| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 2256409 | 334 (0.920) | 4 (0.010) | 4/232 | NT | 1.3% | intergenic (+62/+59) | deoD1/dps | Purine nucleoside phosphorylase DeoD‑type 1/General stress protein 20U |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 2256428 | 318 (0.980) | intergenic (+81/+40) | deoD1/dps | Purine nucleoside phosphorylase DeoD‑type 1/General stress protein 20U | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 427 total aligned reads displayed.
GAAGAACGTCAAAATTCATTTACACAAATGATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATCTGTA‑GATTAGCTTAAGTAAGATTTAAACATCCAATTATGTTTATCTACTGATGTTTGCATACCTATAAACATATCTTCTGATACATCATCGCCAGCATTACCAGCA > USA300TCH1516_ALE/2256288‑2256567 | aagaaCGTCAAAATTCATTTACACAAATGATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCCTTTa < 1:1552532‑M2/141‑2 (MQ=255) gaaCGTCAAAATTCATTTACACAAATGATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGTCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTatg > 1:2583274‑M2/1‑138 (MQ=255) gaaCGTCAAAATTCATTTACACAAATGATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTatg > 2:3055976‑M2/1‑138 (MQ=255) gaaCGTCAAAATTCATTTACACAAATGATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGCAACGTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTatg < 2:4077654‑M2/141‑4 (MQ=255) aaaatcaaaAGTCATTGAACTATATGATGGAAATCGCTTTAGAAATCGAAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTatgt > 2:1759750‑M2/5‑137 (MQ=255) aaCGTCAAAATTCATTTACACAAATGATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATAGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATCTatgt < 2:1284393‑M2/141‑5 (MQ=255) aaCGTCAAAATTCATTTACAAAAATGATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTatgt > 1:380013‑M2/1‑137 (MQ=255) agcacAAAATTCATTTACACAAACCATAAATATCTCTTTATAAATCCCATACTCACTTATTTAAATTCACTTTAATTCCTCTTTAACCATGCGACTAAACTCAAAAACCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTAtgtg < 2:2143952/137‑1 (MQ=255) aCGTCAAAATTCATTTACACAAATGACGGAACTCGCTTTAGAAATCGCAGCGTCCCTTATTCAAATTGACTTTAATCGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTatgtg < 1:3162422‑M2/141‑6 (MQ=255) cGTCAAAATTCATTTACACAAATGATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTatgtgt < 2:594263‑M2/141‑7 (MQ=255) tCAAAATTCATTTACACAAATGATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTatgtgttg > 1:2898741‑M2/1‑133 (MQ=255) tCAAAATTCATTTACACAAATGATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCAGCTatgttttg < 1:4335876‑M2/141‑9 (MQ=255) tCAAAATTCATTTACACAAATGATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAAGTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTatgtgttg > 2:942923‑M2/1‑133 (MQ=255) cAAAATTCATTTACACAAATGATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTCACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTatgtgttgg > 1:1679115‑M2/1‑132 (MQ=255) aaaaTTCATTTACACAAATGATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTatgtgttggc > 2:2870548‑M2/1‑131 (MQ=255) aaaaTTCATTTACACAAATGATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTatgtgttggc > 2:1053140‑M2/1‑131 (MQ=255) aaaTTCATTTACACAAATGATGGAAATCGCTTTAGAAGTCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTatgtgttggct > 2:1818133‑M2/1‑130 (MQ=255) aaaTTCATTTACACAAATGATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTCATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTatgtgttggct > 2:1584461‑M2/1‑130 (MQ=255) aaaTTCATTTACACAAATGATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTatgtgttggct < 2:1478802‑M2/141‑12 (MQ=255) acttcaCTTATACAAATGATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTatgtgttggctt > 2:4006752‑M2/3‑129 (MQ=255) ttCATTTACACAAATGATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTatgtgttggctttt > 1:673885‑M2/1‑127 (MQ=255) tCATTTACACAAATGATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTttta < 2:3599958/141‑1 (MQ=255) cATTTACACAAATGATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTtttat > 1:2401087/1‑141 (MQ=255) cATTTACACAAATGATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTtttat > 1:4403518/1‑141 (MQ=255) tttACACAAATGATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTatgtgttggcttttcttt < 2:2751077‑M2/141‑19 (MQ=255) cacaAATGATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTatat > 1:1832497/1‑141 (MQ=255) aaTGATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATattatt < 2:1662884/141‑1 (MQ=255) atgGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGCTGGCTTTTATTAATATTATTACtt > 1:1346299/1‑141 (MQ=255) ggAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTAt > 1:735730/1‑141 (MQ=255) aaTCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTATACTCAAAAAGCCAACATATTCTGGGCGTATCCCCATTTATCTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATCTg < 2:3888485/141‑1 (MQ=255) aTCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATCTGt < 1:2825569/141‑1 (MQ=255) aTCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATCTGt < 1:3262512/141‑1 (MQ=255) cTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATCTGTA‑GAt < 2:678403/141‑1 (MQ=255) tttAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATCTGTA‑GAtt > 2:2177399/1‑141 (MQ=255) tttAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATCTGTA‑GAtt > 2:3674250/1‑141 (MQ=255) ttAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGGCTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAACACGCGGACAGTTTCTGGGCGTATAGCCAGTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATCTGTA‑GATTa > 1:2781882/1‑141 (MQ=255) gagaTCGCAGAGTAACTTATTTAAACTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATCTGTA‑GATTAGCt < 1:4071267/138‑1 (MQ=255) aaaTCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATCTGTA‑GATTAGCtt < 2:2230389/141‑1 (MQ=255) aaaTCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATCTGTA‑GATTAGCtt < 1:2441957/141‑1 (MQ=255) aTCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATCTGTA‑GATTAGCTtaa < 1:3489099/141‑1 (MQ=255) cGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATCTGTA‑GATTAGCTtaagt > 1:3562010/1‑141 (MQ=255) gagTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACATATTTGTA‑GATTCGCTTTAGTATGa > 1:2256096/1‑141 (MQ=255) agTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATCTGTA‑GATTAGCTTAAGTAAGAt > 1:1755447/1‑141 (MQ=255) agTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATCTGTA‑GATTAGCTTAAGTAAGAt < 1:856387/141‑1 (MQ=255) tAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGATGGCTGTTATTTATATTAGTACGTATCTGTA‑GATTAGCTTAAGTAAGAttt > 1:611424/1‑141 (MQ=255) tAACTGATTTAAATTCACTCTACGTGCTATTTAACAATGCGATTAAACTCTAAAAGCCAACACATTCTTGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATCTGTA‑GATTAGCTTAAGTAAGAttt < 2:3313502/141‑1 (MQ=255) aaCTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATCTGTA‑GATTAGCTTAAGGAAGATTTa < 2:2940583/141‑1 (MQ=255) aaCTTATTTAAATTGACTTTAAGTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATCTGTA‑GATTAGCTTAAGTAAGATTTa < 1:2340441/141‑1 (MQ=255) aCTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATCTGTA‑GATTAGCTTAAGTAAGATTTaa > 1:2149341/1‑141 (MQ=255) cTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAATCTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATCTGTA‑GATTAGCTTAAGTAAGATTTaaa < 2:3376547/141‑1 (MQ=255) cTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATCTGTA‑GATTAGCTTAAGTAAGATTTaaa < 2:355509/141‑1 (MQ=255) ttATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAGCTCAAAACGTAAACTCATTCTGGGCGTATCCACATTTAGTTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATCTGTA‑GATTAGCTTAAGTAAGATTTaaat < 2:503122/141‑2 (MQ=255) tATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATCTGTA‑GATTAGCTTAAGTAAGATTTAAACa < 1:14195/141‑1 (MQ=255) aTTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATCTGTA‑GATTAGCTTCAGTAAGATTTAAACAt > 2:2095493/1‑141 (MQ=255) aTTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATCTGTA‑GATTAGCTTAAGTAAGTTTTatatat > 2:2575820/1‑136 (MQ=255) aTTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATCTGTA‑GATTAGCTTAAGTAAGATTTAAACAt < 2:3936343/141‑1 (MQ=255) ttAAATTGACTGTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATCTGTA‑GATTAGCTTAAGTAAGATTTAAACATcc < 2:1192777/141‑1 (MQ=255) tAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATCTGTA‑GATTAGCTTAAGTAAGATTTAAACATCCa < 2:1378592/141‑1 (MQ=255) tAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATCTGTA‑GATTAGCTTAAGTAAGATTTAAACAGCCa > 1:3359602/1‑141 (MQ=255) aaTTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGAGCGTAATCCAATTTATGTGCTGACTATCATCTCTATTATTACTTCTCTGTA‑GATTTGATTCAGTAAGATTTAGACTTCCAAt > 2:1937438/1‑141 (MQ=255) aTTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTCATATTATTACTTATCTGTA‑GATTAGCTTAAGTAAGATTTAAACATCCAAtt < 1:2856255/141‑1 (MQ=255) ttGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATCTGTA‑GATTAGCTTAAGTAAGATTTAAACATCCAATTa < 1:3684344/141‑1 (MQ=255) gACTTTCTTTGCTCTTTAACAATGCGCTTAATCTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATCTGTA‑GATTAGCTTAAGTAAGATTTAAACATCCAATTATg < 1:2054136/141‑1 (MQ=255) gACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAGCTTAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATCTGTA‑GATTAGCTTAAGTAAGATTTAAACATCCAATTATg < 2:3794528/141‑1 (MQ=255) aCTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAACCTAAAAAAGCCTACACACTCTACGCGGATCCTCATTCATCTGTTGGCTTCTATTTATATTATTACTTATTTGTA‑TATTAGCTCAACTACCATTTAACCATCCAATTATGt < 2:790720/141‑1 (MQ=255) aCTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATCTGTA‑GATTAGCTTAAGTAAGATTTAAACATCCAATTATGt < 2:430489/141‑1 (MQ=255) acttGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTTAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATCTTTA‑GATTAGCTTAAGTAAGATTTAAACATCCAATTATGTTTATc > 2:4337471/3‑141 (MQ=255) tttAATATTGCAATTAAACTTAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATCTGTA‑GATTAGCTTAAGTAAGATTTAAACATCCAATTATGTTTATCTACTGATg < 1:1278788/141‑1 (MQ=255) tttAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTGTTATTTATATTATTACTTATCTGTA‑GATTAGCTTAAGTAAGATTTAAACATCCAATTATGTTTATCTACTGATg < 2:2676339/141‑1 (MQ=255) ttAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATCTGTA‑GATTAGCTTAAGTAAGATTTAAACATCCAATTATGTTTATCTACTGATGt > 1:3415577/1‑141 (MQ=255) tAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATCTGTA‑GATTAGCTTAAGTAAGATTTAAACATCCAATTATGTTTATCTACTGATGtt > 1:3959690/1‑141 (MQ=255) tAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATCTGTA‑GATTAGCTTAAGTAAGATTTAAACATCCAATTATGTTTATCTACTGATGtt < 2:2348810/141‑1 (MQ=255) tAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATCTGTA‑GATTAGCTTAAGTAAGATTTAAACATCCAATTATGTTTATCTACTGATGtt > 1:1605178/1‑141 (MQ=255) aaCAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATCTGTA‑GATTAGCTTAAGTAAGATTTAAACATCCAATTATGTTTATCTACTGATGttt < 1:2173775/141‑1 (MQ=255) aaCAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATCTGTA‑GATTAGCTTAAGTAAGATTTAAACATCCAATTATGTTTATCTACTGATGttt < 1:3104334/141‑1 (MQ=255) aaCAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATCTGTA‑GATTAGCTTAAGTAAGATTTAAACATCCAATTATGTTTATCTACTGATGtct < 2:3216075/141‑3 (MQ=255) ttAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATCTGTA‑GATTAGCTTAAGTAAGATTTAAACATCCAATTATGTTTATCTACTGATGTTTGCATACTtat > 1:4241545/1‑141 (MQ=255) aaaCTCAAAAAGCCAACACCTTCTGGGCGTCTCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATCTGTA‑GATTAGCTTAAGTAAGATTTAAACATCCACTTATGTTTATCTACTGATGTTTGCATACCTATaa < 1:1971408/141‑1 (MQ=255) aaCTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATCTGTA‑GATTAGCTTAAGTAAGATTTAAACATCCAATTATGTTTATCTACTGATGTTTGCATACCTATaaa < 2:2305223/141‑1 (MQ=255) aaCTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATCTGTA‑GATTAGCTTAAGTAAGATTTAAACATCCAATTATGTTTATCTACTGATGTTTGCATACCTATaaa < 1:1478802/141‑1 (MQ=255) aaCTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATCACTACGCCGAG‑GGAAGCAAGATTTAAACATCCAATTATGTTTATCTACTGATGTTTGCATACCTATaaa > 1:1024642/1‑141 (MQ=255) aCTCAAAAAGCCAACACATTCTAGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCGATTATTTATATTATTACTTATCTGTA‑GATTAGCTTAATTAAGATTCAAACATCCAATTATGTTTCTATACTCATATTTGCATGCACATAAAc > 2:4156158/1‑141 (MQ=255) tCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATCTGTA‑GATTAGCTTAAGTAAGATTTAAACATCCAATTATGTTTATCTACTGATGTTTGCATACCTATAAACat < 2:735730/141‑1 (MQ=255) cAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATCTGTA‑GATTAGCTTAAGTAAGATTTAAACATCCAATTATGTTTATCTACTGATGTTTGCATACCTATCAGCata > 1:991742/1‑141 (MQ=255) cAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATCTGTA‑GATTAGCTTAAGTAAGATTTAAACATCCAATTATGTTTATCTACTGATGTTTGCATACCTATAAACata < 1:3042074/141‑1 (MQ=255) aGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTatgtgttggctttttgagtttaatcgcattgttaaagagcaattaaagtcaatttaaataagttactctgcgatttctaaagcgatttccgtcatttgtgtaaatgaattt < 2:3000053‑M2/141‑112 (MQ=255) ccAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATCTGTA‑GATTAGCTTAAGTAAGATTTAAACATCCAATTATGTTTATCTACTGATGTTTGCATACCGATAAACATAtcttctt > 1:2969952/1‑140 (MQ=255) cAACACATTCTGGGTGTATCCCCATTTGTGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATCTGTA‑GATTAGCTTAAGTAAGATTTAAACATCCAATTATGTTTATCTACTGATGTTTGCATACCTATAAACATATCTTCTGa < 2:861107/141‑1 (MQ=255) acacATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATCTGTA‑GATTAGCTTAAGTAAGATTTAAACATCCAATTATGTTTATCTACTGATGTTTGCATACCTATAAACATATCTTCTGATa > 1:505915/1‑141 (MQ=255) acacATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATCTGTA‑GATTAGCTTAAGTAAGATTTAAACATCCAATTATGTTTATCTACTGATGTTTGCATACCTATAAACATATCTTCTGATa > 2:3982751/1‑141 (MQ=255) acaTTCTGGGTGTTTCTCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATCTGTA‑GATTAGCTTAAGTAAGATTTAAACATCCAATTATGTTTATCTACTGATGTTTGCATACCTATAAACATATCTTCTGATAca < 2:2494517/141‑1 (MQ=255) tCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATCTGTA‑GATTAGCTTAAGTAAGATTTAAACATCCAATTATGTTTATCTACTGATGTTTGCATACCTATAAACATATCTTCTGATAcatcat < 1:2549673/141‑1 (MQ=255) tCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATCTGTA‑GATTAGCTTAAGTAAGATTTAAACATCCAATTATGTTTATCTACTGATGTTTGCATACCTATAAACATATCTTCTGATAcatcat > 2:3619432/1‑141 (MQ=255) cTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATCTGTA‑GATTAGCTTAAGTAAGATTTAAACATCCAATTATGTTTATCTACTGATGTTTGCATACCTATAAACATATCTTCTGATACatcatc < 1:1221999/141‑1 (MQ=255) tGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATCTGTA‑GATTAGCTTAAGTAAGATTTAAACATCCAATTATGTTTATCTACTGATGTTTGCATACCTATAAACATATCTTCTGATACatcatcc > 2:4254624/1‑140 (MQ=255) tGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATCTGTA‑GATTAGCTTAAGTAAGATTTAAACATCCAATTATGTTTATCTACTGATGTTTGCATACCTATAAACATATCTTCTGATACATCATCg > 1:904651/1‑141 (MQ=255) gCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATCTGTA‑GATTAGCTTAAGTAAGATTTAAACATCCAATTATGTTTATCTACTGATGTTTGCATACCTATAAACATATCTTCTGATACATCATCGCCa < 2:4403518/141‑1 (MQ=255) gCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATCTGTA‑GATTAGCTTAAGTAAGATTTAAACATCCAATTATGTTTATCTACTGATGTTTGCATACCTATAAACATATCTTCTGATACATCATCGCCa < 1:249374/141‑1 (MQ=255) gTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTCTATATCCTTTTATTTATTTTTA‑GATTAGCTTAAGTAAGATTTAAACATCCAATTATGTTTATCTACTGATGTTTGCATACCTATAAACATATCTTCTGATACATCATCGCCAGc > 1:1916628/1‑141 (MQ=255) ttATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATCTGTA‑GATTAGCTTAAGTAAGATTTAAACATCCAATTATGTTTATCTACTGCAATCGGCGCCCCTAGACACCTCTCTTCTGTTACATCATCGCCAGCATTACCAGCa > 1:1007436/1‑141 (MQ=255) | GAAGAACGTCAAAATTCATTTACACAAATGATGGAAATCGCTTTAGAAATCGCAGAGTAACTTATTTAAATTGACTTTAATTGCTCTTTAACAATGCGATTAAACTCAAAAAGCCAACACATTCTGGGCGTATCCCCATTTATGTGTTGGCTTTTATTTATATTATTACTTATCTGTA‑GATTAGCTTAAGTAAGATTTAAACATCCAATTATGTTTATCTACTGATGTTTGCATACCTATAAACATATCTTCTGATACATCATCGCCAGCATTACCAGCA > USA300TCH1516_ALE/2256288‑2256567 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |