| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_012417 | 2464 = | 671 (1.020) | 4 (0.010) | 3/262 | 50.5 | 0.64% | coding (211/582 nt) | USA300HOU_RS14900 | hypothetical protein |
| ? | NC_012417 | 2498 = | 603 (0.970) | coding (177/582 nt) | USA300HOU_RS14900 | hypothetical protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 688 total aligned reads displayed.
TTTTATTCTCTATGTCGTTTTTTAGTTTTTGGAATCCTTCAGGAACATATCCATATCGAGATTTGGCATTTTCTAGATTAACATCTTTAGCTGTTCCGTCTTTATCTAAAATAATAATTTTGCCATATATGTATTTTAGTTCTTTTTCAATTTCTTTTTCGTTTAAAGTTTCAACGTTTTTATCTGCAATGTTATTTTTGTTTTGGGCTTGAGCTTCTTTGAAATTAAAATCCAAGACCATTGAAAGTATGGTTAAAATACTTAAAGATACTACTAAAA > NC_012417/2359‑2637 | ttATTCTCTATGTCGTTTTTTAGTTTTTGGAATCCTTCAGGAACATATCCATATCGAGATTTGTCATTTTCTAGATTAACATCTTTAGCTGTTCCGTCTTTATCTAAAATAATAATTTTGCCATATATGTATTTTAGTTc > 1:140488/1‑140 (MQ=255) ttATTCTCTATGTCGTTTTTTAGTTTTTGGAATCCTGCAGGAACATATCCATATCGAGATTTGGCATTTTCTAGATTAACATCTTTAGCTGTTCCGTCTTTATCTAAAATAATAATTTTGCCATATATGTATTTTAGTTc < 1:95559/140‑1 (MQ=255) ttCTCTATGTCGTTTTTTAGTTTTTGGAATCCTTCAGGAACATATCCATATCGAGATTTGGCATTTTCTAGATTAACATCTTTAGCTGTTCCGTCTTTATCTTAAATAATAATTTTGCCATATATGTATTTTATTTCttt > 2:60021/1‑140 (MQ=255) tctcTATGTCGTTTTTTAGTTTTTGGAATCCTTCAGGAACATATCCATATCGAGATTTGGCATTTTCTAGATTAACATCTTTAGCTGTTTCGTCTTTATCTAAAATAATAATTTTGCCATATATTTATTTTAGTTCtttt > 2:166873/1‑140 (MQ=255) tctcTATGTCGTTTTTTAGTTTTTGGAATCCTTCAGGAACATATCCATATCGAGATTTGGCATTTTCTAGATTAACATCTTTAGCTGTTCCGTCTTTATCTAAAATAATAATTTTGCCATATATGTATTTTAGTTCtttt < 1:109692/140‑1 (MQ=255) tctATGTCGTTTTTTAGTTTTTGGAATCCTTCAGGAACATATCCATATCGAGATTTGGCATTTTCTAGATTAACATCTTTAGCTGTTCCGTCTTTATCTAAAATAATAATTTTGCCATATATGTATTTtttttctttttc > 2:199371/1‑140 (MQ=255) tctATGTCGTTTTTTAGTTTTTGGAATCCTTCAGGAACATATCCATATCGAGATTTGGCATTTTCTAGATTAACATCTTTAGCTGTTCCGTCTTTATCTAAAATAATAATTTTGCCATATATGTATTTTAGTTCTTTTTc > 1:213587/1‑140 (MQ=255) ttATGTCGTTTTTTAGTTTTTGGAATCCTTCATGAACATATCCATATCGAGATTTGGCATTTTCTAGATTAACATCTTTAGCTGTTCCGTCTTTATCTAAAATAATAATTTTGCCTTATATCTATTTTACTTTTTTTTCa > 2:146783/2‑140 (MQ=255) ctATGTCGTTTTTTAGTTTTTGGTATGCTTCAGGAACATATCCATATCGAGATTTGGCATTTTCTAGATTAACATCTTTAGCTGTTCCGTCTTTATTTAAAATAATAATTTTGCCATATATGTATTTTAGTTCTTTTTCa < 2:124107/140‑1 (MQ=255) ctATGTCGTTTTTTAGTTTTTGGATTCCTTCAGTAACATATCCATATCGAGATTTGTCATTTTCTAGATTAACTTCTTTAGCTGTTTCTTTTTTTTCTAACATACTACTTTTCTCATCTATCTATTCTCTttttttttac > 2:50939/1‑138 (MQ=255) ctATGTCGTTTTTTAGTTTTTGGAATCCTTCAGGAACATATCCATATCAAGATTTGGCATTTTCTAGATTAACATCTTTAGCTGTTCCGTCTTTATCTAAAATAATAATTTTGCTATATATTTATTTTATTTCTTTTTCa > 2:111617/1‑140 (MQ=255) aTGTCGTTTTTTAGTTTTTGGAATCCTTCAGGAACATATCCATATCGAGATTTGGCATTTTCTAGATTAACATCTTTAGCTGTTCCGTCTTTATCTAAAATAATAATTTTGCCATATATGTATTTTAGTTCTTTTTCAAt < 1:217736/140‑1 (MQ=255) tCGTTTTTTAGTTTTTGGAATCCTTCAGGAACATATCCATATCGAGATTTGGCATTTTCTAGATTAACATCTTTAGCTGTTCCGTCTTTATCTAAAATAATAATTTTGCCATATATGTATTTTAGTTCTTTTTCAATTTc > 1:181809/1‑140 (MQ=255) tCGTTTTTTAGTTTTTGGAATCCTTCAGGAACATATCCATATCGAGATTTGGCATTTTCTAGATTAACATCTTTAGCTGTTCCGTCTTTATCTAAAATAATAATTTTGCCATATATGTATTTTAGTTCTTTTTCAATTTc > 1:227824/1‑140 (MQ=255) cGTTTTTTAGTTTTTGGAATCCTTCAGGAACATATCCATATCGAGATTTGGCATTTTCTAGATTAACATCTTTAGCTGTTCCGTCTTTATCTAAAATAATAATTTTGCCATATATGTATTTTAGTTCTTTTTCCCTTTCt > 1:71489/1‑140 (MQ=255) cGTTTTTTAGTTTTTGGAATCCTTCAGGAACATATACATATCGAAATTTGGCATTTTCTAGATTAACCTCTTTAGCTGTTCCGTCTTTATCTAAAATAATAATTTTGCAGTATCTGTATTTTAGTTCTTTTTAAAttttt > 1:123444/1‑138 (MQ=255) gTTTTTTAGTTTTTTGAATCCTTGAGGAACATATCCATATCGAGATTTGGCAATTTCTAGATTAACATCTTTAGCTGTTCCGTCTTTATCTAAAATAATAATTTTGCCATATATGTATTTTAGTTCTTTTTCAATTTCtt < 1:46749/140‑1 (MQ=255) ttttAGTTTTTGGAATCCTTCAGGAACATATCCATATCGAGATTTGGCATTTTCTAGATTAACATCTTTAGCTGTTCCGTCTTTATCTAAAATAATAATTTTTCAATATATGTATTTTAGTTCTTTTTCAATTTCttttt > 2:217984/1‑140 (MQ=255) tttAGTTTTTGGAATCCTTCAGGAACATATCCATATCGTGATTTGGCATTTTCTAGATTAACATCTTTAGCTGTTCCGTCTTTATCTAAAATAATAATTTTGCCATATATGTATTTTAGTTCTTTTTCAATTTCTTTTTc > 2:255696/1‑140 (MQ=255) tttAGTTTTTGGAATCCTTCAGGAACATATCCATATCGAGATTTGGCATTTTCTAGATTAACATCTTTAGCTGTTCCGTCTTTATCTAAAATAATAATTTTGCCATATATGTATTTTAGTTCTTTTTCAATTTCTTTTTc > 2:72715/1‑140 (MQ=255) ttAGTTTTTGGAATCCTTCAGGAACATATCCATATCGAGATTTGGCGTTTTCTAGATTAACATCTTTAGCTGTTCCGTCTTTATCTAAAATAATAAATTTACCATATATGTGTTTTAGTTCTTTTTCACTTTCTTTTTCg > 1:82198/1‑140 (MQ=255) ttAGTTTTTGGAATCCTTCAGGAACATATCCATATCGAGATTTGGCATTTTCTAGATTAACATCTTTAGCTGTTCCGGCTTTATCTAAAATAATGATTTTGCCATATATGTATTTTAGTTCTTTTTCAATTTCTTTTTCg > 1:153428/1‑140 (MQ=255) tAGTTTTTGGAATCCTTCAGGAACATATCCATATCGAGCTTTGGCATTTTCTAGATTAACATCTTTAGTTGTACCGCCCATATCTATGGTAAAAAATGTGCCATATATGTATTTTAGTTCTTTTTCAATTTCTTTTTCGt > 1:237478/1‑140 (MQ=255) tAGTTTTTGGAATCCTTCAGGAACATATCCATATCGAGATTTGGCATTTTCTAGATTAACATCTTTAGCTGTTCCGTCTTTATCTAAAATAATAATTTTGCCATATATGTATTTTAGTTCTTTTTCAATTTCTTTTTCGt < 2:171057/140‑1 (MQ=255) aGTTTTTGGAATCCTTCAGGAACATATCCATATCGAGATTTGGCATTTTCTAGATTAACATCTTTAGCTGTTCCGTCTTTATCTCAAATAATAATTTTGCCATATATGTATTTTAGTTCTTTTTAATTTTCTTTTTCGtt > 1:25280/1‑140 (MQ=255) tGGAATCCTTCAGGAACATATCCATATCGAGATTTGGCATTTTCTAGATTAACATCTTTAGCTGTTCCGTCTTTATCTAAAATAATAATTTTGCCATATATGTATTTTAGTTCTTTTTCAATTTCTTTTTCGTTTAAAGt < 1:3565/140‑1 (MQ=255) ttCAGGAACATATCCATATCGAGATTTGGCATTTTCTAGATTAACATCTTTAGCTGTTCCGTCTTTATCTAAAATAATAATTTTGCCATATATGTATTTTAGTTCTTTTTCAATTTCTTTTTCGTTTATATTTTTAATGt > 2:262419/1‑140 (MQ=255) ttCAGGAACATATCCATATCGAGATTTGGCATTTTCTAGATTAACATCTTTAGCTGTTCCGTCTTTATCTAAAATAATAATTTTGCCATATATGTATTTTAGTTCTTTTTCAATTTCTTTTTCGTTTAAAGTTTCAACGt < 1:114315/140‑1 (MQ=255) cAGGAACATATCCATATCGAGATTTGGCATTTTCTAGATTAACATCTTTAGCTGTTCCGTCTTTATCTAAAATAATAATTTTGCCATATATGTATTTTAGTTCTTTTTAAATTTCTTTTTCTTTTAAATTTTTAA‑Gtttt > 2:65491/1‑140 (MQ=255) ggAACATATCCATATCGAGATTTGGCATTTTCTAGATTAACATCTTTAGCTGTTCCGTCTTTATCTAAAATAATAATTTTGCCATATATGTATTTTAGTTCTTTTTCAATTTCTTTTTCGTTTAAAGTTTCAACGttttt < 1:190267/140‑1 (MQ=255) catatccatatcGAGATTTGGCATTTTCTAGATTAACATCTTTAGCTGTTCCGTCTTTATCTAAAATAATAATTTTGCCATATATGTATTTTAGTTCTTTTTCAATTTCTTTTTCGTTTAAAGTTTTAACGTTTTTATCt > 1:76268/1‑140 (MQ=255) atatccatatcGAGATTTGGCATTTTCTAGATTAACATCTTTAGCTGTTCCGTCTTTATCTAAAATAATAATTTTGCCATATATGTATTTTAGTTCTTTTTCAATTTCTTTTTCGTTTAAAGTTTCAACGTTTTTATCTg > 2:153203/1‑140 (MQ=255) tccatatcGAGATTTGGCATTTTCTAGATTAACATCTTTAGCTGTTCCGTCTTTATCTAAAATAATAATTTTGCCATATATGTATTTTAGTTCTTTTTCAATTTCTTTTTCGTTTAAAGTTTTAACGTTTTTATCTTCaa > 2:46717/1‑140 (MQ=255) tccatatcGAGATTTGGCATTTTCTAGATTAACATCTTTAGCTGTTCCGTCTTTATCTAAAATAATAATTTTGCCATATATGTATTTTAGTTCTTTTTCAATTTCTTTTTCGTTTAAAGTTTCAACGTTTTTATCTGCaa > 2:136581/1‑140 (MQ=255) tatcGAGATTTGGCATTTTCTAGATTAACATCTTTAGCTGTTCCTTCTTTATCTAAAATAATAATTTTGCCATATATGTATTTTAGTTCTTTTTCAATTTCTTTTTCGTTTAAAGTTTCAACGTTTTTATCTGCAATGtt < 2:102938/140‑1 (MQ=255) tatcGAGATTTGGCATTTTCTAGATTAACATCTTTAGCTGTTCCGTCTTTATCTAAAATAATAATTTTGCCATATATGTATTTTAGTTCTTTTTCAATTTCTTTTTCGTTTAAAGTTTCAACGTTTTTATCTGCAATGtt < 1:6387/140‑1 (MQ=255) tcGAGATTTGGCATTTTCTAGATTAACATCTTTAGCTGTTCCGTCTTTATCTAAAATAATAATTTTGCCATATATGTATTTTAGTTCTTTTTCAATTTCTTTTTCGTTTAAAGTTTCAACGTTTTTATCTGCAATGTTAt < 2:27765/140‑1 (MQ=255) cGAGATTTGGCATTTTCTAGATTAACATCTTTAGCTGTTCCGTCTTTATCTAAAATAATAATTTTGCCATATATGTATTTTAGTTCTTTTTCAATTTCTTTTTCTTTTAAAGTTTCAACGTTTTTATCTGCAATGTTAtt < 1:39432/140‑1 (MQ=255) gagaTTTGGCATTTTCTAGATTAACATTTTTAGCTGTTCCGTCTTTATCTAAAATAATAATTTTGCCATATATGTATTTTAGTCCTTTTTCAATTTCTTTTTCGTTTAAAGTTTCAACGTTTTTATCTGCAATGTTAttt < 1:135363/140‑1 (MQ=255) gagaTTTGGCATTTTCTAGATTAACATCTTTAGCTGTTCCGTCTTTATCTAAAATAATAATTTTGCCATATATGTATTTTAGTTCTTTTTCAATTTCTTTTTCGTTTAAAGTTTCAACGTTTTTATCTGCAATGTTCttt > 1:260314/1‑140 (MQ=255) agaTTTGGCATTTTCTAGATTAACATCTTTAGCTGTTCCGTCTTTATCTAAAATAATAATTTTGCCATATATGTATTTTAGTTCTTTTTCAATTTCTTTTTCGTTTAAAGTTTCAACGTTTTTATCTGCAATGTTAtttt > 1:27064/1‑140 (MQ=255) tttGGCATTTTCTAGATTAACATCTTTAGCTGTTCCGTCTTTATCTAAAATAATAATTTTGCCATATATGTATTTTAGTTCTTTTTTAATTTCTTTTTCGTTTAAAGTATCTCCGGTGTTATCTGCAATGTTATttttgt > 2:106477/1‑140 (MQ=255) tttGGCATTTTCTAGATTAACATCTTTAGCTGTTCCGTCTTTATCTAAAATAATAATTTTGCCATATATGTATTGTAGTTCTTTTTCAATTTCTTTTTCGTTTAAAGTTTCAACGTTTTTATCTGCAATGCTATttttgt < 1:156019/140‑1 (MQ=255) ttGGCATTTTCTAGATTAACATCTTTAGCTGTTCCGTCTTTATCTAAAATAATAATTTTGCCATATATGTATTTTAGTTCTTTTTCAATTTCTTTTTCGTTTAAAGTTTCAACGTTTTTATCTGCAATGTTAtttttttt > 2:560/1‑140 (MQ=255) ttgtaTTTTCTAGATTAACATCTTTAGCTGTTCCGTCTTTATATAAAATAATAATTTTGCCATATATGTATTTTAGTGCTTTTTCAATTTCTTTTTCGTTTAAAGTTTCAACGTTTTTATCTGCAATGTTATttttgttt < 1:207425/136‑1 (MQ=255) tgtcATTTTCTAGATTAATATCTTTAGCTGTTCCGTCTTTATCTAAAATAATAATTTTGCCATATATGTATTTTAGTTCTTTTTCAATTTCTTTTTCGTTTAAAGTTTCAACGTTTTTATCTGCAATGTTATttttgttt < 2:21314/137‑1 (MQ=255) tGGCATTTTCTAGATTAACATCTTTAGCTGTTCCGTCTTTATCTAAAATAATAATTTTGCCATATATGTATTTTATTTCCTTTTCAATTTCTTTTTCGTTTAAAGTTTCAACGTCTTTATCTTCAATGTTATtttttttt > 2:222027/1‑140 (MQ=255) tGGCATTTTCTAGATTAACATCTTTAGCTGTTCCGTCTTTATCTAAAATAATAATTTTGCCATATATGTATTTTAGTTCTTTTTCAATTTCTTTTTCGTTTAAAGTTTCAACGTTTTTATCTGCAATGTTATttttgttt < 2:190450/140‑1 (MQ=255) ggCATTTTCTAGATTAACATCTTTATCTGTTCCGTCTTTATCTAAAATATTAATTTTGCCATATATGTATTTTAGTTCTTTTTCAATTTCTTTTTCTTTTAAATTTTCAATCTTTTTATCTTCAATTTTAtttttttttt > 2:31737/1‑140 (MQ=255) ggCATTTTCTAGATTAACATCTTTAGCTGTTCCGTCTTTATCTAAAATAATAATTTTGCCATATATGTATTTTAGTTCTTTTTCAATTTCTTTTTCGTTTAAAGTTTCAACGTTTTTATCTGCAATTTTATttttgtttt > 1:205846/1‑140 (MQ=255) ggCATTTTCTAGATTAACATCTTTAGCTGTTCCGTCTTTATCTAAAATAATAATTTTGCCATATATGTATTTTAGTTCTTTTTCAATTTCTTTTTCGTTTAAAGTTTCAACGTTTTTATCTGCAATGTTATttttgtttt > 2:209198/1‑140 (MQ=255) ggCATTTTCTAGATTAACATCTTTAGCTGTTCCGTCTTTATCTAAAATAATAATTTTGCCATATATGTATTTTAGTTCTTTTTCAATTTCTTTTTCGTTTAAAGTTTCAACGTTTTTATCTGCAATGTTATttttgtttt < 1:169475/140‑1 (MQ=255) ttttATAGATTAACATCTTTAGCTGTTCCGTGTTTATCTAAAATAATAATTTTTGCATATATGTATTTTAGTTCTTTTTCAATTTCTTTTTCGTTTAAATTTTCAACGTTTTTATCTGCAATTTTATTTTTGTTTTGTGc < 2:131414/140‑1 (MQ=255) tttCTAGATTAACATCTTTAGCTGTTCCGTCTTTATCTAAAATAATAATTTTGCCATATATGTATTTTAGTTCTTTTTCAATTTCTTTTTCGTTTAAAGTTTCAACGTTTTTATCTGCAATGTTATTTTTGTTTTGGGCt < 2:175470/140‑1 (MQ=255) gcgaGATTAACATCTGCAGCTGTTCCGTCTTTATCTAAAATAATAATTTTGCCATATATGTATTTTAGTTACTTAACGATTGCGTTTTCGTTTAAAGTTTCAACGTTTTTATCTGCAATGTTATTTTTGTTTTGGGCTTg < 2:162317/137‑1 (MQ=255) gATTAACATCTTTATCTGTTCCGTCTTTATCTAAAATAATAATTTTGCCATATATGTATTTTAGTTCTTTTTCAATTTCTTTTTCGTTTAAAGTTTCAACGTTTTTTTCTGCAATGTTATTTTTGTTTTGGGCTTGAGct < 2:38082/140‑1 (MQ=255) ttAACATCTTTAGCTGTTCCGTCTTTATCTAAAATAATAATTTTGCCATATATGTATTTTAGTTCTTTTTCAATTTCTTTTTAGTTTACCGTTACAACGTTTTTATCTGCAATGTTATTTTTGTTTTTGGCTTTAGtttc > 2:188794/1‑140 (MQ=255) tCTTTAGCTGTTCCGTCTTTATCTAAAATAATAATTTTGCCATATATGTATTTTAGTTCTTTTTCAATTTCTTTTTCGTTTAAAGTTTCAACGTTTTTATCTGCAATGTTATTTTTGTTTTGGGCTTGAGCTTCTTTGaa < 1:240597/140‑1 (MQ=255) 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tttAGTTCGTTTTTAATTTGTTTTTTGTTTAAAGTTTCGTCGTTTTTATCAGCAATCTTATTTTTGTTTTGGGCTTGAGCTTCGTTGAAATTAAAATCCATGACCATTGAAAGTATGGTTAAAATACTTAAAGAtactac < 2:245281/140‑1 (MQ=255) ttAGTTCTTTTTCTATTTCTTTTTCGTTTAAAGTTTCAACGTTTTTATCTGCAATGTTATTTTTGTTTTGGGCTTGAGCTTCTTTGAAATTAAAATCCAAGACCATTGAAAGTATGGTTAAAATACTTAAAGATactact < 2:11834/140‑1 (MQ=255) ttAGTTCTTTTTCAATGTCTTTTTGGTTTAGAGTTTCAACGTTTTTATCTGCAATGTTATTTTTGTTTTGGGCTTGAGCTTCTTTGAAATTAAAATCCAAGACCATTGAAAGAATTGTTAAAATACTTAAAGATactact < 2:83686/140‑1 (MQ=255) atAGTTCTTTTTGAGTTACATTTTTGTTTGAAGTTTCAACGTTTTTATCTGCAATGTTATTTTTGTTTTGGGCTTGAGCTTCTTTGAAATTAAAATCCAAGACCATTGAAAGTATGGTTAAAATACTTAAAGATactact < 2:242262/139‑1 (MQ=255) tAGTTCGTTTTCAATTTCTTTTTCGTTTAAAGTTTCAACGTTTTTATCTGCAATGTTATTTTTGTTTTGGGCTTGAGCTTCTTTGAAATTAAAATCCAAGACCATTGAAAGTATGGTTAAAATACTTAAAGATActacta < 1:100015/140‑1 (MQ=255) aGTTCTTTTTCAATTTCTTTTTCGTTTAAAGTTTCAACGTTTTTATCTGCAATGTTATTTTTGTTTTGGGCTTGAGCTTCTTTGAGATTAAAATCCAAGACCATTGAAAGTTTGGTTAAAATACTTAAAGATACTACTaa > 1:222933/1‑140 (MQ=255) aGTTCTTTTTCAATTTCTTTTTCGTTTAAAGTTTCAACGTTTTTATCTGCAATGTTATTTTTGTTTTGGGCTTGAGCTTCTTTGAAATTAAAATCCAAGACCATTGAAAGTATGGTTAAAATACTTAAAGATACTACTaa > 2:134835/1‑140 (MQ=255) aGTTCTTTTTCAATTTCTTTTTCGTTTAAAGTTTCAACGTTTTTATCTGCAATGTTATTTTTGTTTTGGGCTTGAGCTTCTTTGAAATTAAAATCCAAGACCATTGAAAGTATGGTTAAAATACTTAAAGATACTACTaa > 2:140213/1‑140 (MQ=255) gTTCTTTTTCAATTTCTTTTTCGTTTAAAGTTTCAACGTTTTTATCTGCAATGTTATTTTTGTTTTTTGCTTGAGCTTCTTTGAAATTAAAATCTATTACTATTGAAAGTATTGTTAAAATTCTTAAAGATACTACTaaa > 2:185972/1‑140 (MQ=255) gTTCTTTTTCAATTTCTTTTTCGTTTAAAGTTTCAACGTTTTTATCTGCAATGTTATTTTTGTTTTGGGCTTGAGCTTCTTTGACATTAAAATCCAAGACCATTGAAAGTATGGTTAAAATACTTAAAGATACTACTaaa > 1:59155/1‑140 (MQ=255) gTTCTTTTTCAATTTCTTTTTCGTTTAAAGTTTCAACGTTTTTATCTGCAATGTTATTTTTGTTTTGGGCTTGAGCTTCTTTGAAATTAAAATCCAAGACCATTGAAAGTa < 2:160160/111‑1 (MQ=255) ttCTTTTTCAATTTCTTTTTCGTTTAAAGTTTCAACGTTTTTATCTGCAATGTTATTTTTGTTTTGGGCTTGAGCTTCTTTGAAATTAAAATACAAGATAATTGTAAGTATGGTTAAAATACTTAAAGATACTACTaaaa > 2:80211/1‑140 (MQ=255) | TTTTATTCTCTATGTCGTTTTTTAGTTTTTGGAATCCTTCAGGAACATATCCATATCGAGATTTGGCATTTTCTAGATTAACATCTTTAGCTGTTCCGTCTTTATCTAAAATAATAATTTTGCCATATATGTATTTTAGTTCTTTTTCAATTTCTTTTTCGTTTAAAGTTTCAACGTTTTTATCTGCAATGTTATTTTTGTTTTGGGCTTGAGCTTCTTTGAAATTAAAATCCAAGACCATTGAAAGTATGGTTAAAATACTTAAAGATACTACTAAAA > NC_012417/2359‑2637 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |