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2:855117/1‑141 (MQ=255) tGCCCCTAAGCAAGGTATGATTGTCATACCTACAACTGGATTTATCTTTTTGGCAATGAGTAAACCTACAATTGAAATAATAATAATGAGCCCCATTACTGTTAACCACATATTATCACTATTCATATTATTTTctccctc > 1:978965/1‑141 (MQ=255) tGCCCCTAAGCAAGGTATGATTGTCATACCTACAACTGGATTTATCTTTTTGGCAATGAGTAAACCTACAATTGAAATAATAATAATGAGCCCCATTACTGTTAACCACATATTATCACTATTCATATTATTTTctccctc > 1:1370025/1‑141 (MQ=255) ccccTAAGCAAGGTATGATTGTCATACCTACAACTGGATTTATCTTTTTGGCAATGAGTAAACCTACAATTGAAATAATAATAATGAGCCCCATTACTGTTAACCACATATTATCACTATTCATATTATTTTCTCCCTCCa > 1:44727/1‑141 (MQ=255) cccTAAGCAAGGTATGATTGTCATACCTACAACTGGATTTATCTTTTTGGCAATGAGTAAACCTACAATTGAAATAATAATAATGAGCCCCATTACTGTTAACCACATATTATCACTATTCATATTATTTTCTCCCTCCAc > 2:166152/1‑141 (MQ=255) | GCTTGAATAAACCACTATCGTTCATGATGCCAAAGAAAATAATGGCAAAGATAAACATAATAACAACGTTGATGACTTGATCTAACCCTTTAGCAAAAAATCCAACCAAATCTGTCACACTATATCCTAAAATCATTGCCCCTAAGCAAGGTATGATTGTCATACCTACAACTGGATTTATCTTTTTGGCAATGAGTAAACCTACAATTGAAATAATAATAATGAGCCCCATTACTGTTAACCACATATTATCACTATTCATATTATTTTCTCCCTCCAC > USA300TCH1516_ALE/2760737‑2761016 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |