M1/91‑1 (MQ=255) CCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTCATg < 1:5406860‑M1/91‑1 (MQ=255) CCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTCATg < 1:3729503‑M1/91‑1 (MQ=255) CCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTCATg < 2:162016‑M1/91‑1 (MQ=255) CCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTCATg > 1:2956704‑M1/1‑91 (MQ=255) CCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTCATg < 1:569947‑M1/91‑1 (MQ=255) CCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTCATg > 2:4919393‑M1/1‑91 (MQ=255) ACACGCTTGGATTCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTGAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTCATGaa > 2:2578596‑M1/1‑91 (MQ=255) ACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTCATGaa < 1:2753950‑M1/91‑1 (MQ=255) ACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTCATGAATc < 2:3829889‑M1/91‑1 (MQ=255) gCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTTATGAATCAt > 2:4508207/1‑91 (MQ=255) gCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCGTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTCATGAATCAt < 1:4993234/91‑1 (MQ=255) cTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTCATGAATCAtt < 2:2842218/91‑1 (MQ=255) ttGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTCATGAATCAttt < 2:2132735/91‑1 (MQ=255) tGGAATCTTAAACCAAGgtgtggctttctcttgttatacagtcctatcactatgtcacttttaatcaaaagcgaccgtaattgctgcatat < 1:1610662‑M2/91‑75 (MQ=255) ggAATCTTAAACCAAGgtgtggctttctcttgttatacagtcctatcactatgtcacttttaatcaaaagcgaccgtaattgctgcatatc < 2:4617328‑M2/91‑76 (MQ=255) ggAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTCATGAATCATTTCa > 1:3080770/1‑91 (MQ=255) gAATCTTAAACCAAGgtgtggctttctcttgttatacagtcctatcactatgtcactattaatcaaaagcgaccgtaattgctgcatatca < 2:4117648‑M2/91‑77 (MQ=255) aaTCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTCATGAATCATTTCaat > 2:913761/1‑91 (MQ=255) aaTCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTCATGAATCATTTCaat > 1:4966498/1‑91 (MQ=255) aaTCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTCATGAATCATTTCaat > 1:3601691/1‑91 (MQ=255) aTCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTCATGAATCATTTCaata > 1:1052115/1‑91 (MQ=255) tCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTCATGAATCATTTCaataa > 2:3963422/1‑91 (MQ=255) cTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTCATGAATCATTTCaataat < 2:4454062/91‑1 (MQ=255) tAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTCATGAATCATTTCAATAATGa < 1:4132171/91‑1 (MQ=255) tAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTCATGAATCATTTCAATAATGa > 1:1487552/1‑91 (MQ=255) aaaCCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTCATGAATCATTTCAATAATGAc < 1:711112/91‑1 (MQ=255) aaaCCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTCATGAATCATTTCAATAATGAc > 1:5457101/1‑91 (MQ=255) aaCCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTCATGAATCATTTCAATAATGACa > 2:2774507/1‑91 (MQ=255) aCCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTCATGAATCATTTCAATAATGACAt > 1:349739/1‑91 (MQ=255) aaGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTCATGAATCATTTCAATAATGACATTAt > 2:242353/1‑91 (MQ=255) aGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTCATGAATCATTTCAATAATGACATTATc < 2:2240813/91‑1 (MQ=255) ggTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTCATGAATCATTTCAATAATGACATTATCt > 1:1704637/1‑91 (MQ=255) ggTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTCATGAATCATTTCAATAATGACATTATCt > 1:1104097/1‑91 (MQ=255) | GCAGCAATTACGGTCGCTTTTGATTAAAAGTGACATAGTGATAGGACTGTATAACAAGAGAAAGCCACACGCTTGGAATCTTAAACCAAGGTGTGGCCCTTTTTATTATTGATGGCTATTTAATTTTATAACACTATCGTATTTTCTTTTTCATGAATCATTTCAATAATGACATTATCT > USA300TCH1516_ALE/2733691‑2733870 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |