| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 2256409 | 334 (0.920) | 4 (0.010) | 4/232 | NT | 1.3% | intergenic (+62/+59) | deoD1/dps | Purine nucleoside phosphorylase DeoD‑type 1/General stress protein 20U |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 2256428 | 318 (0.980) | intergenic (+81/+40) | deoD1/dps | Purine nucleoside phosphorylase DeoD‑type 1/General stress protein 20U | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 124 total aligned reads displayed.
TCATATTTTACGTGACGAAGCTACTACACCTGAAGAACGTCAAAATTCATTTACACAAATGATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > USA300TCH1516_ALE/2256257‑2256409‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aaaagccaacacatAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTACTCTGCGATTTCTAAAGCGATTTCCATCATTTGTGTAAATGAATTTTGACGTTCTT < USA300TCH1516_ALE/2256428‑2256289 TCATATTTTACGTGACGAAGCTACTACACCTGAAGAACGTCAAAATTCATTTACACAAATGATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAA > 1:2676339/1‑141 CATATTTTACGTGACGAAGCTACTACACCTGAAGAACGTCAAAATTCATTTACACAAATGATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAA > 1:711338/1‑141 ATATTTTACGTGACGAAGCTACTACACCTGAAGAACGTCAAAATTCATTTACACAAATGATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAA < 1:1040509/141‑1 ATATTTTACGTGACGAAGCTACTACACCTGAAGAACGTCAAAATTCATTTACACAAATGATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAA < 1:2230525/141‑1 TATTTTACGTGACGAAGCTACTACACCTGAAGAACGTCAAAATTCATTTACACAAATGATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAG > 1:2111755/1‑141 TTTTACGTGACGAAGCTACTACACCTGAAGAACGTCAAAATTCATTTACACAAATGATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCC < 2:804676/141‑1 TTTTACGTGACGAAGCTACTACACCTGAAGAACGTCAAAATTCATTTACACAAATGATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCC < 1:3851454/141‑1 TTTTACGTGACGAAGCTACTACACCTGAAGAACGTCAAAATTCATTTACACAAATGATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCC > 1:517605/1‑141 TTTTACGTGACGAAGCTACTACACCTGAAGAACGTCAAAATTCATTTACACAAATGATGGAAATCGCTTTAGAAATAGCAGAGTAACTTATTTAAATTGAATTTAATTGCTCTTTAACAATGCAATTAAACTCACAAAGCC > 1:56810/1‑141 TTTACGTGACGAAGCTACTACACCTGAAGAACGTCAAAATTCATTTACACAAATGATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCA > 1:4407889/1‑141 TTACGTGACGAAGCTACTACACCTGAAGAACGTCAAAATTCATTTACACAAATGATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAA < 2:4278297/141‑1 TTACGTGACGAAGCTACTACACCTGAAGAACGTCAAAATTCATTTACACAAATGATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCAAA > 2:546744/1‑141 TTACGTGACGAAGCTACTACACCTGAAGAACGCCAAAGTTCATTTACACAAATGATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAA > 1:1253134/1‑141 taggttACGAGGCTACTACACCTGAAGAACGTCAAAATTCAGTTACACAAATGATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAAC < 2:3718310/135‑1 taccgGACGAAGCTACTACACCTAAATAACGTCAAAATTCATTTACACAAATGATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAAC < 1:4000162/136‑1 TACGTGACGAAGCTACTACACCTGAAGAACGTCAAAATTCATTTACACAAATGATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAAC < 1:2535483/141‑1 TACGTGACGAAGCTACTACACCTGAAGAACGTCAAAATTCATTTACACAAATGATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAAC < 1:3618749/141‑1 TACGTGAAGAAGCTACTACACCTGAAGAACGTCAAAATTCATTTACACAAATGATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGGGATTAAACTCAAAAAGCCAAC < 1:1924338/141‑1 ACGTGACGAAGCTACTACACCTGAAGAACGTCAAAATTCATTTACACAAATGATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACACTTCGATTAAACTAAAAAAGCCAACA > 1:564566/1‑141 ACGTGACGAAGCTACTACACCTGAAGAACGTCAAAATTCATTTACACAAATGATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACA < 1:1310376/141‑1 ACGTGACGAAGCTACTACACCTGAAGAACGTCAAAATTCATTTACACAAATGATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACA > 1:1493381/1‑141 ACGTGACGAAGCTACTACACCTGAAGAACGTCAAAATTCATTTACACAAATGATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACA > 1:3258544/1‑141 ACGTGACGAAGCTAATACACCTGGAGAACGTCAAAATTCATTTACACAAATGATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACA < 2:1184558/141‑1 tgtaaaGAAGATACTACACCTGAAGAACTTCAAAATTCATTTACACAAATGATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACAC < 2:1735315/135‑1 gGTGACGAAGATAATAGACCTGAAGAACGTCAAAATTCATTTACACAAATGATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACAC < 2:1819470/140‑1 GTGACGAAGCTACTACACCTGAAGAACGTCAAAATTCATTTACACAAATGATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACA < 1:2643724/141‑1 GTGACGAAGCTACTACACCTGAAGAACGTCAAAATTCATTTACACAAATGATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACA < 2:1432171/141‑1 GTGACGAAGCTACTACAACTGAAGAACGTCAAAATTCATTTACACAAATGATGGAAATCGCTTTAGAAAGCGCAGACTAACTTATTTAAATTCACTCTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACA < 1:2565111/141‑1 TGACGAAGCTACTACACCTGAAGAACGTCAAAATTCATTTACACAAATGATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACAT > 1:173511/1‑141 CGAAGCTACTACACCTGAAGAACGTCAAAATTCATTTACACAAATGATGGAAAACGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACccctttt > 2:720644/1‑134 ACGTCAAAATTCATTTACACAAATGATGGAAATCTCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATACATGGGGATACGCCCAGAATGTG < 2:1704576/141‑1 AAATTCATTTACACAAATGACGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCT < 2:3000053/141‑1 aaagAAAAGCCAACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTACTCTGCGATTTCTAAAGCGATTTCCATCATTTGTGTAAA < 2:2751077/137‑1 agagAAGCCAACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTACTCTGCGATTTCTAAAGCGATTTCCATCATTTGTGTAAATG < 2:1944017/137‑1 atAAAGCCAACACATAAATGGGGGTACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTACTCTGCGATTTCTAAAGCGATTTTCATCATTTGTGTAAATGA > 1:3680164/3‑141 AAAAGCCAACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTACTCTGCGATTTCTAAAGCGATTTCCATCATTTGTGTAAATGAA > 1:673885/1‑141 AAAAGCCAACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTACTCTGCGATTTCTAAAGCGATTTCCATCATTTGTGTAAATGAA > 1:3258746/1‑141 AAAAGCCAACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTACTCTGCGATTTCTAAAGCGATTTCCATCATTTGTGTAAATGAA > 1:3779261/1‑141 AAAAGCCAACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTCAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTACTCTGCGATTTCTAAAGCGATTTCCATCATTTGTGTAAATGAA > 1:2809307/1‑141 AAAAGCCAACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTATGAAAGAGCAATTACCGTCAATTGTTATAAGTTACTCTGCGATTTCTAAAGCGATTTCCATCATTTGTGTAAATGAA > 1:3452632/1‑141 AAAGCCAACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTACTCTGCGATTTCTAAAGCGATTTCCATCATTTGTGTAAATGAct > 1:693081/1‑139 AAAGCCAACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTACTCTGCGATTTCTAAAGCGATTTCCATCATTTGTGTAAATGAAT > 1:3357576/1‑141 AAAGCCAACACACAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTACTCTGCGATTTCTAAAGCGATTTCCATCATTTGTGTAAATGAAT < 2:4020338/141‑1 AAGCCAACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTACTCTGCGATTTCTAAAGCGATTTCCATCATTTGTGTAAATGAATT < 1:2570989/141‑1 AAGCCAACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTACTCTGCGATTTCTAAAGCGATTTCCATCATTTGTATAAGTGAAgt > 2:4006752/1‑139 AGCCAACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTACTCTGCGATTTCTAAAGCGATTTCCATCATTTGTGTAAATGAATTT > 1:2848685/1‑141 AGCCAACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTACTCTGCGATTTCTAAAGCGATTTCCATCATTTGTGTAAATGAATTT < 2:1478802/141‑1 AGCCAACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTACTCTGCGATTTCTAAAGCGATTTCCATCATTTGTGTAAATGAATTT > 2:441383/1‑141 AGCCAACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTACTCTGCGACTTCTAAAGCGATTTCCATCATTTGTGTAAATGAATTT > 2:1818133/1‑141 AGCCAACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTACTCTACGATTTCTAAAGCGATTTCCATCATTTGTGTAAACTAATTT > 2:4140278/1‑141 AGCCAACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATGAAAGTCAATTTAAATAAGTTACTCTGCGATTTCTAAAGCGATTTCCATCATTTGTGTAAATGAATTT > 2:1584461/1‑141 GCCAACACATAAATGGGGATACGCGCAGAATGAGTTGGCGTTTTGAGTTTAAGCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTACTCTGCGATTTCTAAAGCGATTTCCATCATTTGTGTAAATGAATTTT > 2:1699988/1‑141 GCCAACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTACTCTGCGATTTCTAAAGCGATTTCCATCATTTGTGTAAATGAATTTT > 2:1053140/1‑141 GCCAACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTACTCTGCGATTTCTAAAGCGATTTCCATCATTTGTGTAAATGAATTTT > 2:2870548/1‑141 GCCAACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTACTCTGCGATTTCTAAAGCGATTTCCATCATTTGTGTAAATGAATTTT > 2:1483195/1‑141 GCCAACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTACTCTGCGATTTCTAAAGCGATTTCCATCATTTGTGTAAATGAATTTT > 1:3781675/1‑141 GCCAACACATAAATGGGGATACGCCCAGAAAGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATAGCAATGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTACTCTGCGATTTCTAAAGCGATTTCCATCATTTGTGTAAATGAATTTT > 1:306295/1‑141 CAACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCACTTTAAATAAGTTACTCTGCGATTTCTAAAGCGATTTCCATCATTTGTGTAAATGAATTTTGA > 2:942923/1‑141 CAACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTACTCTGCGATTTCTAAAGCGATTTCCATCATTTGTGTAAATGAATTTTGA > 1:953246/1‑141 CAACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTACTCTGCGATTTCTAAAGCGATTTCCATCATTTGTGTAAATGAATTTTGA > 1:2163359/1‑141 CAACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTACTCTGCGATTTCTAAAGCGATTTCCATCATTTGTGTAAATGAATTTTGA > 1:2898741/1‑141 CAAAACATAGCTGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTACTCTGCGATTTCTAAAGCGATTTCCATCATTTGTGTAAATGAATTTTGA < 1:4335876/141‑1 AACGCAGAAATGGGGATACGGGCAGAATGTGTTGGCTTGTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTACTCTGCGATTTCTAAAGCGATTTCCATCATTTGTGTAAATGAATTTTGAC < 2:4123887/141‑1 AACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGGGATTACAAGGTCAATTTAAATAAGTTACTCTGCGATTTCTAAAGCGATTTCCATCATTTGTGTAAATGAATTTTGAC < 1:2088143/141‑1 AACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTACTCTGCGATTTCTAAAGCGATTTCCATCATTTGTGTAAATGACTTTTGAC > 2:2321774/1‑141 AACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTACTCTGCGATTTCTAAAGCGATTTCCATCATTTGTGTAAATGAATTTTGAC < 1:2851284/141‑1 AACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTACTCTGCGATTTCTAAAGCGATTTCCATCATTTGTGTAAATGAATTTTGAC < 2:2613125/141‑1 ACACGTAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCCAATTCTATGCACGCGAGTAAAGTCAATTTAAATAAGTTACTCTGCGATTTCTAAAGCGATTTCCATCATTTGTGTAAATGAATTTTGACG < 1:1023598/141‑1 ACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTTAATTTAAATAAGTTACTCTGCGATTTCTAAAGCGATTTCCATCATTTGTGTAAATGAATTTTGACG > 1:4388782/1‑141 ACACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTACTCTGCGATTTCTAAAGCGATTTCCATCATTTGTGTAAATGAATTTTGACG < 2:594263/141‑1 ACACATAAATGGGGATACGCACAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTACTCTGCGATTTCTAAAGCGATTTCCATCATTTGTGTAAATGAATTTTGACG < 2:1978562/141‑1 ACACAGAAATGGGGATACGCTCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAACTAAGTTACTCTGCGATTTCTAAAGCGATTTCCATCATTTGTGTAAATGAATTTTGACG < 2:3874981/141‑1 ctgATAAATGAGGATACGCGCAGAATGTGTTGGCTGTTTGAGTTTAATCGCATTG‑TAAAGAGTAATTAACGTCAATTTAAATAAGTTACTCTGCGATTTCTAAAGCGATTTCCATCATGTGTGTAAATGAATTTTGACGTT < 2:734605/138‑1 aACATAGATGGGGATACGTCCATAATGTGTTGTCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTACTCTGCGATTTCTAAAGCGATTTCCATCATTTGTGTAAATGAATTTTGACGT < 2:3600998/140‑1 CACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCGATTAAAGTCAATTTGAATAAGGGACGCTGCGATTTCTAAAGCGAGTTCCGTCATTTGTGTAAATGAATTTTGACGT < 1:3162422/141‑1 CACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTACTCTGCGATTTCTAAAGCGTTTTCCATCATTTGTGTAAATGAATTTTGACGT < 1:856305/141‑1 CACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTACTCTGCGATTTCTAAAGCGATTTCCATCATTTGTGTAAATGAATTTTGACGT > 1:4020862/1‑141 CACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTACTCTGCGATTTCTAAAGCGATTTCCATCATTTGTGTAAATGAATTTTGACGT < 2:3788983/141‑1 CACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTACTCTGCGATATCTAAAGCGATTTCCATCATTTGTGTAAATGAATTTTGACGT > 2:921799/1‑141 CACATAAATGGGGATACGCCCAGAATCTACTCGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTACTCTGCGATTTCTAAAGCGATTTCCATCATTTGTGTAAATGAATTTTGACGT < 2:4032900/141‑1 ACATAGATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCTATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTACTCTGCGATTTCTAAAGCGATTTCCATCATTTGTGTAAATGAATTTTGACGTT < 2:1284393/141‑1 ACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTACTCTTCGATTTCTAAAGCGATTTCCATCATATAGTTCAATGACTTTTGAtttt > 2:1759750/1‑137 ACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTACTCTGCGATTTCTAAAGCGATTTCCATCATTTTTGTAAATGAATTTTGACGTT > 1:380013/1‑141 ACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTACTCTGCGATTTCTAAAGCGATTTCCATCATTTGTGTAAATGAATTTTGACGTT < 1:627836/141‑1 ACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTACTCTGCGATTTCTAAAGCGATTTCCATCATTTGTGTAAATGAATTTTGACGTT > 2:809409/1‑141 ACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTACTCTGCGATTTCTAAAGCGATTTCCATCATTTGTGTAAATGAATTTTGACGTT > 1:1423019/1‑141 ACATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTACTCTGCGATTTCTAAAGCGATTTCCATCATTTGTGTAAATGAATTTTGACGTT > 1:1304423/1‑141 CATAAATGGTGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTACTCTGCGATTTCTAAAGCGATTTCCATCATTTGTGTAAATGAATTTTGACGTTC < 1:1413237/141‑1 CATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCACTTAAACTCAATTTAAATAAGTTACTCTGCGATTTCTAAAGCGATTTCCATCATTTGTGTAAATGAATTTTGACGTTC > 2:322251/1‑141 CATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTACTCTGCGTTTTCTAAAGCGATTTCCATCATTTGTGTAAATGAATTTTGACGTTC > 1:1885896/1‑141 CATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTACTCTGCGATTTCTAAAGCGATTTCCATCATTTGTGTAAATGAATTTTGACGTTC > 2:3055976/1‑141 CATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGACTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTACTCTGCGATTTCTAAAGCGATTTCCATCATTTGTGTAAATGAATTTTGACGTTC > 1:2583274/1‑141 ATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTACTCTGCGATTTCTAAAGCGATTTCCATCATTTGTGTAAATGAATTTTGACGTTCT > 1:2392332/1‑141 ATAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTACTCTGCGATTTCTAAAGCGATTTCCATCATTTGTGTAAATGAATTTTGACGTTCT > 1:2606857/1‑141 TAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTACTCTGCGATTTCTAAAGCGATTTCCATCATTTGTGTAAATGAATTTTGACGTTCTT < 1:2881240/141‑1 TAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTACTCTGCGATTTCTAAAGCGATTTCCATCATTTGTGTAAATGAATTTTGACGTTCTT > 2:3714395/1‑141 TAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTACTCTGCGATTTCTAAAGCGATTTCCATCATTTGTGTAAATGAATTTTGACGTTCTT < 2:2549673/141‑1 TAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTACTCTGCGATTTCTAAAGCGATTTCCATCATTTGTGTAAATGAATTTTGACGTTCTT > 1:1826837/1‑141 TAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATCACAGTAAATTTAAATAAATCACTCTACGGTTTATAAACAGATTCCCATCATTTGTGTAAAGGCATTTTGACGTTCTT > 2:2167518/1‑141 TAAAGGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTACTCTGCGATTTCTAAAGCGATTTCCATCATTTGTGTAAATGAATTTTGACGTTCTT < 1:1552532/141‑1 TCATATTTTACGTGACGAAGCTACTACACCTGAAGAACGTCAAAATTCATTTACACAAATGATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > USA300TCH1516_ALE/2256257‑2256409‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aaaagccaacacatAAATGGGGATACGCCCAGAATGTGTTGGCTTTTTGAGTTTAATCGCATTGTTAAAGAGCAATTAAAGTCAATTTAAATAAGTTACTCTGCGATTTCTAAAGCGATTTCCATCATTTGTGTAAATGAATTTTGACGTTCTT < USA300TCH1516_ALE/2256428‑2256289 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |