New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 190 total aligned reads displayed.
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2:1424585/141‑1 (MQ=255) ctcgATTTATCTTTTTGGCCATGAGTAAACCTACAATTGACATAATAATCACGCGCCCCATTACTG‑TACCCACCCTCTAATCACTACTCATCTTATTTTCTCCCTCCACTTTTAATACAATTTACATAATCCCCCTCtttc < 1:1402624/138‑2 (MQ=255) cTGGATTTATCTTTTTGGCAATGAGTAAACCTACAATTGAAATAATAATAATGAGCCCCATTACTGTTAACCA‑CATATTATCACTATTCATATTATTTTCTCCCTCCACTTTTAATACAATTTACATAATCCCCCTCTTTa < 3:493131/141‑1 (MQ=255) gATTTATCTTTTTGGCAATGAGTAAACCTACAATTGAAATAATAATAATGAGCCCCATTACTGTTAACCA‑CATATTATCACTATTCATATTATTTTCTCCCTCCACTTTTAATACAAttt > 1:528594/1‑120 (MQ=255) gATTTATCTTTTTGGCAATGAGTAAACCTACAATTGAAATAATAATAATGAGCCCCATTACTGTTAACCA‑CATATTATCACTATTCATATTATTTTCTCCCTCCACTTTTAATACAATTTACATAATCCCCCTCTTTAACt < 3:322607/141‑1 (MQ=255) gATTTATCTTTTTGGCAAGGAGTAAACCTACAATTGAAATAATAATAATGAGCCCCATTACTGTTAACCA‑CATATTATCACTATTCATAGTATTTTCTCCCTCCACTTTTAATACAATTTACATAATCCCCCTCTTTAACt > 2:450309/1‑141 (MQ=255) tttATCTTTTTGGCAATGAGTAAACCTACAATTGAAATAATAATAATGAGCCCCATTACTGTTAACCA‑CATATTATCACTATTCATATTATTTTCTCCCTCCACTTTTAATACAATTTACATAATCCCCCTCTTTAACTTa < 4:269363/141‑1 (MQ=255) tATCTTTTTGGCAATGAGTAAACCTACAATTGAAATAATAATAATGAGCCCCATTACTGTTAACCA‑CATATTATCACTATTCATATTATTTTCTCCCTCCACTTTTAATACAATTTACATAATCCCCCTCTTTAACTTaaa > 3:156572/1‑141 (MQ=255) cttcttGGCAATGAGTAAACCTACAATTGAAATAATAATAATAAGCCCCATTACTGTTAACCA‑CATATTATCACTATTCATATTATTTTCTCCTTCCACTTTTAATACAATTTACATAATCCCCCTCTTTAACTTAAatat > 4:342736/1‑141 (MQ=255) cTTTTTGGCAATGAGTAAACCTACAATTGAAATAATAATAATGAGCCCCATTACTGTTAACCA‑CATATTATCACTATTCATATTATTTTCTCCCTCCACTTTTAATACAATTTACATAATCCCCCTCTTTAACTTAAatat > 1:253311/1‑141 (MQ=255) cTTTTTGGCAATGAGTAAACCTACAATTGAAATAATAATAATGAGCCCCATTACTGTTAACCA‑CATATTATCACTATTCATATTATTTTCTCCCTCCACTTTTAATACAATTTACATAATCCCCCTCTTTAACTTAAagat < 1:809276/141‑1 (MQ=255) tttttGGCAATGAGTAAACCTACAATTGAAATAATAATAATGAGCCCCATTACTGTTAACCA‑CATATTATCACTATTCATATTATTTTCTCCCTCCACTTTTAATACAATTTACATAATCCCCCTCTTTAACTTAAAtatt > 1:373076/1‑141 (MQ=255) | ATAAACATAATAACAACGTTGATGACTTGATCTAACCCTTTAGCAAAAAATCCAACCAAATCTGTCACACTATATCCTAAAATCATTGCCCCTAAGCAAGGTATGATTGTCATACCTACAACTGGATTTATCTTTTTGGCAATGAGTAAACCTACAATTGAAATAATAATAATGAGCCCCATTACTGTTAACCA‑CATATTATCACTATTCATATTATTTTCTCCCTCCACTTTTAATACAATTTACATAATCCCCCTCTTTAACTTAAATATTAT > USA300TCH1516_ALE/2760787‑2761061 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |