New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_012417 | = 1057 | 840 (0.770) | 6 (0.010) | 6/222 | NT | 0.75% | coding (138/192 nt) | USA300HOU_RS15665 | hypothetical protein |
? | NC_012417 | = 1071 | 865 (0.930) | coding (124/192 nt) | USA300HOU_RS15665 | hypothetical protein | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 1160 total aligned reads displayed.
AAAAAGCACATTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTT‑ATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATAGCAA > NC_012417/932‑1210 | aaaaaGCAAATTCAATTACCGCAGTTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTTTTTTTTGTTGATTTTTT‑ATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAg < 2:575314/140‑1 (MQ=255) aaaGCACATTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTT‑ATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGtg > 1:80847‑M2/1‑138 (MQ=255) aGCACATTCAATTACCGCAATTTGGAATGTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTT‑ATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGtgtc > 2:697979‑M2/1‑136 (MQ=255) gCACATTCAAGTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTT‑ATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGtgtca > 2:478397‑M2/1‑135 (MQ=255) aagagtgcaattgccGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTT‑ATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGtgtca > 1:98110‑M2/8‑135 (MQ=255) cacaTTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTT‑ATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGtgtcac < 1:19075‑M2/140‑7 (MQ=255) acaTTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTT‑ATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGtgtcaca < 2:31873‑M2/140‑8 (MQ=255) caTTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTT‑ATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGtgtcacaa < 2:85026‑M2/140‑9 (MQ=255) caTTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATATTTT‑ATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTTGATGTAGtctcacac < 2:612196‑M2/140‑9 (MQ=255) aTTCAAATACCGCAATTTGGGATTTCGAAAAGCAAAATTAATATTTAAAACATTAGTGGTTACTAATGTCTTTTTTTTTGATTTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGtgtcacaa > 1:144266‑M2/1‑132 (MQ=255) tCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTT‑ATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGtgtcacaaaaa < 2:436828‑M2/140‑12 (MQ=255) aTTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTT‑ATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGtgtcacaaaaataa < 1:687784‑M2/140‑15 (MQ=255) aTTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTT‑ATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGtggcacaacaataa < 1:589716‑M2/140‑15 (MQ=255) ccGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTT‑AGAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGtgtcacaaaaataagaca < 2:660306‑M2/140‑19 (MQ=255) cAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTT‑ATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAAc > 1:398436/1‑140 (MQ=255) aTTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTT‑ATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGc < 1:6086/140‑1 (MQ=255) ttttGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTGGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTT‑ATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCa < 2:189001/140‑1 (MQ=255) tgtGGAATTACGAAAAGCAAACGTATCATTTAAGACATCAGTGTTGACTAGTGTCTTTTTTGTTGATTTTGT‑AACCAAAAGTACTGTCTTATGTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCa < 1:440110/138‑1 (MQ=18) gAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTT‑ATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAatat < 1:428380/140‑1 (MQ=255) aaTTTCGAAAAGCAGAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTT‑ATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAatata < 1:251423/140‑1 (MQ=255) tttCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTT‑ATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATAtt > 1:649722/1‑140 (MQ=255) aaaGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTT‑ATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTca < 1:600019/140‑1 (MQ=255) aaGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTT‑ATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTcac < 2:241046/140‑1 (MQ=255) aaGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTT‑ATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTcac < 2:377193/140‑1 (MQ=255) aGCAAAGTTATTATTAAAGACATTAGTGCTGACTGATGTGTTTTTGGTTGATTTGTT‑ATAAAAAAGTACTGTCTTATGTTTGGGACAGATGCGGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTcaca < 1:621950/140‑1 (MQ=255) gCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTT‑ATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACaa > 1:740523/1‑140 (MQ=255) aaaTTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTT‑ATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACaaaaa < 1:100891/140‑1 (MQ=255) gttattattTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTT‑ATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATa < 2:687889/139‑1 (MQ=255) attattattTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTT‑ATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATa > 2:180247/1‑140 (MQ=255) attattattTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTT‑ATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATa > 1:459002/1‑140 (MQ=255) attattTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTT‑ATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGa < 1:659036/140‑1 (MQ=255) attattTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTT‑ATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATAAATTGTGTCACAAAAATAAGa > 1:124540/1‑140 (MQ=255) attTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTT‑ATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAg > 2:253347/1‑140 (MQ=255) ttAAGACATTAGTGTTGACTAATGGCTTTTTTGTTGAGTTTTT‑ATAACAAAGCACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTa < 1:26372/140‑1 (MQ=255) aaGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTT‑ATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACa < 1:131816/140‑1 (MQ=255) aaGACATGAGTGCTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATGTTTT‑AGAAAGAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACa < 2:510697/140‑1 (MQ=37) aGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTT‑ATAAAAAAGTACTGTCTTATTGTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAg < 1:196839/140‑1 (MQ=255) gACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTT‑ATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGc > 2:332614/1‑140 (MQ=255) gtgtTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTT‑ATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTAt < 1:37960/140‑1 (MQ=255) tgtTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTT‑ATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATGTCTTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACCGCTTTTTATg > 2:40798/1‑140 (MQ=255) gtTGACTAAGGTCTTTTTGGTTGATTTTTT‑ATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGa < 1:712277/140‑1 (MQ=255) gACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTT‑ATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGatat > 1:732428/1‑140 (MQ=255) aCTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTT‑ATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATc < 2:266260/140‑1 (MQ=255) cTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTT‑ATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCTCAAAAATAAGTCAAAAGCAATATATTGTTTCACAAAAATAAAACAACACACCTTTTTATTATATCa > 2:551741/1‑140 (MQ=25) cTAATGTCTTGTTTGTTGATTCTTT‑ATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCa < 1:296804/140‑1 (MQ=255) tAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTT‑ATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCAc < 1:532661/140‑1 (MQ=255) tAATGTATTTTTTGATGATTTCTT‑AGAAAAAAGTACTGTCTTATTTATGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCAc < 2:29521/140‑1 (MQ=38) aaTGTCTTTTTTATTGAGTTTTT‑ATAAAAAAGTACTGTCGTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGCAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACt < 2:673597/140‑1 (MQ=255) gTCTTTTTTGTTGATTTTTT‑ATAAAATAGTACTGTCTTATTTTTGTGACATATGCTGTATGTAGTGTCACTAAAATAAGACAAACTCTATATATTGTGTAACATAAATAAGACAGTCAAGCTTTGTATGATATCACttca > 2:36404/1‑138 (MQ=37) cTTTTTTGTTGATTTTTT‑ATAATACTGTACTATCCCATCTCTGCCTCGCTGGCAGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATACGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTaaa < 1:753124/140‑1 (MQ=255) tttttGTTGATTTTTT‑ATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACttttacat > 2:35453/1‑135 (MQ=255) tttttGTTGATTTTTT‑ATAAAAAAGTACTGTCATATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAAt < 1:497716/140‑1 (MQ=255) ttttGTTGATTTTTT‑ATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTGGTGGGACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATa < 1:175842/140‑1 (MQ=255) tttGTTGATTTTTT‑AAAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATAc < 1:482755/140‑1 (MQ=255) ttgttgATTTTTT‑ATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGTCATATGCTATAAGTAGTGTCACACAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACACCTCTCTATGATCTCACTCTaaactccc > 2:343051/1‑135 (MQ=255) gttgATTTTTT‑ATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCtt > 2:594252/1‑140 (MQ=255) ttgATTTTTT‑ATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTa > 1:700183/1‑140 (MQ=255) ttttt‑ATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATTATATCACTTTAAAATACCTTAAAAcc > 2:619478/1‑140 (MQ=255) gt‑ataAAAAGGTACTGTCTTATTTTGAGAACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCt < 2:757283/139‑1 (MQ=38) t‑ataAAGAAGTACTTTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTg < 2:202934/140‑1 (MQ=255) t‑ataAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTg > 2:501241/1‑140 (MQ=255) t‑ataAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTg > 2:398647/1‑140 (MQ=255) ataAAAAATTACTGTCTTATTTATGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTgg < 2:125307/140‑1 (MQ=255) ataAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATATGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTgg > 1:338718/1‑140 (MQ=255) taAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGa > 1:47405/1‑140 (MQ=255) aaaaaGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATATAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATAATATCACTTAAAAATACCTTAAAACCCCTggctt > 2:46072/1‑137 (MQ=255) aaaaGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTATGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCTCTGGAAtt > 2:220522/1‑140 (MQ=255) aGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCCCAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCt > 1:364455/1‑140 (MQ=255) tACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACCGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTgg > 1:163791/1‑140 (MQ=255) aCTGTCTTATTTTTGTGACAAGTGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATCTGAGACCGACGCGAGGGTGTCTCCCAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGc < 2:162230/140‑1 (MQ=21) cTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCt < 2:521380/140‑1 (MQ=255) cTGTCTGAGTTTGGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCt < 2:282420/140‑1 (MQ=255) tGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCtt > 2:7107/1‑140 (MQ=255) gTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCttt > 1:569533/1‑140 (MQ=255) tttGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGAcc < 2:391066/140‑1 (MQ=255) tggagACAAATGCTGTATGTAGGGTCACCAAAATAAGACAACCGCAAGGTATTGTGTCACAAAAATAAGACGGTACAGCTTTGTATGATATCCCTTTAAAATACCTTACAACCCCTGGAATTTCTGGCTGTGCCAGACCt < 1:217607/136‑1 (MQ=25) tgtgACAAATGCTGTGTGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTa < 2:134485/140‑1 (MQ=255) gtgACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTAt < 1:233225/140‑1 (MQ=255) tgACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATc > 1:307119/1‑140 (MQ=255) tgACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATc < 1:55062/140‑1 (MQ=255) tgACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATc > 2:586135/1‑140 (MQ=255) gACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCa < 2:727331/140‑1 (MQ=255) cAAATGCTGTATGGAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCAtt < 2:423061/140‑1 (MQ=255) aaaTGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCAttt < 1:272871/140‑1 (MQ=255) aaaTACTGTATGTGGTGACACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCAttt < 2:734239/140‑1 (MQ=255) aaTGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCAtttt < 1:41145/140‑1 (MQ=255) aaTGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATAATGTTTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCAttca < 1:321538/140‑3 (MQ=255) aTGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCAttttt > 1:115299/1‑140 (MQ=255) tgtatgtaGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAAt < 1:639339/140‑1 (MQ=255) tgtaGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATa > 1:206428/1‑140 (MQ=255) gtaGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATAg < 2:149166/140‑1 (MQ=255) gtaGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATAg > 1:579290/1‑140 (MQ=255) gtaGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATAg < 1:351101/140‑1 (MQ=255) gtaGTGACACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATAg < 2:744145/140‑1 (MQ=255) taGTGTCACAAAAATACGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGCACAGCTATGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAACACCCCTGGAATTCCTGACTTTCCTAACACTATCATTTTTTaagtttcgc > 1:514651/1‑133 (MQ=25) taGTGTAACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATAGc < 2:644965/140‑1 (MQ=255) gaGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATAGc < 2:113141/139‑1 (MQ=255) gtgtCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATAGCaa < 2:306864/140‑1 (MQ=255) gtgtCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGGGTCACAAAAATAAGACAGGACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAATCACCTGGAATTGCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATAGCaa < 2:229679/140‑1 (MQ=25) gtgtCACAAAAATAAGACAAACGCAAGATATCGTGTCACAAAAATATGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTCCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATAGCaa < 2:53838/140‑1 (MQ=255) | AAAAAGCACATTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTT‑ATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATAGCAA > NC_012417/932‑1210 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |