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Only 100 of 226 total aligned reads displayed.
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cacaTATTGTCCTTGCCTTATTATGTAAAGTTATTTTCTTTCTATCTTTTTATTAAATTTAACTATTCTTCATAATCCCGATTCCCTTTAAAGTAACGTCTATCTTGTTTACTATATACATTTTCAGGATTAAAAAACGGt > 3:294882/1‑141 (MQ=255) acaTATTGTCCTTGCCTTATTATGTAAAGTTATTTTCTTTCTATCTTTTTATTAAATTTAACTATTCTTCATAATCCCGATTCCCTTTAAAGTAACGTCTATCTTGTTTACTATATACATTTTCAGGATTAAAAAACGGtt < 1:1193774/141‑1 (MQ=255) acaTATTGTCCTTGCCTTATTATGTAAAGTTATTTTCTTTCTATCTTTTTATTAAATTTAACTATTCTTCATAATCCCGATTCCCTTTAAAGTAACGTCTATCTTGTTTACTATATACATTTTCAGGATTAAAAAACGGtt < 2:497219/141‑1 (MQ=255) atTGTCCTTGCCTTATTATGTAAAGTTATTTTCTTTCTATCTTTTTATTAAATTTAACTATTCTTCATAATCCCGATTCCCTTTAAAGTAACGTCTATCTTGTTTACTATATACATTTTCAGGATTAAAAAACGGTTTGAg > 3:99727/1‑141 (MQ=255) atTGTCCTTGCCTTATTATGTAAAGTTATTTTCTTTCTATCTTTTTATTAAATTTAACTATTCTTCATAATCCCGATTCCCTTTAAAGTAACGTCTATCTTGTTTACTATATACATTTTCAGGATTAAAAAACGGTTTGAg < 1:1197480/141‑1 (MQ=255) atTGTCCTTGCCTTATTATGTAAAGTTATTTTCTTTCTATCTTTTTATTAAATTTAACTATTCTTCATAATCCCGATTCCCTTTAAAGTAACGTCTATCTTGTTTACTATATACATTTTCAGGATTAAAAAACGGTTTGAg < 2:1544085/141‑1 (MQ=255) atTGTCCTTGCCTTATTATGTAAAGTTATTTTCTTTCTATCTTTTTATTAAATTTAACTATTCTTCAAAATCCCGATTCCCTTTAAAGTAACGTCTATCTTGTTTACTATATACATTTTCAGGATTAAAAAACGGTTTGAg < 1:289775/141‑1 (MQ=255) ttGTCCTTGCCTTATTATGTAAAGTTATTTTCTTTCTATCTTTTTATTAAATTTAACTATTCTTCATAATCCCGATTCCCTTTa < 1:862807/84‑1 (MQ=255) tGTCCTTGCCTTATTATGTAAAGTTATTTTCTTTCTATCTTTTTATTAAATTTAACTATTCTTCATAATCCCGATTCCCTTTAAAGTAACGTCTATCTTGTTTACTATATACATTTTCAGGATTAAAAAACGGTTTGAGtt < 1:100397/141‑1 (MQ=255) gTCCTTGCCTTATTATGTAAAGTTATTTTCTTTCTATCTTTTTATTAAATTTAACTATTCTTCATAATCCCGATTCCCTTTAAAGTAACGTCTATCTTGTTTACTATATACATTTTCAGGATTAAAAAACGGTTTGAGttt < 3:572999/141‑1 (MQ=255) tCCTTGCCTTATTATGTAAAGTTATTTTCTTTCTATCTTTTTATTAAATTTAACTATTCTTCATAATCCCGATTCCCTTTAAAGTAACGTCTATCTTGTTTACTATATACATTTTCAGGATTAAAAAACGGTTTGAGTTta < 1:1622384/141‑1 (MQ=255) | GCAATACATTACAACCTTTTTCAGAAAATTCGGTGTATTGATTTTAAAATTTTTTAAAATAAAAAAGGCAAGACATTTGTGCCTATAAAAATGCTTAACCAAGATTTTTATATTGAAGTTGTACTTCTTGCACATATTGTCCTTGCCTTATTATGTAAAGTTATTTTCTTTCTATCTTTTTATTAAATTTAACTATTCTTCATAATCCCGATTCCCTTTAAAGTAACGTCTATCTTGTTTACTATATACATTTTCAGGATTAAAAAACGGTTTGAGTTTAT > USA300TCH1516_ALE/2840792‑2841072 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |