| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 354 total aligned reads displayed.
TACTTGATAACATGGCATGACTAATCCTTGTATATCCTGTCCTGTATTTCATTTTGATCTATCATTTTTATTATTGCTTTCTATTGCACAAAAAATCTGGCTAAAGGTCGCTATGATAGTAACGACTTCAACCAGATTTCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGTATCTTTTTCTCTATTGTAATATTCATATTTAAAACGCATATCATTATCGCTTAAATCCTTCATTATTAGACTATTCACAAAGCCGCCCATGTCTTAATTTCAAT > USA300TCH1516_ALE/2761150‑2761429 | aCTTGATAACATGGCATGACTAATCCTTGTATATCCTGTCCTGTATTTCATTTTGATCTATCATTTTTATTATTGCTTTCTATTGCACAAAAAAGCTCACTAAAGGTCGCTATGATAGTAACGACTTCAACCAGATTTCaa > 1:3013081/1‑141 (MQ=255) cTTGATAACATGGCATGACTAATCCTTGTATATCCTGTCCTGTATTTCATTTTGATCTATCATTTTTATTATTGCTTTCTATTGCACAAAAAATCTGGCTAAAGGTCGCTATGATAGTAACGACTTCAACCAGATTTCAAt < 2:2505130/141‑1 (MQ=255) aCATGGCATGACTAATCCTTGTATATCCTGTCCTGTATTTCATTTTGATCTATCATTTTTATTATTGCTTTCTATTGCACAAAAAATCTGGCTAAAGGTCGCTATGATAGTAACGACTTCAACCAGATTTCAATTTATCCa > 1:3778477/1‑141 (MQ=255) aCATGGCATGACTAATCCTTGTATATCCTGTCCTGTATTTCATTTTGATCTATCATTTTTATTATTGCTTTCTATTGCACAAAAAATCTGGCTAAAGGTCGCTATGATAGTAACGACTTCAACCAGATTTCAATTTATCCa > 1:907551/1‑141 (MQ=255) 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1:2131496/1‑141 (MQ=255) cAACCAGATTTCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGTATCTTTTTCTCTATTGTAATATTCATATTTAAAACGCATATCATTATCGCTTAAATCCTTCATTATTAGACTATTCACAAAGCCGCCCATGTc > 1:2352359/1‑141 (MQ=255) ccagatttCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGTATCTTTTTCTCTATTGTAATATTCATATTTAAAACGCATATCATTATTGCTTAAATCCTTCATTATTAGACTATTCACAAAGCATCACATGTCTTa > 2:1780748‑M2/9‑141 (MQ=255) cagatttCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGTATCTTTTTCTCTATTGTAATATTCATATTTAAAACGCATATCATTATCGCTTAAATCCTTCATTATTAGACTATTCACAAAGCCGCCCATGTCTTaa < 2:3743382‑M2/134‑1 (MQ=255) agatttCAATTTATCCTCCTATTTTATTAAGTTTGTTATTGGTATCTGCTTTTCTATTGTAATATTCATATTTAAAACGCATATCATTATCGCTTAAATCCTTCATTATTAGACTATTCACAAAGCCGCCCATGTCTTAAt < 2:4267578‑M2/135‑1 (MQ=255) gatttCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGTATCTTTTTCTCTATTGTAATATTCATATTTAAAACGCATATCATTATCGCTTAAATCCTTCATTATTAGACTATTCACAAAGCCGCCCATGTCTTAAtt < 1:3746373‑M2/136‑1 (MQ=255) atttCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGTATCTTTTTCTCTATTGTAATATTCATATTTAAAACGCATATCATTATCGCTTAAATCCTTCATTATTAGACTATTCACAAAGCCGCCCATGTCTTAAttt > 1:2487403‑M2/5‑141 (MQ=255) atttCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGTATCTTTTTCTCTATTGTAATATTCATATTTAAAACGCATATCATTATCGCTTAAATCCTTCATTATTAGACTATTCACAAAGCCGCCCATGTCTTAAttt > 1:3097704‑M2/5‑141 (MQ=255) atttCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGTATCTTTTTCTCTATTGTAATATTCATATTTAAAACGCATATCATTATCGCTTAAATCCTTCATTATTAGACTATTCACAAAGCCGCCCATGTCTTAAttt > 2:2925986‑M2/5‑141 (MQ=255) atttCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGTATCTTTTTCTCTATTGTAATATTCATATTTAAAACGCATATCATTATCGCTTAAATCCTTCATTATTACACTATTCACAAAGCCGCACATGTCTTAAttt > 2:2573577‑M2/5‑141 (MQ=255) tttCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGTATCTTTTTCTCTATTGTAATATTCATATTTAAAACGCATATCATTATCGCTTAAATCCTTCATTATTAGACTATTCACAAAGCCGCCCATGTCTTAATTTc < 1:4338975‑M2/138‑1 (MQ=255) tCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGTATCTTTTTCTCTATTGTAATATTCATATTTAAAACGCATATCATTATCGCTTAAATCCTTCATTATTAGACTATTCACAAAGCCGCCCATGTCTTAATTTCaa < 2:2281363‑M2/140‑1 (MQ=255) tCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGTATCTTTTTCTCTATTGTAATATTCATATTTAAAACGCATATCATTATCGCTTAAATCCTTCATTATTAGACTATTCACAAAGCCGCCCATGTCTTAATTTCaa < 1:2658101‑M2/140‑1 (MQ=255) cAATTTATCCACCTATTTTAGTAAGTTTGTTCTACGTATCTTTTTCTCTATTGTAATATTCATATTTAAAACGCATATCATTATCGCTTAAATCCTTCATTATTAGACTATTCACAAAGCCGCCCATGTCTTAATTTCAAt < 2:2380929/141‑1 (MQ=255) | TACTTGATAACATGGCATGACTAATCCTTGTATATCCTGTCCTGTATTTCATTTTGATCTATCATTTTTATTATTGCTTTCTATTGCACAAAAAATCTGGCTAAAGGTCGCTATGATAGTAACGACTTCAACCAGATTTCAATTTATCCACCTATTTTATTAAGTTTGTTCTACGTATCTTTTTCTCTATTGTAATATTCATATTTAAAACGCATATCATTATCGCTTAAATCCTTCATTATTAGACTATTCACAAAGCCGCCCATGTCTTAATTTCAAT > USA300TCH1516_ALE/2761150‑2761429 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |