New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_012417 | = 1992 | 1492 (0.970) | 6 (0.000) | 5/246 | NT | 0.43% | intergenic (+225/+101) | USA300HOU_RS14895/USA300HOU_RS14900 | hypothetical protein/hypothetical protein |
? | NC_012417 | = 2020 | 1329 (0.910) | intergenic (+253/+73) | USA300HOU_RS14895/USA300HOU_RS14900 | hypothetical protein/hypothetical protein | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
TTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_012417/1848‑1992 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgaatgGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCTTCATGATAATCATATTTTTCTTCCAT < NC_012417/2020‑1882 ttggaTTTACTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGAC < 2:519452/135‑1 tgTGTTGTTCTACATAGTTGGTGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGAC < 2:206443/138‑1 TTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGAC < 2:47967/140‑1 TTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGAC < 1:221673/140‑1 TTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGAC < 2:200998/140‑1 TTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGAC < 1:574102/140‑1 TTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGAC > 2:691302/1‑140 TTTGTTTTTATATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGAC < 1:465990/140‑1 TTTGTTTGTCAATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGAC < 2:696190/140‑1 TTGTTTTTCTATGAAGATGATGCTGTTGACGAGATGGAAGAAGAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGCCGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTATCTAAACTTGCAGACG < 2:49046/140‑1 TTGTTTTTCTATAAAGATGTGGCTTTTGACGATATAGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGTCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACG < 2:30384/140‑1 TTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACG < 2:302036/140‑1 TTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACG > 2:338876/1‑140 TTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACG > 1:98276/1‑140 TTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTCCAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACG > 1:263576/1‑140 TTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGAAGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCTGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACATGCAGACG > 2:621128/1‑140 TTGTGTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACG < 2:180661/140‑1 TGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGA > 2:612321/1‑140 TGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGA > 1:457242/1‑140 TGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGA > 1:44861/1‑140 TGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGA < 1:446997/140‑1 TGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGA > 1:118543/1‑140 TGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGA > 1:234259/1‑140 TGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGA < 1:231731/140‑1 TGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGA > 1:211529/1‑140 TGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTGGAGAAGAACACTTAACTAAACTTGCAGAAGA > 2:185500/1‑140 TGTTTTTCTATAAAGACATTGCTTTTGACAAGATCGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGA < 2:596502/140‑1 TGTTTTTCTAGAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGA < 1:523993/140‑1 TGTTTTACTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTTAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGA < 1:430612/140‑1 TGTTTATCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGA < 2:247363/140‑1 GTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGTTGTTTAGAAGAACCCTTAACTAAAATTGCAGACGAA > 2:25111/1‑140 GTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGACGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAA < 1:458026/140‑1 GTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAc > 1:323445/1‑139 GTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAA < 1:630510/140‑1 GTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAA < 1:639002/140‑1 GTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAA > 1:314637/1‑140 GTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAA > 1:372516/1‑140 GTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAA > 1:117595/1‑140 GTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAA > 1:686054/1‑140 TTTTTCTATAGAGATGATGCGTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCCGACattc < 2:230539/140‑5 attgaTATAAAGAGGATGCTTTTGAAGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATG < 1:358712/135‑1 TTTTCTATATAGATGATGCTTTTGACGATATGTAAGTAAAATATGATTATCATTAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTTCATACAAATG > 2:477172/1‑140 TTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGTAGATAATAAAAAATAGAAGAATCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATG > 2:609380/1‑140 TTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATG > 1:429935/1‑140 TTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATG > 1:400451/1‑140 TTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATG > 1:607277/1‑140 TTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATG > 2:599146/1‑140 TTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACATGCAGACGAATG > 2:68634/1‑140 tgTCTATAAAGATGATGCTTNTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGn < 1:529012/138‑2 TTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACtcatgtc > 2:366052/1‑133 TTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGGc > 2:346197/1‑139 TCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGATAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGCGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACATGCAGACGAATatcg > 2:630248/1‑136 gagaaaGAATAAAAATATGAGTATCATGAAGATAATAAAAAAGAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCC < 2:507168/134‑1 gagGGAAGAAAAATAGGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTCAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGA < 1:406176/137‑1 GATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGA < 2:637130/140‑1 GATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTT < 1:182467/140‑1 AGATAATAAAAAATAGACGACGCACTGATGCCGAGAAAATTCATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGT < 2:581944/140‑1 ATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAGCTAAACTTGCAGACGAAT‑GTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCT < 2:57045/140‑1 tcgttcGGTGGGGTTCATAGCCCACGCTATGCTGACATTCGTATGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATTAATAAATTTTCTCTGCATAAATGCGTCGCCTATTTTTTATTATCTTCATGATAATCATATTTTTC < 2:242898/134‑1 CGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCCTAAATCCGCCTGCTAGTTTTTATTATCTTCCTGATAATCAGATTTTTCT < 1:330974/140‑1 CGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCTTCATGATAATCATATTTTTCT > 1:652520/1‑140 CGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCTTCATGATAATCATATTTTTCT > 1:65988/1‑140 CGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCGATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCTTCTTGATAATCATATTTTTCT < 1:643745/140‑1 gggTGGTTGGCTTAGTAGCTCACGCTATGCCGACATGCGTCGTGAAGTTCAGTTAAGGGTTCTGCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCTTCATGATAATCATATTTTTCTT < 2:489077/137‑1 ggATGGTCGGCTTATTAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCTTCATGATAATCATATTTTTCTT < 2:136083/138‑1 gcATGGTCGGCTTTATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCACATTCAGTTAATGGTTCTTCTCAACATCACTAAATCTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCTTCATGATAATCATATTTTTCTT < 2:245385/138‑1 GAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGTCGACATTCGGCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTGTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCGTCATGATAATCATATTTTTCTT < 2:285037/140‑1 GAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCTTCATGATAATCATATTTTTCTT < 1:495941/140‑1 GAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCTTCATGATAATCATATTTTTCTT < 1:50334/140‑1 GAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCTTCATGATAATCATATTTTTCTT < 1:581441/140‑1 GAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCTTCATGATAATCATATTTTTCTT < 1:107513/140‑1 GAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCTTCATGATAATCATATTTTTCTT < 2:527875/140‑1 GAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCTTCATGATAATCATATTTTTCTT < 2:55927/140‑1 GAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCTTCATGATAATCATATTTTTCTT < 1:690910/140‑1 GAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCCATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCTTCATGATAATCATATTTTTCTT < 1:91703/140‑1 GAATGGTCGGCTTAATAGCCCAAGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCTTCATGATAATCATATTTTTCTT < 1:356295/140‑1 GAATGGTCGGCTTAAGAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTGTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCTTCATGATAATCATATTTTTCTT < 2:187543/140‑1 AATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCTTCATGATAATCATATTTTTCTTC < 2:80135/140‑1 AATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCTTCATGATAATCATATTTTTCTTC < 2:320919/140‑1 AATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCTTCATGATAATCATATTTTTCTTC < 1:680215/140‑1 AATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCTTCATGATAATCATATTTTTCTTC > 2:191001/1‑140 AATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCTTCATGATAATCATATTTTTCTTC < 2:212495/140‑1 AATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCTTCATGATAATCATATTTTTCTTC < 2:455538/140‑1 AATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTATAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCTTCATGATAATCATATTTTTCTTC < 1:585143/140‑1 AATGGTCGGCTTAATAGCTAACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCTTCATGATAATCATATTTTTCTTC < 2:277407/140‑1 AATGGGCGGCTTAATCGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCTTCATGATAATCATATTTTTCTTC < 1:633219/140‑1 TGGTCGGCTTGATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACAGCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCTTCATGATAATCATATTTTTCTTCCA < 1:690363/140‑1 TGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCTTCATGATAATCATATTTTTCTTCCA > 2:559858/1‑140 TGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCTTCATGATAATCATATTTTTCTTCCA < 1:353988/140‑1 GGTTGGCTTAATAGCTCACGCTTTGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCTTCATGATAATCATATTTTTCTTCCAT < 2:215135/140‑1 GGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCTTCATGATAATCATATTTTTCTTCCtt > 2:80053/1‑138 GGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCTTCATGATAATCATATTTTTCTTCCAT > 2:522814/1‑140 GGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCTTCATGATAATCATATTTTTCTTCCAT > 1:39503/1‑140 GGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCTTCATGATAATCATATTTTTCTTCCAT > 1:336932/1‑140 TTTGTTTTTCTATAAAGATGATGCTTTTGACGAGATGGAAGAAAAATATGATTATCATGAAGATAATAAAAAATAGACGACGCATTTATGCCGAGAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_012417/1848‑1992 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgaatgGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACATCAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTCGTCTATTTTTTATTATCTTCATGATAATCATATTTTTCTTCCAT < NC_012417/2020‑1882 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |