| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 223 total aligned reads displayed.
CTACTTGATAACATGGCATGACTAATCCTTGTATATCCTGTCCTGTATTTCATTTTGATCTATCATTTTTATTATTGCTTTCTATTGCACAAAAAATCTGGCTAAAGGTCGCTATGATAGTAACGACTTCAACCAGATTTCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGTATCTTTTTCTCTATTGTAATATTCATATTTAAAACGCATATCATTATCGCTTAAATCCTTCATTATTAGACTATTCACAAAGCCGCCCATGTCTTAATTTCAAT > USA300TCH1516_ALE/2761149‑2761429 | cTACTTGATAACATGGCATGACTAATCCTTGTATATCCTGTCCTGTATTTCATTTTGATCTATCATTTTTATTATTGCTTTCTATTGCACAAAAAATCTGGCTAAAGGTCGCTATGATAGTAACGACTTCAACCAGATTTc < 4:646596/141‑1 (MQ=255)cTACTTGATAACATGGCATGACTAATCCTTGTATATCCTGTCCTGTATTTCATTTTGATCTATCATTTTTATTATTGCTTTCTATTGCACAAAAAATCTGGCTAAAGGTCGCTATGATAGTAACGACTTCAACCAGATTTc > 3:304477/1‑141 (MQ=255) tACTTGATAACATGGCATGACTAATCCTTGTATATCCTGTCCTGTATTTCATTTTGATCTATCATTTTTATTATTGCTTTCTATTGCACAAAAAATCTGGCTAAAGGTCGCTATGATAGTAACGACTTCAACCAGATTTCa > 1:1151086/1‑141 (MQ=255) aCTTGATAACATGGCATGACTAATCCTTGTATATCCTGTCCTGTATTTCATTTTGATCTATCATTTTTATTATTGCTTTAAAAAAAAAAAAAAATCTGGCTAAAGGTCGCTATGATAGTAACGACTTCAACCAGATTTCaa < 2:226512/141‑1 (MQ=255) cTTGATAACATGGCATGACTAATCCTTGTATATCCTGTCCTGTATTTCATTTTGATCTATCATTTTTATTATTGCTTTCTATTGCACAACAAATCTGGCTAAAGGTCGCTATGATAGTAACGACTTCAACCAGATTTCAAt < 2:414634/141‑1 (MQ=255) aCATGGCATGACTAATCCTTGTATATCCTGTCCTGTATTTCATTTTGATCTATCATTTTTATTATTGCTTTCTATTGCACAAAAAATCTGGCTAAAGGTCGCTATGATAGTAACGACTTCAACCAGATTTCAATTTATCCa > 4:388784/1‑141 (MQ=255) tGGCATGACTAATCCTTGTATATCCTGTCCTGTATTTCATTTTGATCTATCATTTTTATTATTGCTTTCTATTGCACAAAAAATCTGGCTAAAGGTCGCTATGATAGTAACGACTTCAACCAGATTTCAATTTATCCACCt > 1:1636304/1‑141 (MQ=255) ggCATGACTAATCCTTGTATATCCTGTCCTGTATTTCATTTTGATCTATCATTTTTATTATTGCTTTCTATTGCACAAAAAATCTGGCTAAAGGTCGCTATGATAGTAACGACTTCAACCAGATTTCAATTTATCCACCTa < 1:982331/141‑1 (MQ=255) gCATGACTAATCCTTGTATATCCTGTCCTGTATTTCATTTTGATCTATCATTTTTATTATTGCTTTCTATTGCACAAAAAATCTGGCTAAAGGTCGCTATGATAGTAACGACTTCAACCAGATTTCAATTTATCCACCTAt > 4:699715/1‑141 (MQ=255) gCATGACTAATCCTTGTATATCCTGTCCTGTATTTCATTTTGATCTATCATTTTTATTATTGCTTTCTATTGCACAAAAAATCTGGCTAAAGGTCGCTATGATAGTAACGACTTCAACCAGATTTCAATTTATCCACCTAt > 1:884353/1‑141 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ttttATTATTGCTTTCTATTGCACAAAAAATCTGGCTAAAGGTCGCTATGATAGTAACGACTTCAACCAGATTTCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGTATCTTTTTCTCTATTGTAATATTCATAttt > 1:222846/1‑141 (MQ=255) tattatTGCTTTCTATTGCACAAAAAATCTGGCTAAAGGTCGCTATGATAGTAACGACTTCAACCAGATTTCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGTATCTTTTTCTCTATTGTAATATTCATATTTaaa < 4:169585/141‑1 (MQ=255) tattatTGCTTTCTATTGCACAAAAAATCTGGCTAAAGGTCGCTATGATAGTAACGACTTCAACCAGATTTCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGTATCTTTTTCTCTATTGTAATATTCATATTTaaa < 2:315096/141‑1 (MQ=255) attattGCTTTCTATTGCACAAAAAATCTGGCTAAAGGTCGCTATGATAGTAACGACTTCAACCAGATTTCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGTATCTTTTTCTCTATTGTAATATTCATATTTaaaa < 3:167058/141‑1 (MQ=255) attattGCTTTCTATTGCACAAAAAATCTGGCTAAAGGTCGCTATGATAGTAACGACTTCAACCAGATTTCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGTATCTTTTTCTCTATTGTAATATTCATATTTaaaa < 3:430226/141‑1 (MQ=255) tattGCTTTCTATTGCACAAAAAATCTGGCTAAGGGTCGCTATGATAGTAACGACTTCAACCAGATTTCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGTATCTTTTTCTCTATTGTAATATTCATATTTAAAACg < 2:1375645/141‑1 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gccagatttCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGTATCTTTTTCTCTATTGTAATATTCATATTTAAAACGCATATCATTATCGCTTAAATCCTTCATTATTAGACTATTCACAAAGCCGCCCATGTCtt < 3:423546‑M2/132‑1 (MQ=255) aCCAGATTTCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGTATCTTTTTCTCTATTGTAATATTCATATTTAAAACGCATATCATTATCGCTTAAATCCTTCATTATTAGACTATTCACAAAGCCGCCCATGTCtt < 2:360739/141‑1 (MQ=255) cagatttCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGTATCTTTTTCTCTATTGTAATATTCATATTTAAAACGCATATCATTATCGCTTAAATCCTTCATTATTAGACTATTCACAAAGCCGCCCATGTCTTaa < 1:897515‑M2/134‑1 (MQ=255) gatttCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGTATCTTTTTCTCTATTGTAATATTCATATTTAAAACGCATATCATTATCGCTTAAATCCTTCATTATTAGACTATTCACAAAGCCGCCCATGTCTTAAtt < 1:453751‑M2/136‑1 (MQ=255) atttCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGTATCTTTTTCTCTATTGTAATATTCATATTTAAAACGCATATCATTAt < 2:813763‑M2/84‑1 (MQ=255) atttCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGTATCTTTTTCTCTATTGTAATATTCATATTTAAAACGCATATCATTAt > 1:813763‑M2/5‑88 (MQ=255) atttCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGTATCTTTTTCTCTATTGTAATATTCATATTTAAAACGCATATCATTATCGCTTAAATCCTTCATTATTAGACTATTCACAAAGCCGCCCATGTCTTAAttt > 1:933017‑M2/5‑141 (MQ=255) tttCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGTATCTTTTTCTCTATTGTAATATTCATATTTAAAACGCATATCATTATCGCTTAAATCCTTCATTATTAGACTATTCACAAAGCCGCCCATGTCTTAATTTc < 3:447612‑M2/138‑1 (MQ=255) tCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGTATCTTTTTCTCTATTGTAATATTCATATTTAAAACGCATATCATTATCGCTTAAATCCTTCATTATTAGACTATTCACAAAGCCGCCCATGTCTTAATTTCaa > 4:520927‑M2/2‑141 (MQ=255) tCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGTATCTTTTTCTCTATTGTAATATTCATATTTAAAACGCATATCATTATCGCTTAAATCCTTCATTATTAGACTATTCACAAAGCCGCCCATGTCTTAATTTCaa > 2:1260089‑M2/2‑141 (MQ=255) cAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGTATCTTTTTCTCTATTGTAATATTCATATTTAAAACGCATATCATTATCGCTTAAATCCTTCATTATTAGACTATTCACAAAGCCGCCCATGTCTTAATTTCAAt < 2:70197/141‑1 (MQ=255) | CTACTTGATAACATGGCATGACTAATCCTTGTATATCCTGTCCTGTATTTCATTTTGATCTATCATTTTTATTATTGCTTTCTATTGCACAAAAAATCTGGCTAAAGGTCGCTATGATAGTAACGACTTCAACCAGATTTCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGTATCTTTTTCTCTATTGTAATATTCATATTTAAAACGCATATCATTATCGCTTAAATCCTTCATTATTAGACTATTCACAAAGCCGCCCATGTCTTAATTTCAAT > USA300TCH1516_ALE/2761149‑2761429 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |