New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | = 1657692 | 205 (0.710) | 10 (0.040) | 9/130 | NT | 5.0% | intergenic (‑15/+37) | comGA/USA300HOU_RS08250 | ComG operon protein 1/putative metallo‑hydrolase |
? | USA300TCH1516_ALE | = 1657702 | 210 (0.900) | intergenic (‑25/+27) | comGA/USA300HOU_RS08250 | ComG operon protein 1/putative metallo‑hydrolase |
Only 100 of 308 total aligned reads displayed.
AAAATGTACATCACTCGCTTTCATTTCTATCGCTTTATTAATTATTTCTTGAAATAGAATCTTCAAAAAAACACCTCCTACATATAATCACGTAGGAGGTGTTTTTATTACTTCAATTTAACCGTGTAAAAATGGATTTAATTGTTCATCATCAACCGTCGTATATGGACCATGTCCAGGG > USA300TCH1516_ALE/1657612‑1657792 | aaaTGTACATCACTCGCTTTCATTTCTATCGCTTTATTAATTATTTCTTGAAATAGAATCTTCAAAAACACACCTCCTACATATAATCACg < 2:2872721‑M2/91‑2 (MQ=255) aaTGTACATCACTCGCTTTCATTTCTATCGCTTTATTAATTATTTCTTGAAATAGAATCTTCAAAAAAACACCTCCTACATATAATCACgt > 2:25627‑M2/1‑89 (MQ=255) aTGTACATCACTCGCTTTCATTTCTATCGCTTTATTAATTATTTCTTGAAATAGAATCTTCAAAAAAACACCTCCTACATATAATCACgta < 2:810105‑M2/91‑4 (MQ=255) aTGTACATCACTCGCTTTCATTTCTATCGCTTTATTAATTATTTCTTGAAATAGAATCTTCAAAAAAACACCTCCTACATATAATCACgta < 1:1745796‑M2/91‑4 (MQ=255) cATCACTCGCTTTCATTTCTATCGCTTTATTAATTATTTCTTGAAATCGAATCTTCAAAAAAACACCTCCTACATATAATCACgtaggagg > 1:4399256‑M2/1‑83 (MQ=255) cATCACTCGCTTTCATTTCTATCGCTTTATTAATTATTTCTTGAAATAGAATCTTCAAAAAAACACCTCCTACATATAATCACgtaggagg < 1:3027125‑M2/91‑9 (MQ=255) cATCACTCGCTTTCATTTCTATCGCTTTATTAATTATTTCTTGAAATAGAATCTTCAAAAAAACACCTCCTACATATAATCACgtaggagg > 1:354604‑M2/1‑83 (MQ=255) cATCACTCGCTTTCATTTCTATCGCTTTATTAATTATTTCTTGAAATAGAATCTTCAAAAAAACACCTCCTACATATAATCACgtaggagg > 1:4125902‑M2/1‑83 (MQ=255) aTCACTCGCTTTCATTTCTATCGCTTTATTAATTATTTCTTGAAATAGAATCTTCAAAAAAACACCTCCTACATATAATCACgtaggaggt > 1:4539125‑M2/1‑82 (MQ=255) cACTCGCTTTCATTTCTATCGCTTTATTAATTATTTCTTGAAATAGAATCTTCAAAAAAACACCTCCTACATATAATCACgtaggaggtgt > 2:4583960‑M2/1‑80 (MQ=255) cTCGCTTTCATTTCTATCGCTTTATTAATTATTTCTTGAAATAGAATCTTCAAAAAAACACCTCCTACATATAATCACgtaggaggtgttt > 1:3297456‑M2/1‑78 (MQ=255) cTCGCTTTCATTTCTATCGCTTTATTAATTATTTCTTGAAATAGAATCTTCAAAAAAACACCTCCTACATATAATCACgtaggaggtgttt > 1:887213‑M2/1‑78 (MQ=255) gCTTTCATTTCTATCGCTTTATTAATTATTTCTTGAAATAGAATCTTCAAAAAAACACCTCCTACATATAATCACgtaggaggtgtttttt < 2:1468505‑M2/91‑17 (MQ=255) cTTTCATTTCTATCGCTTTATTAATTATTTCTTGAAATAGAATCTTCAAAAAAACACCTCCTACATATAATCACGTAGGAGGTGTTTttat < 1:2864420/91‑1 (MQ=255) cTTTCATTTCTATCGCTTTATTAATTATTTCTTGAAATAGAATCTTCAAAAAAACACCTCCTACATATAATCACGTAGGAGGTGTTTttat < 1:3618733/91‑1 (MQ=255) tttCATTTCTATCGCTTTATTAATTATTTCTTGAAATAGAATCTTCAAAAAAACACCTCCTACATATAATCACGTAGGAGGTGTTTttatt > 2:2136349/1‑91 (MQ=255) ttCATTTCTATCGCTTTATTAATTATTTCTTGAAATAGAATCTTCAAAAAAACACCTCCTACATATAATCACGTAGGAGGTGTTTttatta < 2:1269782/91‑1 (MQ=255) tCATTTCTATCGCTTTATTAATTATTTCTTGAAATAGAATCTTCAAAAAACCACCTCCTACATATAATCACGTAGGAGGTGTTTTTATTAc < 1:4689862/91‑1 (MQ=255) tCATTTCTATCGCTTTATTAATTATTTCTTGAAATAGAATCTTCAAAAAAACACCTCCTACATATAATCACGTAGGAGGTGTTTTTATTAc > 1:646609/1‑91 (MQ=255) cATTTCTATCGCTTTATTAATTATTTCTTGAAATAGAATCTTCAAAAAAACACCTCCTACATATAATCACGTAGGAGGTGTTTTTATTACt < 1:1192710/91‑1 (MQ=255) aTTTCTATCGCTTTATTAATTATTTCTTGAAATAGAATCTTCAAAAAAACACCTCCTACATATAATCACGTAGGAGGTGTTTTTATTACtt > 2:2437133/1‑91 (MQ=255) aTTTCTATCGCTTTATTAATTACTTCTTGAAATAGAATCTTCAAAAAAACACCTCCTACATATAATCACGTAGGAGGTGTTTTTATTACtt > 2:2249703/1‑91 (MQ=255) tttCTATCGCTTTATTAATTATTTCTTGAAATAGAATCTTCAAAAAAACACCTCCTACATATAATCACGTAGGAGGTGTTTTTATTACTTc > 1:4999785/1‑91 (MQ=255) ttCTATCGCTTTATTAATTATTTCTTGAAATAGAATCTTCAAAAAAACACCTCCTACATATAATCACGTAGGAGGTGTTTTTATTACTTCa < 2:1086361/91‑1 (MQ=255) cTATCGCTTTATTAATTATTTCTTGAAATAGAATCTTCAAAAAAACACCTCCTACATATAATCACGTAGGAGGTGTTTTTATTACTTCAAt > 1:4874709/1‑91 (MQ=255) tATCGCTTTATTAATTATTTCTTGAAATAGAATCTTCAAAAAAACACCTCCTACATATAATCACgtaggaggtgtttttttgaagattcta < 1:219632‑M2/91‑28 (MQ=255) gCTTTATTAATTATTTCTTGAAATAGAATCTTCAAAAAAACACCTCCTACATATAATCACGTAGGAGGTGTTTTTATTACTTCAATTTAAc > 1:3368642/1‑91 (MQ=255) tttATTAATTATTTCTTGAAATAGAATCTTCAAAAAAACACCTCCTACATATAATCACGTAGGAGGTGTTTTTATTACTTCAATTTAACCg < 2:2039138/91‑1 (MQ=255) tttATTAATTATTTCTTGAAATAGAATCTTCAAAAAAACACCTCCTACATATAATCACGTAGGAGGTGTTTTTATTACTTCAATTTAACCg < 1:923322/91‑1 (MQ=255) tttATTAATTATTTCTTGAAATAGAATCTTCAAAAAAACACCTCCTACATATAATCACGTAGGAGGTGTTTTTATTACTTCAATTTAACCg > 1:3968030/1‑91 (MQ=255) attaattaTTTCTTGAAATAGAATCTTCAAAAAAACACCTCCTACATATAATCACGTAGGAGGTGTTTTTATTACTTCAATTTAACCgtgt < 1:123805/91‑1 (MQ=255) taattaTTTCTTGAAATAGAATCTTCAAAAAAACACCTCCTACATATAATCACGTAGGAGGTGTTTTTATTACTTCAATTTAACCGTGTaa > 2:5011685/1‑91 (MQ=255) aattaTTTCTTGAAATAGAATCTTCAGAAAAACACCTCCTACATATAATCGCGTAGGAGGTGTTTTTATTACTTCAATTTAACCGTGTaaa < 2:735458/91‑1 (MQ=255) ttattTCTTGAAATAGAATCTTCAAAAAAACACCTCCTACATATAATCACGTAGGAGGTGTTTTTATTACTTCAATTTAACCGTGTaaaaa < 1:3536128/91‑1 (MQ=255) ttattTCTTGAAATAGAATCTTCAAAAAAACACCTCCTACATATAATCACGTAGGAGGTGTTTTTATTACTTCAATTTAACCGTGTaaaaa > 2:1137157/1‑91 (MQ=255) ttattTCTTGAAATAGAATCTTCAAAAAAACACCTCCTACATATAATCACGTAGGAGGTGTTTTTATTACTTCAATTTAACCGTGTaaaaa > 1:3097810/1‑91 (MQ=255) ttattTCTTGAAATAGAATCTTCAAAAAAACACCTCCTACATATAATCACGTAGGAGGTGTTTTTATTACTTCAATTTAACCGTGTaaaaa < 1:5267897/91‑1 (MQ=255) ttattTCTTGAAATAGAATCTTCAAAAAAACACCTCCTACATATAATCACGTAGGAGGTGTTTTTATTACTTCAATTTAACCGTGTaaaaa > 2:2474778/1‑91 (MQ=255) ttattTCTTGAAATAGAATCTTCAAAAAAACACCTCCTACATATAATCACGTAGGAGGTGTTTTTATTACTTCAATTTAACCGTGTaaaaa > 2:306463/1‑91 (MQ=255) tattTCTTGAAATAGAATCTTCAAAAAAACACCTCCTACATATAATCACGTAGGAGGTGTTTTTATTACTTCAATTTAACCGTGTAAAAAt > 2:3899387/1‑91 (MQ=255) attTCTTGAAATAGAATCTTCAAAAAAACACCTCCTACATATAATCACGTAGGAGGTGTTTTTATTACTTCAATTTAACCGTGTAAAAATg < 1:3247163/91‑1 (MQ=255) attTCTTGAAATAGAATCTTCAAAAAAACACCTCCTACATATAATCACGTAGGAGGTGTTTTTATTACTTCAATTTAACCGTGTAAAAATg < 2:693777/91‑1 (MQ=255) attTCTTGAAATAGAATCTTCAAAAAAACACCTCCTACATATAAGGACGTAGGAGGTGTTTTTATTACTTCAATTTAACCGTGTAAAAATg > 2:5476836/1‑91 (MQ=255) tttCTTGAAATAGAATCTTCAAAAAAACACCTCCTACATATAATCACGTAGGAGGTGTTTTTATTACTTCAATTTAACCGTGTAAAAATgg < 1:2413662/91‑1 (MQ=255) ttCTTGAAATAGAATCTTCAAAAAAACACCTCCTACATATAATCACGTAGGAGGTGTTTTTATTACTTCAATTTAACCGTGTAAAAATGGa < 1:1040636/91‑1 (MQ=255) tCTTGAAATAGAATCTTCAAAAAAACACCTCCTACATATAATCACGTAGGAGGTGTTTTTCTTACTTCAATTTAACCGTGTAAAAATGGAt > 1:4353837/1‑91 (MQ=255) tCTTGAAATAGAATCTTCAAAAAAACACCTCCTACATATAATCACGTAGGAGGTGTTTTTATTACTTCAATTTAACCGTGTAAAAATGGAt < 1:1418610/91‑1 (MQ=255) tCTTGAAATAGAATCTTCAAAAAAACACCTCCTACATATAATCACGTAGGAGGTGTTTTTATTACTTCAATTTAACCGTGTAAAAATGGAt < 2:5188927/91‑1 (MQ=255) cTTGAAATAGAATCTTCAAAAAAACACCTCCTACATATAATCACGTAGGAGGTGTTTTTATTACTTCAATTTAACCGTGTAAAAATGGAtt < 1:2493907/91‑1 (MQ=255) cTTGAAATAGAATCTTCAAAAAAACACCTCCTACATATAATCACGTAGGAGGTGTTTTTATTACTTCAATTTAACCGTGTAAAAATGGAtt < 2:4042829/91‑1 (MQ=255) cTTGAAATAGAATCTTCAAAAAAACACCTCCTACATATAATCACGTAGGAGGTGTTTTTATTACTTCAATTTAACCGTGTAAAAATGGAtt < 2:478000/91‑1 (MQ=255) ttGAAATAGAATCTTCAAAAAAACACCTCCTACATATAATCACGTAGGAGGTGTTTTTATTACTTCAATTTAACCGTGTAAAAATGGAttt < 2:3106797/91‑1 (MQ=255) tGAAATAGAATCTTCAAAAAAACACCTCCTACATATAATCACGTAGGAGGTGTTTTTATTACTTCAATTTAACCGTGTAAAAATGGATTTa > 2:626486/1‑91 (MQ=255) tGAAATAGAATCTTCAAAAAAACACCTCCTACATATAATCACGTAGGAGGTGTTTTTATTACTTCAATTTAACCGTGTAAAAATGGATTTa < 1:2915095/91‑1 (MQ=255) tGAAATAGAATCTTCAAAAAAACACCTCCTACATATAATCACGTAGGAGGTGTTTTTATTACTTCAATTTAACCGTGTAAAAATGGATTTa > 1:2990800/1‑91 (MQ=255) tGAAATAGAATCTTCAAAAAAACACCTCCTACATATAATCACGTAGGAGGTGTTTTTATTACTTCAATTTAACCGTGTAAAAATGGATTTa > 1:2335285/1‑91 (MQ=255) tGAAATAGAATCTTCAAAAAAACACCTCCTACATATAATCACGTAGGAGGTGTTTTTATTACTTCAATTTAACCGTGTAAAAATGGATTTa > 1:5145781/1‑91 (MQ=255) gAAATAGAATCTTCAAAAAAACACCTCCTAGATATAATCACGTAGGAGGTGTTTTTATTACTTCAATTTAACCGTGTAAAAATGGATTTaa < 2:5599953/91‑1 (MQ=255) gAAATAGAATCTTCAAAAAAACACCTCCTACATATAATCACGTAGGAGGTGTTTTTATTACTTCAATTTAACCGTGTAAAAATGGATTTaa > 2:514303/1‑91 (MQ=255) aaTAGAATCTTCAAAAAAACACCTCCTACATATAATCACGTAGGAGGTGTTTTTATTACTTCAATTTAACCGTGTAAAAATGGATTTAAtt > 2:184905/1‑91 (MQ=255) aTAGAATCTTCAAAAAAACACCTCCTACATATAATCACGTAGGAGGTGTTTTTATTACTTCAATTTAACCGTGTAAAAATGGATTTAATTg < 1:3938416/91‑1 (MQ=255) aTAGAATCTTCAAAAAAACACCTCCTACATATAATCACGTAGGAGGTGTTTTTATTACTTCAATTTAACCGTGTAAAAATGGATTTAATTg < 1:507729/91‑1 (MQ=255) aTAGAATCTTCAAAAAAACACCTCCTACATATAATCACGTAGGAGGTGTTTTTATTACTTCAATTTAACCGTGTAAAAATGGATTTAATTg < 1:3337578/91‑1 (MQ=255) tAGAATCTTCAAAAAAACACCTCCTACATATAATCACGTAGGAGGTGTTTTTATTACTTCAATTTAACCGTGTAAAAATGGATTTAATTGt > 2:4391623/1‑91 (MQ=255) aGAATCTTCAAAAAAACACCTCCTACATATAATCACGTAGGAGGTGTTTTTATTACTTCAATTTAACCGTGTAAAAATGGATTTAATTGtt > 2:4103312/1‑91 (MQ=255) aaTCTTCAAAAAAACACCTCCTACATATAATCACGTAGGAGGTGTTTTTATTACTTCAATTTAACCGTGTAAAAATGGATTTAATTGTtca < 1:456260/91‑1 (MQ=255) aaTCTTCAAAAAAACACCTCCTACATATAATCACGTAGGAGGTGTTTTTATTACTTCAATTTAACCGTGTAAAAATGGATTTAATTGTtca > 1:1979706/1‑91 (MQ=255) tCTTCAAAAAAACACCTCCTACATATAATCACGTAGGAGGTGTTTTTATTACTTCAATTTAACCGTGTAAAAATGGATTTAATTGTtcatc < 1:3821662/91‑1 (MQ=255) tCTTCAAAAAAACACCTCCTACATATAATCACGTAGGAGGTGTTTTTATTACTTCAATTTAACCGTGTAAAAATGGATTTAATTGTtcatc < 2:2993122/91‑1 (MQ=255) tCTTCAAAAAAACACCTCCTACATATAATCACGTAGGAGGTGTTTTTATTACTTCAATTTAACCGTGTAAAAATGGATTTAATTGTtcatc < 1:2521265/91‑1 (MQ=255) cTTCAAAAAAACACCTCCTACATATAATCACATAGGAGGTGTTTTTATTACTTCAAAAAAAAAAAAAAAAAATGGATTTAATTGTtcatca < 2:2662548/91‑1 (MQ=255) ttCAAAAAAACACCTCCTACATATAATCACGTAGGAGGTGTTTTTATTACTTCAATTTAACCGTGTAAAAATGGATTTAATTGTtcatcat < 1:2602910/91‑1 (MQ=255) aaCACCTCCTACATATAATCACGTAGGAGGTGTTTTTATTACTTCAATTTAACCGTGTAAAAATGGATTTAATTGTTCATCATCAACcgtc < 1:4320860/91‑1 (MQ=255) acacCTCCTACATATAATCACGTAGGAGGTGTTTTTATTACTTCAATTTAACCGTGTAAAAATGGATTTAATTGTTCATCATCAACcgtcg < 1:5555733/91‑1 (MQ=255) cacCTCCTACATATAATCACGTAGGAGGTGTTTTTATTACTTCAATTTAACCGTGTAAAAATGGATTTAATTGTTCATCATCAACcgtcgt > 2:2084265/1‑91 (MQ=255) cacCTCCTACATATAATCACGTAGGAGGTGTTTTTATTACTTCAATTTAACCGTGTAAAAATGGATTTAATTGTTCATCATCAACcgtcgt > 1:2047036/1‑91 (MQ=255) cacCTCCTACATATAATCACGTAGGAGGTGTTTTTATTACTTCAATTTAACCGTGTAAAAATGGATTTAATTGTTCATCATCAACcgtcgt < 1:2810295/91‑1 (MQ=255) acCTCCTACATATAATCACGTAGGAGGTGTTTTTATTACTTCAATTTAACCGTGTAAAAATGGATTTAATTGTTCATCATCAACCGTCGta > 1:182297/1‑91 (MQ=255) acCTCCTACATATAATCACGTAGGAGGTGTTTTTATTACTTCAATTTAACCGTGTAAAAATGGATTTAATTGTTCATCATCAACCGTCGta > 1:5405579/1‑91 (MQ=255) cctcctACATATAATCACGTAGGAGGTGTTTTTATTACTTCAATTTAACCGTGTAAAAATGGATTTAATTGTTCATCATCAACCGTCGtat > 1:2691023/1‑91 (MQ=255) cctcctACATATAATCACGTAGGAGGTGTTTTTATTACTTCAATTTAACCGTGTAAAAATGGATTTAATTGTTCATCATCAACCGTCGtat < 2:2189347/91‑1 (MQ=255) cctcctACATATAATCACGTAGGAGGTGTTTTTATTACTTCAATTTAACCGTGTAAAAATGGATTTAATTGTTCATCATCAACCGTCGtat < 2:3992916/91‑1 (MQ=255) cctcctACATATAATCACGTAGGAGGTGTTTTTATTACTTCAATTTAACCGTGTAAAAATGGATTTAATTGTTCATCATCAACCGTCGtat > 1:3449184/1‑91 (MQ=255) cctcctACATATAATCACGTAGGAGGTGCTTTCATTACTTCAATTTAACCGTGTCAAAATGGATTTAATTGTTCATCATCACCCGTCGtac > 2:3734912/1‑90 (MQ=255) ctcctACATATAATCACGTAGGAGGTGTTTTTATTACTTCAATTTAACCGTGTAAAAATGGATTTAATTGTTCATCATCAACCGTCGtata > 2:3226008/1‑91 (MQ=255) cctACATATAATCACGTAGGAGGTGTTTTTATTACTTCAATTTAACCGTGTAAAAATGGATTTAATTGTTCATCATCAACCGTCGTATATg > 1:2298004/1‑91 (MQ=255) ctACATATAATCACGTAGGAGGTGTTTTTATTACTTCAATTTAACCGTGTAAAAATGGATTTAATTGTTCATCATCAACCGTCGTATATgg < 2:1556998/91‑1 (MQ=255) aCATATAATCACGTAGGAGGTGTTTTTATTACTTCAATTTAACCGTGTAAAAATGGATTTAATTGTTCATCATCAACCGTCGTATATGGAc < 2:5431752/91‑1 (MQ=255) cATATAATCACGTAGGAGGTGTTTTTATTACTTCAATTTAACCGTGTAAAAATGGATTTAATTGTTCATCATCAACCGTCGTATATGGAcc < 1:1616422/91‑1 (MQ=255) cATATAATCACGTAGGAGGTGTTTTTATTACTTCAATTTAACCGTGTAAAAATGGATTTAATTGTTCATCATCAACCGTCGTATATGGAcc < 1:850154/91‑1 (MQ=255) tataATCACGTAGGAGGTGTTTTTATTACTTCAATTTAACCGTGTAAAAATGGATTTAATTGTTCATCATCAACCGTCGTATATGGACCAt < 2:4983392/91‑1 (MQ=255) tataATCACGTAGGAGGTGTTTTTATTACTTCAATTTAACCGTGTAAAAATGGATTTAATTGTTCATCATCAACCGTCGTATATGGACCAt > 1:4966649/1‑91 (MQ=255) taATCACGTAGGAGGTGTTTTTATTACTTCAATTTAACCGTGTAAAAATGGATTTAATTGTTCATCATCAACCGTCGTATATGGACCATGt < 1:1212240/91‑1 (MQ=255) taATCACGTAGGAGGTGTTTTTATTACTTCAATTTAACCGTGTAAAAATGGATTTAATTGTTCATCATCAACCGTCGTATATGGACCATGt > 2:1763976/1‑91 (MQ=255) aTCACGTAGGAGGTGTTTTTATTACTTCAATTTAACCGTGTAAAAATGGATTTAATTGTTCATCATCAACCGTCGTATATGGACCATGTcc < 1:1318665/91‑1 (MQ=255) cACGTAGGAGGTGTTTTTATTACTTCAATTTAACCGTGTAAAAATGGATTTAATTGTTCATCATCAACCGTCGTATATGGACCATGTCCAg < 1:783696/91‑1 (MQ=255) cACGTAGGAGGTGTTTTTATTACTTCAATTTAACCGTGTAAAAATGGATTTAATTGTTCATCATCAACCGTCGTATATGGACCATGTCCAg < 2:533691/91‑1 (MQ=255) cACGTAGGAGGTGTTTTTATTACTTCAATTTAACCGTGTAAAAATGGATTTAATTGTTCATCATCAACCGTCGTATATGGACCATGTCCAg < 1:5019762/91‑1 (MQ=255) aCGTAGGAGGTGTTTTTATTACTTCAATTTAACCGTGTAAAAATGGATTTAATTGTTCATCATCAACCGTCGTATATGGACCATGTCCAgg > 1:215494/1‑91 (MQ=255) aCGTAGGAGGTGTTTTTATTACTTCAATTTAACCGTGTAAAAATGGATTTAATTGTTCATCATCAACCGTCGTATATGGACCATGTCCAgg < 2:194715/91‑1 (MQ=255) | AAAATGTACATCACTCGCTTTCATTTCTATCGCTTTATTAATTATTTCTTGAAATAGAATCTTCAAAAAAACACCTCCTACATATAATCACGTAGGAGGTGTTTTTATTACTTCAATTTAACCGTGTAAAAATGGATTTAATTGTTCATCATCAACCGTCGTATATGGACCATGTCCAGGG > USA300TCH1516_ALE/1657612‑1657792 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |