| New junction evidence | |||||||||||
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| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 1545 total aligned reads displayed.
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atatTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATGCTCTTACGGAGtttt > 2:324765/1‑140 (MQ=255) atTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATGCTCTTACGGAGtttttc > 1:317600/1‑139 (MQ=255) ttGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATCGCAAATTCTCCTTATGCTCTTACGGAGTTGTTag > 2:220794/1‑140 (MQ=255) tcacaaaaataagacagtacAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATAGCAACTTCTCCTTATGCTCTTACGGAGTTTTTAGAGaaa > 1:576831‑M2/21‑140 (MQ=255) aaaataagacagtacAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTCAAAAGCAGTGGAATTTATGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATGCTCTTACGGAGCTTTTATAGaacaatta > 2:251706‑M2/16‑140 (MQ=255) aaataagacagtacAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATGCTCTTCCGGAGTTTTTAGAGaaaaattaa > 2:378952‑M2/15‑140 (MQ=255) aaataagacagtacAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATGCTCTTACGGAGTATTTAGAGacaaattaa > 2:665797‑M2/15‑140 (MQ=255) aataagacagtacAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATGCTCTTACGGAGTTTTTAGAGaaaaattaaa > 1:613541‑M2/14‑140 (MQ=255) taagacagtacAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATGCTCTTACGGAGTTTTTAGAGcaaaattaaaaa > 1:101964‑M2/12‑140 (MQ=255) taagacagtacAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATGCTCTTACGGAGTTTTTAGAGaaaaattaaaaa > 1:30198‑M2/12‑140 (MQ=255) agacagtacAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATGCTCTTACGGAGTTTTTAGAGaaaaattaaaaatt > 1:154591‑M2/10‑140 (MQ=255) agacagtacAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATGCTCTTACGGAGTTTTTAGAGaaaaattaaaaatt > 1:341749‑M2/10‑140 (MQ=255) agacagtacAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATGCTCTTACGGAGTTTTTAGAGaaaaattaaaaatt < 1:409939‑M2/131‑1 (MQ=255) gacagtacAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATGCTCTTACGGAGTTTTTAGAGAAAAATTAAAAATtc > 2:276427‑M2/9‑140 (MQ=255) gACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTATAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTAGCTTTGCCAGACATATGATTACTGAATGATAGGAAGTTCTCCTTACTCCGTTACGGGGCTTACAGAGAAACAGTAGAAATtc > 2:313175/1‑140 (MQ=12) acagtacAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATGCTCTTACCGAGTTTTTAGAGAACAATTAAAAATtct > 1:455019‑M2/8‑140 (MQ=255) gtacAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATGCTCTTACGGAGTTTTTAGAGAAAAATTAAAAATTCTCGa < 2:101863‑M2/136‑1 (MQ=255) acAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGAACTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATGCTCTTACGGAGATTTTAGAGAAAAATTAAAAATTCACGAtt > 2:125717‑M2/3‑140 (MQ=255) cAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATGCTCTTACGGAGTTTTTAGAGAAAAATTAAGACTTCTCGAttt > 2:234811‑M2/2‑140 (MQ=255) cAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATGCTCTTACGGAGTTTTTAAAGAAAAATTAAAAATTCTCGAttt > 2:391905‑M2/2‑140 (MQ=255) | AAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTTTGAATGATAGCAAATTCTCCTTATGCTCTTACGGAGTTTTTAGAGAAAAATTAAAAATTCTCGATTTT > NC_012417/987‑1265 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |