| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_012417 | = 997 | 548 (0.910) | 5 (0.010) | 5/234 | 31.7 | 0.98% | intergenic (+9/+6) | USA300HOU_RS14890/USA300HOU_RS15665 | replication protein/hypothetical protein |
| ? | NC_012417 | = 1001 | 510 (0.920) | intergenic (+13/+2) | USA300HOU_RS14890/USA300HOU_RS15665 | replication protein/hypothetical protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
TTAAACTTAGACGATGTCGAAGATGGTAATTTGATTAATGCAAGTGATGAAGATAAAACAACAGACGAAGAAGAAAAAGCACATTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_012417/859‑997‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aagacattagtCAACACTAATGTCTTAAATAATAATTTTGCTTTTCGAAATTCCAAATTGCGGTAATTGAATGTGCTTTTTCTTCTTCGTCTGTTGTTTTATCTTCATCACTTGCATTAATCAAATTACCATCTTCGAC < NC_012417/1001‑874 TTAAACTTAGACGATGTCGAAGATGGTAATTTGATTAATGCAAGTTATGAAGATAAAAGAAGAGACGAAGAAGAAAAAGCACATTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTAATATTTA > 2:27576/1‑129TTAAACTTAGACGATGTCGAAGATGGTAATTTGATTAATGCAAGTGATGAAGATAAAACAACAGACGAAGAAGAAAAAGCACATTCAATTACCGCACTTTGGAATTTCGAAAAGCAACATTATTATTTA > 2:90679/1‑129TTAAACTTAGACGATGTCGAAGATGGTAATTTGATTAATGCAAGTGATGAAGATAAAACAACAGACGAAGAAGAAAAAGCACATTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTA > 1:226010/1‑129TTAAACTTAGACGATGTCGAAGATGGTAATTTGATTAATGCAAGTGATGAAGATAAAACAACAGACGAAGAAGAAAAAGCACATTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTA > 2:19142/1‑129TTAAACTTAGACGATGTCGAAGATGGTAATTTGATTAATGCAAGTGATGAAGATAAAACAACAGACGAAGAAGAAAAAGCACATTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTA > 2:107895/1‑129TTAAACTTAGACGATGTCGAAGATGGTAATTTGATTAATGCAAGTGATGAAGATAAAACAACAGACGAAGAAGAAAAAGCACATTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTA > 2:148732/1‑129TTAAACTTAGACGATGTCGAAGATGGTAATTTGATTAATGCAAGTGATGAAGATAAAACAACAGACGAAGAAGAAAAAGCACATTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTA > 2:27413/1‑129TTAAACTTAGACGATGTCGAAGATGGTAATTTGATTAATGCAAGTGATGAAGATAAAACAACAGACGAAGAAGAAAAAGCACATTCAATTACCGCAATTTGGAATTTAGAAAAGCAAAATTATGATTTA > 2:218401/1‑129TTAAACTTAGACGATGTCGAAGATGGTAATTTGATTAATGCAAGTGATGAAGATAAAACAACAGACGAAGAAGAAAAAGCAACTTCAATAACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTA > 2:203081/1‑129TTAAACTTAGACGATGTCGAAGATGGTAATTTGATTAATGCAAGTGATGAAAATAAAACAACAGACGAAGAAGAAAAAGCACATTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTA > 1:45565/1‑129 tagACTTAGACGATGTCGAAGATGGTAATTTGATTAATGCAAGTGATGAAGATAAAACAACAGACGAAGAAGAAAAAGTTTATTCAATTACCGCAATTTGGAATTGCGAAAAGCAAAATTATTATTTAA < 1:29877/126‑1 TAAACTTAGACGATGTCGAAGATGGTAATTTGTTTACTACAAGGGATGAAGATAAAACAACAGACGAAGAAGAAAAAGCACATTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAA < 1:43045/129‑1 TAAACTTAGACGATGTCGAAGATGGTAATTTGATTAATGCAAGTGATGAAGATAAAACAACAGACGAAGAAGAAAAAGTACATTCAATTACTGTAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAA < 1:179934/129‑1 TAAACTTAGACGATGTCGAAGATGGTAATTTGATTAATGCAAGTGATGAAGATAAAACAACAGACGAAGAAGAAAAAGCACATTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAA < 1:137898/129‑1 TAAACTTAGACGATGTCGAAGATGGTAATTTGATTAATGCAAGTGATGAAGATAAAACAACAGACGAAGAAGAAAAAGCACATTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAA < 2:162688/129‑1 TAAACTTAGACGATGTCGAAGATGGTAATTTGATTAATGCAAGTGATGAAGATAAAACAACAGACGAAGAAGAAAAAGCACATTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAA < 1:83028/129‑1 agaggTAGACGATGTCGAAGATGGTAATTTGATTAATGCAAGTGATGAAGATAAAACAACAGACGAAAAAGAAAGAGCAAATTAAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAG < 2:83520/124‑1 AAACTTAGACTATGTCGAAGATGGTAATTTGATTAATGCAAGTGATGAAGATAAAACAACAGACGAAGAAGAAAAAGCACATTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAG < 2:74476/129‑1 AAACTTAGACGATGTCGAAGATGGTAATTTGATTAATGCAAGTGATGAATATAAAACAACAGATGAATAAGAAAAAGTACATTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAG < 1:201536/129‑1 AAACTTAGACGATGTCGAAGATGGTAATTTGATTAATGCAAGTGATGAAGATAAAACAACATACGAAGAAGAAAAAGCACATTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAG < 2:85139/129‑1 AAACTTAGACGATGTCGAAGATGGTAATTTGATTAATGCAAGTGATGAAGATAAAACAACAGACGAAGAAGAAAAAGCACATTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAG < 2:122678/129‑1 AAACTTAGACGATGTCGAAGATGGTAATTTGATTAATGCAAGTGATGAAGATAAAACAACAGACGAAGAAGAAAAAGCACATTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAG > 1:111379/1‑129 AAACTTAGACGATGTCGAAGATGGTAATTTGATTAATGCAAGTGATGAAGATAAAACAACAGACGAAGAAGAAAAAGCACATTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAG > 1:35351/1‑129 AAACTTAGACGATGTCGAAGATGGTAATTTGATTAATGCAAGTGATGAAGATAAAACAACAGACGAAGAAGAAAAAGCACATTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAG < 2:57287/129‑1 AAACTTAGACGATGTCGAAGATGGTAATTTGATTAATGCAAGAGATGAAGATAAAACAACAGACGAAGAAGAAAAAGCACATTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAG > 1:116492/1‑129 AAACTGAGACGATGTCGAAGATGGTAATTTGATTAATGCAAGTGATGAAGATAAAACAACAGACGAAGAAGAAAAAGCACATTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAG < 2:58172/129‑1 AAACGTAGACGATGTCGAAGATGGTAAGTTGATTAATGCAAGTGATGAAGATAAAACAACAGACGAAGAAGAAAAAGCACATTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAG < 2:112248/129‑1 AACTTAGACGATGTCGAAGATGGTAATTTGATTAATGCAAGTGATGAAGATAAAACAACAGACGAAGAAGAAAAAGCACATTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGA < 1:46187/129‑1 AACGTAGACGATGTCGAAGATGGTAATTTGATTAATGCAAGTGATGAAACTACAACAACAGACGAAGAAGAAAAAGCACATTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGA < 2:82198/129‑1 CTTAGACGATGTCGAAGATGGTAATTTGATTAATGCAAGTGATGAAGATAAAACAACAGACGAAGAAGAAAAAGCACATTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCACAGTTATTATTTAAAACA > 2:44496/1‑129 CTTAGACGATGTCGAAGATGGTAATTTGATTAATGCAAGTGATGAAGATAAAACAACAGACGAAGAAGAAAAAGCACATTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGCCA > 2:205711/1‑129 CTTAGACGATGTCGAAGATGGTAATTTGATTAATGCAAGTGATGAAGATAAAACAACAGACGAAGAAGAAAAAGCACATTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACA > 1:30110/1‑129 CTTAGACGATGTCGAAGATGGTAATTTGATTAATGCAAGTGATGAAGATAAAACAACAGACGAAGAAGAAAAAGCACATTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACA < 1:10475/129‑1 CTTAGACGATGTCGAAGATGGTAATTTGATTAATGCAAGTGATGAAGATAAAACAACAGACGAAAAAGAAAATTCACATTTAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACA < 1:135509/129‑1 CTTAGAAGATGTCGAAGATGGTAATTTGATTAATTCAAGTGATGAAGATAAAACAACAGACGAAGAAGAAAAAGCATATTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACA < 1:154218/129‑1 gaAGAAGATGTCAAAGATGGTAATTAGATTAATGCAAGTGATGAAGATAAAACAACAGACGAAGAAGAAAAAGCACATTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGACAAGCACAAGTATTATTTAAGACAT < 2:156571/127‑1 aTAGACGATGGCGAAGATGGTAATTTGATTAATGAAAGTGATGAAGATAAAACAACAGACGAAGAAGAAAAAGCACATTCAATTACCGCAATTTGGAATATCGACAAGCGAAATTATTATTTAGGATAT < 2:156554/128‑1 TTATACGATGTCAAAGATGGTAAGTTGATTAATGCAAGTCATGAAGATAAAACAACAGACAAAGAATAAAAAGCACATTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACAT < 2:133404/129‑1 TTAGACTATGTCGAAGATGGTAATTTGATTAATGCAAGTGATGAAGATAAAAAAACAGACGAAGAAGAAAAAGCACATTTAATTACCGCAATTTGGAATTGCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACAT < 1:236404/129‑1 TTAGACGATGTCGAAGATGGTAATTTGATTAATGCAAGTGATTAAGATAAAACAACAGACGAAGAATAAAAATCACATTCAATTTCCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACAT < 1:200919/129‑1 TTAGACGATGTCGAAGATGGTAATTTGATTAATGCAAGTGATGAGGATAAAACAACAGACGAAGAAGAAAAAGCACATTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACAT > 2:194685/1‑129 TTAGACGATGTCGAAGATGGTAATTTGATTAATGCAAGTGATGAAGATAAAACAACAGACGAATAATTAAAAGCATATTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACAT < 1:33953/129‑1 TTAGACGATGTCGAAGATGGTAATTTGATTAATGCAAGTGATGAAGATAAAACAACAGACGAAGAAGAAAAAGCACATTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACAT > 2:126920/1‑129 TTAGACGATGTCGAAGATGGTAATTTGATTAATGCAAGTGATGAAGATAAAACAACAGACGAAGAAGAAAAAGCACATTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACAT < 1:215072/129‑1 TTAGACGATGTCGAAGATGGTAATTTGATTAATGCAAGTGATAAAGATAAAACAACAGACGAAGAAGAAAAAGCACATTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACAT > 1:1596/1‑129 TTAGACGAGGTCGAAGAAGGTAATTTGATTAATGTAAGTGATGAAGATAAAACAACAGACGAAGAAGAAAAAGCACATTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACAT < 2:139885/129‑1 TTAGACAATGTCGAAGATAGTAATTTGATTAATGCAAGTGATGAAGATAAAACAACAGACGAAGAAGAAAAAGCACATTCAATTACCGCAATTTGGAATTACGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACAT < 1:25761/129‑1 tatACGATGTCGAAGATGGTAATTTGATTAATGCAAGTGATGAAGATAAATCAACAGACGAAGATGATATATTACATTCAATTACCGCAATTAGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATT < 1:59594/126‑1 TAGACGATGTCGAAGATGGTAATTTGATTAATGCAAGTGATGAAGATAAAACAACAGACGAAGAAGAAAAAGCACATTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATT > 1:178992/1‑129 TAGACGATGTCGAAGATGGTAATTTGATTAATGCAAGTGATGAAGATAAAACAACAGACGAAGAAGAAAAAGCACATTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATT > 2:58530/1‑129 TAGACGATGTCGAAGATGGTAATTTGATTAATGCAAGTGATGAAGATAAAACAACAGACGAAGAAGAAAAAGCACATTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATT > 2:74428/1‑129 TAGACGATGTCGAAGATGGTAATTTGATTAATGCAAGTGATGAAGATAAAACAACAGACGAAGAAGAAAAAGCACATTCAATTAACGCAATTTGGAATTTCGAAAAGAAAAATTATGATTTAAGACATT > 2:77852/1‑129 AGACGATGTCGAAGATGGTAATTTGATTAATGCAAGTGATGAAGATAAAACAACAGACGAAGAAGAAAAAGCACATTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTA > 2:18252/1‑129 AGACGATGTAGAAGATGGTAATTTGATTAATGCAAGTGATGAAAATAAAACAACAGAAAAATTAGTAAAACCACATTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAACATATTATTTAAGACATTA > 2:142573/1‑129 GACGATGTCGCAGATGGTAATTTGATTAATGCAAGAGATGAAGATAAATCAAGAGACGAAGAAGAAAAAGCACATTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATCAG > 2:218138/1‑129 ATGTCGAAGATGGTAATTTGATTAATGCAAGTGATGAAGATAAAACAACAGACGAAGAAGAAAAAGCACATTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTCAA < 2:131014/129‑1 TGATTAATGCAAGTGATGAAGATAAAACAACAGACGAAGAACAAAAAGCACATTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTGAAGACATTAGCCAACACTAATTTCTTAAATAA < 1:162346/129‑1 GAAGATAAAACAACAGACGAAGAAGAAAAAGCACATTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTCAACACTAATGTCTTAAATAATAATTTTGCTTTTCGAA > 2:147650/1‑129 CGAAGAAGAAAAAGCACATTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTCAACACTAATGTCTTAAATAATAATTTTGCTTTTCGAAATTCAAAATTGCGGTAA > 2:159133/1‑129 AGCACATTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTCAACACTAATGTCTTAAATAATAATTTTGCTTTTCGAAATTCCAAATTGCGGTAATTGAATGTGCTT < 2:182518/129‑1 AAGACATTAGTCAACACTAATGTCTTAACTAATGCTTTTGCTTTTCAAAATTACAAATTACGGTAATTAAATGTACTTTTTCTTCTTCGTCTGTTGTTTTATCTTCATCATTTGCATTAATAAAATTAC > 1:71516/1‑129 AGACATTAGTCAACACTAATGTCTTAAATAATACTTTTGCTTTTCGAAATTCCAAATTGCGGTAATTGTTTGTGAAACTACAGCATCGTCTGTTGTTTTATCTTCATCACTTGCATTAATCAACTTACC > 1:109290/1‑129 AGACATTAGTCAACACTAATGTCTTAAATAATAATTTTGCTTTTCGAAATTCCAAATTGCGGTAATTGAATGTGCTTTTTTTTATTCGTCTGTTGTTTTATCTTCATCACTTGCATTAATCAAATTACC < 1:90908/129‑1 AGACATTAGTCAACACTAATGTCTTAAATAATAATTTTGCTTTTCGAAATTCCAAATTGCGGTAATTGAATGTGCTTTTTCTTCTTCGTCTGTTGTTTTATCTTCATCACTTGCATTAATCAAATTACC < 2:74083/129‑1 AGACATTAGTCAACACTAATGTCTTAAATAATAATTTTGCTTTTCGAAATTCCAAATTGCGGTAATTGAATGTGCTTTTTCTTCTTCGTCTGTTGTTTTATCTTCATCACTTGCATTAATCAAATTACC > 2:73493/1‑129 GACATTAGTCAACACTAATGTCTTAAATAATAATTTTGCTTTTCGAAATTCCAAATTGCGGTAATTGAATGTGCTTTTTTTTCTTCGTCTGTTGTTTTATCTTCATCACTTGCATTAATCAAATTACCA < 1:69696/129‑1 GACATTAGTCAACACTAATGTCTTAAATAATAATTTTGCTTTTCGAAATTCCAAATTGCGGTAATTGAATGTGCTTTTTCTTCTTCGTCTGTTGTTTTATCTTCATCACTTGCATTAATCAAATTACCA < 2:129081/129‑1 GACATTAGTCAACACTAATGTCTTAAATAATAATTTTGCTTTTCGAAATTCCAAATTGCGGTAATTGAATGTGCTTTTTCTTCTTCGTCTGTTGTTTTATCTTCATCACTTGCATTAATCAAATTACCA < 1:161575/129‑1 GACATTAGTCAACACTAATGTCTTAAATAATAATTTTGCTTTTCGAAATTCCAAATTGCGGTAATTGAATGTGCTTTTTCTTCTTCGTCTGTTGTTTTATCTTCATCACTTGCATTAATCAAATTACCA < 1:68852/129‑1 GACATTAGTCAACACTAATGTCTTAAATAATAATTTTGCTTTTCGAAATTCCAAATTGCGGTAATTGAATGTGCTTTTTATTCTTCGTCTGTTCTTTTATCTTCATCTCTTGCATTAATCAAATTACCt > 2:164387/1‑128 atATTAGTCAACACTAATGTCTTAAATAGTACTTTTGCTTTTCGAAATTCCAAATTGCTGTAATTGAATTTGCTTTTTCTTCTTCGTCTGTTGTTTTATCTTCATCACTTGCATTAATCAAATTACCAT < 2:87172/127‑1 ACATTAGTCAACACTAATGTCTTAAATAATAATTTTGCTTTTCGAGATTCCAAATTGCGGTAATTGAATGTGCTTTTTCTTCTTCGTCTGTTGTTTTATCTTCATCACTTGCATTAATAAAATTACCAT > 1:181831/1‑129 ACATTAGTCAACACTAATGTCTTAAATAATAATTTTGCTTTTCGAAATTCCAAATTGCGGTAATTGAATGTGCTTTTTCTTCTTCGTCTGTTGTTTTATCTTCATCACTTGCATTAATCAAATTACCAT < 2:223905/129‑1 ACATTAGTCAACACTAATGTCTTAAATAATAATTTTGCTTTTCGAAATTCCAAATTGCGGTAATTGAATGTGCTTTTTCTTCTTCGTCTGTTGTTTTATCTTCATCACTTGCATTAATCAAATTACCAT < 2:18010/129‑1 CATTAGTCAACACTAATGTCTTAAATAATAATTTTGCTTTTCGAAATTCCAAATTGCGGTAATTGAATGTGCTTTTTCTTCTTCGTCTGTTGTTTTATCTTCATCACTTGCATTAATCAAATTACCATC < 1:148260/129‑1 CATTAGTCAACACTAATGTCTTAAATAATAATTTTGCTTTTCGAAATTCCAAATTACGGTAATTGAATGTGCTTTTTCTTCTTCGTCTGTTGTTTTATCTTCATCACTTGCATTAATCAAATTACCATC > 1:157057/1‑129 CATTAGTCAACACTAATGTCTTAAATAATAATTTTGCTTTTCGAAATTCCAAATTACGATAATTGAATGTGATTTTTCTTATTAGTCTGTTGTTTTATCTTCATCACTTGCATTAATCAAATTACCATC > 1:218326/1‑129 CATTAGTCAACACTAATGTCTTAAATAATAATTTTGCTTTTCGAAATTCCAAATAGCGGTAATTGAATGTGCTTTTTCTTCTTCGTCTGTTGTTTTATCTTCATCACTTGCATTAATCAAATTACCATC > 1:148932/1‑129 ATTATTCAACACTAATGACTTAAATAATAATTTTGCTTTTCGAAATTCTCAATTGCTGTAATTGAATGTGCTTTTACTTCTTCGTCTGTTGTTTTATCTTCATCACTTGCATTAATCAAATTACCATCT < 2:191138/129‑1 ATTAGTTAACACGAATGTCTTAAATAATAATTTTGCTTTTTGAAATTCCAAATTGCGGTAATTGAATGTGCTTTTTCTTCTTCGTCTGTTGTTTTATCTTCATCACTTGCATTAATCAAATTACCATCT < 2:173936/129‑1 ATTAGTCAACACTAATGTCTTAAATAATAATTTTGCTTTTCGAAATTCCAAATTGCGGTAATTGAATGTGCTTTTTCTTCTTCGTCTGTTGTTTTATCTTCATCACTTGCATTAATCAAATTACCATCT < 2:215248/129‑1 ATTAGTCAACACTAATGTCTTAAATAATAATTTTGCTTTTCGAAATTCCAAATTGCGGTAATTGAATGTGCTTTTTCTTCTTCGTCTGTTGTTTTATCTTCATCACTTGCATTAATCAAATTACCATCT < 2:69176/129‑1 ATTAGTCAACACTAATGTCTTAAATAATAATTTTGCTTTTCGAAATTCCAAATTGCGGTAATTGAATGTGCTTTTTCTTCTTCGTCTGTTGTTTTATCTTCATCACTTGCATTAATCAAATTACCATCT < 1:176167/129‑1 ATTAGTCAACACTAATGTCGTAAATGATTATTTTGCTTTTCTACATTCCAAATTGCGGTAATTGAATGTGCTTTTTCTTCTTCGTCTGTTGTTTTATCTTCATCACTTGCATTAATCAAATTACCATCT < 2:77251/129‑1 TTAGTCAACACTTATGTCTTAAATAATAATTTTGCTTTTCGAAATTCCAAATTGCGGTAATTGAATGTGCTTTTTCTTCTTCGTCTGTTGTTTTATCTTCATCACTTGCATTAATCAAATTACCATCTT < 2:150320/129‑1 TTAGTCAACACTAATGTCTTAAATAATAATTTTGCTTTTCGAAATTCCAAATTGCGGTAATTGAATGTGCTTTTTCTTCTTCGTCTGTTGTTTTATTTTCATCACTTGTATTAATCAAATTACCATCTT > 2:120201/1‑129 TTACTCAACACTAACGGATCCAAGAATAATTTTGCTTTTCGAAATTCCAAATTGCGGTAATTGAATGTGCTTTTTCTTCTTCGTCTGTTGTTTTATCTTCATCACTTGCATTAATCAAATTACCATCTT > 2:106902/1‑129 TAGTCAACACTAATGTCTTAAATAATAATTTTGCTTTTCGAAATTCCAAATTGCGGTAATTGAATGTGCTTTTTCTTCTTCGTCTGTTGTTTTATCTTCATCACTTGCATTAATCAAATTACCATCTTC < 1:3538/129‑1 TAGTCAACACTAATGTCTTAAATAATAATTTTGCTTTTCGAAATTCCAAATTGCGGTAATTGAATGTGCTTTTTCTTCTTCGTCTGTTGTTTTATCTTCATCACTTGCATTAATCAAATTACCATCTTC > 1:135119/1‑129 TAGTCAACACTAATGTCTTAAATAATAATTTTGCTTTTCGAAATTCCAAATTGAAGTAATTGAATATACTTTTTCTTCTTCGTCTGTTGTTTTATCTTCATCACTTACATTAATCAAATTACCATCTTC > 1:22592/1‑129 AGTCAACACTAATGTCTTAAATAATAATTTTGCTTTTCGAAATTCCAAATTGCGGTAATTGAATGTGTTTTTTCTTCTTCTTCTTTTTTTTTATCTTCATCACTTGCATTAATCAAATTACCATCTTCG < 1:112017/129‑1 AGTCAACACTAATGTCTTAAATAATAATTTTGCTTTTCGAAATTCCAAATTGCGGTAATTGAATGTGCTTTTTCTTCTTCGTCTGTTGTTTTATCTTCATCACTTGCATTAATCAAATTACCATCTTCG > 1:18567/1‑129 AGTCAACACTAATGTCTTAAATAATAATTTTGCTTTTCGAAATTCCAAATTGCGGTAATTGAATGTGCTTTTTCTTCTTCGTCTGTTGTTTTATCTTCATCACTTGCATTAATCAAATTACCATCTTCG < 1:60188/129‑1 AGTCAACACTAATGTCTTAAATAATAATTTTGCTTTTCGAAATTCCAAATTGCGGTAATTGAATGTGCTTTTTCTTCTTCGTCTGTTGTTTTATCTTCATCACTTGCATTAATCAAATTACCATCTTCG > 1:61494/1‑129 AGTCAACACTAATGTCTTAAATAATAATTTTGCTTTTCGAAATACCAAATTACGGTAATTGAATGTGCTTTTTCTTCTTCGTCTGTTGTTTTATCTTCATCACTTGCATTAATCAAATTACCATCTTCG > 1:146082/1‑129 GTCAACACTAATGTCTTAAATAATAATTTTGCTTTTCGAAATTCCAAATTGCGGTAATTGAATGTTCTTTTTCTTCTTCGTCTGTTGTTTTATCTTCATCACTTGCATTAATCAAATTACCATCTTCGA < 1:78466/129‑1 GTCAACACTAATGTATTAAATAATAATTTTGCTTTTCGAAATTCCAAATTGCGGTAATCGAATGTGCTTTTTCTTCTTAGTCTGTTTTTTTATATTAATTTGTTTCATTAATCAAATTACTATATTCGA > 2:2191/1‑129 TCAACACTAATGTCTTAAATAATAATTTTGCTTTTCGAAATTCCAAATTGCGGTAATTGAATGTGCTTTTTCTTCTTCGTCTGTTGTTTTATCTTCATCACTTGCATTAATCCAATTACCATCTTCGAC > 2:121733/1‑129 TCAACACTAATGTCTTAAATAATAATTTTGCTTTTCGAAATTCCAAATTGCGGTAATTGAATGTGCTTTTTCTTCTTCGTCTGTTGTTTTATCTTCATCACTTGCATTAATCAAATTACCATCTTCGAa > 2:195205/1‑128 TCAACACTAATGTCTTAAATAATAATTTTGCTTTTCGAAATTCCAAATTGCGGTAATTGAATGTGCTTTTTCTTCTTCGACTATAAGAAAAGCTGCATCACTTGCATTAATCAAATTACCATCTTCGAC > 2:166560/1‑129 TTAAACTTAGACGATGTCGAAGATGGTAATTTGATTAATGCAAGTGATGAAGATAAAACAACAGACGAAGAAGAAAAAGCACATTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_012417/859‑997‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aagacattagtCAACACTAATGTCTTAAATAATAATTTTGCTTTTCGAAATTCCAAATTGCGGTAATTGAATGTGCTTTTTCTTCTTCGTCTGTTGTTTTATCTTCATCACTTGCATTAATCAAATTACCATCTTCGAC < NC_012417/1001‑874 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |