| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 286957 | 235 (0.820) | 19 (0.080) | 10/140 | NT | 7.7% | intergenic (+36/‑303) | rihA/manR_1 | Pyrimidine‑specific ribonucleoside hydrolase RihA/Transcriptional regulator ManR |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 286973 | 252 (1.000) | intergenic (+52/‑287) | rihA/manR_1 | Pyrimidine‑specific ribonucleoside hydrolase RihA/Transcriptional regulator ManR | |||||
Only 100 of 357 total aligned reads displayed.
TGGAACTTGATAGACCATAAGTTACGTACATACGAATAATAATACTTAATTAAATAGATACAGTTAACCCTAAGGCGCCTGATATAAGCGTCCTTAGGGTTTTTGTATTGGGTTACAATGGTCATGACAATTTGATAATGATTGAGATATGTATGTTAAAAATGCTTCAAAAAAACACAAA > USA300TCH1516_ALE/286883‑287063 | tgGAACTTGATAGACCATAAGTTACGTACATACGAATAATAATACTTAATTAAATAGATACAGTTAACCCTAAGGCGCCTGATATAAGCGt > 1:102558/1‑91 (MQ=255)tgGAACTTGATAGACCATAAGTTACGTACATACGAATAATAATACTTAATTAAATAGATACAGTTAACCCTAAGGCGCCTGATATAAGCGt > 1:2356878/1‑91 (MQ=255) ggAACTTGATAGACCATAAGTTACGTACATACGAATAATAATACTTAATTAAATAGATACAGTTAACCCTAAGGCGCCTGATATAAGCGTc < 2:32888‑M2/91‑2 (MQ=255) ggAACTTGATAGACCATAAGTTACGTACATACGAATAATAATACTTAATTAAATAGATACAGTTAACCCTAAGGCGCCTGATATAAGCGTc < 1:2633728‑M2/91‑2 (MQ=255) ggAACTTGATAGACCATAAGTTACGTACATACGAATAATAATACTTAATTAAATAGATACAGTTAACCCTAAGGCGCCTGATATAAGCGTc < 1:1817396‑M2/91‑2 (MQ=255) gAACTTGATAGACCATAAGTTACGTACATACGAATAATAATACTTAATTAAATAGATACAGTTAACCCTAAGGCGCCTGATATAAGCGTcc < 1:2565524‑M2/91‑3 (MQ=255) aCTTGATAGACCATAAGTTACGTACATACGAATAATAATACTTAATTAAATAGATACAGTTAACCCTAAGGCGCCTGATATAAGCGTcctt > 2:3515800‑M2/1‑87 (MQ=255) aCTTGATAGACCATAAGTTACGTACATACGAATAATAATACTTAATTAAATAGATACAGTTAACCCTAAGGCGCCTGATATAAGCGTcctt > 2:4287576‑M2/1‑87 (MQ=255) aCTTGATAGACCATAAGTTACGTACATACGAATAATAATACTTAATTAAATAGATACAGTTAACCCTAAGGCGCCTGATATAAGCGTcctt > 2:1985438‑M2/1‑87 (MQ=255) aCTTGATAGACCATAAGTTACGTACATACGAATAATAATACTTAATTAAATAGATACAGTTAACCCTAAGGCGCCTGATATAAGCGTcctt > 1:896438‑M2/1‑87 (MQ=255) cTTGATAGACCATAAGTTACGTACATACGAATAATAATACTTAATTAAATAGATACAGTTAACCCTAAGGCGCCTGATATAAGCGTcctta > 1:775681‑M2/1‑86 (MQ=255) gATAGACCATAAGTTACGTACATACGAATAATAATACTTAATTAAATAGATACAGTTAACCCTAAGGCGCCTGATATAAGCGTccttaggg < 2:3866430‑M2/91‑9 (MQ=255) aTAGACCATAAGTTACGTACATACGAATAATAATACTTAATTAAATAGATACAGTTAACCCTAAGGCGCCTGATATAAGCGTccttagggt < 2:248894‑M2/91‑10 (MQ=255) aGACCATAAGTTACGTACATACGAATAATAATACTTAATTAAATAGATACAGTTAACCCTAAGGCGCCTGATATAAGCGTCCTTAGGGttt > 1:2248840/1‑91 (MQ=255) aGACCATAAGTTACGTACATACGAATAATAATACTTAATTAAATAGATACAGTTAACCCTAAGGCGCCTGATATAAGCGTCCTTAGGGttt > 1:5406124/1‑91 (MQ=255) aGACCATAAGTTACGTACATACGAATAATAATACTTAATTAAATAGATACAGTTAACCCTAAGGCGCCTGATATAAGCGTCCTTAGGGttt > 1:2887681/1‑91 (MQ=255) aGACCATAAGTTACGTACATACGAATAATAATACTTAATTAAATAGATACAGTTAACCCTAAGGCGCCTGATATAAGCGTCCTTAGGGttt > 1:4049972/1‑91 (MQ=255) gACCATAAGTTACGTACATACGAATAATAATACTTAATTAAATAGATACAGTTAACCCTAAGGCGCCTGATATAAGCGTCCTTAGGGtttt > 2:131822/1‑91 (MQ=255) ccATAAGTTACGTACATACGAATAATAATACTTAATTAAATAGATACAGTTAACCCTAAGGCGCCTGATATAAGCGTCCTTAGGGTTTTTg > 2:3909589/1‑91 (MQ=255) cATAAGTTACGTACATACGAATAATAATACTTAATTAAATAGATACAGTTAACCCTAAGGCGCCTGATATAAGCGTCCTTAGGGTTTTTGt < 1:4799651/91‑1 (MQ=255) cATAAGTTACGTACATACGAATAATAATACTTAATTAAATAGATACAGTTAACCCTAAGGCGCCTGATATAAGCGTCCTTAGGGTTTTTGt < 1:4884347/91‑1 (MQ=255) cATAAGTTACGTACATACGAATAATAATACTTAATTAAATAGATACAGTTAACCCTAAGGCGCCTGATATAAGCGTCCTTAGGGTTTTTGt < 2:5012135/91‑1 (MQ=255) tAAGTTACGTACATACGAATAATAATACTTAATTAAATAGATACAGTTAACCCTAAGGCGCCTGATATAAGCGTCCTTAGGGTTTTTGTAt < 1:325107/91‑1 (MQ=255) tAAGTTACGTACATACGAATAATAATACTTAATTAAATAGATACAGTTAACCCTAAGGCGCCTGATATAAGCGTCCTTAGGGTTTTTGTAt > 1:702001/1‑91 (MQ=255) aaaGTTACGTACATACGAATAATAATACTTAATTAAATAGATACAGTTAACCCTAAGGCGCCTGATATAAGCGTCCTTAGGGTTTTTGTAt < 1:1980457/90‑1 (MQ=255) aGTTACGTACATACGAATAATAATACTTAATTAAATAGATACAGTTAACCCTAAGGCGCCTGATATAAGCGTCCTTAGGGTTTTTGTATTg > 1:3094221/1‑91 (MQ=255) tACGTACATACGAATAATAATACTTAATTAAATAGATACAGTTAACCCTAAGGCGCCTGATATAAGCGTCCTTAGGGTTTTTGTATTGGGt > 1:2812209/1‑91 (MQ=255) cGTACATACGAATAATAATACTTAATTAAATAGATACAGTTAACCCTAAGGCGCCTGATATAAGCGTCCTTAGGGTTTTTGTATTGGGTTa > 1:5257091/1‑91 (MQ=255) aTACGAATAATAATACTTAATTAAATAGATACAGTTAACCCTAAGGCGCCTGATATAAGCGTCCTTAGGGTTTTTGTATTGGGTTACAATg > 1:3559255/1‑91 (MQ=255) aTACGAATAATAATACTTAATTAAATAGATACAGTTAACCCTAAGGCGCCTGATATAAGCGTCCTTAGGGTTTTTGTATTGGGTTACAATg > 2:444903/1‑91 (MQ=255) aTACGAATAATAATACTTAATTAAATAGATACAGTTAACCCTAAGGCGCCTGATATAAGCGTCCTTAGGGTTTTTGTATTGGGTTACAATg < 2:5314420/91‑1 (MQ=255) cGAATAATAATACTTAATTAAATAGATACAGTTAACCCTAAGGCGCCTGATATAAGCGTCCTTAGGGTTTTTGTATTGGGTTACAATGGTc > 1:3029011/1‑91 (MQ=255) cGAATAATAATACTTAATTAAATAGATACAGTTAACCCTAAGGCGCCTGATATAAGCGTCCTTAGGGTTTTTGTATTGGGTTACAATGGTc > 1:3628315/1‑91 (MQ=255) cGAATAATAATACTTAATTAAATAGATACAGTTAACCCTAAGGCGCCTGATATAAGCGTCCTTAGGGTTTTTGTATTGGGTTACAATGGTc > 2:2747920/1‑91 (MQ=255) cGAATAATAATACTTAATTAAATAGATACAGTTAACCCTAAGGCGCCTGATATAAGCGTCCTTAGGGTTTTTGTATTGGGTTACAATGGTc < 1:2408965/91‑1 (MQ=255) ataataataCTTAATTAAATAGATACAGTTAACCCTAAGGCGCCTGATATAAGCGTCCTTAGGGTTTTTGTATTGGGTTACAATGGTCATg > 1:1109961/1‑91 (MQ=255) taataataCTTAATTAAATAGATACAGTTAACCCTAAGGCGCCTGATATAAGCGTCCTTAGGGTTTTTGTATTGGGTTACAATGGTCATGa > 2:848013/1‑91 (MQ=255) aataataCTTAATTAAATAGATACAGTTAACCCTAAGGCGCCTGATATAAGCGTCCTTAGGGTTTTTGTATTGGGTTACAATGGTCATGAc < 2:2171217/91‑1 (MQ=255) aataataCTTAATTAAATAGATACAGTTAACCCTAAGGCGCCTGATATAAGCGTCCTTAGGGTTTTTGTATTGGGTTACAATGGTCATGAc > 2:3566719/1‑91 (MQ=255) ataataCTTAATTAAATAGATACAGTTAACCCTAAGGCGCCTGATATAAGCGTCCTTAGGGTTTTTGTATTGGGTTACAATGGTCATGACa > 2:4395371/1‑91 (MQ=255) aataCTTAATTAAATAGATACAGTTAACCCTAAGGCGCCTGATATAAGCGTCCTTAGGGTTTTTGTATTGGGTTACAATGGTCATGACAAt > 1:5648256/1‑91 (MQ=255) aCTTAATTAAATAGATACAGTTAACCCTAAGGCGCCTGATATAAGCGTCCTTAGGGTTTTTGTATTGGGTTACAATGGTCATGACAATTTg > 2:1853748/1‑91 (MQ=255) aCTTAATTAAATAGATACAGTTAACCCTAAGGCGCCTGATATAAGCGTCCTTAGGGTTTTTGTATTGGGTTACAATGGTCATGACAATTTg > 2:2429720/1‑91 (MQ=255) ttaattaaATAGATACAGTTAACCCTAAGGCGCCTGATATAAGCGTCCTTAGGGTTTTTGTATTGGGTTACAATGGTCATGACAATTTGAt < 2:763559/91‑1 (MQ=255) ttaattaaATAGATACAGTTAACCCTAAGGCGCCTGATATAAGCGTCCTTAGGGTTTTTGTATTGGGTTACAATGGTCATGACAATTTGAt < 2:1444354/91‑1 (MQ=255) taattaaATAGATACAGTTAACCCTAAGGCGCCAGATATAAGCGTCCTTAGGGTTTTTGTATTGGGTTACAATGGTCATGCCAATTTGATa > 1:5626725/1‑91 (MQ=255) attaaATAGATACAGTTAACCCTAAGGCGCCTGATATAAGCGTCCTTAGGGTTTTTGTATTGGGTTACAATGGTCATGACAATTTGATAAt > 1:2049291/1‑91 (MQ=255) attaaATAGATACAGTTAACCCTAAGGCGCCTGATATAAGCGTCCTTAGGGTTTTTGTATTGGGTTACAATGGTCATGACAATTTGATAAt < 2:4544587/91‑1 (MQ=255) taaATAGATACAGTTAACCCTAAGGCGCCTGATATAAGCGTCCTTAGGGTTTTTGTATTGGGTTACAATGGTCATGACAATTTGATAATGa < 1:84235/91‑1 (MQ=255) aaTAGATACAGTTAACCCTAAGGCGCCTGATATAAGCGTCCTTAGGGTTTTTGTATTGGGTTACAATGGTCATGACAATTTGATAATGAtt < 2:2612000/91‑1 (MQ=255) aaTAGATACAGTTAACCCTAAGGCGCCTGATATAAGCGTCCTTAGGGTTTTTGTATTGGGTTACAATGGTCATGACAATTTGATAATGAtt < 1:392743/91‑1 (MQ=255) aaTAGATACAGTTAACCCTAAGGCGCCTGATATAAGCGTCCTTAGGGTTTTTGTATTGGGTTACAATGGTCATGACAATTTGATAATGAtt > 1:4203293/1‑91 (MQ=255) aaTAGATACAGTTAACCCTAAGGCGCCTGATATAAGCGTCCTTAGGGTTTTTGTATTGGGTTACAATGGTCATGACAATTTGATAATGAtt < 2:583906/91‑1 (MQ=255) aTAGATTCAGTTAACCCTAAGGCGCCTGATATAAGCGTCCTTAGGGTTTTTGTATTGGGTTACAATGGTCATGACAATTTGATAATGATTg < 2:5178181/91‑1 (MQ=255) aTAGATACAGTTAACCCTAAGGCGCCTGATATAAGCGTCCTTAGGGTTTTTGTATTGGGTTACAATGGTCATGACAATTTGATAATGATTg < 1:429463/91‑1 (MQ=255) aTAGATACAGTTAACCCTAAGGCGCCTGATATAAGCGTCCTTAGGGTTTTTGTATAGGGTTACAATGGTCATGACAATTTGATAATGATTg > 2:4133677/1‑91 (MQ=255) aGATACAGTTAACCCTAAGGCGCCTGATATAAGCGTCCTTAGGGTTTTTTTATTTTTTTACAATGGTCATGACAATTTGATAATGATTgag > 2:2264055/1‑91 (MQ=255) gATACAGTTAACCCTAAGGCGCCTGATATAAGCGTCCTTAGGGTTTTTGTATTGGGTTACAATGGTCATGACAATTTGATAATGATTgaga > 2:4662608/1‑91 (MQ=255) aTACAGTTAACCCTAAGGCGCCTGATATAAGCGTCCTTAGGGTTTTTGTATTGGGTTACAATGGTCATGACAATTTGATAATGATTGAGat > 2:5201887/1‑91 (MQ=255) tACAGTTAACCCTAAGGCGCCTGATATAAGCGTCCTTAGGGTTTTTGTATTGGGTTACAATGGTCATGACAATTTGATAATGATTGAGata > 2:1098967/1‑91 (MQ=255) aCAGTTAACCCTAAGGCGCCTGATATAAGCGTCCTTAGGGTTTTTGTATTGGGTTACAATGGTCATGACAATTTGATAATGATTGAGatat > 1:3747772/1‑91 (MQ=255) cAGTTAACCCTAAGGCGCCTGATATAAGCGTCCTTAGGGTTTTTGTATTGGGTTACAATGGTCATGACAATTTGATAATGATTGAGAtatg < 1:4515155/91‑1 (MQ=255) aGTTAACCCTAAGGCGCCTGATATAAGCGTCCTTAGGGTTTTTGTATTGGGTTACAATGGTCATGACAATTTGATAATGATTGAGAtatgt > 2:1777404/1‑91 (MQ=255) aGTTAACCCTAAGGCGCCTGATATAAGCGTCCTTAGGGTTTTTGTATTGGGTTACAATGGTCATGACAATTTGATAATGATTGAGAtatgt > 1:1488533/1‑91 (MQ=255) aGTTAACCCTAAGGCGCCTGATATAAGCGTCCTTAGGGTTTTTGTATTGGGTTACAATGGTCATGACAATTTGATAATGATTGAGAtatgt > 2:3213003/1‑91 (MQ=255) tAACCCTAAGGCGCCTGATATAAGCGTCCTTAGGGTTTTTGTATTGGGTTACAATGGTCATGACAATTTGATAATGATTGAGAtatgtatg < 2:2963591/91‑1 (MQ=255) aaCCCTAAGGCGCCTGATATAAGCGTCCTTAGGGTTTTTGTATTGGGTTACAATGGTCATGACAATTTGATAATGATTGAGATatgtatgt < 1:2480747/91‑1 (MQ=255) aaCCCTAAGGCGCCTGATATAAGCGTCCTTAGGGTTTTTGTATTGGGTTACAATGGTCATGACAATTTGATAATGATTGAGATatgtatgt < 2:3629517/91‑1 (MQ=255) cccTAAGGCGCCTGATATAAGCGTccttagggttaactgtatctatttaattaagtattattattcgtatgtacgtaacttatggtctatc < 1:1954014‑M2/91‑68 (MQ=255) cccTAAGGCGCCTGATATAAGCGTCCTTAGGGTTTTTGTATTGGGTTACAATGGTCATGACAATTTGATAATGATTGAGATATGTATGTTa < 2:702001/91‑1 (MQ=255) ccTAAGGCGCCTGATTTAAGCGTCCTTAGGGTTTTTGTATTGGGTCACAATGGTCATGACAATTTGATAATGATTGAGATATGTATGTTaa < 2:5535955/91‑1 (MQ=255) aaGGCGCCTGATATAAGCGTccttagggttaactgtatctatttaattaagtattattattcgtatgtacgtaacttatggtctatcaagt < 1:3831466‑M2/91‑72 (MQ=255) aaGGCGCCTGATATAAGCGTCCTTAGGGTTTTTGTATTGGGTTACAATGGTCATGACAATTTGATAATGATTGAGATATGTATGTTaaaaa > 1:1680661/1‑91 (MQ=255) aaGGCGCCTGATATAAGCGTCCTTAGGGTTTTTGTATTGGGTTACAATGGTCATGACAATTTGATAATGATTGAGATATGTATGTTaaaaa < 2:4236295/91‑1 (MQ=255) aGGCGCCTGATATAAGCGTCCTTAGGGTTTTTGTATTGGGTTACAATGGTCATGACAATTTGATAATGATTGAGATATGTATGTTCAAAAt > 2:4970279/1‑91 (MQ=255) aGGCGCCTGATATAAGCGTCCTTAGGGTTTTTGTATTGGGTTACAATGGTCATGACAATTTGATAATGATTGAGATATGTATGTTAAAAAt > 2:1230487/1‑91 (MQ=255) gcgcCTGATATAAGCGTccttagggttaactgtatctatttaattaagtattattattcgtatgtacgtaacttatggtctatcaagttcc < 1:5357541‑M2/91‑75 (MQ=255) gcgcCTGATATAAGCGTCCTTAGGGTTTTTGTATTGGGTTACAATGGTCATGACAATTTGATAATGATTGAGATATGTATGTTAAAAATGc > 1:3449384/1‑91 (MQ=255) cgcCTGATATAAGCGTccttagggttaactgtatctatttaattaagtattattattcgtatgtacgtaacttatggtctatcaagttcca < 2:3097691‑M2/91‑76 (MQ=255) cgcCTGATATAAGCGTCCTTAGGGTTTTTGTATTGGGTTACAATGGTCATGACAATTTGATAATGATTGAGATATGTATGTTAAAAATGCt < 2:211978/91‑1 (MQ=255) cgcCTGATATAAGCGTCCTTAGGGTTTTTGTATTGGGTTACAATGGTCATGACAATTTGATAATGATTGAGATATGTATGTTAAAAATGCt > 1:2670209/1‑91 (MQ=255) cgcCTGATATAAGCGTCCTTAGGGTTTTTGTATTGGGTTACAATGGTCATGACAATTTGATAATGATTGAGATATGTATGTTAAAAATGCt < 1:4458594/91‑1 (MQ=255) cgcCTGATATAAGCGTCCTTAGGGTTTTTGTATTGGGTTACAATGGTCATGACAATTTGATAATGATTGAGATATGTATGTTAAAAATGCt > 1:5170664/1‑91 (MQ=255) gcCTGATATAAGCGTccttagggttaactgtagctatttaattaagtcttattattcgtatgtacgtaacttatggtctatcaagttccac < 2:1607564‑M2/91‑77 (MQ=255) gcCTGATATAAGCGTCCTTAGGGTTTTTGTATTGGGTTACAATGGTCATGACAATTTGATAATGATTGAGATGTGTATGTTAAATATGCtt > 1:4726907/1‑91 (MQ=255) ccTGATATAAGCGTCCTTAGGGTTTTTGTATTGGGTTACAATGGTCATGACAATTTGATAATGATTGAGATATGTATGTTAAAAATGCTTc > 1:3541473/1‑91 (MQ=255) tGATATAAGCGTCCTTAGGGTTTTTGTATTGGGTTACAATGGTCATGACAATTTGATAATGATTGAGATATGTATGTTAAAAATGCTTCaa > 1:3668046/1‑91 (MQ=255) tGATATAAGCGTCCTTAGGGTTTTTGTATTGGGTTACAATGGTCATGACAATTTGATAATGATTGAGATATGTATGTTAAAAATGCTTCaa < 1:32888/91‑1 (MQ=255) gATATAAGCGTccttagggttaactgtatctatttaattaagtattattattcgtatgtacgtaacttatggtctatcaagttccacactt < 2:2899767‑M2/91‑81 (MQ=255) gATATAAGCGTCCTTAGGGTTTTTGTATTGGGTTATAATGGTCATGACAATTTGATAATGATTGAGATATGTATGTTAAAAATGCTTCaaa > 2:5112705/1‑91 (MQ=255) gATATAAGCGTCCTTAGGGTTTTTGTATTGGGTTACAATGGTCATGACAATTTGATAATGATTGAGATATGTATGTTAAAAATGCTTCaaa > 2:4825127/1‑91 (MQ=255) gATATAAGCGTCCTTAGGGTTTTTGTATTGGGTTACAATGGTCATGACAATTTGATAATGATTGAGATATGTATGTTAAAAATGCATaaaa < 2:53323/91‑1 (MQ=255) atatAAGCGTCCTTAGGGTTTTTGTATTGGGTTACAATGGTCATGACAATTTGATAATGATTGAGATATGTATGTTAAAAATGCTTCaaaa > 2:1667890/1‑91 (MQ=255) tataAGCGTCCTTAGGGTTTTTGTATTGGGTTACAATGGTCATGATAATTTGATAATGATTGAGATATGTATGTTAAAAATGCTTCaaaaa > 2:5478033/1‑91 (MQ=255) tataAGCGTCCTTAGGGTTTTTGTATTGGGTTACAATGGTCATGACAATTTGATAATGATTGAGATATGTATGTTAAAAATGCTTCaaaaa < 2:2776529/91‑1 (MQ=255) ataAGCGTCCTTAGGGTTTTTGTATTGGGTTACAATGGTCATGACAATTTGATAATGATTGAGATATGTATGTTAAAAATGCTTCaaaaaa > 1:400472/1‑91 (MQ=255) ataAGCGTCCTTAGGGTTTTTGTATTGGGTTACAATGGTCATGACAATTTGATAATGATTGAGATATGTATGTTAAAAATGCTTCaaaaaa > 1:1319262/1‑91 (MQ=255) taAGCGTCCTTAGGGTTTTTGTATTGGGTTACAATGGTCATGACAATTTGATAATGATTGAGATATGTATGTTAAAAATGCTTCaaaaaaa > 2:342476/1‑91 (MQ=255) taAGCGTCCTTAGGGTTTTTGTATTGGGTTACAATGGTCATGACAATTTGATAATGATTGAGATATGTATGTTAAAAATGCTTCaaaaaaa < 1:5124180/91‑1 (MQ=255) aaGCGTCCTTATGGTTTTTGTATTGGGTTACAATGGTCGTGACAATTTGCTAATGATTGAGATATGTATGTTAAAAATGCTTCaaaaaaaa > 2:5625035/1‑90 (MQ=255) | TGGAACTTGATAGACCATAAGTTACGTACATACGAATAATAATACTTAATTAAATAGATACAGTTAACCCTAAGGCGCCTGATATAAGCGTCCTTAGGGTTTTTGTATTGGGTTACAATGGTCATGACAATTTGATAATGATTGAGATATGTATGTTAAAAATGCTTCAAAAAAACACAAA > USA300TCH1516_ALE/286883‑287063 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |