New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_012417 | = 1057 | 840 (0.770) | 6 (0.010) | 6/222 | NT | 0.75% | coding (138/192 nt) | USA300HOU_RS15665 | hypothetical protein |
? | NC_012417 | = 1071 | 865 (0.930) | coding (124/192 nt) | USA300HOU_RS15665 | hypothetical protein | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 1328 total aligned reads displayed.
AACAGACGAAGAAGAAAAAGCACATTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTT > NC_012417/918‑1196 | aGACGAAGAAGAAAAAGCACATTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGGATTATTTTTGTGACAAAt > 2:224280/1‑140 (MQ=255) aGACGAAGAAGAAAAAGCACATTCAATTACCGCAATTTGGAATTGCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAAt < 1:390505/140‑1 (MQ=255) gACGAAGAAGAAAAAGCACATTCAATTCCCGAAATTGGGAATATCGAAAAGCAAAATTATAATTCAAGCCATTACTGTTGACTAGTGTCTGTTTAGTGGATTGGTTATCGAAAAGGAGTGGCTTATTTATGTGACATATg > 2:484458/1‑140 (MQ=255) gACGAAGAAGAAAAAGCACATTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTATTATTTTTGTGACAAATg > 1:113347/1‑140 (MQ=255) aCGAAGAAGAAAAAGCACATTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGc > 2:193477/1‑140 (MQ=255) aagaagaaAAAGCACATTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCtgt < 1:564600/140‑1 (MQ=255) agaagaaAAAGCACATTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCtgta > 2:134596/1‑140 (MQ=255) agaagaaAAAGCAAATTCCATTACAGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCtgta > 1:215086/1‑140 (MQ=255) cagaaAAAGCACATTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCtgtatg < 1:7597/139‑1 (MQ=255) aagaaAAAGCACATTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTGATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCtgtatg < 2:761124/140‑1 (MQ=255) gaaAAAGCACATTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCtgtatgta < 2:438375/140‑1 (MQ=255) aaaGCACATTTAATTATCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGtg > 1:594878‑M2/1‑138 (MQ=255) aaGCACATTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGtgt > 2:577490‑M2/1‑137 (MQ=255) aaGCACATTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGtgt < 2:560051‑M2/140‑4 (MQ=255) gCACATTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTCTTTCTTGATTTTTTCGATAGTAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGtgtca > 2:542104‑M2/1‑135 (MQ=255) aagagtgcaattgccGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGtgtca > 1:98110‑M2/8‑135 (MQ=255) gaaattcAATTAACGCAAATTGGAATTTCGAAAAACAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTTATTTTTTATAACAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGtgtcac > 1:401682‑M2/4‑134 (MQ=255) cacaTTCAATTGCCGCAATTNGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGtgtcan > 1:633381‑M2/1‑134 (MQ=255) caTTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGtgtcacaa < 1:180150‑M2/140‑9 (MQ=255) tCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACCAATGCTGTATGTAGtgtcacaaaaa < 1:35108‑M2/140‑12 (MQ=255) tCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGtgtcacaaaaa > 2:682846‑M2/1‑129 (MQ=255) tACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGtgtcacaaaaataaga > 2:423617‑M2/1‑124 (MQ=255) aCCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGtgtcacaaaaataagac > 2:712563‑M2/1‑123 (MQ=255) ccGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGtgtcacaaaaataagaca < 2:392287‑M2/140‑19 (MQ=255) ccGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTAGAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGtgtcacaaaaataagaca < 2:660306‑M2/140‑19 (MQ=255) aTTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATTAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGc > 1:477883/1‑140 (MQ=255) tttGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCa < 1:306679/140‑1 (MQ=255) ggAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTAGGTAGTGTCACAACAATCAGACAAACGCAata > 1:65388/1‑140 (MQ=255) taaTTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAatat < 2:509426/139‑1 (MQ=255) gAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAatat < 1:150803/140‑1 (MQ=255) gAATGTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTTATTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATCAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAatat < 2:614161/140‑1 (MQ=255) agtttCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAatata < 2:751986/138‑1 (MQ=255) tCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTGGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATtgt < 1:319591/140‑1 (MQ=255) aaggCAAAACTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTca < 1:607083/137‑1 (MQ=255) aaGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTcac < 2:377193/140‑1 (MQ=255) aaaTTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACaaaaa < 1:100891/140‑1 (MQ=255) aaTTATTTATTAAGACATCAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAAt < 1:587131/140‑1 (MQ=255) aaTTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAAt < 2:410387/140‑1 (MQ=255) attattTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATAAATTGTGTCACAAAAATAAGa > 1:124540/1‑140 (MQ=255) ttattTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGAc > 2:184113/1‑140 (MQ=255) ttAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTa < 2:229704/140‑1 (MQ=255) ttAAGACATTAGTGTTGACTAATGGCTTTTTTGTTGAGTTTTTATAACAAAGCACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTa < 1:26372/140‑1 (MQ=255) tAAGATATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTAc < 2:302818/140‑1 (MQ=255) aGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAg < 1:484755/140‑1 (MQ=255) gACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATGATGCAGGACTACCATATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGc < 2:739069/140‑1 (MQ=38) aCATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCt < 2:675169/140‑1 (MQ=255) aCATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCt < 1:82398/140‑1 (MQ=255) ccttAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCACTATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCtt < 1:66502/138‑1 (MQ=255) cATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAACAACAAACAGTACAGCtt > 2:117527/1‑140 (MQ=255) aGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTa < 1:232872/140‑1 (MQ=255) tgtTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATg < 2:126262/140‑1 (MQ=255) tgtTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATg > 1:194030/1‑140 (MQ=255) gACTAATGTCTTTTTTTTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGatat < 1:734801/140‑1 (MQ=255) aCTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTGTGATATc > 1:442069/1‑140 (MQ=255) aCTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATc > 1:272953/1‑140 (MQ=255) aaTGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAGATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACt > 2:353239/1‑140 (MQ=255) ttttttGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTaaaa > 2:59034/1‑140 (MQ=255) tttGTGGATTTTTTATAAAAAAGTACTGCCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATAc < 1:36402/140‑1 (MQ=255) ttgttgATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAAttaa > 2:155024/1‑137 (MQ=255) ttgttgATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATAcc > 1:572420/1‑140 (MQ=255) gttgATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTTCAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCtt < 2:239316/140‑1 (MQ=255) gttgATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCtt < 2:645893/140‑1 (MQ=255) gATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGACACCCAAATAAGAAAGTACACCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTaaa > 2:85490/1‑140 (MQ=38) tttATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTAAAGCTTTGTATGATATTACTTTAAAATACCTTAAAAcccc < 1:745111/140‑1 (MQ=255) tttATAAAAAAGTACTGTCTTATATGGGCGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTAACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAAcccc > 2:625183/1‑140 (MQ=38) tataAAGAAGTACTTTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTg < 2:202934/140‑1 (MQ=255) ataAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATCAGACAAACGCAATATATTGTGGCACCACAATAAGACAGTACCGCTTTGTATGATATCACGTTAAAATACCTTACAACACCTgc > 1:543685/1‑139 (MQ=37) aGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTTGAATTTCt > 1:132738/1‑140 (MQ=255) aCTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGc > 1:705533/1‑140 (MQ=255) cTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCt < 2:521380/140‑1 (MQ=255) cTGCCTTATCTCTGCGACACATGCTTTATGTAGTCTCACAAAACTAAGACAACCGCACTATATTGTGTCACAAGAATACGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCt < 1:338047/140‑1 (MQ=25) tGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTAAAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCtt > 2:313771/1‑140 (MQ=255) tGTCTTATTTTTGTGACAAATGATGTAAGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCtt < 2:696450/140‑1 (MQ=255) gTCTTATTTTTGTGACActacatacagcatttgtcacaaaaataagacagtacttttttatacaaaatcaacaaaaaagacattagtcaacactaatgtcttaaataataattttgcttttcgaaattccgaattgcggt > 2:169902‑M1/1‑17 (MQ=255) gTCTTATTTTTGTGACActacatacagcatttgtcacaaaaataagacagtacttttttataaaaaatcaacaaaaaagacattagtcaacactaatgtcttaaataataattttgcttttcgaaattgcaaagtgcggt > 1:376157‑M1/1‑17 (MQ=255) gTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCACTACATTGTGTTACAAGAATGGGTGGACAGAACAGGGAATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTCGCttt > 2:342140/1‑140 (MQ=19) gTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCttt > 2:290895/1‑140 (MQ=255) gTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCGTAAAACCCCTAGACTTTCTGGCttt > 2:400045/1‑140 (MQ=255) ttATTTTTGTGACActacatacagcatttgtcacaaaaataagacagtacttttttataaaaaatcaacaaaaaagacattagtcaacactaatgtcttaaataataattttgcttttcgccattccaaatttcggtaat > 2:362984‑M1/1‑14 (MQ=255) aTTTTTGTGACActacatacagcatttgtcacaaaaataagacagtacttttttataaaaaatcaacaaaaaagacattagtcaacactaatgtcttaaataataattttgcttttcgaaattccaaattgcggtaattg < 1:615665‑M1/140‑129 (MQ=255) aTTTTTGTGACActacatacagcatttgtcacaaaaataagacagtacttttttataaaaaatcaacaaaaaagacattagtcaacactaatgtcttaaataataattttgcttttcgaaattccaaattgcggtaattg > 1:646293‑M1/1‑12 (MQ=255) aTTTTTGTGACActacatacagcatttgtcacaaaaataagacagtacttttttataaaaaatcaacaaaaaagacattagtcaacactaatgtcttaaataataattttgcttttcgaaattccaaattgcggtaattg > 1:429475‑M1/1‑12 (MQ=255) aTTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAg < 1:416069/140‑1 (MQ=255) ttttGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGAc > 2:454350/1‑140 (MQ=255) tttGTGACActacatacagcatttgtcacaaaaataagacagtacttttttataaaaaatcaacaaaaaagacattagtcaacactaatgtcttaaataataattttgcttttcgaaattccaaattgcggtaattgaat < 1:463429‑M1/140‑132 (MQ=255) ttGTGACActacatacagcatttgtcacaaaaataagacagtacttttttataaaaaatcaacaaaaaagacattagtcaacactaatgtcttaaataataattttgcttttcgaaattccaaattgcggtaattgaatg > 2:25317‑M1/1‑8 (MQ=255) ttGTGACActacatacagcatttgtcacaaaaataagacagtacttttttataaaaaatcaacaaaaaagacattagtcaacactaatgtcttaaataataattttgcttttcgaaattccaaattgcggtaattgaatg < 1:693846‑M1/140‑133 (MQ=255) ttGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATGGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCt < 2:278629/140‑1 (MQ=255) tgtgACActacatacagcatttgtcacaaaaataagacagtacttttttataaaaaatcaacaaaaaagacattagtcaacactaatgtcttaaataataattttgcttttcgaaattccaaattgcggtaattgaatgt > 2:705868‑M1/1‑7 (MQ=255) tgtgACActacatacagcatttgtcacaaaaataagacagtacttttttataaaaaatcaacaaaaaagacattagtcaacactaatgtcttaaataataattttgcttttcgaaattccaaattgcggtaattgaatgt > 1:200200‑M1/1‑7 (MQ=255) tgcgacactacatacagcatttgtcacaaaaataagacagtacttttttataaaaaatcaacaaaaaagacattagtcaacactaatgtcttaaataataattttgcttttcgaaattcaacattgcggtaattgattat > 2:732896‑M1/4‑7 (MQ=255) tgACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATc < 1:165014/140‑1 (MQ=255) tgACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATc < 1:503008/140‑1 (MQ=255) gACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAACCCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCa > 1:525497/1‑140 (MQ=255) gACAAACGCAGCATGGACTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCa < 1:244994/140‑1 (MQ=37) acactacatacagcatttgtcacaaaaataagacagtacttttttataaaaaatcaacaaaaaagacattagtcaacactaatgtcttaaataataattttgcttttcgaaattccaaattgcggtaattgaatgtgctt > 2:600630‑M1/1‑3 (MQ=255) cactacatacagcatttgtcacaaaaataagacagtacttttttatacaaaagcaacaaaaaagacattagtcaacactaatgtcttaaataataattttgcttttcgaaagtccaaattgcggtaattgaatgtgcttt > 1:722127‑M1/1‑2 (MQ=255) cactacatacagcatttgtcacaaaaataagacagtacttttttataaaaaatcaacaaaaaagacattagtcaacactaatgtcttaaataataattttgcttttcgaaattccaaattgcggtaattgaatgtgcttt > 1:294499‑M1/1‑2 (MQ=255) cAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCAtt > 2:32625/1‑140 (MQ=255) aaaTGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCACGACCTATCAttt > 2:261679/1‑140 (MQ=255) | AACAGACGAAGAAGAAAAAGCACATTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTT > NC_012417/918‑1196 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |