New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | 955970 = | 170 (0.930) | 10 (0.060) | 9/230 | NT | 6.4% | intergenic (‑192/+50) | glpQ_1/argH | Glycerophosphodiester phosphodiesterase/Argininosuccinate lyase |
? | USA300TCH1516_ALE | 956005 = | 139 (0.840) | intergenic (‑227/+15) | glpQ_1/argH | Glycerophosphodiester phosphodiesterase/Argininosuccinate lyase |
Only 100 of 204 total aligned reads displayed.
ACAAAAACCTGCTTGTGAAAACGCTTTACACATTTCTTTTACAATTTATAACATTTTTGTAATATAAATTTAAAAGAATTATCAAACATTTTAGGAATCTTAAAAATGTGATGTTCAACAAGACGAAGAGAGCATTAAAATACCCACAATGTAATTTTAATAGACATTGTGGGTAGGTAGATTAACGTATTTATTGTGATAGTAATTGTTTAGCAACATCAAGTTGTTGTTTGACCGATGATTGACCTGTTGAACCGTAACTTTGACGTCGTTTTAAACA > USA300TCH1516_ALE/955830‑956109 | acAAAAACCTGCTTGTGAAAACGCTTTACACATTTCTTTTACAATTTATAACATTTTTGTAATATAAATTTAAAAGAATTATCAAACATTTTAGGAATCTTAAAAATGTGATGTTCAACAAGACGAAGAGAGCATTAAAAt < 4:640266/141‑1 (MQ=255) tgccgatatttacgattatttgcagcctgaaaattgtttaaaacgacgtcaaagttacggttcaacaggtcaatcatcggtcaaacaacaacttgatgttgctaaacaattactatcacaataaatacgttaatctaccta < 2:692360‑M1/2‑1 (MQ=255) aaaaaCCTGCTTGTGAAAACGCTTTACACATTTCTTTTACAATTTATAACATTTTTGTAATATAAATTTAAAAGAATTATCAAACATTTTAGGAATCTTAAAAATGTGATGTTCAACAAGACGAAGAGAGCATTAAAATAc < 3:621898/141‑1 (MQ=255) ccgatatttacgattatttgcagcctgaaaattgtttaaaacgacgtcaaagttacggttcaacaggtcaatcatcggtcaaacaacaacttgatgttgctaaacaattactatcacaataaatacgttaatctacctacc > 2:1140896‑M1/138‑141 (MQ=255) aaaCCTGCTTGTGAAAACGCTTTACACATTTCTTTTACAATTTATAACATTTCTGTAATATAAATTTAAAAGAATTATCAAACATTTTAGGAATCTTAAAAATGTGATGTTCAACAAGACGAAGAGAGCATTAAAATAccc < 2:1004006/141‑1 (MQ=255) gatatttacgattatttgcagcctgaaaattgtttaaaacgacgtcaaagttacggttcaacaggtcaatcatcggtcaaacaacaacttgatgttgctaaacaattactatcacaataaatacgttaatctaccTACCca > 4:373817‑M1/136‑141 (MQ=255) cTGCTTGTGAAAACGCTTTACACATTTCTTTTACAATTTATAACATTTTTGTAATATAAATTTAAAAGAATTATCAAACATTTTAGGAATCTTAAAAATGTGATGTTCAACAAGACGAAGAGAGCATTAAAATACCCACaa > 1:813435/1‑141 (MQ=255) atttacgattatttgcagcctgaaaattgtttaaaacgacgtcaaagttacggttcaacaggtcaatcatcggtcaaacaacaacttgatgttgctaaacaattactatcacaataaatacgttaatctaccTACCCACaa < 2:1108861‑M1/9‑1 (MQ=255) tttacgattatttgcagcctgaaaattgtttaaaacgacgtcaaagttacggttcaacaggtcaatcatcggtcaaacaacaacttgatgttgctaaacaattactatcacaataaatactttaatctaccTACCCACAAt < 2:361468‑M1/10‑1 (MQ=255) gCTTGTGAAAACGCTTTACACATTTCTTTTACAATTTATAACATTTTTGTAATATAAATTTAAAAGAATTATCAAACATTTTAGGAATCTTAAAAATGTGATGTTCAACAAGACGAAGAGAGCATTAAAATACCCACAATg < 2:935858/141‑1 (MQ=255) tacgattatttgcagcctgaaaattgtttaaaacgacgtcaaagttacggttcaagaggtcaatcatcggtcaaacaacaacttgatgttgctaaacaattactatcacaataaatacgttaatctaccTACCCACAATGt < 1:100108‑M1/12‑1 (MQ=255) cTTGTGAAAACGCTTTACACATTTCTTTTACAATTTATAACATTTTTGTAATATAAATTTAAAAGAATTATCAAACATTTTAGGAATCTTAAAAATGTGATGTTCAACAAGACGAAGAGAGCATTAAAATACCCACAATGt < 4:71434/141‑1 (MQ=255) cTTGTGAAAACGCTTTACACATTTCTTTTACAATTTATAACATTTTTGTAATATAAATTTAAAAGAATTATCAAACATTTTAGGAATCTTAAAAATGTGATGTTCAACAAGACGAAGAGAGCATTAAAATACCCACAATGt > 2:1377344/1‑141 (MQ=255) cTTGTAAAAACGCTTTACACATTTCTTTTACAATTTATAACATTTTTGTAATATAAATTTAAAAGAATTATCAAACATTTTAGGAATCATAAAAATGTGATGTTCAACAAGACGAAGAGAGCATTAAAATACCCACAATGt < 4:438102/141‑1 (MQ=255) ttGTGAAAACGCTTTACACATTTCTTTTACAATTTATAACATTTTTGTAATATAAATTTAAAAGAATTATCAAACATTTTAGGAATCTTAAAAATGTGATGTTCAACAAGACGAAGAGAGCATTAAAATACCCACAATGTa < 1:1625976/141‑1 (MQ=255) gtgAAAACGCTTTACACATTTCTTTTACAATTTATAACATTTTTGTAATATAAATTTAAAAGAATTATCAAACATTTTAGGAATCTTAAAAATGTGATGTTCAACAAGACGAAGAGAGCATTAAAATACCCACAATGTAAt < 2:1523621/141‑1 (MQ=255) gtgAAAACGCTTTACACATTTCTTTTACAATTTATAACATTTTTGTAATATAAATTTAAAAGAATTATCAAACATTTTAGGAATCTTAAAAATGTGATGTTCAACAAGACGAAGAGAGCATTAAAATACCCACAATGTAAt < 1:1607655/141‑1 (MQ=255) aaaCGCTTTACACATTTCTTTTACAATTTATAACATTTTTGTAATATAAATTTAAAAGAATTATCAAACATTTTAGGAATCTTAAAAATGTGATGTTCAACAAGACGAAGAGAGCATTAAAATACCCACAATGTAATTTTa > 3:651510/1‑141 (MQ=255) tttgcagcctgaaaattgtttaaaacgacgtcaaagttacggttcaacaggtcaatcatcggtcaaacaacaacttgatgttgctaaacaattactatcacaataaatacgttaatctaccTACCCACAATGTAATTTTaa > 2:1000614‑M1/122‑141 (MQ=255) tgcagcctgaaaattgtttaaaacgacgtcaaagttacggttcaacaggtcaatcatcggtcaaacaacaacttgatgttgctaaacaattactatcacaataaatacgttaatctaccTACCCACAATGTAATTTTAATa > 1:128372‑M1/120‑141 (MQ=255) cGCTTTACACATTTCTTTTACAATTTATAACATTTTTGTAATATAAATTTAAAAGAATTATCAAACATTTTAGGAATCTTAAAAATGTGATGTTCAACAAGACGAAGAGAGCATTAAAATACCCACAATGTAATTTTAATa > 2:241774/1‑141 (MQ=255) gcagcctgaaaattgtttaaaacgacgtcaaagttacggttcaacaggtcaatcatcggtcaaacaacaacttgatgttgctaaacaattactatcacaataaatacgttaatctaccTACCCACAATGTAATTTTAATAg > 2:92491‑M1/119‑141 (MQ=255) gCTTTACACATTTCTTTTACAATTTATAACATTTTTGTAATATAAATTTAAAAGAATTATCAAACATTTTAGGAATCTTAAAAATGTGATGTTCAACAAGACGAAGAGAGCATTAAAATACCCACAATGTAATTTTAATAg < 2:1610692/141‑1 (MQ=255) cTTTACACATTTCTTTTACAATTTATAACATTTTTGTAATATAAATTTAAAAGAATTATCAAACATTTTAGGAATCTTAAAAATGTGATGTTCAACAAGACGAAGAGAGCATTAAAATACCCACAATGTAATTTTAATAGa > 2:210484/1‑141 (MQ=255) cTTTACACATTTCTTTTACAATTTATAACATTTTTGTAATATAAATTTAAAAGAATTATCAAACATTTTAGGAATCTTAAAAATGTGATGTTCAACAAGACGAAGAGAGCATTAAAATACCCACAATGTAATTTTAATAGa > 1:1164232/1‑141 (MQ=255) cTTTACACATTTCTTTTACAATTTATAACATTTTTGTAATATAAATTTAAAAGAATTATCAAACATTTTAGGAATCTTAAAAATGTGATGTTCAACAAGACGAAGAGAGCATTAAAATACCCACAATGTAATTTTAATAGa > 1:1110877/1‑141 (MQ=255) tACACATTTCTTTTACAATTTATAACATTTTTGTAATATAAATTTAAAAGAATTATCAAACATTTTAGGAATCTTAAAAATGTGATGTTCAACAAGACGAAGAGAGCATTAAAATACCCACAATGTAATTTTAATAGACAt > 1:1442164/1‑141 (MQ=255) tACACATTTCTTTTACAATTTATAACATTTTTGTAATATAAATTTAAAAGAATTATCAAACATTTTAGGAATCTTAAAAATGTGATGTTCAACAAGACGAAGAGAGCATTAAAATACCCACAATGTAATTTTAATAGACAt > 2:724749/1‑141 (MQ=255) cctgaaaattgtttaaaacgacgtcaaagttacggttcaacaggtcaatcatcggtcaaacaacaacttgatgttgctaaacaattactatcacaataaatacgttaatctaccTACCCACAATGTAATTTTAATAGACAt > 1:606571‑M1/115‑141 (MQ=255) cacaTTTATTTTACAAATTATAACATTTTTGTAATATAAATTTAAAAGAATTATCAACCATTTTAGGAATCTTAAAACTGTGATGTTCAACAAGACGAAGAGAGCATTAAAAAACCCACAATGTAATTTTAATAAACATtg > 4:335248/1‑141 (MQ=255) tttCTTTTACAATTTATAACATTTTTGTAATATAAATTTAAAAGAATTATCAAACATTTTAGGAATCTTAAAAATGTGATGTTCAACAAGACGAAGAGAGCATTAAAATACCCACAATGTAATTTTAATAGACATTGTggg < 1:247663/141‑1 (MQ=255) aattgtttaaaacgacgtcaaagttacggttcaacaggtcaatcatcggtcaaacaacaacttgatgttgctaaacaattactatcacaataaatacgttaatctaccTACCCACAATGt > 4:460690‑M1/109‑120 (MQ=255) tCTTTTACAATTTATAACATTTTTGTAATATAAATTTAAAAGAATTATCAAACATTTTAGGAATCTTAAAAATGTGATGTTCAACAAGACGAAGAGAGCATTAAAATACCCACAATGTAATTTTAATAGACATTGTGggta > 1:1492225/1‑141 (MQ=255) attttATAATTTATAACATTTTTGTAATATAAATTTAAAAGAAGTATCAAACATGTTAGGAATCTTAAAAATGTGATGTTCAACAAGACGAAGAGAGCATTAAAATACCCACAATGTAATTTTAATAGACATTGTGggtag < 4:137776/140‑1 (MQ=255) ttttACAATTTATAACATTTTTGTAATATAAATTTAAAAGAATTATCAAACATTTTAGGAATCTTAAAAATGTGATGTTCAACAAGACGAAGAGAGCATTAAAATACCCACAATGTAATTTTAATAGACATTGTGggtagg < 1:1425951/141‑1 (MQ=255) ttttACAATTTATAACATTTTTGTAATATAAATTTAAAAGAATTATCAAACATTTTAGGAATCTTAAAAATGTGATGTTCAACAAGACGAAGAGAGCATTAAAATACCCACAATGTAATTTTAATAGACATTGTGggtagg > 1:1447948/1‑141 (MQ=255) ttttACAATTTATAACATTTTTGTAATATAAATTTAAAAGAATTATCAAACATTTTAGGAATCTTAAAAATGTGATGTTCAACAAGACGAAGAGAGCATTAAAATACCCACAATGTAATTTTAATAGACATTGTGggtagg < 3:174884/141‑1 (MQ=255) aCAATTTATAACATTTTTGTAATATAAATTTAAAAGAATTATCAAACATTTTAGGAATCTTAAAAATGTGATGTTCAACAAGACGAAGAGAGCATTAAAATACCCACAATGTAATTTTAATAGACATTGTGGGTAGGTAGa > 1:1141585/1‑141 (MQ=255) aCAATTTATAACATTTTTGTAATATAAATTTAAAAGAATTATCAAACATTTTAGGAATCTTAAAAATGTGATGTTCAACAAGACGAAGAGAGCATTAAAATACCCACAATGTAATTTTAATAGACATTGTGGGTAGGTAGa > 2:1268856/1‑141 (MQ=255) aCAATGTATAACATTTTTGTAATATAAATTTAATAGAATTATCAAACATTTTAGGAATCTTAAAAATGTGATGTTCAACAAGACGAAGAGAGCATTAAAATACCCACAATGTAATTTTAATATACATTTTTGGTAGTTAGa > 4:169338/1‑141 (MQ=255) aTTTATAACATTTTTGTAATATCAATTTAAGAGATTTATTAAACATTTTAGGAATCTTAAAAATGAGATGTTCAACAAGACGAAGAGAGCATTAAAATACCCTCAATGTAATTTGAATATACAATGTGGGTAGGTAGATTa > 4:533200/1‑141 (MQ=255) ttATAACATTTTTGTAATATAAATTTAAAAGAATTATCAAACATTTTAGGAATCTTAAAAATGTGATGTTCAACAAGACGAAGAGAGCATTAAAATACCCACAATGTAATTTTAATAGACATTGTGGGTAGGTAGATTAAc < 3:419009/141‑1 (MQ=255) ttATAACATTTTTGTAATATAAATTTAAAAGAATTATCAAACATTTTAGGAATCTTAAAAATGTGATGTTCAACAAGACGAAGAGAGCATTAAAATACCCACAATGTAATTTTAATAGACATTGTGGGTAGGTAGATTAAc > 2:307191/1‑141 (MQ=255) ttATAACATTTTTGTAATATAAATTTAAAAGAATTATCAAACATTTTAGGAATCTTAAAAATGTGATGTTCAACAAGACGAAGAGAGCATTAAAATACCCACAATGTAATTTTAATAGACATTGTGGGTAGGTAGATTAAc < 1:54823/141‑1 (MQ=255) ttATAACATTTTTGTAATATAAATTTAAAAGAATTATCAAACATTTTAGGAATCTTAAAAATGTGATGTTCAACAAGACGAAGAGAGCATTAAAATACCCACAATGTAATTTTAATAGACATTGTGGGTAGGTAGATTAAc < 1:1055561/141‑1 (MQ=255) ttATAACATTTTTGTAATATAAAATTAAAAGAATTATCAAACATTTAAGGAATCTTAAAAATGTGATGTTAAACAAGACGAAGAGACCATTAAAATACGCACAATGTAATTTTAATAGAAATCATGGGTAGGTAGATTAAc > 4:224307/1‑141 (MQ=255) tataACATTTTTGTAATATAAATTTAAAAGAATTATCAAACATTTTAGGAATCTTAAAAATGTGATGTTCAACAAGACGAAGAGAGCATTAAAATACCCACAATGTAATTTTAATAGACATTGTGGGTAGGTAGATTAACg < 3:45543/141‑1 (MQ=255) aaCATTTTTGTAATATAAATTTAAAAGAATTATCAAACATTTTAGGAATCTTAAAAATGTGATGTTCAACAAGACGAAGAGAGCATTAAAATACCCACAATGTAATTTTAATAGACATTGTGGGTAGGTAGATTAACGtat > 1:284326/1‑141 (MQ=255) aaCATTTTTGTAATATAAATTTAAAAGAATTATCAAACATTTTAGGAATCTTAAAAATGTGATGTTCAACAAGACGAAGAGAGCATTAAAATACCCACAATGTAATTTTAATAGACATTGTGGGTAGGTAGATTAACGtat > 1:1207643/1‑141 (MQ=255) aCATTTTTGTAATATAAATTTAAAAGAATTATCAAACATTTTAGGAATCTTAAAAATGTGATGTTCAACAAGACGAAGAGAGCATTAAAATACCCACAATGTAATTTTAATAGACATTGTGGGTAGGTAGATTAACGtatt < 4:91237/141‑1 (MQ=255) cATTTTTGTAATATAAATTTAAAAGAATTATCAAACATTTTAGGAATCTTAAAAATGTGATGTTCAACAAGACGAAGAGAGCATTAAAATACCCACAATGTAATTTTAATAGACATTGTGGGTAGGTAGATTAACGtattt > 2:539723/1‑141 (MQ=255) ttGTAATATAAATTTAAAAGAATTATCAAACATTTTAGGAATCTTAAAAATGTGATGTTCAACAAGACGAAGAGAGCATTAAAATACCCACAATGTAATTTTAATAGACATTGTGGGTAGGTAGATTAACGTATTTATtgt > 3:586536/1‑141 (MQ=255) aaTATAAATTTAAAAGAATTATCAAACATTTTAGGAATCTTAAAAATGAGATGTTCAACAAGACGAAGAGAGCATTAAAATACCCACAATGTAATTTTAATAGACATTGTGGGTGGGTAGATTAACGTATTTCTTGTGAtc > 2:1311478/1‑140 (MQ=255) tataAATTTAAAAGAATTATCAAACATTTTAGGAATCTTAAAAATGTGATGTTCAACAAGACGAAGAGAGCATTAAAATACCCACAATGTAATTTTAATAGACATTGTGGGTAGGTAGATTAACGTATTTATTGTGATAGt > 1:1251423/1‑141 (MQ=255) ataAATTTAAAAGAATTATCAAACATTTTAGGAATCTTAAAAATGTGATGTTCAACAAGACGAAGAGAGCATTAAAATACCCACAATGTAATTTTAATAGACATTGTGGGTAGGTAGATTAACGTATTTATTGTGATAGTa < 1:1536496/141‑1 (MQ=255) taAATTTAAAAGAATTATCAAACATTTTAGGAATCTTAAAAATGTGATGTTCAACAAGACGAAGAGAGCATTAAAATACCCACAATGTAATTTTAATAGACATTGTGGGTAGGTAGATTAACGTATTTATTGTGATAGTaa < 1:995465/141‑1 (MQ=255) taAATTTAAAAGAATTATCAAACATTTTAGGAATCTTAAAAATGTGATGTTCAACAAGACGAAGAGAGCATTAAAATACCCACAATGTAATTTTAATAGACATTGTGGGTAGGTAGATTAACGTATTTATTGTGATAGTaa < 4:493237/141‑1 (MQ=255) aaaTTTAAAAGAATTATCAAACATTTTAGGAATCTTAAAAATGTGATGTTCAACAAGACGAAGAGAGCATTAAAATACCCACAATGTAATTTTAATAGACATTGTGGGTAGGTAGATTAACGTATTTATTGTGATAGTAAt > 3:694512/1‑141 (MQ=255) aaTTTAAAAGAATTATCAAACATTTTAGGAATCTTAAAAATGTGATGTTCAACAAGACGAAGAGAGCATTAAAATACCCACAATGTAATTTTAATAGACATTGTGGGTAGGTAGATTAACGTATTTATTGTGATAGTAAtt < 1:624704/141‑1 (MQ=255) aaTTTAAAAGAATTATCAAACATTTTAGGAATCTTAAAAATGTGATGTTCAACAAGACGAAGAGAGCATTAAAATACCCACAATGTAATTTTAATAGACATTGTGGGTAGGTAGATTAACGTATTTATTGTGATAGTAAtg < 1:1571490/141‑2 (MQ=255) tttAAAAGAATTATCAAACATTTTAGGAATCTTAAAAATGTGATGTTCAACAAGACGAAGAGAGCATTAAAATACCCACAATGTAATTTTAATAGACATTGTGGGTAGGTAGATTAACGTATTTATTGTGATAGTAATTGt < 2:1457501/141‑1 (MQ=255) tAAAAGAATTATCAAACATTTTAGGAATCTTAAAAATGTGATGTTCAACAAGACGAAGAGAGCATTAAAATACCCACAATGTAATTTTAATAGACATTGTGGGTAGGTAGATTAACGTATTTATTGTGATAGTAATTGttt < 2:1200222/141‑1 (MQ=255) aaaaGAATTATCAAACATTTTAGGAATCTTAAAAATGTGATGTTCAACAAGACGAAGAGAGCATTAAAATACCCACAATGTAATTTTAATAGACATTGTGGGTAGGTAGATTAACGTATTTATTGTGATAGTAATTGTTTa > 2:47299/1‑141 (MQ=255) aaaGAATTATCAAACATTTTAGGAATCTTAAAAATGTGATGTTCAACAAGACGAAGAGAGCATTAAAATACCCACAATGTAATTTTAATAGACATTGTGGGTAGGTAGATTAACGTATTTATTGTGATAGTAATTGTTTAg > 2:86715/1‑141 (MQ=255) aaGAATTATCACACATCACAGGAAGCTTAAAAATGTGATGTTCAACAAGACGAAGAGAGCATTAAAATGCCAACAATGTAATGTTAATAGAGATCTTGGGTAGGTAGAACAACGTACTTATTGTGATAGTAATTGGTTAGc > 4:511459/1‑141 (MQ=255) gAATTATCAAACATTTTAGGAATCTTAAAAATGTGATGTTCAACAAGACGAAGAGAGCATTAAAATACCCACAATGTAATTTTAATAGACATTGTGGGTAGGTAGATTAACGTATTTATTGTGATAGTAATTGTTTAGCaa < 4:175889/141‑1 (MQ=255) aaTTATCAAACATTTTAGGAATCTTAAAAATGTGATGTTCAACAAGACGAAGAGAGCATTAAAATACCCACAATGTAATTTTAATAGACATTGTGGGTAGGTAGATTAACGTATTTATTGTGATAGTAATTGTTTAGCAAc > 4:270410/1‑141 (MQ=255) ttATCAAAAATTTTAGGAATCTTAAAAATGTGATGTTCAACAAGACGAAGAGAGAATTAAAATACCCACAATGTAATTTTAATAGACATTGTGGGTAGGTAGATTAACGTATTTATTGTGATAGTAATTGTTTAGCAACAt < 4:672516/141‑1 (MQ=255) tATCAAACATTTTAGGAATCTTAAAAATGTGATGTTCAACAAGACGAAGAGAGCATTAAAATACCCACAATGTAATTTTAATAGACATTGTGGGTAGGTAGATTAACGTATTTATTGTGATAGTAATTGTTTAGCAACATc < 2:682826/141‑1 (MQ=255) tATCAAACATTTTAGGAATCTTAAAAATGTGATGTTCAACAAGACGAAGAGAGCATTAAAATACCCACAATGTAATTTTAATAGACATTGTGGGTAGGTAGATTAACGTATTTATTGTGATAGTAATTGTTTAGCAACATc < 3:146246/141‑1 (MQ=255) tCAAACATTTTAGGAATCTTAAAAATGTGATGTTCAACAAGACGAAGAGAGCATTAAAATACCCACAATGTAATTTTAATAGACATTGTGGGTAGGTAGATTAACGTATTTATTGTGATAGTAATTGTTTAGCAACATCaa > 1:198153/1‑141 (MQ=255) aaaCATTTTAGGAATCTTAAAAATGTGATGTTCAACAAGACGAAGAGAGCATTAAAATACCCACAATGTAATTTTAATAGACATTGTGGGTAGGTAGATTAACGTATTTATTGTGATAGTAATTGTTTAGCAACATCAAgt < 1:118630/141‑1 (MQ=255) ggAATCTTAAAAATGTGATGTTCAACAAGACGAAGAGAGCATTAAAATACCCACAATGTAATTTTAATAGACATTGTGGGTAGGTAGATTAACGTATTTATTGTGATAGTAATTGTTTAGCAACATCAAGTTGTTGTTTGa < 4:253504/141‑1 (MQ=255) ggAATCTTAAAAATGTGATGTTCAACAAGACGAAGAGAGCATTAAAATACCCACAATGTAATTTTAATAGACATTGTGGGTAGGTAGATTAACGTATTTATTGTGATAGTAATTGTTTAGCAACATCAAGTTGTTGTTTGa < 1:373401/141‑1 (MQ=255) gAATCTTAAAAATGTGATGTTCAACAAGACGAAGAGAGCATTAAAATACCCACAATGTAATTTTAATAGACATTGTGGGTAGGTAGATTAACGTATTTATTGTGATAGTAATTGTTTAGCAACATCAAGTTGTTGTTTGAc < 2:139064/141‑1 (MQ=255) aTCTTAAAAATGTGATGTTCAACAAGACGAAGAGAGCATTAAAATACCCACAATGTAATTTTAATAGACATTGTGGGTAGGTAGATTAACGTATTTATTGTGATAGTAATTGTTTAGCAACATCAAGTTGTTGTTTGACCg < 2:1132463/141‑1 (MQ=255) ttAAAAATGTGATGTTCAACAAGACGAAGAGAGCATTAAAATACCCACAATGTAATTTTAATAGACATTGTGGGTAGGTAGATTAACGTATTTATTGTGATAGTAATTGTTTAGCAACATCAAGTTGTTGTTTGACCgatg < 2:612052/141‑1 (MQ=255) tAAAAATGTGATGTTCAACAAGACGAAGAGAGCATTAAAATACCCACAATGTAATTTTAATAGACATTGTGGGTAGGTAGATTAACGTATTTATTGTGATAGTAATTGTTTAGCAACATCAAGTTGTTGTTTGACCgatga > 1:331473/1‑141 (MQ=255) tAAAAATGTGATGTTCAACAAGACGAAGAGAGCATTAAAATACCCACAATGTAATTTTAATAGACATTGTGGGTAGGTAGATTAACGTATTTATTGTGATAGTAATTGTTTAGCAACATCAAGTTGTTGTTTGACCgatga < 1:417385/141‑1 (MQ=255) aaaaaTGTGATGTTCAACAAGACGAAGAGAGCATTAAAATACCCACAATGTAATTTTAATAGACATTGTGGGTAGGTAGATTAACGTATTTATTGTGATAGTAATTGTTTAGCAACATCAAGTTGTTGTTTGACCgatgat < 1:554455/141‑1 (MQ=255) aaaaaTGTGATGTTCAACAAGACGAAGAGAGCATTAAAATACCCACAATGTAATTTTAATAGACATTGTGGGTAGGTAGATTAACGTATTTATTGTGATAGTAATTGTTTAGCAACATCAAGTTGTTGTTTGACCgatgat < 2:1072073/141‑1 (MQ=255) aaaTGTGATGTTCAACAAGACGAAGAGAGCATTAAAATACCCACAATGTAATTTTAATAGACATTGTGGGTAGGTAGATTAACGTATTTATTGTGATAGTAATTGTTTAGCAACATCAAGTTGTTGTTTGACCGATGATTg < 2:512871/141‑1 (MQ=255) tgATGTTCAACAAGACGAAGAGAGCATTAAAATACCCACAATGTAATTTTAATAGACATTGTGGGTAGGTAGATTAACGTATTTATTGTGATAGTAATTGTTTAGCAACATCAAGTTGTTGTTTGACCGATGATTGACCTg > 3:401547/1‑141 (MQ=255) tgATGTTCAACAAGACGAAGAGAGCATTAAAATACCCACAATGTAATTTTAATAGACATTGTGGGTAGGTAGATTAACGTATTTATTGTGATAGTAATTGTTTAGCAACATCAAGTTGTTGTTTGACCGATGATTGACCTg > 2:1496477/1‑141 (MQ=255) tgATGTTCAACAAGACGAAGAGAGCATTAAAATACCCACAATGTAATTTTAATAGACATTGTGGGTAGGTAGATTAACGTATTTATTGTGATAGTAATTGTTTAGCAACATCAAGTTGTTGTTTGACCGATGATTGACCTg < 2:1221605/141‑1 (MQ=255) gTTCAACAAGACGAAGAGAGCATTAAAATACCCACAATGTAATTTTAATAGACATTGTGGGTAGGTAGATTAACGTATTTATTGTGATAGTAATTGTTTAGCAACATCAAGTTGTTGTTTGACCGATGATTGACCTGTTGa < 3:495391/141‑1 (MQ=255) tCAACAAGACAACGAGAGCATTAAAATACCCACAATGTAATTTTAATAGACATTGTGGGTAGGTAGATTAACGTATTTATTGTGATAGTAATTGTTTAGCAACATCAAGTTGTTGTTTGACCGATGATTGACCTGTTGGAc < 2:902499/141‑1 (MQ=255) caacaaGACGAAGAGAGCATTAAAATACCCACAATGTAATTTTAATAGACATTGTTGGTAGGTAGATGAACGTATTTATTGTGATAGTAATTGTTTAGCAACATCAAGTTGTTGTTTGACCGATGATTGACCTGTTGAAcc < 2:411752/141‑1 (MQ=255) caacaaGACGAAGAGAGCATTAAAATACCCACAATGTAATTTTAATAGACATTGTGGGTAGGTAGATTAACGTATTTATTGTGATAGTAATTGTTTAGCAACATCAAGTTGTTGTTTGACCGATGATTGACCTGTTGAAcc > 2:898887/1‑141 (MQ=255) acaaGACGAAGAGAGCATTAAAATACCCACAATGTAATTTTAATAGACATTGTGGGTAGGTAGATTAACGTATTTATTGTGATAGTAATTGTTTAGCAACATCAAGTTGTTGTTTGACCGATGATTGACCTGTTGAACCGt > 2:1033290/1‑141 (MQ=255) aaGACGAAGAGAGCATTAAAATACCCACAATGTAATTTTAATAGACATTGTGGGTAGGTAGATTAACGTATTTATTGTGATAGTAATTGTTTAGCAACATCAAGTTGTTGTTTGACCGATGATTGACCTGTTGAACCGTaa < 1:1299087/141‑1 (MQ=255) aGACGAAGAGAGCATTAAAATACCCACAATGTAATTTTAATAGACATTGTGGGTAGGTAGATTAACGTATTTATTGTGATAGTAATTGTTTAGCAACATCAAGTTGTTGTTTGACCGATGATTGACCTGTTGAACCGTAAc < 2:163234/141‑1 (MQ=255) taaatacgttaatctaccTACCCACAATGTAATTTTAATAGACATTGTGGGTAGGTAGATTAACGTATTTATTGTGATAGTAATTGTTTAGCAACATCAAGTTGTTGTTTGACCGATGATTGACCTGTTGAACCGTAACtt < 2:1551512‑M1/123‑1 (MQ=255) aCGAAGAGAGCATTAAAATACCCACAATGTAATTTTAATAGACATTGTGGGTAGGTAGATTAACGTATTTATTGTGATAGTAATTGTTTAGCAACATCAAGTTGTTGTTTGACCGATGATTGACCTGTTGAACCGTAACtt > 2:1409343/1‑141 (MQ=255) gagCATTAAAATACCCACAATGTAATTTTAATAGACATTGTGGGTAGGTAGATTAACGTATTTATTGTGATAGTAATTGTTTAGCAACATCAAGTTGTTGTTTGACCGATGATTGACCTGTTGAACCGTAACTTTGAcgtc < 1:631590/141‑1 (MQ=255) agCATTAAAATACCCACAATGTAATTTTAATAGACATTGTGGGTAGGTAGATTAACGTATTTATTGTGATAGTAATTGTTTAGCAACATCAAGTTGTTGTTTGACCGATGATTGACCTGTTGAACCGTAACTTTGAcgtcg > 2:201785/1‑141 (MQ=255) gCATTAAAATACCCACAATGTAATTTTAATAGACATTGTGGGTAGGTAGATTAACGTATTTATTGTGATAGTAATTGTTTAGCAACATCAAGTTGTTGTTTGACCGATGATTGACCTGTTGAACCGTAACTTTGAcgtcgt < 3:197778/141‑1 (MQ=255) aTTAAAATACCCACAATGTAATTTTAATAGACATTGTGGGTAGGTAGATTAACGTATTTATTGTGATAGTAATTGTTTAGCAACATCAAGTTGTTGTTTGACCGATGATTGACCTGTTGAACCGTAACTTTGACGTCGttt > 2:801579/1‑141 (MQ=255) aaTACCCACAATGTAATTTTAATAGACATTGTGGGTAGGTAGATTAACGTATTTATTGTGATAGTAATTGTTTAGCAACATCAAGTTGTTGTTTGACCGATGATTGACCTGTTGAACCGTAACTTTGACGTCGTTTTAAAc < 1:1037944/141‑1 (MQ=255) aTACCCACAATGTAATTTTAATAGACATTGTGGGTAGGTAGATTAACGTATTTATTGTGATAGTAATTGTTTAGCAACATCAAGTTGTTGTTTGACCGATGATTGACCTGTTGAACCGTAACTTTGACGTCGTTTTAAACa < 1:957870/141‑1 (MQ=255) | ACAAAAACCTGCTTGTGAAAACGCTTTACACATTTCTTTTACAATTTATAACATTTTTGTAATATAAATTTAAAAGAATTATCAAACATTTTAGGAATCTTAAAAATGTGATGTTCAACAAGACGAAGAGAGCATTAAAATACCCACAATGTAATTTTAATAGACATTGTGGGTAGGTAGATTAACGTATTTATTGTGATAGTAATTGTTTAGCAACATCAAGTTGTTGTTTGACCGATGATTGACCTGTTGAACCGTAACTTTGACGTCGTTTTAAACA > USA300TCH1516_ALE/955830‑956109 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |