| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_012417 | 2664 = | 702 (1.070) | 4 (0.010) | 4/270 | 50.1 | 0.58% | coding (11/582 nt) | USA300HOU_RS14900 | hypothetical protein |
| ? | NC_012417 | 2715 = | 686 (1.070) | intergenic (‑41/–) | USA300HOU_RS14900/– | hypothetical protein/– | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 708 total aligned reads displayed.
AGTTTCAACGTTTTTATCTGCAATGTTATTTTTGTTTTGGGCTTGAGCTTCTTTGAAATTAAAATCCAAGACCATTGAAAGTATGGTTAAAATACTTAAAGATACTACTAAAATCTTTCTTAGTGATATACTGTTT‑TGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGTTTTTTTACTTTTTGATTATTTTATTATCTGTATTTTTAATTTTTA > NC_012417/2525‑2803 | aGTTTCAATGTTTTTATCTGCAATGTTATTTTTGTTTTGGGCTTGAGGTTTTTTGAAATTAAAATCCAAGACCATTGAAATTATGGTTAAAATACTTAAAGATACTACTAAAATCTTTCTTAGTGATATACTGTTT‑TGaa < 2:33913/140‑1 (MQ=255) ttCAACGTTTTTATCTGCAATGTTATTTTTGTTTTGGGCTTGAGCTTCTTTGAAATTAAAATCCAAGACCATTGAAAGTATGGTTAAAATACTTAAAGATACTACTAAAATCTTTTTTAGTGATATACTATTT‑TGAATTg > 2:238473/1‑140 (MQ=255) ttCAACGTTTTTATCTGCAATGTTATTTTTGTTTTGGGCTTGAGCTTCTTTGAAATTAAAATCCAAGACCATTGAAAGTATGGTTAAAATACTTAAAGATACTACTAAAATCTTTCTTAGTGATATACTGTTT‑TGAATTg < 1:84015/140‑1 (MQ=255) gtCAACGTTGTTATCTGCAATGTTATTTTTGTTTTGGGCTTGAGCTTCTTTGAAATTAAAATCCAAGACCATTGAAAGTATGGTTAAAATACTTAAAGATACTACTAAAATCTTTCTTAGTGATATACTGTTT‑TGAATTg < 1:134264/139‑1 (MQ=255) tCAACGTTTTTATCTGCAATGTTATTTTTGTTTTGGGCTTGAGCTTCTTTGAAATTAAAATCCAAGACCATTGAAAGTATGGTTAAAATACTTAAAGATACTACTAAAATCTTTCTTAGTGATATACTGTTT‑TGAATTGc > 2:212713/1‑140 (MQ=255) aCGTTTTTATCTGCAATGTTATTTTTGTTTTGGGCTTGAGCTTCTTTGAAATTAAAATCCAAGACCATTGAAAGTATGGTTAAAATACTTAAAGATACTACTAAAATCTTTCTTAGTGATATGCTGTTT‑TGAATTGcatt > 1:212516/1‑140 (MQ=255) aCGTTTTTATCTGCAATGTTATTTTTGTCTTGGGCTTTAGCTTCTTTGAAATTAAAATCCAAGACCATTGAAAGTATGGTTAAAATACTTAAAGATACTACTAAAATCTTTCTTAGTGATATACTGTTT‑TGAATTGcatt < 2:221752/140‑1 (MQ=255) tttttATCTGCAATGTTATTTTTGTTTTGGGCTTGAGCTTCTTTGAAATTAAAATCCAAGACCATTGAAAGTATGGTTAAACTACTTAAAGATACTACTAAAATCTTTCTTAGTGATATACTGTTT‑TGAATTGcattcat > 2:11310/1‑140 (MQ=255) ttttATCTGCAATGTTATTTTTGTTTTGGGCTTGAGCTTCTTTGAAATTAAAATCCAAGACCATTGAAAGTATGGTTAAAATACTTAAAGATACTACTAAAATCTTTCTTAGTGATATACTATTT‑TGAATTGcattcatt > 1:55075/1‑140 (MQ=255) tATCTGCAATGTTATTTTTGTTTTGGGCTTGAGCTTCTTTGAAATTAAAATCCAAGACCATTGAAAGTATGGTTAAAATACTTAAAGATACTACTAAAATCTTTCTTAGTGATATACTGTTT‑TGAATTGCATTCATTGTa > 1:117899/1‑140 (MQ=255) tATCTGCAATGTTATTTTTGTTTTGGGCTTGAGCTTCTTTGAAATTAAAATCCAAGACCATTGAAAGTATGGTTAAAATACTTAAAGATACTACTAAAATCTTTCTTAGTGATATACTGTTT‑TGAATTGCATTCATTGTa < 1:58879/140‑1 (MQ=255) tGCAATGTTATTTTTGTTTTGGGCTTGAGCTTCTTTGAAATTAAAATCCAAGACCATTGAAAGTATGGTTAAAATACTTAAAGATACTACTAAAATCTTTCTTAGTGATATACTGTTT‑TGAATTGCATTCATTGTAAATg > 1:137587/1‑140 (MQ=255) gCAATGTTATTTTTGTTTTGGGCTTGAGCTTCTTTGAAATTAAAATCCAAGACCATTGAAAGTATGGTTAAAATACTTAAAGATACTACTAAAATCTTTCTTAGTGATATACTGTTT‑TGAATTGCATTCATTGTAAATGc < 2:168429/140‑1 (MQ=255) aaTGTTATTTTGGTTTTGGGCTTTATCTTCTTTGAAATTAAAATCCAAGACCATTGAAAGTATGGTTAAAATACTTAAAGATACTACTAAAATCTTTCTTAGTGATATACTGTTT‑TGAATTGCATTCATTGTAAATGccc < 2:257561/140‑1 (MQ=255) aTGTTATTTTTGTTTTGGGCTTGAGCTTTTTTGAAATTAAAATCCAAGACCATTGAAAGTATGGTTAAAATACTTAAAGATATTAATAAAATCTTTCTTAGTGATATACTGTTT‑TGAATTCAATTCATTGTAAATGcttc > 2:172012/1‑137 (MQ=255) tGTTATTTTTGTTTTGGGCTTGAGCTTCTTTGAAATTAAAATCCAAGACCATTGAAAGTATGGTTAAAATACTTAAAGATACTACTAAAATCTTTCTTAGTGATATACTGTTT‑TGAATTGCATTCATTGTAAATGccccc < 2:49334/140‑1 (MQ=255) tATTTTTGTTTTGGGCTTGATCTTCTTTGAAATTAAAATACAAGACCATTGAAAGTATGGTTAAAATACTTAAAGATACTACTAAAATCTTTCTTAGTGATATACTGTTT‑TGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCttg < 1:27999/140‑1 (MQ=255) tATTTTTGTTTTGGGCTTGAGCTTCTTTGAAATTAAAATCCAAGACCATTGAAAGTATGGTTAAAATACTTAAAGATACTACTAAAATCTTTCTTAGTGATATACTGTTT‑TGAATTGCATTCATTGTAAATGCCTCCttg > 2:265991/1‑140 (MQ=255) aTTTTTGTTTTGGGCTTGAGCTTCTTTGAAATTAAAATCCAAGACCATTGAAAGTATGGTTAAAATACTTAAAGATACTACTAAAATCTTTCTTAGTGATATACTGTTT‑TGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCttgt > 1:188214/1‑140 (MQ=255) ttttgttttgGGCTTGAGCTTCTTTGAAATTAAAATCCAAGACCATTGAAAGTATGGTTAAAATACTTAAAGATACTACTAAAATCTTTCTTAGTGATATACTGTTT‑TGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCttgttt > 1:222507/1‑140 (MQ=255) ttgttttgGGCTTGAGCTTCTTTGAAATTAAAATCCAAGACCATTGAAAGTATGGTTAAAATACTTAAAGATACTACTAAAATCTTTCTTAGTGATATACTGTTT‑TGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCttgttttg < 1:10694/140‑1 (MQ=255) gttttgGGCTTGAGCTTCTTTGAAATTAAAATCCAAGACCATTGAAAGTATGGTTAAAATACTTAAAGATACTACTAAAATCTTTCTTAGTGATATACTGTTT‑TGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCttgttttgtt > 2:201768/1‑140 (MQ=255) ttttgTTCTTGAGCTTCTTTGAAATTAAAATCCAAGACTATTCAAAGTATTGTTAAAATACTTAACGATACTACTAAAATCTTTCTTAGTGATATCCTATTT‑TGAATTTCATTCATTTTAAATTCCCCCTTGTTTTTTTa > 2:39424/1‑140 (MQ=255) tttgTGCTTGAGCTTCTTTGAAATTAAAATCCAAGACCATTGAAAGTATGGTTAAAATACTTAAAGATACTACTAAAATCTTACCGTGTTATAGACTGTTT‑TGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTAt < 1:102408/140‑1 (MQ=255) gggCTTGAGCTTCTTTGAAATTAAAATCCAAGACCATTGAAAGTATGGTTAAAATACTTAAAGATACTACTAAAATCTTTCTTAGTGATATACTGTTT‑TGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTa < 1:185154/140‑1 (MQ=255) gCTTGAGCTTCTTTGAAATTAAAATCCAAGACCATTGAAAGTATGGTTAAAATACTTAAAGATACTACTAAAATCTTTCTTAGTGATATACTGTTT‑TGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCTTTGTTTTGTTATTTaaa > 2:177075/1‑140 (MQ=255) gCTTGAGCTTCTTTGAAATTAAAATCCAAGACCATTGAAAGTATGGTTAAAATACTTAAAGATACTACTAAAATCTTTCTTAGTGATATACTGTTT‑TGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTaaa > 1:93013/1‑140 (MQ=255) ttGAGCTTCTTTGAAATTAAAATCCAAGACCATTGAAAGTATGGTTAAAATACTTAAAGATACTACTAAAATCTTTCTTAGTGATATACTGTTT‑TGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTGtttggttt > 1:192256/1‑135 (MQ=255) cttcttTGAAATTAAAATCCAAGACCATTGAAAGTATGGTTAAAATACTTAAAGATACTACTAAAATCTTTCTTAGTGATATACTGTTT‑TGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTc < 2:152482/140‑1 (MQ=255) ttcttTGAAATTAAAATCCAAGACCATTGAAAGTATGGTTAAAATACTTAAAGATACTACTAAAATCTTTCTTAGTGATATACTGTTT‑TGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCa < 1:81433/140‑1 (MQ=255) tcttTGAAATTAAAATCCAAGACCATTGAAAGTATGGTTAAAATACTTAAAGATACTACTAAAATCTTTCTTAGTGATATACTGTTT‑TGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTaaa > 1:1812/1‑140 (MQ=255) tcttTGAAATTAAAATCCAAGACCATTGAAAGTATGGTTAAAATACTTAAAGATACTACTAAAATCTTTCTTAGTGATATACTGTTT‑TGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCaa > 1:235052/1‑140 (MQ=255) tcttTGAAATTAAAATCCAAGACCATTGAAAGTATGGTTAAAATACTTAAAGATACTACTAAAATCTTTCTTAGTGATATACTGTTT‑TGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCaa > 1:243600/1‑140 (MQ=255) tttGAAATTAAAATCCAAGACCATTGAAAGTATGGTTAAAATACTTAAAGATACTACTAAAATCTTTCTTAGTGATATACTGTTT‑TGAATTGCATTCATTGTAAATGACCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCaata > 1:65396/1‑140 (MQ=255) tttaaaTTAAAATCCAATACCATTTAAATTATAGTTAAAATACTTAAAGATACTACTAAAATCTTTCTTAGTGATATACTGTTT‑TGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCaatat < 1:168299/137‑1 (MQ=255) gAAATTAAAATCCAAGACCATTGAAAGTATGGTTAAAATACTTAAAGATACTACTAAAATCTTTCTTAGTGATATACTGTTT‑TGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCaatataa < 2:251831/140‑1 (MQ=255) gAAATTAAAATCCAAGACCATTGAAAGTATGGTTAAAATACTTAAAGATACTACTAAAATCTTTCTTAGTGATATACTGTTT‑TGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCaatataa > 1:254408/1‑140 (MQ=255) gAAATTAAAATCCAAGACCATTGAAAGTATGGTTAAAATACTTAAAGATACTACTAAAATCTTTCTTAGTGATATACTGTTT‑TGAATTGAATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCaatataa > 2:36917/1‑140 (MQ=255) aaTTAAAATCCAAGACCATTGAAAGTATGGTTAAAATACTTAAAGATACTACTAAAATATTTCTTAGTGATATACTGTTT‑TGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCaatataata > 1:16045/1‑140 (MQ=255) aaaaTCCAAGACCATTGAAAGTATGGTTAAAATACTTAAAGATACTACTAAAATCTTTCTTAGTGATATACTGTTT‑TGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTaa > 2:54392/1‑140 (MQ=255) aaaaTCCAAGACCATTGAAAGTATGGTTAAAATACTTAAAGATACTAATAAAATCTTTCTTAGTGATATACTGTTT‑TGAATTGCATTGATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTTAATTTGATATTaa > 1:45209/1‑140 (MQ=255) aaaTCCAAGACCATTGAAAGTATGGTTAAAATACTTAAAGATACTACTAAAATCTTTCTTAGTGATATACTGTTT‑TGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAAc < 1:40602/140‑1 (MQ=255) ccAAGACCATTGAAAGTATGGTTAAAATACTTAAAGATACTACTAAAATCTTTCTTAGTGATATACTGTTT‑TGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACatat > 1:144220/1‑140 (MQ=255) ccAAGACCATTGAAAGTATGGTTAAAATACTTAAAGATACTACTAAAATCTTTCTTAGTGATATACTGTTT‑TGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACatat < 1:77894/140‑1 (MQ=255) cagagtgcATTGAAAGTATGGTTAAAATACTTAAAGATACTACTAAAATCTTTCTTAGTGATATACTGTTT‑TGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACatat < 2:12200/133‑1 (MQ=255) caaaGACCATTGGAAGTATGTTTAAAATAATTAAAGATACTACTAAAATCTTTCTTAGTGATATACTGTTT‑TGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACatat < 2:62168/138‑1 (MQ=255) aaGACCATTGAAAGTATGGTTAAAATACTTAAAGATACTACTAAAATCTTTCTTAGTGATATACTGTTT‑TGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATaa < 2:75153/140‑1 (MQ=255) aaGACCATTGAAAGTATGGTTAAAATACTTAAAGATACTACTAAAATCTTTCTTAGTGATATACTGTTT‑TGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATaa > 1:23881/1‑140 (MQ=255) aaGACCATTGAAAGTATGGTTAAAATACTTAAAGATACTACTAAAATCTTTCTTAGTGATATACTGTTT‑TGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTATTATTATAGTGAATTCAATATAATATTAACATATaa > 2:243754/1‑140 (MQ=255) aGACCATTGAAAGTATGGTTAAAATACTTAAAGATACTACTAAAATCTTTCTTAGTGATATACTGTTT‑TGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATaaa < 1:66814/140‑1 (MQ=255) aCCATTGAAAGTATGGTTAAAATACTTAAAGATACTACTAAAATCTTTCTTAGTGAGATACTGTTT‑TGAATTGCATTCAGTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATaaaaa < 2:146299/140‑1 (MQ=255) aCCATTGAAAGTATGGTTAAAATACTTAAAGATACTACTAAAATCTTGCTTAGTGATATACTGTTT‑TGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATaaaaa < 1:127845/140‑1 (MQ=255) gcagtggaaGTATGTTTAAAATACTTAAAGATAATATTAAAATCTTTCTTATTGATATACTGTTT‑TGAATTTCAATTATTGTAAATACTCCATTCTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAAc < 2:182216/133‑1 (MQ=255) ccATTGAAAGTATGGTTAAAATACTTAAAGATACTACTAAAATCTTTCTTAGTGATATACTGTTT‑TGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAAc > 2:128208/1‑140 (MQ=255) cATTGAAAGTATGGTTAAAATACTTAAAGATACTACTAAAATCTTTCTTAGTGATATACTGTTT‑TGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCACTATAATATTAACATATAAAAACa > 1:220865/1‑140 (MQ=255) cATTGAAAGTATGGTTAAAATACTTAAAGATACTACTAAAATCTTTCTTAGTGATATACTGTTT‑TGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACa < 1:26021/140‑1 (MQ=255) cATTGAAAGTATGGTTAAAATACTTAAAGATACTACTAAAATCTTTCTTAGTGATATACTGTTT‑TGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACa < 2:89485/140‑1 (MQ=255) tGAAAGTATGGTTAAAATACTTAAAGATACTACTAAAATCTTTCTTAGTGATATACTGTTT‑TGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAg < 1:36268/140‑1 (MQ=255) gAAAGTATGGTTAAAATACTTAAAGATACTACTAAAATCTTTCTTAGTGATATAAAAATCAAGAAAT‑TGTGCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAgg < 1:62149/140‑1 (MQ=255) gTATGGTTAACATACTTAAAGATACTACTAAAATCTTTCTTAGTGATATACTGTTT‑TGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGtt < 2:71668/140‑1 (MQ=255) gTATGGTTAAAATACTTAAAGATACTACTAAAATCTTTCTTAGTGATATACTGTTT‑TGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGCATTCAATATAATATTAACATATACAAACAAACTAGtt > 2:58028/1‑140 (MQ=255) tATGGTTAAAATACTTAAAGATACTACTAAAATCTTTCTTAGTGATATACTGTTT‑TGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGttt < 1:199930/140‑1 (MQ=255) tGGTTAAAATACTTAAAGATACTACTAAAATCTTTCTTAGTGATATACTGTTT‑TGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTaa > 2:80557/1‑140 (MQ=255) gTTACAATACTTAAAGCTACTACTAAAATCTTTCTTAGTGATATACTGTTT‑TGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAata < 1:100111/140‑1 (MQ=255) tAAAATACTTAAAGATACTACTAAAATCTTTCTTAGTGATATACTGTTT‑TGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCACTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATg < 2:44634/140‑1 (MQ=255) aaaaTACTTAAAGATACTACTAAAATCTTTCTTAGTGATATACTGTTT‑TGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGa < 1:112755/140‑1 (MQ=255) aaaTACTTAAAGATACTACTAAAATCTTTCTTAGTGATATACTGTTT‑TGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGaa > 2:29301/1‑140 (MQ=255) aTACTTAAAGATACTACTAAAATCTTTCTTAGTGATATACTGTTT‑TGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATa > 2:138388/1‑140 (MQ=255) tACTTAAAGATACTACTAAAATCTTTCTTAGTGATATACTGTTT‑TGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATaa < 1:208359/140‑1 (MQ=255) cTTAAAGATACTACTAAAATCTTTCTTAGTGATATACTGTTT‑TGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGt > 1:139713/1‑140 (MQ=255) cTTAAAGATACTACTAAAATCTTTCTTAGTGATATACTGTTT‑TGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGt > 2:136842/1‑140 (MQ=255) cTTAAAGATACTACTAAAATCTTTCTTAGTGATATACTGTTT‑TGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGt > 2:117974/1‑140 (MQ=255) cTTAAAGATACTACTAAAATCTTTCTTAGTGATATACTGTTT‑TGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGt > 2:110737/1‑140 (MQ=255) cTTAAAGATACTACTAAAATCTTTCTTAGTGATATACTGTTT‑TGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGt > 1:247241/1‑140 (MQ=255) ttAAAGATACTACTAAAATCTTTCTTAGTGATATACTGTTT‑TGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAAGAAAGGTGTTTAATATGAATATGtt > 1:107933/1‑140 (MQ=255) ttAAAGATACTACTAAAATCTTTCTTAGTGATATACTGTTT‑TGAATTGAATTCCTTGTAAATGCTCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGtt < 1:194309/140‑1 (MQ=255) actactAAAATCTTTCTTAGTGATATACTGTTT‑TGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGTAGTTTCAAATGAACAGGTTTTTTTCCt > 2:93377/1‑140 (MQ=255) tactaAAATCTTTCTTAGTGATATTCTGTTT‑TGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGTTTTTTTACttt < 1:15543/140‑1 (MQ=255) tactaAAATCTTTCTTAGTGATATACTGTTT‑TGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGTTTTTTTACttt < 2:205648/140‑1 (MQ=255) aaaTCTTTCTTAGTGATATACTGTTT‑TGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGTTTTTTTACTTTTTgtt > 2:193696/1‑138 (MQ=255) aaaTCTTTCTTAGTGATATACTGTTA‑TGAATTGCATTCATTGTACATGCACCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGTTTTTTTACTTTTTGat > 2:107282/1‑140 (MQ=255) aaTGTTTTTTAGTTATATATTTTTT‑TGAATTGCATTAATTGTAAATGCCTCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGTTTTTTTACTTTTTGatt < 2:157635/140‑1 (MQ=255) ctttcttAGTGATATACTGTTT‑TGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTTTTTTTTTTTTTAATTCAATATAATCTTAACATATAAAATTAAAGTAGTTTAATATTAATAATTTTTTTTTCTTTTTTtttatt > 2:101630/1‑140 (MQ=255) tcttAGTGATATACGGTTT‑TGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGTTTTTTTACTTTTTAAatctttta > 2:163789/1‑140 (MQ=255) ttAGTGATATACTGTTT‑TGAATTGAATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTAAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGTTTTTTTACTTTTTATttattttatt > 2:18751/1‑140 (MQ=255) tAGTGATATACTGTTT‑TGAATTGTATTTATTGTAAATGTCTCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGTTTTTTTACTTTTTGATTATTttatta < 1:17561/140‑1 (MQ=255) tAGTGATATACTGTTT‑TGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGTTTTTTTACTTTTTGATTATTttatta > 1:20603/1‑140 (MQ=255) tatgtattGTTT‑TGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCTCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATTCCACCATTCTTGTTTAATATGAATAAGTTTTTTTACTTTTTGATTATTTTATTATCTg < 1:50939/133‑1 (MQ=255) ataCTGTTT‑TGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGTTTTTTTACTTTTTGATTATTTTATTATCTGTat > 1:217777/1‑140 (MQ=255) ataCTGTTT‑TGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGTTTTTTTACTTTTTGATTATTTTATTATCTGTat < 2:227824/140‑1 (MQ=255) cTGTTT‑TGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGTTTTTTTACTTTTTGATTATTTTATTATCTGTctttt > 1:86963/1‑140 (MQ=255) ttttt‑tGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGTTTTTTTACTTTTTGATTATTTTATTATCTGTattttt < 1:229789/138‑1 (MQ=255) tGTTT‑TGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGTTTTTTTACTTTTTGCTTATTTTATTatctttatcttt > 2:64792/1‑140 (MQ=255) tGTTT‑TGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGTTTTTTTACTTTTTGATAATTTTATTATCTACattttt > 2:13315/1‑140 (MQ=255) gTTT‑TGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATAATAACACCTTATAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGTTTTTTTACTTTTTGATTATTTTATTATCTGTattttta > 1:264853/1‑140 (MQ=255) t‑tGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGTTTTTTTAATTTCTGCCGACTGGATGATCTGTatttttaatt < 2:83937/140‑1 (MQ=255) gAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGTTTTTTTACTTTTTGATTATTTTATTATCTGTatttttaatttt > 1:73683/1‑140 (MQ=255) aaTTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGTTTTTTTACTTTTTGATTATTTTATTATCTGTatttttaattttt > 1:165123/1‑140 (MQ=255) aTTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGTTTTTTTACTTTTTGATTATTTTATTATCTGTatttttaattttta > 2:14978/1‑140 (MQ=255) aTTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGTTTTTTTACTTTTTGATTATTTTATTATCTGTatttttaattttta > 1:226680/1‑140 (MQ=255) | AGTTTCAACGTTTTTATCTGCAATGTTATTTTTGTTTTGGGCTTGAGCTTCTTTGAAATTAAAATCCAAGACCATTGAAAGTATGGTTAAAATACTTAAAGATACTACTAAAATCTTTCTTAGTGATATACTGTTT‑TGAATTGCATTCATTGTAAATGCCCCCTTGTTTTGTTATTTAAATGAATTCAATATAATATTAACATATAAAAACAAAGGAGTTTAATATGAATAAGTTTTTTTACTTTTTGATTATTTTATTATCTGTATTTTTAATTTTTA > NC_012417/2525‑2803 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |