New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | 1533866 = | 173 (0.950) | 9 (0.050) | 9/232 | NT | 5.7% | coding (219/588 nt) | USA300HOU_RS07480 | hypothetical protein |
? | USA300TCH1516_ALE | 1533900 = | 138 (0.830) | coding (185/588 nt) | USA300HOU_RS07480 | hypothetical protein |
Only 100 of 193 total aligned reads displayed.
ACACGTTTGCGAAGTGAATTTGAATATCAAAAGCACAGTTATGATTAGCGATATAATCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCACTTTTATATAGTTAAGCACCCAAACTGCAATACGCGACTTAAATCGATATTGAAAAAGTAAATATTCAATAAA > USA300TCH1516_ALE/1533760‑1534039 | acacGTTTGCGAAGTGAATTTGAATATCAAAAGCACAGTTATGATTAGCGATATAATCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAAttt > 3:555387/1‑141 (MQ=255) cacGTTTGCGAAGTGAATTTGAATATCAAAAGCACAGTTATGATTAGCGATATAATCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTc < 1:36874/141‑1 (MQ=255) cacGTTTGCGAAGTGAATTTGAATATCAAAAGCACAGTTATGATTAGCGATATAATCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTc < 2:580032/141‑1 (MQ=255) cacGTTTGCGAAGTGAATTTGAATATCAAAAGCACAGTTATGATTAGCGATATAATCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTc > 2:1069096/1‑141 (MQ=255) acGTTTGCGAAGTGAATTTGAATATCAAAAGCACAGTTATGATTAGCGATATAATCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCt < 1:459623/141‑1 (MQ=255) tttGCGACGTGAATTTGAATATCAAAAGCACAGTTATGATTAGCGATATAATCAAATATTTCATTTGTATTCCTTCACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAAt < 3:420836/141‑1 (MQ=255) ttGCGAAGTGAATTTGAATATCAAAAGCACAGTTATGATTAGCGATATAATCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATg < 2:911784/141‑1 (MQ=255) tGCGAAGTGAATTTGAATATCAAAAGCACAGTTATGATTAGCGATATAATCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGt > 4:403279/1‑141 (MQ=255) gCGAAGTGAATTTGAATATCAAAAGCACAGTTATGATTAGCGATATAATCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTattatt > 2:372795/1‑136 (MQ=255) cGAAGTGAATTTGAATATCAAAAGCACAGTTATGATTAGCGATATAATCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGttt > 2:973339/1‑141 (MQ=255) cGAAGTGAATTTGAATATCAAAAGCACAGTTATGATTAGCGATATAATCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGttt > 1:609303/1‑141 (MQ=255) aaGTGAATTTGAATATCAAAAGCACAGTTATGATTAGCGATATAATCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑Ca > 2:116081/1‑141 (MQ=255) gAATTTGAATATCAAAAGCACAGTTATGATTAGCGATATAATCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑Catgat < 1:347957/141‑1 (MQ=255) aTTTGAATATCAAAAGCACAGTTATGATTAGCGATATAATCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CAtgatga < 1:1144252/141‑1 (MQ=255) ttGAATATCAAAAGCACAGTTATGATTAGCGATATAATCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGAATTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGAtt > 4:320998/1‑141 (MQ=255) atatCAAAAGCACAGTTATGATTAGCGATATAATCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAAtt < 2:1016138/141‑1 (MQ=255) atatCAAAAGCACAGTTATGATTAGCGATATAATCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAAtt > 3:482507/1‑141 (MQ=255) atatCAAAAGCACAGTTATGATTAGCGATATAATCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAAtt > 1:1659149/1‑141 (MQ=255) atCAAAAGCACAGTTATGATTAGCGATATAATCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAAtttt > 3:689042/1‑141 (MQ=255) cAAAAGCACAGTTATGATTAGCGATATAATCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTg < 1:381575/141‑1 (MQ=255) cAAAAGCAAAGATATGATTAGCGATATAATCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTg > 2:332936/1‑141 (MQ=255) aaGCACAGTTATGATTAGCGATATAATCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTAt > 2:1641123/1‑141 (MQ=255) aaGCACAGTTATGATTAGCGATATAATCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTAt > 3:243633/1‑141 (MQ=255) aGCACAGTTATGATTAGCGATATAATCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAAt > 1:1111167/1‑115 (MQ=255) caGTTATGATTAGCGATATAATCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACa > 1:1517633/1‑141 (MQ=255) aGTTATGATTAGCGATATAATCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACaa > 2:284911/1‑141 (MQ=255) gTTATGATTAGCGATATAATCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACaaa > 2:1110667/1‑141 (MQ=255) tATGATTAGCGATATAATCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAaat < 1:1435117/141‑1 (MQ=255) aTGATTAGCGATATAATCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAaatg < 2:425904/141‑1 (MQ=255) aTTAGCGATATAATCAAATATTTCCTTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGGAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAACTTTTGTATCTACAAaatgaat < 2:1169557/141‑1 (MQ=255) aTTAGCGATATAATCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTACTGTTTCCATG‑TCACTAATTTTTGTATCTACAAaatgaat < 2:73834/141‑1 (MQ=255) gCGATATAATCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGttt > 4:452678/1‑141 (MQ=255) gCGATATAATCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGttt > 2:825789/1‑141 (MQ=255) gCGATATAATCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGttt > 2:825435/1‑141 (MQ=255) atatAATCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGcc < 1:1536965/141‑1 (MQ=255) tCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTCGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCGAATTTc > 2:407675/1‑141 (MQ=255) aacattcattttgtagatacaaaaattaatcatcatgaaacattagaaattgcagaagcgtgacttcccacttctgcaattTCTAATGTTT‑CAtgatga > 1:951776‑M2/82‑99 (MQ=255) aacattcattttgtagatacaaaaattaatcatcatgaaacattagaaattgcagaagcgtgacttcccacttctgcaattTCTAATGTTT‑CAtgatga < 2:951776‑M2/18‑1 (MQ=255) aaTATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGcc < 1:821920/141‑1 (MQ=255) ttCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCAtt > 1:1501712/1‑141 (MQ=255) ttCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCAtt < 2:779075/141‑1 (MQ=255) tCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTGATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTc < 1:1641517/141‑1 (MQ=255) tCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCAttt > 1:766239/1‑140 (MQ=255) tCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTc < 4:260004/141‑1 (MQ=255) tCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTc > 2:801175/1‑141 (MQ=255) cATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCa < 4:547305/141‑1 (MQ=255) aTTTGTATTCATTAACTTTATATTACTCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCTCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATTTTTGCCAATTTCGCCTCATTCAc > 2:419666/1‑141 (MQ=255) aTTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCAc > 1:779387/1‑141 (MQ=255) aTTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCAc < 3:645440/141‑1 (MQ=255) ttGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCACtt < 3:293417/141‑1 (MQ=255) atacaaaaattaatcatcatgaaacattagaAATTGCAGAAGTGGGAAGTCACGCTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCACTTTtatat < 2:447119‑M1/110‑1 (MQ=255) cATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGCCTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CAAGATGATTAATTTTTGTATTTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCGTCATTCACTTTattata > 1:890459/1‑141 (MQ=255) aTTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCACTTTTATATAg > 4:653175/1‑141 (MQ=255) ttAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTACCAATTTCGCCTCATTCACTTTTATATAGt > 3:580295/1‑141 (MQ=255) tAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCACTTTTATATAGtt > 2:400477/1‑141 (MQ=255) tAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCACTTTTATATAGtt > 2:485467/1‑141 (MQ=255) aCTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCACTTTTATATAGTTaa < 1:794836/141‑1 (MQ=255) ttATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCACTTTTATATAGTTAAGCa < 1:1205729/141‑1 (MQ=255) ttATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCACTTTTATATAGTTAAGCa < 2:1641968/141‑1 (MQ=255) ttATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCACTTTTATATAGTTAAGCa < 1:939410/141‑1 (MQ=255) atatTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCTCCTCATTCACTTTTATATAGTTATGCAcc > 2:250267/1‑141 (MQ=255) atatTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCACTTTTATATAGTTAAGCa < 1:80933/139‑1 (MQ=255) tatTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCACTTTTATATAGTTAAGCAccc < 1:1065737/141‑1 (MQ=255) tatTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCACTTTTATATAGTTAAGCAccc > 1:512856/1‑141 (MQ=255) atTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCACTTTTATATAGTTAAGCACCCa < 4:221002/141‑1 (MQ=255) aCGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCACTTTTATATAGTTAAGCACCCAAAc > 1:1266758/1‑141 (MQ=255) cGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCACTTTTATATAGTTAAGCACCCAAACt > 2:177207/1‑141 (MQ=255) cTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCACTTTTATATAGTTAAGCACCCAAACTGc < 2:1266758/141‑1 (MQ=255) cTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCACTTTTATATAGTTAAGCACCCAAACTGc < 3:36638/141‑1 (MQ=255) tAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCACTTTTATATAGTTAAGCACCCAAACTGCaa < 1:187580/141‑1 (MQ=255) tgaattgCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCACTTTTATATAGTTAAGCACCCAAACTGCAATACGCGAc > 2:65720/1‑141 (MQ=255) gaattgCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCACTTTTATATAGTTAAGCACCCAAACTGCAATAcgc > 1:1500158/1‑137 (MQ=255) gaattgCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCACTTTTATATAGTTAAGCACCCAAACTGCAATAcgc < 2:1500158/137‑1 (MQ=255) gaattgCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCACTTTTATATAGTTAAGCACCCAAACTGCAATACGCGACt > 1:231949/1‑141 (MQ=255) TTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCACTTTTATATAGTTAAGCACCCAAACt < 4:503358‑M1/125‑1 (MQ=255) TTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCACTTTTATATAGTTAAGCACCCAAACTGCAATACGCGACTTaa < 1:1156524‑M1/141‑1 (MQ=255) tgcagaagtgggaagtcacgcttctgcaattTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCACTTTTATATAGTTAAGCACCCAAACTGCAATACGCGACTTaaa > 1:1466294‑M2/32‑141 (MQ=255) GCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGACTGTTTGCCAATTTCGCCACATTCACTTTTATATAGTTAAGCACCCAAACTGCAATACGCGACTTAAAt < 4:607531‑M1/141‑1 (MQ=255) GCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCACTTTTATATAg < 2:1263090‑M1/108‑1 (MQ=255) GCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTACCAATTTCGCCTCATTCACTTTTATATAGTTAAGCACCCAAACTGCAATACGCGACTTAAAt < 2:276200‑M1/141‑1 (MQ=255) AGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCACTTTTATATAGTTAAGCACCCAAGCTGCAATACGCGACTTAAATCg > 1:346348‑M1/1‑141 (MQ=255) GAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCACTTTTATATAGTTAAGCACCCAAACTGCAATACGCGacttaaaaaaa > 2:609303‑M1/1‑137 (MQ=255) gggaagtcacgcttctgcaattTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCACTTTTATATAGTTAAGCACCCAAACTGCAATACGCGACTTAAATCGATATTg > 2:79689‑M2/23‑141 (MQ=255) gACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCACTTTTATATAGTTAAGCACCCAAACTGCAATACGCGACTTAAATCGATATTGaa > 3:409160/1‑141 (MQ=255) gACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCACTTTTATATAGTTAAGCACCCAAACTGCAATACGCGACTTAAATCGATATTGaa > 2:1382099/1‑141 (MQ=255) aagtcacgcttctgcaattTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCACTTTTATATAGTTAAGCACCCAAACTGCAAAACGCGACTTAAATCGATATTGaaa > 3:507660‑M2/20‑141 (MQ=255) aCTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCACTTTTATATAGTTAAGCa > 1:251081/1‑104 (MQ=255) aCTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCACTTTTATATAGTTAAGCACCCAAACTGCAATACGCGACTTAAATCGATATTGaaa > 4:572906/1‑141 (MQ=255) aCTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCACTTTTATATAGTTAAGCACCCAAACTGCAATACGCGACTTAAATCGATATTGaaa > 2:523706/1‑141 (MQ=255) cccACTTCTGCAATTTCTAATGTTA‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCACTTATATATAGTTAAGCACCCAAACTGCAATACGCGACTTAAATCGATATGGAAAAAGt > 4:190592/1‑141 (MQ=255) cACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTAACTTTTCTATAGTTAAGCACCCACACTGCAATACGCGACTTAAATCGATATTGAAAAAGTaa > 1:152363/1‑141 (MQ=255) ctgcaattTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCACTTTTATATAGTTAAGCACCCAAACTGCAATACGCGACTTAAATCGATATTGAAAAAGTAAATAtt > 2:1124103‑M2/9‑141 (MQ=255) ctgcaattTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCACTTTTATATAGTTAAGCACCCAAACTGCAATACGCGACTTAAATCGATATTGAAAAAGTAAATAtt > 3:137850‑M2/9‑141 (MQ=255) tgcaattTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCACTTTTATATAGTTAAGCACCCAAACTGCAATACGCGACTTAAATCGATATTGAAAAAGTAAATATTc > 1:1414222‑M2/8‑141 (MQ=255) tgcaattTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCACTTTTATATAGTTAAGCACCCAAACTGCAATACGCGACTTAAATCGATATTGAAAAAGTAAATATTc > 1:588458‑M2/8‑141 (MQ=255) caattTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCACTTTTATATAGTTAAGCACCCAAACTGCAATACGCGACTTAAATCGATATTGAAAAAGTAAATATTCaa < 1:6980‑M2/136‑1 (MQ=255) caattTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCACTTTTATATAGTTAAGCACCCAAACTGCAATACGCGACTTAAATCGATATTGAAAAAGTAAATATTCaa < 1:284911‑M2/136‑1 (MQ=255) aattTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCACTTTTATATAGTTAAGCACCCAAACTGCAATACGCGACTTAAATCGATATTGAAAAAGTAAATATTCAAt < 1:1629226‑M2/137‑1 (MQ=255) ttTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCACTTTTATATAGTTAAGCACCCAAACTGCAATACGCGACTTAAATCGATATTGAAAAAGTAAATATTCAATaa > 1:1614231‑M2/3‑141 (MQ=255) tTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCACTTTTATATAGTTAAGCACCCAAACTGCAATACGCGACTTAAATCGATATTGAAAAAGTAACTATTCAATaaa > 2:946704‑M2/2‑141 (MQ=255) | ACACGTTTGCGAAGTGAATTTGAATATCAAAAGCACAGTTATGATTAGCGATATAATCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCACTTTTATATAGTTAAGCACCCAAACTGCAATACGCGACTTAAATCGATATTGAAAAAGTAAATATTCAATAAA > USA300TCH1516_ALE/1533760‑1534039 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |