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Only 100 of 1860 total aligned reads displayed.
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aaaaaGTGCTGACTAATTGGTGGGAGAAATTCTGTATGGAGGGTCAC‑AAAAATAAGACAAACGCAATATATGGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAAGACCTTAAAACCCCTGGAAt < 1:323387/140‑1 (MQ=25) aaaaaGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATTCTATATGTAGTGTCAC‑ATAAATTAGACAAACGCAATATATTGTGTCTCAAAAATAAGACAGTAACGCTTTGTATAATATCACTTTAAAATACCTTAAAACACCTCGAAt > 2:574299/1‑140 (MQ=37) aaGTACGGTCTTAGTTTTGTGACAGATGCTGTATGTAGTGTCAC‑AAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTc < 2:622868/140‑1 (MQ=255) aGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCAC‑AAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCt < 1:283314/140‑1 (MQ=255) aGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCAC‑AAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTCTCTGAGATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCt > 1:190942/1‑140 (MQ=255) | TGCAAGTGATGAAGATAAAACAACAGACGAAGAAGAAAAAGCACATTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAAATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCAC‑AAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTG > NC_012417/897‑1175 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |