New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | 2529497 = | 76 (1.350) | 3 (0.060) | 3/234 | NT | 4.1% | coding (441/1551 nt) | zinT | Metal‑binding protein ZinT |
? | USA300TCH1516_ALE | = 2529493 | 70 (1.370) | coding (445/1551 nt) | zinT | Metal‑binding protein ZinT | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
TAATTTTTTGTAGTTTTTCTCATAGTCATCTTTATGTTTTGGATCTTTTTTCACTAATTCATCTTTAATTTCTTTAGCGAAAGTTTGGTTAATTTTAGGATCTAACCATACGTGTGGATCATATCCACCATGATGATGATGATGTTCTTCTTTCTCATGATCATGTCCCTCATGTTCATGCTCTTCACCATGCTCGTGTTGATCAGTTAAAAGCTTTGCTTTATCTAATTTATCCTCTAAAGACAGTTTTTTATCTTTATCTTTGATAGTAG > USA300TCH1516_ALE/2529365‑2529636 | gtttaattttttgtagtttttctcatagtcatctttatgttttggatcttttttcactaattcatctttaatttctttagcgcaagtttggttaattttaggatctaaccatacgtgtgcctcatatccaccatcatcat < 2:190246‑M1/8‑7 (MQ=255) tttaattttttgtagtttttctcatagtcatctttatgttttggatcttttttcactacttcatctttaatttctttagcgtaagtttggttaattttaggatctaaccatacgtgtggctcatatccaccatcattctg < 2:276131‑M1/9‑8 (MQ=255) tttaattttttgtagtttttctcatagtcatctttatgttttggatcttttttcactaattcatctttaatttctttagtgaaagtttggttaattttaggatctacccatacgtgtggatcatatccgccattatgatg < 2:378851‑M1/9‑1 (MQ=255) aTTTTTTGTAGTTTTTCTCATAGTCATCTTTATGTTTTGGTTCTTTTTTCACTAATTCATCTTTAATTTCTTTAGCGAAAGTTTGGTTAATTTTAGGATCTAACCATACGTGTGGATCATATCCACCatgatgatgatga > 2:442884/1‑140 (MQ=255) taattttttgtagtttttctcatagtcatctttatgttttggatcttttttcactaattcatctttaatttctttagcgaaagtttggttaattttaggatctaaccatacgtgtggatcatatccaccatgatgatgat > 1:135294‑M1/130‑140 (MQ=255) ttttGTAGTTTTTCTCATAGTCATCTTTATGTTTTGGATCTTTTTTCACTAATTCATCTTTAATTTCTTTAGCGAAAGTTTGGTTAATTTTAGGATCTAACCATACGTGTGGATCATATCCACCATGATGATGATGATGt < 1:215493/140‑1 (MQ=255) ttttGTAGTTTTTCTCATAGTCATCTTTATGTTTTGGATCTTTTTTCACTAATTCATCTTTAATTTCTTTAGCGAAAGTTTGGTTAATTTTAGGATCTAACCATACGTGTGGATCATATCCACCATGATGATGATGATGt > 1:636143/1‑140 (MQ=255) ttttGTAGTTTTTCTCATAGTCATCTTTATGTTGGTGATCCTTTTTCACTAATTCATCTTTAATTTCTTTAGCGAAAGTTCGGTTAATTTTAGGATCTAACCATACGTGTGGATCATATCCACCATGATGATGATGATGt < 1:440862/140‑1 (MQ=255) ttGTCGTTTTTCTCATAGTCATCTTTATGTTTTGGATCTTTTTTCGCTAATTCGTCTTTCGTTTCTGTAGCGAAAGTTTGGTTAATTTTAGGATCTAACCATACGTGTGGATCATATCCACCATGATGATGATGATGttc < 2:12578/140‑1 (MQ=255) ttGTAGTTTTTCTCATAGTCATCTTTATGTTTTGGATCTTTTTTCACTAATTCATCTTTAATTTCTTTAGCGAAAGTTTGGTTAATTTTAGGATCTAACCATACGTGTGGATCATATCCACCATGATGATGATGATGttc < 2:386775/140‑1 (MQ=255) tGTAGTTTTTCTCATAGTCATCTTTATGTTTTGGATCTTTTTTCACTAATTCATCTTTAATTTCTTTAGCGAAAGTTTGGTTAATTTTAGTATCTAACCATACGTGTGGATCATATCCACCATGATGATGATGATGttct < 1:320914/140‑1 (MQ=255) tAGTTTTTCTCATAGTCATCTTTATGTTTTGGATCTTTTTTCACTAATTCATCTTTAATTTCTTTAGCGAAAGTTTGGTTAATTTTAGGATCTAACCATACGTGTGGATCATATCCACCATGATGATGATGATGttcttc > 1:374944/1‑140 (MQ=255) tttCTCATCGGCAGCGTTATGTTTTTGATCTTTTTTCACTAATTCATCTTTAATTTCTTTAGCGGAGGTTTGGTTAAGTTTAGGATCTAATCATACGTGTGGATCATATCCACTATGATGATGATGATGTTCttctttct < 2:534762/140‑1 (MQ=255) tcATAGTCATCTTTATGTTTTGGATCTTTTTTCACTAATTCATCTTTAATTTCTTTAGCGAAAGTTTGGTTAATTTTAGGATCTAACCATACGTGTGGATCATATCCACCATGATGATGATGATGTTCTTCTTTCTCATg > 1:17301/1‑140 (MQ=255) tcATAGTCATCTTTATGTTTTGGATATTTTTTCACTAATTCATCTTTAATTTATTTAGCGAAAGTTTGGTTAATTTTAGGATCTAACCATACGTGTGGATCATATCCACGATGATGGTGATGCTGTTCtgctttctgttg > 1:321204/1‑136 (MQ=255) aTAGTCATCTTTATGTTTTGGATCTTTTTTCACTAATTCATGTTTAATTTCTTTAGCGAAAGTTTGGTTAATTTTAGGATCTAACCATACGTGTGGATCATATCCCCCATGATGATGCTGATGTTCTTCTTTTTCTTgtt > 1:593297/1‑138 (MQ=255) aTAGTCATCTTTATGTTTTGGATCTTTTTTCACTAATTCATCTTTAATTTCTTTAGCGAAAGTTTGGTTAATTTTAGGATCTAACCATACGTGTGGGTCATATCCATCGTGATGGTGGTTATGTTCttctttcttttcat > 1:559574/1‑134 (MQ=255) aTAGTCATCTTTATGTTTTGGATCTTTTTTCACTAATTCATCTTTAATTTCTTTAGCGAAAGTTTGGTTAATTTTAGGATCTAACCATACGTGTGGATCATATCCACCATGATGATGATGATGTTCTTCTTTCTCATGAt < 2:265234/140‑1 (MQ=255) aTAGTCATCTTTATGTTTCGGGACTAAATTTGCTTTTTGTTCTTTGATTTCTTTAGCGAAAGTTTGGTTAATTTTAGGATCTAACCATACGTGTGGGTCATATCCACCATGATGATGATGATGTTCTTCTTTCTCGTGAt > 1:135330/1‑140 (MQ=255) tAGTCATCTTTATGTTTTGGATCTTTTTTCACTAATTCATCTTTAATTTCTTTAGCGAAATTTTGGTTAATTTTAGGATCTAACCATACGTGTGGATCATATTCACCATGATGATGATGATGTTCTTCTTTCTCTTAATc > 2:638131/1‑140 (MQ=255) tAGTCATCTTTATGTTTTGGATCTTTTTTCACTAATTCATCTTTAATTTCTTTAGCGAAAGTTTGGTTAATTTTAGGATCTAACCATACGTGTGGATCATATCCACCATGATGATGATGATGTTCTTCTTTCTCATGATc > 2:196369/1‑140 (MQ=255) tAGTCATCTTTATGTTTTGGATCTTTTTTCACTAATTCATCTTTAATTTCTTTAGCGAAAGTTTGGTTAATGTTAGGATCTAACCATACGTGTGGATCATATCCACCATGATGATGATGATGTTCTTCTTTCTCATGCTc > 1:25546/1‑140 (MQ=255) aGTCATCTTTATGTTTTGGATCTTTTTTCACTAATTCATCTTTAATTTCTTTAGCGAAAGTTTGGTTAATTTTAGGATCTAACCATACGTGTGGATCATATCCACCATGATGATGATGATGTTCTTCTTTCTCATGATCa > 2:637865/1‑140 (MQ=255) tagtcatctttatgttttggatcttttttcactaattcatctttaatttctttagcgaaagtttggttaattttaggatctaaccatacgtgtggatcatatccaccATGATGATGATGTTCTTCTTTCTCATGATCATg < 2:169449‑M1/33‑1 (MQ=255) cATCTTTATGTTTTGGATCTTTTTTCACTAATTCATCTTTAATTTCTTTAGCGAAAGTTTGGTTAATTTTAGGATCTAACCATACGTGTGGATCATATCCATCATGATGATGATGATGTTCTTCTTTCTCATGATCactt > 1:672569/1‑137 (MQ=255) cATCTTTATGTTTTGGATCTTTTTTCACTAATTCATCTTTAATTTCTTTAGCGAAAGTTTGGTTAATTTTAGGATCTAACCATACGTGTGGATCATATCCACCATGATGATGATGTTGTTCTTCTTTGTCATGATCATGt > 1:525969/1‑140 (MQ=255) catctttatgttttggatcttttttcactaattcatctttaatttctttagcgaaagtttggttaattttaggatctaaccatacgtgtggatcatatccaccATGATGATGATGTTCTTCTTTCTCATGATCATgtctc < 2:93687‑M1/37‑3 (MQ=255) ttATGTTTTGGATCTTTTTTCACTAATTCATCTTTAATTTCTTTAGCGAAAGTTTGGTTAATTTTAGGATCTAACCATACGTGTGGATCATATCCACCATGATGATGATGATGTTCTTCTTTCTCATGATCATGTCCCTc > 1:320841/1‑140 (MQ=255) tATGTTTTGGATCTTTTTTCACTAATTCATCTTTAATTTCTTTAGCGAAAGTTTGGTTAATTTTAGGATCTAACCATACGTGTGGATCATATCCACCATGATGAGGATGATGTTCTTCTTTCGCATGATCATGTCCCTCa > 1:91948/1‑140 (MQ=255) aTGTTTTGGATCTTTTTTCACTAATTCATCTTTAATTTCTTTAGCGAAAGTTTGGTTAATTTTAGGATCTAACCATACGTGTGGATCATATCCACCATGATGATGATGATGTTCTTCTTTCTCATGATCATGTCCCTCAt > 1:432081/1‑140 (MQ=255) tGTTTTGGATCTTTTTTCACTAATTCATCTTTAATTTCTTTAGCGAAAGTTTGGTTAATTTTAGGATCTAACCATACGTGTGGATCATATCCACCATGATGATGATGATGTTCTTCTTTCTCATGATCATGT‑CCTCATGt > 1:389740/1‑140 (MQ=255) gATCTTTTTTCACTAATTCATCTTTAATTTCTTTAGCGAAAGTTTGGTTAATTTTAGGATCTAACCATACGTGTGGATCATATCCACCATGATGATGATGATGTTCTTCTTTCTCATGATCATGTCCCTCATGTTCATGc > 2:286298/1‑140 (MQ=255) aTCTTTTTTCACTAATTCATCTTTAATTTCTTTAGCGAAAGTTTGGTTAATTTTAGGATCTAACCATACGTGTGGATCATATCCACCATGATGATGATGATGTTCTTCTTTCTCATGATCATGTCCCTCATGTTTATGct > 1:173139/1‑140 (MQ=255) ttttttCACTAATTCATCTTTAATTTCTTTAGCGAAAGTTTGGTTAATTTTAGGATCTAACCATACGTGTGGATCATATCCACCATGATGATGATGATGTTCTTCTTTCTCATGATCATGTCCCTCATGTTCATGCTCtt > 1:150920/1‑140 (MQ=255) ttttCACTAATTCATCTTTAATTTCTTTCGCGAATGTTTGGTTAATTTTAGGATCTATCCATACGTGTGGATCATATCCACAATGATGATGCTGATGTTCTTCTTTCTCCTTCTCATGTACCTCCTGTTCGTCCTTTTcc > 2:48033/1‑139 (MQ=255) ttCACTAATTCATCTTTAATTTCTTTAGCGAAAGTTTGGTTAATTTTAGGATCTAACCATACGTGTGGATCATATCCACCATGATGATGATGATGTTCTTCTTTCTCATGATCATGTCCCTCATGTTCATGCTCTTCAcc > 1:424958/1‑140 (MQ=255) ttCACTAATTCATCTTTAATTTCTTTAGCGAAAGTTTGGTTAATTTTAGGATCTAACCATACGTGTGGATCATATCCACCATGATGATGATGATGTTCTTCTTTCTCATGATCATGTCCCTCATGTTCATGCTCTTCAcc > 1:81008/1‑140 (MQ=255) tCACTAATTCATCTTTAATTTCTTTAGCGAAAGTTTGGTTAATTTTAGGATCTAACCATACGTGTGGATCATATCCACCATGATGATGATGATGTTCTTCTTTCTCATGATCATGTCCCTCATGTTCATGCTCTTCACCa > 2:221378/1‑140 (MQ=255) tCACTAATTCATCTTTAATTTCTTTAGCGAAAGTTTGGTTAATTTTAGGATCTAACCATACGTGTGGATCATATCCACCATGATGATGATGATGTTCTTCTTTCTCATGATCATGTCCCTCATGTTCATGCTCTTCACCa > 2:482280/1‑140 (MQ=255) cACTAATTCATCTTTAATTTCTTTAGCGAAAGTTTGGTTAATTTTAGGATCTAACCATACGTGTGGATCATATCCACCATGATGATGATGATGTTCTTCTTTCTCATGATCATGTCCCTCATGTTCATGCTCTTCACCAt > 1:516182/1‑140 (MQ=255) aCTAATTCATCTTTAATTTCTTTAGCGAAAGTTTGGTTAATTTTAGGATCTAACCATACGTGTGGATCATATCCACCATGATGATGATGATGTTCTTCTTTCTCATGATCATGTCCCTCATGTTCATGCTCTTCACCATg > 1:344798/1‑140 (MQ=255) aCTAATTCATCTTTAATTTCTTTAGCGAAAGTTTGGTTAATTTTAGGATCTAACCATACGTGTGGATCATATCCACCATGATGATGATGATGTTCTTCTTTCTCATGATCATGTCCCTCATGTTCATGCTCTTCACCATg > 1:273115/1‑140 (MQ=255) tcggtagtttCTTTATCCAAGGTTTCGTGAATTTTAGGATCTAACCATACGTGTGGATCATATCCACCATGATGATGATTATGTTCTTCTTTCTCATGATCATGTCCCTCATGTTCATGCTCTTCACCATGCTCGTGTTg < 2:608946/133‑1 (MQ=255) ttCTTTAGCGAAAGTTTGGTTAATTTTAGGATCTAACCATACGTGTGGATCATATCCACCATGATGATGATGATGTTCTTCTTTCTCATGATCATGTCCCTCATGTTCATGCTCTTCACCATGCTCGTGTTGATCAGTTa < 1:671149/140‑1 (MQ=255) tCTTTAGCGAAAGTTTGGTTAATTTTAGGATCTAACCATACGTGTGGATCATATCCACCATGATGATGATGATGTTCTTCTTTCTCATGATCATGTCCCTCATGTTCATGCTCTTCACCATGCTCGTGTTGATCAGTTaa < 2:415077/140‑1 (MQ=255) tCTTTAGCGAAAGTTTGGTTAATGTTAGGATTTAACCATACGTGTGGATCCCGACAGGTTACAGTACTCTGTTGTGAATAGGTCTCATGATCATGTCCCTCATGTTCATGCTCTTCACCATGCTCGTGTTGATCAGTTaa < 2:500734/140‑1 (MQ=255) ttttgggAAAGGTTGGTTTATTTTCGGAGCCAACCATACGTGTGGATCATATCCACCATGATGATGATGATGTTCTTCTTTCTCATTATCATGTCCCTCATGTTCATGCTCTTCACCATGCTCGTGTTGATCAGTTaaaa < 2:3216/134‑1 (MQ=255) ttAGCGAAAGTTTGGTTAATTTTAGGATCTAACCATACGTGTGGATCATATCCACCATGATGATGATGATGTTCTTCTTTCTCATGATCATGTCCCTCATGTTCATGCTCTTCACCATGCTCGTGTTGATCAGTTAAAAg < 2:592225/140‑1 (MQ=255) aGCGAAAGTTTGGTTAATTTTAGGATCTAACCATACGTGTGGATCATATCCACCATGATGATGATGATGTTCTTCTTTCTCATGATCATGTCCCTCATGTTCATGCTCTTCACCATGCTCCTGTTGATCAGCTACAAgct > 2:619933/1‑140 (MQ=255) gCGAAAGTTTGGTTAATTTTAGGATCTAACCATACGTGTGGATCATATCCACCATGATGATGATGATGTTCTTCTTTCTCATGATCATGTCCCTCATGTTCATGCTCTTCACCATGCTCGTGTTGATCAGTTAAAAgctt > 1:113588/1‑140 (MQ=255) aaGTTTGGTTAATTTTAGGATCTAACCATACGTGTGGATCATATCCACCATGATGATGATGATGTTCTTCTTTCTCATGATCATGTCCCTCATGTTCATGCTCTTCACCATGCTCGTGTTGATCAGTTAAAAgctttgct > 1:432542/1‑140 (MQ=255) aaGTTTGGTTAATTTTAGGATCTAACCATACGTGTGGATCATATCCACCATGATGATGATGATGTTCTTCTTTCTCATGATCATGTCCCTCATGTTCATGCTCTTCACCATGCTCGTGTTGATCAGTTAAAAgctttgct < 2:695013/140‑1 (MQ=255) aGTTTGGTTAATTTTAGGATCTAACCACACGTGTGGATCATATCCACCATGATGATGATGATGTTCTTCTTTCTCATGATCATGTCCCTCATGTTCATGCTCTTCACCATGCTCGTGTTGATCAGTTAAAAgctttgctt > 1:456142/1‑140 (MQ=255) tGGTTAATTTTAGGCTCTAACCATACGTGTGGATCATATCCACCATGATGATGATGATGTTCTTCTTTCTCATGATCCTGTCCCTCATGTTCATGCTCTTCCCCTTGCTCGAGATGCTCAGTTAAAAGCTTTGCTTTATc > 2:643271/1‑140 (MQ=255) tGGTTAATTTTAGGATCTAACCATACGTGTGGATCATATCCACCATGATGATGATGATGTTCTTCTTTCTCATGATCATGTCCCTCATGTTCATGCTCTTCACCATGCTCGTGTTGATCAGTTCAAAGCTTTGCTTTATc > 2:466260/1‑140 (MQ=255) ggTTAATTTTAGGATCTAACCATTCGTGTGGATCATATCCACAATGATGATGATGATGTTCTTCTTTCTCATGATCATGTCCCTCATGTTCATGCTCTTCACCATGCTCGTCTTGATCAGTTAAAAGCTTTGCTTTATcc > 2:370146/1‑139 (MQ=255) ggTTAATTTTAGGATCTAACCATACGTGTGGATCATATCCACCATGATGATGATGATGTTCTTCTTTCTCATGATCATGTCCCTCATGTTCATGCTCTTCACCATGCTCGTGTTGATCAGTTAAAAGCTTTTCTTTATCt > 2:404975/1‑140 (MQ=255) gTTATTTTTAGGATCTAAGCATACGTTTGGTTCATATCCACCATGATGATGATGATGTTCTTCTTTCTCATGATCATTTGCCTCATGTTCATGCTCTTCTCCATTCTTGTGTTGATCAGTTAAAAGCTTTGCTTTATCTa < 2:182957/140‑1 (MQ=255) gTTAATTTTAGGATCTAACCATACGTGTGGATCATATCCACCATGATGATGATGATGTTCTTCTTTCTCATGATCATGTCCCTCATGTTCATGCTCTTCACCATGCTCGTGTTGATCAGTTAAAAGCTTTGCTTAATCTa > 2:416456/1‑140 (MQ=255) gTTAACTTTTGAATCTAACCATACGTGTGTATCATATCCGCGATTATGATGATTATGTTCTTCTTTCTCATGATCATGTCCCTCATGTTCTTTCTCTTCACCATGCTCGTGTTGATCAGTTAAACGCTTTGCTTTATCTa < 2:542434/140‑1 (MQ=255) ttAATTTTAGTATCTAACCATACGTGTGGATCATATCCACCATGATGATGATGATGTTCTTCTTTCTCATGATCATGTCCCTCATGTTCATGCTCTTCACCATGCTCGTGTTGATCAGTTAAAAGCTTTGCTTTATCTaa < 2:520322/140‑1 (MQ=255) ttAATTTTAGGATCTAACCATACGTGTGGATCATATCCACCATGATGATGATGATGTTCTTCTTTCTCATGATCATGTCCCTCATGTTCATGCTCTTCACCATGCTCGTGTTGATCAGTTAAAAGCTTTGCTTTATCTaa < 2:513064/140‑1 (MQ=255) tAATCTTAGGATCTAACCATACGTGTGGATCATATCCACCATGATGATGATGATGTTCTTCTTTCTCATGATCATGTCCCTCATGTTCATGCTCTTCACCATGCTCGTGTTGATCAGTTAAAAGCTTTGCTTTATCTAAt < 1:378851/140‑1 (MQ=255) aaTTTTAGGATCTAACCATACGTGTGGATCATATCCACCATGATGATGATGATGTTCTTCTTTCTCATGATCATGTCCCTCGTGTTCATGCTCTTCACCATGCTCGTGTTGATCAGTTAAAAGCTTTGCTTTATCTAAtt < 2:356937/140‑1 (MQ=255) taagATCTAACCATACGTGTGGATCATATCCACCATGATGATGATGATGTTCTTCTTTCTCATGATCATGTCCCTCATGTTCATGCTCTTCACCATGCTCGTGTTGATCAGTTAAAAGCTTTGCTTTATCTAATTTATcc < 1:281883/137‑1 (MQ=255) ggATCTAACCATACGTGTGGATCATATCCACCATGATGATGATGATGTTCTTCTTTCTCATGATCATGTCCCTCATGTTCATGCTCTTCACCTTGCTCGTGTTGATCAGTTAAAAGCTTTGCTTTATCTAATTTATCctc < 2:237011/140‑1 (MQ=255) ggATCTAACCATACGTGTGGATCATATCCACCATGATGATGATGATGTTCTTCTTTCTCATGATCATGTCCCTCATGTTCATGCTCTTCACCATGCTCGTGTTGATCAGTTCAAAGCTTTGCTTTATCTCATTTATCctc > 1:309791/1‑140 (MQ=255) ggATCTAACCATACGTGTGGATCATATCCACCATGATGATGATGATGTTCTTCTTTCTCATGATCATGTCCCTCATGTTCATGCTCTTCACCATGCTCGTGTTGATCAGTTAAAAGTTTTGCTTTATCTCATTTATCctc > 1:682804/1‑140 (MQ=255) gATCTAACCATACGTGTGGATCATATCCACCATGATGATGATGATGTTCTTCTTTCTCATGATCATGTCCCTCATGTTCATGCTCTTCACCATGCTCGTGTTGATCAGTTAAAAGCTTTGCTTTATCTAATTTATCctct < 1:442884/140‑1 (MQ=255) atatAAGCATATGTTTGGATCATATCCACCATGATGATGATGATGTTCTTCTTTCTCATGATTATGTACCTCATTTTCATGCTCTTCACCATGCTCGTGTTGATCAGTTAAAAGCTTTGCTTTATCTAATTTATCCTCTa < 2:704707/137‑1 (MQ=255) tCTAACCATACGTGTGGATCATATCCACCATGATGATGATGATGTTCTTCTTTCTCATGATCATGTCCCTCATGTTCATGCTCTTCACCATGCTCGTGTTTATCAGTTAAACGCTCTGCTTTATCTAATTTATCCTCTac > 1:368935/1‑139 (MQ=255) aaCCATACGTGTGGATCATATCCACCATGATGATGATGATGTTCTTCTTTCTCATGATCATGTCCCTCATGTTCATGCTCTTCACCATGCTCGTGTTGATCAGTTAAAAGCTTTGCTTTATCTAATTTATCCTCTAAAGa > 1:602349/1‑140 (MQ=255) aaCCATACGTGTGGATCATATCCACCATGATGATGATGATGTTCTTCTTTCTCATGATCATGTCCATCATATTGATGTTTTTGAGCAACCCCCAGTTGATCATTTAAAAGACATGCATTATCTAATTTATCCTCTAAAGa > 1:132193/1‑140 (MQ=255) ccATACGTGTGGATCATATCCACCATGATGATGATGATGTTCTTCTTTCTCATGATCATGTCCCTCATGTTCATGCTCTTCACCATGCTCGTGTTGATCAGTTAAAAGCTTTGCTTTATCTAATTTATCCTCTAAAGACa > 1:543538/1‑140 (MQ=255) ggATCATATCCACCATGATGATGATTATGTTCTTCTTTCTCATGATCATGTCCCTCATGTTCATGCTCTTCACCATGCTCGTGTTGATCAGTTAAAAGCTTTGCTTTATCTAATTTATCCTCTAAAGACAGTTTtttatc < 2:371173/140‑1 (MQ=255) ggATCATATCCACCATGATGATGATGATGTTCTTCTTTCTCATGATCATGTCCCTCATGTTCATGCTCTTCACCATGCTCGTGTTGATCAGTTAAAAGCTTTGCTTTATCTAATTTATCCTCTAAAGACAGTTTtttatc < 2:507452/140‑1 (MQ=255) ggATCATATCCACCATGATGATGATGATGTTCTTCTTTCTCATGATCATGTCCCTCATGTTCATGCTCTTCACCATGCTCGTGTTGATCAGTTAAAAGCTTTGCCTTATCTAATTTATCCTCTACATACAGTCAtttatc > 2:475938/1‑140 (MQ=255) cATATCCACCATGATGATGATGATGTTCTTCTTTCTCATGATCATGTCCCTCATGTTCATGCTCTTCACCATGCTCGTGTTGATCAGTTAAAAGCTTTGCTTTATCTAATTTATCCTCTAAAAACAGTTTtttatctttg > 2:379939/1‑139 (MQ=255) atatCCACCATGATGATGATGATGTTCTTCTTTCTCATGATCATGTCCCTCATGTTCATGCTCTTCACCATGCTCGTGTTGATCAGTTAAAAGCTTTGCTTTATCTAATTTATCCTCTAAAGACAGTTTtttatctttat < 2:374944/140‑1 (MQ=255) tCCACCATGATGATGATGATGTTCTTCTTTCTCATGATCATGTCCCTCATGTTCATGCTCTTCACCATGCTCGTGTTGATCAGTTAAAAGCTTTGCTTTATCTAATTTATCCTCTAAAGACAGTTTTTtatctttatctt < 2:150920/140‑1 (MQ=255) tatccaccATGATGATGATGTTCTTCTTTCTCATGATCATGTCCCTCATGTTCATGCTCTTCACCATGCTCGTGTTGATCAGTTAAAAGCTTTGCTTTATCTAATTTATCCTCTAAAGACAGTTTTTTatctttatcttt > 1:169449‑M1/9‑140 (MQ=255) caccaTGATGATGATGATGTTCTTCTTTCTCATGATCATGTCCCTCATGTTCATGCTCTTCACCATGCTCGTGTTGATCAGTTAAAAGCTTTGCTTTATCTAATTTATCCTCTAAAGACAGTTTTTTATCTTTATCTTTg > 1:574338/1‑140 (MQ=255) caccaTGATGATGATGATGTTCTTCTTTCTCATGATCATGTCCCTCATGTTCATGCTCTTCACCATGCTCGTGTTGATCAGTTAAAAGCTTTGCTTTATCTAATTTATCCTCTAAAGACAGTTTTTTATCTTTATCTTTg < 2:344798/140‑1 (MQ=255) ccaTGATGATGATGATGTTCTTCTTTCTCATGATCATGT‑CCTCATGTTCATGCTCTTCACCATGCTCGTGTTGATCAGTTAAAAGCTTCGCTTTATCTAATTTATCCTCTAAAGACAGTTTTTTATCTTTATCTTTGAta < 2:389740/140‑1 (MQ=255) tgatgatgatgatgTTCTTCTTTCTCATGATCATGTCCCTCATGTTCATGCTCTTCACCATGCTCGTGTGGATCAGTTAAAAGCTTTGCTTTATCTAATTTATCCTCTAAAGACAGTTTTTTATCTTTATCTTTGAtagt > 2:567168/1‑140 (MQ=255) ATGATGATGATGTTCTTCTTTCTCATGATCATGTCCCTCATGTTCATGCTCTTCACCATGCTCGTGTTGATCAGTTAAAAGCTTTGCTTTATTTAATTTATCCTCTAAAGACAGTTTTTTATCTTTATCTTTGAtagtag < 2:694855‑M1/140‑1 (MQ=255) | TAATTTTTTGTAGTTTTTCTCATAGTCATCTTTATGTTTTGGATCTTTTTTCACTAATTCATCTTTAATTTCTTTAGCGAAAGTTTGGTTAATTTTAGGATCTAACCATACGTGTGGATCATATCCACCATGATGATGATGATGTTCTTCTTTCTCATGATCATGTCCCTCATGTTCATGCTCTTCACCATGCTCGTGTTGATCAGTTAAAAGCTTTGCTTTATCTAATTTATCCTCTAAAGACAGTTTTTTATCTTTATCTTTGATAGTAG > USA300TCH1516_ALE/2529365‑2529636 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |