New junction evidence | |||||||||||
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Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 1054 total aligned reads displayed.
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1:41526‑M2/1‑20 (MQ=255) gggggTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaatcaagataataaaacgttaaaagatatgacgaaaagtgggaaacaacgcccatggagagaaaagaaaatagataatgtaagctatgcagata < 1:719497‑M2/140‑127 (MQ=255) gggggTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaatcaagataataaaacgttaaaagatatgacgaaaagtgggaaacaacgcccatggagagaaaagaaaatagataatgtaagctatgcagat < 2:301446‑M2/140‑127 (MQ=255) gggTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaatcaagataataaaacgttaaaagatatgacgaaaagtgggaaacaacgcccatggagagaaaagaaaatagataatgtaagctatgcagatat < 1:46754‑M2/140‑129 (MQ=255) gggTCTTTTTAAatgcaatataatactactagaaggataaccgaaaatcaagataataaaacgttaaaagataagacgaaaagtgggaaacaacgaccatggagagaaaagaaaatagataatgtaagctatgcagatat > 2:20862‑M2/1‑12 (MQ=255) gaatcttTTAATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaaacaagataataaaacgttaaaagataagacgaaaagtgggaaacaacgcccatggagagaaaagaaaatagataatgtaagctatgcagatat > 2:329023‑M2/4‑12 (MQ=255) gTCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaatcaagataataaaacgttaaaagatatgacgaaaagtgggaaacaacgcccatggagagaaaagaaaatagataatgtaagctatgcagatatac < 2:569727‑M2/140‑131 (MQ=255) tCTTTTTATatgcaatataatactactagaagtataaccgaaaatcaagataataaaacgttaaaagatatgacgaaaagtgggaaacaacgcccatggagagaacagcaaatagctaatgtaagctatgccgctatact < 1:8486‑M2/140‑132 (MQ=255) | ATAACTCGATTTTATATATATAGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGTTATATTATTAAGGTGTCGAATCTTAAATAATACTGGGGGTCTTTTTAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_012417/2979‑3125 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |