New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 705 total aligned reads displayed.
ATTTTTAATTTTGTTAATTCGATTTTATTTGATAATCCTTTTGACTTTTTAGAAAGTTTTATTTATTCATTGGTTTTCACATTAATTTATTTAGGTTTAGAGGGTCATAAAAAGAAGAAGGAATAGGTTGTTTTTTGAAACGAGTGTGAACGAGTTTCTTCTTGTCTTGATACTATATAGAAATAACTCGATTTTATATATATAGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGT > NC_012417/2797‑3077 | atttttaattttGTTAATTCGAATTTATTTGATAATCCTTTTGACTTTTTTGCGATGTTGATGTATTCACTGGTTTTCTGATTAATTTATTTAGGTTTAGAGGGTCATAAAAAGAAGAAGGAATAGGTTGTTTTTTGAAAC < 1:75272‑M1/141‑1 (MQ=255) tttttaattttGTTAATTCGATTTTATTTGATAATCCTTTTGACTTTTTAGAAAGTTTTATTTATTCATTGGTTTTCACATTAATTTATTTAGGTTTAGAGGGTCATAAAAAGAAGAAGGAATAGGTTGTTTTTTGAAACg < 1:244607/141‑1 (MQ=255) tttaattttGTTAATTCGATTTTATTTTATAATCCTTTTGACTTTTTAGAAAGTTTTATTTATTCATTGGTTTTCACATTAATTTATTTAGGTTTAGAGGGTCATAAAAAGAAGAAGGAATAGGTTGTTTTTTGAAACGAg < 2:187946/141‑1 (MQ=255) tttaattttGTTAATTCGATTTTATTTGATAATCCTTTTGACTTTTTAGAAAGTTTTATTTATTCATTGGTTTTCACATTATTTTATTTAGGTTTAGATGGTCATTAAAAGAAGAAGGAATAGGTTGTTTTTTGATACGAg > 2:111808/1‑141 (MQ=255) tttaattttGTTAATTCGATTTTATTTGATAATCCTTTTGACTTTTTAGAAAGTTTTATTTATTCATTGGTTTTCACATTAATTTATTTAGGTTTAGAGGGTCATAAAAAGAAGAAGGAATAGGTTGTTTTTTGAAACGAg > 1:301451/1‑141 (MQ=255) tttaattttGTTAATTCGATTTTATTTGATAATCCTTTTGACTTTTTAGAAAGTTTTATTTATTCATTGGTTTTCACATTAATTTATTTAGGTTTAGAGGGTCATAAAAAGAAGAAGGAATAGGTTGTTTTTTGAAACGAg > 1:174232/1‑141 (MQ=255) ttaattttGTTAATTCGATTTGATTTGATAATCCTTTTGACTTTTTAGAAAGTTTTATTTATTCATTGGTTTTCACATTAATTTATTTAGGTTTAGAGGGTCATAAAAAGAAGAAGGAATAGGTTGTTTTTTGAAACGAgt < 2:204092/141‑1 (MQ=255) ttttGTTAATTCGATTTTATTTGATAATCCTTTTGACTTTTTAGAAAGTTTTATTTATTCATTGGTTTTCACATTAATTTATTTAGGTTTAGAGGGTCATAAAAAGAAGAAGGAATAGGTTGTTTTTTGAAACGAGTGTGa < 2:395333/141‑1 (MQ=255) ttGTTAATTCGATTTTATTTGATAATCCTTTTGACTTTTTAGAAAGTTTTATTTATTCATTGGTTTTCACATTAATTTATTTAGGTTTAGAGGGTCATAAAAAGAAGAAGGAATAGGTTGTTTTTTGAAACGAGTGTGAAc < 1:206138/141‑1 (MQ=255) gTTAATTCGATTTTATTTGATAATCCTTTTGACTTTTTAGAAAGTTTTATTTATTCATTGGTTTTCACATTAATTTATTTAGGTTTAGAGGGTCATAAAAAGAAGAAGTAATAGGTTGTTTTTTGAAACGAGTGTGAACGa > 2:373582/1‑141 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2:26798/141‑1 (MQ=255) gaagGAATAGGTTGTTTTTTGAAACGAGTGTGAACGAGTTTCTTCTTGTCTTGATACTATATAGAAATAACTCGATTTTATATATATAGCTGTAACTGTTGATATTACAGTATTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGaa > 2:333464/1‑141 (MQ=255) aaagGAATAGCTTGTTTTTTGAACCGAGTGTCAACGAGTTTCTTCTTGTCTTGATACTATATAGCAATAACTCGATTTTATATATATAGCTGTAACTGTTGATATTCCAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGaa < 1:78639/140‑1 (MQ=39) aagTAATTGGTTGTTTTTTGAAACGAGTGTGAACGAGTTTCTTCTTGTCTTGATACTATATAGAAATAACTCGATTTTATATATATAGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGaaa < 2:245405/141‑1 (MQ=255) aagGAATAGGTTGTTTTTTGAAACGAGTGTGAACGAGTTTCTTCTTGTCTTGATACTATATAGAAATAACTCGATTTTATATATATAGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGaaa > 1:18299/1‑141 (MQ=255) aTAGGTTGTTTTTTGAAACGAGTGTGAACGAGTTTCTTCTTGTCTTGATACTATATAGAAATAACTCGATTTTATATATATAGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTg < 1:360614/141‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) tttttGAAACGAGTGTGAACGAGTTTCTTCTTGTCTTGATACTATATAGAAATAACTCGATTTTATATATATAGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATaaaa < 2:19459/141‑1 (MQ=255) tttGAAAGGAGTGTGAACGAGTTTGTTCTTGTCTTGATACTATATAGAAATAACTCGATTTTATATATATAGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATaaaata < 2:390048/141‑3 (MQ=255) gttGAAACGAGGGGGAACGAGTTTCTTCTGAGCTTGATAGTATAGAGAAATAACTGGATTTTATATATATAGCTGTAACGGTTGGTATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATaaaaaa < 2:118487/140‑1 (MQ=255) ttGAAACGAGTGTAAACGAGTTTATTTTTGGTTTGATACTATATAGAAATAACTCGATTTTATATATATAGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAAc < 2:100483/141‑1 (MQ=255) tGAAACGAGTGTGAACGAGTTTCTTCTTGTCTTGATACTATATAGAAATAACTCGATTTTATATATATAGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGTGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAAcc > 1:48686/1‑141 (MQ=255) tGAAAAGAGTGTGAATGAGTTTCTTCTTATCTTGATACTATATAGAAATAACTCGATTTTATATATATAGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTATTTTTGTGCTTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAAcc < 2:123081/141‑1 (MQ=255) gAAACGAGTGTGAACGAGTTTCTTCTTGTCTTGATACTATATAGAAATAACTAGATTTTATATATATAGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCTTGAAAGGAAATTTTGACAATAAAAAAccc > 2:262533/1‑141 (MQ=255) aaaaCGAGTGTGAACGAGTTTCTTTTTGTCTTGATACTATATAGAAATAACTCGATTTTATATATATAGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAAccc < 2:173932/140‑1 (MQ=255) aaaCtcgttcacactcgtttcaaaaaacaacctattccttcttctttttatgaccctctaaacctaaataaattaatgtgaaaaccaatgaataaataaaactttctaaaaagtcaaaaggattatcaaataaaatcgaat > 1:22327‑M1/1‑4 (MQ=255) aaaCGAGTGTGAACGAGTTTCTTCTTGTCTTGATACTATATAGAAATAACTCGATTTTATATATATAGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTAACAATAAAAAAcccc > 1:193033/1‑141 (MQ=255) aaCtcgttcacactcgtttcaaaaaacaacctattccttcttctttttatgaccctctaaacctaaataaattaatgtgaaaaccaatgaataaataaaactttctaaaaagtcaaaaggattatcaaataaaatcaaatt > 1:306989‑M1/1‑3 (MQ=255) | ATTTTTAATTTTGTTAATTCGATTTTATTTGATAATCCTTTTGACTTTTTAGAAAGTTTTATTTATTCATTGGTTTTCACATTAATTTATTTAGGTTTAGAGGGTCATAAAAAGAAGAAGGAATAGGTTGTTTTTTGAAACGAGTGTGAACGAGTTTCTTCTTGTCTTGATACTATATAGAAATAACTCGATTTTATATATATAGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGT > NC_012417/2797‑3077 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |