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cAAGACATTTGTGCCTATAAAAATGCTTAACCAAGATTTTTATATTGAAGTTGTACTTCTTGCACATATTGTCCTTGCCTTATTATGTAAAGTTATTTTCTTTCTATCTTTTTATTAAATTTAACTATTCTTCATAATccc < 2:339491/141‑1 (MQ=255) aaGgacaatatgtgcaagaagtacaacttcaatataaaaatcttggttaagcatttttataggcacaaatgtcttgccttttttattttaaaaaattttaaaatcaatacaccgaattttctgaaaaaggttgtaatgtat < 1:206597‑M1/141‑139 (MQ=255) aGACATTTGTGCCTATAAAAATGCTTAACCAAGATTTTTATATTGAAGTTGTACTTCTTGCACATATTGTCCTTGCCTTATTATGTAAAGTTATTTTCTTTCTATCTTTTTATTAAATTTAACTATTCTTCATAATCCCGa < 1:228669/141‑1 (MQ=255) ggacaatatgtgcaagaagtacaacttcaatataaaaatcttgcttaagcatttttataggcacaaatgtcttgccttttttattttaaaaaattttaaaatcaatacaccgaattttctgaaaaaggttgtaatgtattg < 1:1305340‑M1/141‑141 (MQ=255) gACATTTGTGCCTATAAAAATGCTTAACCAAGATTTTTATATTGAAGTTGTACTTCTTGCACATATTGTCCTTGCCTTATTATGTAAAGTTATTTTCTTTCTATCTTTTTATTAAATTTAACTATTCTTCATAATCCCGAt < 3:217503/141‑1 (MQ=255) | ATTTTCGTTGTTTGCTTTACTTCTCTACCACGCTAAAGTGTAATATGATTAATAACTTATCATTTTTAGCAATACATTACAACCTTTTTCAGAAAATTCGGTGTATTGATTTTAAAATTTTTTAAAATAAAAAAGGCAAGACATTTGTGCCTATAAAAATGCTTAACCAAGATTTTTATATTGAAGTTGTACTTCTTGCACATATTGTCCTTGCCTTATTATGTAAAGTTATTTTCTTTCTATCTTTTTATTAAATTTAACTATTCTTCATAATCCCGAT > USA300TCH1516_ALE/2840724‑2841003 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |