| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 2661788 = | 201 (1.100) | 4 (0.030) | 4/222 | NT | 2.4% | intergenic (‑181/‑140) | ybiV/yydI | Sugar phosphatase YbiV/putative peptide export ATP‑binding protein YydI |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 2661832 = | 151 (0.950) | intergenic (‑225/‑96) | ybiV/yydI | Sugar phosphatase YbiV/putative peptide export ATP‑binding protein YydI | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 241 total aligned reads displayed.
TCCATCTCATGACAAGCAATGAAGTTTGTCATACCACAATGAACCTATATTCACATTTTGAAATTGCTTTCATATATGCAAAACACATTACACTGGATATAGCATTCAGAGGCGAACATAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATCACACTATATTTATCATTTAGA‑CA‑AAATATAGTGTGATATACTAATTTATAACATCTATACATAATGTGAAAGAATTTTTAAAAATACAATTAAATATCGGTGTAATAAATCCCTTTATACATAGGAGTTGTAT > USA300TCH1516_ALE/2661648‑2661925 | agttgtttgtttttaacttttaaagaatagttatttagtttcatgtatacaactcctatgtataaagggatttattacaccgatatttaattgtatttttaaaaattctttcacattatgtatagatgttataaattagta < 2:1493607‑M1/1‑1 (MQ=255) gttgtttgtttttaacttttaaagaatagttatttagtttcatgtatacaactcctatgtataaagggatttattacaccgatatttaattgtatttttaaaaattctttcacattatgtatagatgttataaattagtat > 2:167405‑M1/140‑141 (MQ=255) ccATCTCATGCCAAGCAATGAAGTTTGTCATACCACAATGAACCTATATTCACATTTTGAAATTGCTTTCATATATGCAAAACACATTACACTGGATATAGCATTCAGAGGCGAACATAAATTTCAGAATATTGTAAAAat > 2:516967/1‑141 (MQ=255) ccATCTCATGACAAGCAATGAAGTTTGTCATACCACAATGAACCTATATTCACATTTTGAAATTGCTTTCATATATGCAAAACACATTACACTGGATATAGCATTCAGAGGCGAACATAAATTTCAGAATATTGTaaaaaa > 3:543286/1‑140 (MQ=255) tgtttgttttttatttttatagaatagttatttagtttcatgtatacaactcttatttataattgtatttattataccgatatttaattgtttttttttaaattctttcacattatgtatagatgttataaattattatat < 4:151710‑M1/4‑1 (MQ=255) tgtttgtttttaacttttaaagaatagttatttagtttcatgtatacaactcctatgtataaagggatttattacaccgatatttaattgtatttttaaaaattctttcacattatgtatagatgttataaattagtatat > 4:132693‑M1/138‑141 (MQ=255) aTCTCATGACAAGCAATGAAGTTTGTCATACCACAATGAACCTATATTCACATTTTGAAATTGCTTTCATATATGCAAAACACATTACACTGGATATAGCATTCAGAGGCGAACATAAATTTCAGAATATTGTAAAAatat < 1:444693/141‑1 (MQ=255) tctcATGACAAGCAATGAAGTTTGTCATACCACAATGAACCTATATTCACATTTTGAAATTGCTTTCATATATGCAAAACACATTACACTGGATATAGCATTCAGAGGCGAACATAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATc < 3:508248/141‑1 (MQ=255) cATGACAAGCAATGAAGTTTGTCATACCACAATGAACCTATATTCACATTTTGAAATTGCTTTCATATATGCAAAACACATTACACTGGATATAGCATTCAGAGGCGAACATAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATcaca > 1:1005084/1‑141 (MQ=255) cATGACAAGCAATGAAGTTTGTCATACCACAATGAACCTATATTCACATTTTGAAATTGCTTTCATATATGCAAAACACATTACACTGGATATAGCATTCAGAGGCGAACATAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATcaca > 2:938565/1‑141 (MQ=255) cATGACAAGCAATGAAGTTTGTCATACCACAATGAACCTATATTCACATTTTGAAATTGCTTTCATATATGCAAAACACATTACACTGGATATAGCATTCAGAGGCGAACATAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATcaca < 2:573573/141‑1 (MQ=255) gtttttaacttttaaagaatagttatttagtttcatgtatacaactcctatgtataaagggatttattacaccgatatttaattgtatttttaaaaattctttcacattatgtatagatgttataaattagtATATCacac < 2:1264356‑M1/9‑1 (MQ=255) aTGACAAGCAATGAAGTTTGTCATACCACAATGAACCTATATTCACATTTTGAAATTGCTTTCATATATGCAAAACACATTACACTGGATATAGCATTCAGAGGCGAACATAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATCacac > 2:340235/1‑141 (MQ=255) aTGACAAGCAATGAAGTTTGTCATACCACAATGAACCTATATTCACATTTTGAAATTGCTTTCATATATGCAAAACACATTACACTGGATATAGCATTCAGAGGCGAACATAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATCacac > 4:55457/1‑141 (MQ=255) tGACAAGCAATGAAGTTTGTCATACCACAATGAACCTATATTCACATTTTGAAATTGCTTTCATATATGCAAAACACATTACACTGGATATAGCATTCAGAGGCGAACATAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATCACACt > 4:689597/1‑141 (MQ=255) acacGCAATGAAGTTTGTCATACCACAATGAACCTATATTCACATTTTGAAATTGCTTTCATATATGCAAAACACATTACACTGGATATAGCATTCAGAGGCGAACATAAATTTCTGAATATTGTAAAAATATCACACtat < 4:518976/141‑1 (MQ=255) taacttttaaagaatagttatttagtttcatgtatacaactcctatgtataaagggatttattacaccgatatttaattgtatttttaaaaattctttcacattatgtatagatgttataaattagtATATCACACTatat < 1:1430691‑M1/14‑1 (MQ=255) aacttttaaagaatagttatttagtttcatgtatacaactcctatgtataaagggatttattacaccgatatttaattgtatttttaaaaattctttcacattatgtatagatgttataaattagtATATCACACTATAtt > 2:363504‑M1/127‑141 (MQ=255) aacttttaaagaatagttatttagtttcatgtatacaactcctatgcataaagggatttattacaccgatatttaattgtatttttaaaaattctttcacattatgtatagatgttataaattagtATATCACACTATAtt < 3:587103‑M1/15‑1 (MQ=255) gCAATGAAGTTTGTCATACCACAATGAACCTATATTCACATTTTGAAATTGCTTTCATATATGCAAAACACATTACACTGGATATAGCATTCAGAGGCGAACATAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATCACACTATAttt > 1:953722/1‑141 (MQ=255) gCAATGAAGTTTGTCATACCACAATGAACCTATATTCACATTTTGAAATTGCTTTCATATATGCAAAACACATTACACTGGATATAGCATTCAGAGGCGAACATAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATCACACTATAttt < 1:1240198/141‑1 (MQ=255) aaGTTTGTCATACCACAATGAACCTATATTCACATTTTGAAATTGCTTTCATATATGCAAAACACATTACACTGGATATAGCATTCAGAGGCGAACATAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATCACACTATATTTATCAtt < 1:856266/141‑1 (MQ=255) aGTTTGTCATACCACAATGAACCTATATTCACATTTTGAAATTGCTTTCATATATGCAAAACACATTACACTGGATATAGCATTCAGAGGCGAACATAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATCACACTATATTTATCAttt > 1:73438/1‑141 (MQ=255) ttGTCATACCACAATGAACCTATATTCACATTTTGAAATTGCTTTCATATATGCAAAACACATTACACTGGATATAGCATTCAGAGGCGAACATAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATCACACTATATTTATCATTTAGa > 3:659048/1‑141 (MQ=255) tCATACCACAATGAACCTATATTCACATTTTGAAATTGCTTTCATATATGCAAAACACATTACACTGGATATAGCATTCAGAGGCGAACATAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATCACACTATATTTATCATTTAGA‑Ca‑a > 4:398451/1‑141 (MQ=255) aTACCACAATGAACCTATATTCACATTTTGAAATTGCTTTCATATATGCAAAACACATTACACTGGATATAGCATTCAGAGGCGAACATAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATCACACTATATTTATCATTTAGA‑Ca‑aaa < 2:250653/141‑1 (MQ=255) tACCACAATGAACCTATATTCACATTTTGAAATTGCTTTCATATATGCAAAACACATTACACTGGATATAGCATTCAGAGGCGAACATAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATCACACTATATTTATCATTTAGA‑CA‑AAat < 2:851311/141‑1 (MQ=255) aCCACAATGAACCTATATTCACATTTTGAAATTGCTTTCATATATGCAAAACACATTACACTGGATATAGCATTCAGAGGCGAACATAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATCACACTATATTTATCATTTAGA‑CA‑AAata > 1:330548/1‑141 (MQ=255) ccACAATGAACCTATATTCACATTTTGAAATTGCTTTCATATATGCAAAACACATTACACTGGATATAGCATTCAGAGGCGAACATAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATCACACTATATTTATCATTTAGA‑CA‑AAatat > 4:255031/1‑141 (MQ=255) gAACCTATATTCACATTTTGAAATTGCTTTCATATATGCAAAACACATTACACTGGATATAGCATTCAGAGGCGAACATAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATCACACta > 1:386497/1‑111 (MQ=255) aCCTATATTCACATTTTGAAATTGCTTTCATATATGCAAAACACATTACACTGGATATAGCATTCAGAGGCGAACATAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATCACACTATATTTATCATTTAGA‑CA‑AAATATAgtgttaca > 1:1029147/1‑137 (MQ=255) aCCTATATTCACATTTTGAAATTGCTTTCATATATGCAAAACACATTACACTGGATATAGCATTCAGAGGCGAACATAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATCACACTATATTTATCATTTAGA‑CA‑AAATATAGTGTGata < 4:627602/141‑1 (MQ=255) aCCTATATTCACATTTTGAAATTGCTTTCATATATGCAAAACACATTACACTGGATATAGCATTCAGAGGCGAACATAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATCACACTATATTTATCATTTAGA‑CA‑AAATATAGTGTGata > 2:1303385/1‑141 (MQ=255) ccTATATTCACATTTTGAAATTGCTTTCATATATGCAAAACACATTACACTGGATATAGCATTCAGAGGCGAACATAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATCACACTATATTTATCATTTAGA‑CA‑AAATATAGTGTGatat > 1:994854/1‑141 (MQ=255) ccTATATTCACATTTTGAAATTGCTTTCATATATGCAAAACACATTACACTGGATATAGCATTCAGAGGCGAACATAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATCACACTATATTTATCATTTAGA‑CA‑AAATATAGTGTGatat > 2:1617775/1‑141 (MQ=255) atatTCACATTTTGAAATTGCTTTCATATATGCAAAACACATTACACTGGATATAGCATTCAGAGGCGAACATAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATCACACTATATTTATCATTTAGA‑CA‑AAATATAGTGTGATATACt < 1:1289665/141‑1 (MQ=255) atatTCACATTTTGAAATTGCTTTCATATATGCAAAACACATTACACTGGATATAGCATTCAGAGGCGAACATAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATCACACTATATTTATCATTTAGA‑CA‑AAATATAGTGTGATATACt < 1:1392900/141‑1 (MQ=255) atTCACATTTTGAAATTGCTTTCATATATGCAAAACACATTACACTGGATATAGCATTCAGAGGCGAACATAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATCACACTATATTTATCATTTAGA‑CA‑AAATATAGTGTGATATACTaa > 2:1177088/1‑141 (MQ=255) caactcctatgtataaagggatttattacaccgatatttaattgtatttttaaaaattctttcacattatgtatagatgttataaattagtATATCACACTATATTTATCATTTAGA‑CA‑AAATATAGTGTGATATACTAAt > 1:98176‑M1/92‑141 (MQ=255) cacaTTTTGAAATTGCTTTCATATATGCAAAACACATTACACTGGATATAGCATTCAGAGGCGAACATAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATCACACTATATTTATCATTTAGA‑CA‑AAATATAGTGTGATATACTAAttt < 3:622179/141‑1 (MQ=255) acaTTTTGAAATTGCTTTCATATATGCAAAACACATTACACTGGATATAGCATTCAGAGGCGAACATAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATCACACTATATTTATCATTTAGA‑CA‑AAATATAGTGTGATATACTAATTta < 2:171443/141‑1 (MQ=255) acaTTTTGAAATTGCTTTCATATATGCAAAACACATTACACTGGATATAGCATTCAGAGGCGAACATAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATCACACTATATTTATCATTTAGA‑CA‑AAATATAGTGTGATATACTAATTta < 4:572601/141‑1 (MQ=255) caTTTTGAAATTGCTTTCATATATGCAAAACACATTACACTGGATATAGCATTCAGAGGCGAACATAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATCACACTATATTTATCATTTAGA‑CA‑AAATATAGTGTGATATACTAATTtat < 1:28530/141‑1 (MQ=255) aTTTTGAAATTGCTTTCATATATGCAAAACACATTACACTGGATATAGCATTCAGAGGCGAACATAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATCACACTATATTTATCATTTAGA‑CA‑AAATATAGTGTGATATACTAATTtata > 1:1264356/1‑141 (MQ=255) ttGAAATTGCTTTCATATATGCAAAACACATTACACTGGATATAGCATTCAGAGGCGGACATACATATAAGTATATTCGAAGAATCGCACACTATATTTATCATTGAGA‑CG‑ATATATAGTGTGATATACTAATTTATAACa > 1:156496/1‑141 (MQ=255) gAAATTGCTTTCATATATGCAAAACACATTACACTGGATATAGCATTCAGAGGCGAACATAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATCACACTATATTTATCATTTAGA‑CA‑AAATATAGTGTGATATACTAATTTATAACATc > 2:204108/1‑141 (MQ=255) aaTTGCTTTCATATATGCAAAACACATTACACTGGATATAGCATTCAGAGGCGAACATAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATCACACTATATTTATCATTTAGA‑CA‑AAATATAGTGTGATATACTAATTTATAACATCta > 1:212628/1‑141 (MQ=255) aTTGCTTTCATATATGCAAAACACATTACACTGGATATAGCATTCAGAGGCGAACATAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATCACACTATATTTATCATTTAGA‑CA‑AAATATAGTGTGATATACTAATTTATAACATCtat < 1:490526/141‑1 (MQ=255) ttGCTTTCATATATGCAAAACACATTACACTGGATATAGCATTCAGAGGCGAACATAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATCACACTATATTTATCATTTAGA‑CA‑AAATATAGTGTGATATACTAATTTATAACATCtata > 4:427737/1‑141 (MQ=255) tGCTTTCATATATGCAAAACACATTACACTGGATATAGCATTCAGAGGCGAACATAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATCACACTATATTTATCATTTAGA‑CA‑AAATATAGTGTGATATACTAATTTATAACATCTATAc < 1:186790/141‑1 (MQ=255) tGCTTTCATATATGCAAAACACATTACACTGGATATAGCATTCAGAGGCGAACATAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATCACACTATATTTATCATTTAGA‑CA‑AAATATAGTGTGATATACTAATTTATAACATCTATAc < 4:548282/141‑1 (MQ=255) ttCATATATGCAAAACACATTACACTGGATATAGCATTCAGAGGCGAACATAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATCACACTATATTTATCATTTAGA‑CA‑AAATATAGTGTGATATACTAATTTATAACATCTATACATaa > 2:1552945/1‑141 (MQ=255) tatatGCAAAACACATTACACTGGATATAGCATTCAGAGGCGAACATAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATCACACTATATTTATCATTTAGA‑CA‑AAATATAGTGTGATATACTAATTTATAACATCTATACATAAtgtg < 3:55457/141‑1 (MQ=255) tatatGCAAAACACATTACACTGGATATAGCATTCAGAGGCGAACATAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATCACACTATATTTATCATTTAGA‑CA‑AAATATAGTGTGATATACTAATTTATAACATCTATACATAAtgtg > 2:139236/1‑141 (MQ=255) tatGCAAAACACATTACACTGGATATAGCATTCAGAGGCGAACATAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATCACACTATATTTATCATTTAGA‑CA‑AAATATAGTGTGATATACTAATTTATAACATCTATACATAATGTGaa < 2:1368981/141‑1 (MQ=255) tatGCAAAACACATTACACTGGATATAGCATTCAGAGGCGAACATAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATCACACTATATTTATCATTTAGA‑CA‑AAATATAGTGTGATATACTAATTTATAACATCTATACATAATGTGaa < 1:836505/141‑1 (MQ=255) gCAAAACACATTACACTGGATATAGCATTCAGAGGCGAACATAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATCACACTATATTTATCATTTAGA‑CA‑AAATATAGTGTGATATACTAATTTATAACATCTATACATAATGTGAAAGa < 2:733097/141‑1 (MQ=255) cAAAACACATTACACTGGATATAGCATTCAGAGGCGAACATAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATCACACTATATTTATCATTTAGA‑CA‑AAat < 3:425513/94‑1 (MQ=255) aaaaCACATTACACTGGATATAGCATTCGGAGGCGAACATAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATAACGATATATTTATCATTTGGA‑CA‑AAATATAGTGTGATATACTAATTTATAACATCTATACATAATGTGAAAAAAt < 1:532858/141‑1 (MQ=255) aaaCACATTACACTGGATATAGCATTCAGAGGCGAACATAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATCACACTATATTTATCATTTAGA‑CA‑AAATATAGTGTGATATACTAATTTATAACATCTATACATAATGTGAAAGAAtt > 1:1101997/1‑141 (MQ=255) aaCACATTACACTGGATATAGCATTCAGAGGCGAACATAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATCACACTATATTTATCATTTAGA‑CA‑AAATATAGTGTGATATACTAATTTATAACATCTATACATAATGTGAAAGAAttt < 2:652236/141‑1 (MQ=255) caTTACACTGGATATAGCATTCAGAGGCGAACATAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATCACACTATATTTATCATTTAGA‑CA‑AAATATAGTGTGATATACTAATTTATAACATCTATACATAATGTGAAAGAATTTTTaa > 1:1347668/1‑141 (MQ=255) tACACTGGATATAGCATTCAGAGGCGAACATAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATCACACTATATTTATCATTTAGA‑CA‑AAATATAGTGTGATATACTAATTTATAACATCTATACATAATGTGAAAGAATTTTTaaaaa < 3:12912/141‑1 (MQ=255) tACACTGGATATAGCATTCAGAGGCGAACATAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATCACACTATATTTATCATTTAGA‑CA‑AAATATAGTGTGATATACTAATTTATAACATCTATACATAATGTGAAAGAATTTTTaaaaa > 2:972349/1‑141 (MQ=255) atttttaaaaattctttcacattatgtatagatgttataaattagtATATCACACTATATTT‑TG‑TCTAAATGATAAATATAGTGTGATATACTAATTTATAACATCTATACATAATGTGAAAGAATTTTTAAAAATACAAt < 1:228037‑M1/95‑1 (MQ=255) atatAGCATTCAGAGGCGAACATAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATCACACTATATTTATCATTTAGA‑CA‑AAATATAGTGTGATATACTAATTTATAACATCTATACATAATGTGAAAGAATTTTTAAAAATACAATTa > 2:1111444/1‑141 (MQ=255) taGCATTCAGAGGCGAACATAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATCACACTATATTTATCATTTAGA‑CA‑AAATATAGTGTGATATACTAATTTATAACATCTATACATAATGTGAAAGAATTTTTAAAAATACAATTAAat < 1:1384409/141‑1 (MQ=255) cATTCAGAGGCGAACATAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATCACACTATATTTATCATTTAGA‑CA‑AAATATAGTGTGATATACTAATTTATAACATCTATACATAATGTGAAAGAATTTTTAAAAATACa > 2:400134/1‑131 (MQ=255) cATTCAGAGGCGAACATAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATCACACTATATTTATCATTTAGA‑CA‑AAATATAGTGTGATATACTAATTTATAACATCTATACATAATGTGAAAGAATTTTTAAAAATACAATTAAATATc > 4:505767/1‑141 (MQ=255) ttCAGAGGCGAACATAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATCACACt > 2:272586/1‑46 (MQ=255) ttCAGAGGCGAACATAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATCACACTATATTTATCATTTAGA‑CA‑AAATATAGTGTGATATACTAATTTATAACATCTATACATAATGTGAAAGAATTTTTAAAAATACAATTAAATATCgg > 2:1356420/1‑141 (MQ=255) agagGCGAACATAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATCACACTATATTTATCATTTAGA‑CA‑AAATATAGTGTGATATACTAATTTATAACATCTATACATAATGTGAAAGAATTTTTAAAAATACAATTAAATATCGgtgt < 4:410829/141‑1 (MQ=255) agagGCGAACATAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATCACACTATATTTATCATTTAGA‑CA‑AAATATAGTGTGATATACTAATTTATAACATCTATACATAATGTGAAAGAATTTTTAAAAATACAATTAAATATCGgtgt < 4:208211/141‑1 (MQ=255) agGCGAACATAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATCACACTATATTTATCATTTAGA‑CA‑AAATATAGTGTGATATACTAATTTATAACATCTATACATAATGTGAAAGAATTTTTAAAAATACAATTAAATATCGGTGtaa > 1:566436/1‑141 (MQ=255) agGCGAACATAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATCACACTATATTTATCATTTAGA‑CA‑AAATATAGTGTGATATACTAATTTATAACATCTATACATAATGTGAAAGAATTTTTAAAAATACAATTAAATATCGGTGtaa < 3:93086/141‑1 (MQ=255) agGCGAACATAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATCACACTATATTTATCATTTAGA‑CA‑AAATATAGTGTGATATACTAATTTATAACATCTATACATAATGTGAAAGAATTTTTAAAAATACAATTAAATATCGGTGtaa > 3:20363/1‑141 (MQ=255) gCGAACATAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATCACACTATATTTATCATTTAGA‑CA‑AAATATAGTGTGATATACTAATTTATAACATCTATACATAATGTGAAAGAATTTTTTAAAATACAATTAAATATCGGTGtaata > 2:481566/1‑141 (MQ=255) cGAACATAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATCACACTATATTTATCATTTAGA‑CA‑AAATATAGTGTGATATACTAATTTATAACATCTATACATAATGTGAAAGAATTTTTAAAAATACAATTAAATATCGGTGtaataa < 1:139236/141‑1 (MQ=255) cGAACATAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATCACACTATATTTATCATTTAGA‑CA‑AAATATAGTGTGATATACTAATTTATAACATCTATACATAATGTGAAAGAATTTTTAAAAATACAATTAAATATCGGTGtaataa < 4:370970/141‑1 (MQ=255) aCATAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATCACACTATATTTATCATTTAGA‑Ca > 1:1019389/1‑53 (MQ=255) aCATAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATCACACTATATTTATCATTTAGA‑CA‑AAATATAGTGTGATATACTAATTTATAACATCTATACATAATGTGAAAGAATTTTTAAAAATACAATTAAATATCGGTGTAATAAATc > 2:580660/1‑141 (MQ=255) cATAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATCACACTATATTTATCATTTAGA‑CA‑AAATATAGTGTGATATACTAATTTATAACATCTATACATAATGTGAAAGAATTTTTAAAAATACAATTAAATATCGGTGTAATAAATcc > 1:424636/1‑141 (MQ=255) cATAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATCACACTATATTTATCATTTAGA‑CA‑AAATATAGTGTGATATACTAATTTATAACATCTATACATAATGTGAAAGAATTTTTAAAAATACAATTAAATATCGGTGTAATAAATcc < 2:1022485/141‑1 (MQ=255) cATAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATCACACTATATTTATCATTTAGA‑CA‑AAATATAGTGTGATATACTAATTTATAACATCTATACATAAGTTGAAAGAATTTTTAAAAATACAATTAAAAATCGGTGAAATAAATcc > 2:1573351/1‑141 (MQ=255) aTAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATCACACTATATTTATCATTTAGA‑CA‑AAATATAGTGTGATATACTAATTTATAACATCTATACATAATGTGAAAGAATTTTTACAAATACAATTAAATATCGGGGTAATAAATccc > 4:277019/1‑141 (MQ=255) tAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATCACACTATATTTATCATTTAGA‑CA‑AAATATAGTGTGATATACTAATTTATAACATCTATACATAATGTGAAAGAATTTTTAAAAATACAATTAAATATCGGTGTAATAAATCCCt < 1:393463/141‑1 (MQ=255) tAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATCACACTATATTTATCATTTAGA‑CA‑AAATATAGTGTGATATACTAATTTATAACATCTATACATAATGTGAAAGAATTTTTAAAAATACAATTAAATATCGGTGTAATAAATCCCt > 2:1351969/1‑141 (MQ=255) aaaTTTCAGAATATTGTAAAAATATCACACTATATTTATCATTTAGA‑CA‑AAATATAGTGTGATATACTAATTTATAACATCTATACATAATGTGAAAGAATTTTTAAAAATACAATTAAATATCGGTGTAATAAATCCCtt < 2:1567776/141‑1 (MQ=255) aaTTTCAGAATATTGTAAAAATATCACACTATATTTATCATTTAGA‑CA‑AAATATAGTGTGATATACTAATTTATAACATCTATACATAATGTGAAAGAATTTTTAAAAATACAATTAAATATCGGTGTAATAAATCCCttt > 4:450090/1‑141 (MQ=255) aTTTCAGAATATTGTAAAAATATCACACTATATTTATCATTTAGA‑CA‑AAATATAGTGTGATATACTAATTTATAACATCTATACATAATGTGAAAGAATTTTTAAAAATACAATTAAATATCGGTGTAATAAATCCCTTta < 2:1118222/141‑1 (MQ=255) tttCAGAATATTGTAAAAATATCACACTATATTTATCATTTAGA‑CA‑AAATATAGTGTGATATACTAATTTATAACATCTATACATAATGTGAAAGAATTTTTAAAAATACAATTAAATATCGGTGTAATAAATCCCTTtat < 2:82534/141‑1 (MQ=255) ttCAGAATATTGTAAAAATATCACACTATATTTATCATTTAGA‑CA‑AAATATAGTGTGATATACTAATTTATAACATCTATACATAATGTGAAAGAATTTTTAAAAATACAATTAAATATCGGTGTAATAAATCCCTTtata < 1:1637924/141‑1 (MQ=255) aGAATATTGTAAAAATATCACACTATATTTATCATTTAGA‑CA‑AAATATAGTGTGATATACTAATTTATAACATCTATACATAATGTGAAAGAATTTTTAAAAATACAATTAAATATCGGTGTAATAAATCCCTTTATACAt < 3:337209/141‑1 (MQ=255) aaTATTGTAAAAATATCACACTATATTTATCATTTAGA‑CA‑AAATATAGTGTGat > 1:781693/1‑54 (MQ=255) aaTATTGTAAAAATATCACACTATATTTATCATTTAGA‑CA‑AAATATAGTGTGat < 2:781693/54‑1 (MQ=255) atatTGTAAAAATATCACACTATATTTATCATTTAGA‑CA‑AAATATAGTGTGATATACTAATTTATAACATCTATACATAATGTGAAAGAATTTTTAAAAATACAATTAAATATCGGTGTAATAAATCCCTTTATACATAgg < 2:1434841/141‑1 (MQ=255) ttGTAAAAATATCACACTATATTTATCATTTAGA‑CA‑AAATATAGTGTGATATACTAATTTATAACATCTATACATAATGTGAAAGAATTTTTAAAAATACAATTAAATATCGGTGTAATAAATCCCTTTATACATAGGAGt < 1:719732/141‑1 (MQ=255) tGTAAAAATATCACACTATATTTATCATTTAGA‑CA‑AAATATAGTGTGATATACTAATTTATAACATCTATACATAATGTGAAAGAATTTTTAAAAATACAATTAAATATCGGTGTAATAAATCCCTTTATACATAGGAGtt > 3:445857/1‑141 (MQ=255) agTAAAAATATCACACTATATTTATCATTTAGA‑CA‑AAATATAGTGTGATATACTAATTTATAACATCTATACATAATGTGAAAGAATTTTTAAAAATACAATTAAATATCGGTGTAATAAATCCCTTTATACATAGGAGtt < 1:1205134/140‑1 (MQ=255) aaaaaTATCACACTATATTTATCATTTAGA‑CA‑AAATATAGTGTGATATACTAATTTATAACATCTATACATAATGTGAAAGAATTTTTAAAAATACAATTAAATATCGGTGTAATAAATCCCTTTATACATAGGAGTTGta < 2:1005084/141‑1 (MQ=255) | TCCATCTCATGACAAGCAATGAAGTTTGTCATACCACAATGAACCTATATTCACATTTTGAAATTGCTTTCATATATGCAAAACACATTACACTGGATATAGCATTCAGAGGCGAACATAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATCACACTATATTTATCATTTAGA‑CA‑AAATATAGTGTGATATACTAATTTATAACATCTATACATAATGTGAAAGAATTTTTAAAAATACAATTAAATATCGGTGTAATAAATCCCTTTATACATAGGAGTTGTAT > USA300TCH1516_ALE/2661648‑2661925 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |