| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000731 | 21020 = | 135 (0.240) | 5 (0.020) | 4/268 | 8.6 | 4.9% | coding (51/675 nt) | USA300HOU_pUSA300HOUMR0027 | IS431mec transposase |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 36498 = | 63 (0.840) | coding (54/675 nt) | USA300HOU_RS00140 | hypothetical protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 145 total aligned reads displayed.
TAGCTCAATGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTATTTTATGAGTACACTCTAAATTAAGGAGATG > CP000731/20988‑21160 | tAGCTCAATGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTTTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGt < 2:119880/141‑1 (MQ=14)tAGCTCAATGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGt < 1:377830/141‑1 (MQ=31)tAGCTCAATGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGt > 1:80268/1‑141 (MQ=31)tAGCTCAATGCATATCTGAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATAGCTGAAAGAGGTCATACAGAAGACTCCGGTTTGGTAAAATGATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGt < 2:217031/141‑1 (MQ=11) gCTCAATGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACCTCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTAt > 1:307584/1‑141 (MQ=17) gCTCAATGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATCGTTCATACAGCAGACTCCTTTTTGTTACACTTATATTATAAATTCAACTTTGCAGCCGAACCGTAt > 2:633552/1‑141 (MQ=11) gCTCAATGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTACAATTATCTTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTAt > 2:47641/1‑141 (MQ=17) gCTCAATGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTAt > 2:850225/1‑141 (MQ=32) gCTCAATGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTAt > 2:757810/1‑141 (MQ=32) gCTCAATGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTAt > 2:152213/1‑141 (MQ=32) gCTCAATGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTAt > 1:751190/1‑141 (MQ=32) gCTCAATGCATATCTTAGATAATAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCAGACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTAt > 1:476103/1‑141 (MQ=17) cTCAATGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTCAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTAtt > 1:439403/1‑141 (MQ=18) cTCAATGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTAtt > 2:613977/1‑141 (MQ=33) atCAATGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTAtt > 2:427776/2‑141 (MQ=18) tCAATGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTAttt > 1:877147/1‑141 (MQ=34) cAATGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTAtttt > 1:516695/1‑141 (MQ=35) aaTGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTATTTTa < 1:198651/141‑1 (MQ=35) aTGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTATTTTAt > 2:340855/1‑141 (MQ=37) aTGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTATTTTAt > 1:887113/1‑141 (MQ=37) aTGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTATTTTAt < 2:292012/141‑1 (MQ=37) aTGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTATTTTAt < 2:872316/141‑1 (MQ=37) tGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTATTTTATg < 2:804033/141‑1 (MQ=38) tGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTATTTTATg < 2:712107/141‑1 (MQ=38) agCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTATTTTATg < 2:729756/140‑1 (MQ=38) gCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGCCTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTATTTTATGa < 2:454343/141‑1 (MQ=38) gCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTATTTTATGa < 2:603694/141‑1 (MQ=38) gCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTATTTTAGGa < 2:108955/141‑1 (MQ=25) gCATATCGTAGCTAGTAGCCAACGGCTACAGTGCTAACATCCTTGTTAAATTGCTCATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAGATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTATTTTATGa < 2:505305/141‑1 (MQ=14) cATATCTTAGATAGTAGCCAATGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTATTTTATGAg < 1:769676/141‑1 (MQ=255) ttttCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTATTTTATGAGt < 1:717018/138‑1 (MQ=255) atatCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTTAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACATAACCGTATTTTATTAGt > 2:111142/1‑141 (MQ=255) atatCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTATTTTATGAGt < 1:82265/141‑1 (MQ=38) tatCTTAGATCGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTGCTATCGGTGAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTATTTTATGAGtc > 1:669563/1‑140 (MQ=14) tatCTTAGATAGTAGCCAACGGCTAAAGTTTTAACTTCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAAAAGAACCGTATTTTATGAGTa > 1:678058/1‑141 (MQ=14) atCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAGCATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTATTTTATGAGTac < 1:618461/141‑1 (MQ=255) atCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCACCAGAACAGTATTTTATGAGTaa > 1:809573/1‑140 (MQ=255) atCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTATTTTATGAGTac > 1:444036/1‑141 (MQ=40) atCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTATTTTATGAGTac > 1:509233/1‑141 (MQ=40) tCTTGGATAGTAGCCAACGGTTACAGTGAGAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTATTTTATGAGTata < 2:384859/141‑3 (MQ=255) tCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTATTTTATGAGTaca < 2:832788/141‑1 (MQ=40) cTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATACCATCCTTGTTAATTTGTTCATAACCGAAATAGTTAATACAGAAGAATATTTTTTGTTAAAATTATATTATCAATTCAACTTTGCAACAGAACTGTCTTTAATGAGTacat > 2:326821/1‑140 (MQ=11) cTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGACAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATTTTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTATTTTATGAGTacac < 1:522675/141‑1 (MQ=255) tAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTATTTTATGAGttttctt > 1:116680/1‑135 (MQ=255) tAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTATTTTATGAGTACActc < 2:855131/141‑1 (MQ=255) tAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTATTTTATGAGTACActc < 1:361346/141‑1 (MQ=255) tAGATAGTAGCAAACGGCTACAGTGATAACATACTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTATTTTATGAGTACActc < 1:8006/141‑1 (MQ=255) aGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTATTTTATGAGTACActct > 2:2004/1‑141 (MQ=255) gATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTATTTTATGAGTACACTCTa < 1:614665/141‑1 (MQ=255) aTAGTAGCCAACGGCTACAGTGATCACCTGCTGGATAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTATTTTATGAGTACACTCTaa > 1:219741/1‑141 (MQ=14) aTAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAACTAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTATTTTATGAGTACACTCTaa > 1:614704/1‑141 (MQ=255) aTAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTATTTTATGAGTACACTCTaa < 1:509036/141‑1 (MQ=255) tagtagCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTATTTTATGAGTACACTCTaaa > 1:756187/1‑141 (MQ=255) agtagCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGCAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTATTTTATGAGTACACTCTAAAt > 1:117782/1‑141 (MQ=255) agtagCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTATTTTATGAGTACACTCTAAAt < 1:49648/141‑1 (MQ=255) agtagCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTATTTTATGAGTACACTCTAAAt < 2:29068/141‑1 (MQ=255) agtagCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTATTTTATGAGTACACTCTAAAt > 1:605452/1‑141 (MQ=255) agtagCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTACATTATAGATTCAACTTTGCAACAGAACCGTATTTTATGAGTACACTCTAAAt < 1:179151/141‑1 (MQ=255) agtagCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATACCTGAAATAGTTCATACCGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTGAACTTTGCAACAGAACCGTATTTTATGGGAACACTCTAAAt > 1:265194/1‑141 (MQ=14) gtagCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACGGTATTTTCTGAGTACACTCTAAAtt > 1:9327/1‑141 (MQ=255) gtagCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTATTTTATGAGTACACTCTAAAtt > 2:671072/1‑141 (MQ=255) gtagCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTATTTTATGAGTACACTCTAAAtt > 2:386355/1‑141 (MQ=255) gtagCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTATTTTATGAGTACACTCTAAAtt < 1:325962/141‑1 (MQ=255) gtagCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTATTTTATGAGTACACTCTAAAtt > 1:801206/1‑141 (MQ=255) gtagCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAAACGTATTTTATGAGTACACTCTAAAtt > 2:745618/1‑141 (MQ=255) gtagCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTATGAAATTGTTTATCTCTGAAATAGATCATCCAGGAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTCTGCAACAGAACAGTATTTTATAAGTACACTCCAAAta > 2:22815/1‑140 (MQ=14) gtagCCAACGGCTAAAGTCAGAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGCAATAGTTCATACAGAAGATTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAGTTCAACTTTGCAACAGAACCGTATTTTATGAGTACACTCTAAAtt < 1:94313/141‑1 (MQ=17) gtagCCAACCGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTATTTTATGAGTACACTCTAAAtt < 2:924625/141‑1 (MQ=255) atagCCATCGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTATTTTATGAGTACACTCTAAAtt < 2:498652/140‑1 (MQ=255) tagCCACCGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGTAACAGAACCGTATTTTATGAGTACACTCTAAATTa < 1:515410/141‑1 (MQ=255) tagCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTTTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTATTTTATGAGTACACTCTAAATTa < 1:524449/141‑1 (MQ=255) tagCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTATTTTATGAGTACACTCTAAATTa < 1:309222/141‑1 (MQ=255) tagCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTATTTTATGAGTACACTCTAAATTa < 2:833136/141‑1 (MQ=255) gCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTATTTTATGAGTACACTCTAAATTAAg < 2:7813/141‑1 (MQ=255) gCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTCCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTATTTTATGAGTACACTCTAAATTAAg > 2:545939/1‑141 (MQ=255) gCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATACTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTATTTTATGAGTACACTCTAAATTAAg < 2:609868/141‑1 (MQ=255) ccgttggCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTATTTTATGAGTACACTCTAAATTAAgg > 2:124807/6‑141 (MQ=255) ccAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTATTTTATGAGTACACTCTAAATTAAgg > 2:141315/1‑141 (MQ=255) ccAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTATTTTATGAGTACACTCTAAATTAAgg > 2:115822/1‑141 (MQ=255) ccAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTATTTTATGAGTACACTCTAAATTAAgg > 1:601801/1‑141 (MQ=255) cAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTTTTTTTTTTTTATTATAAATACAACTTTGCAACAGAACCGTATTTTATGAGTACACACTAAATTAAGga > 2:674056/1‑141 (MQ=17) cAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTCTTTTATGAGTAAACTCTAAATTAAGga > 2:433258/1‑141 (MQ=255) cAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTATTTTATTAGTACACTCTAAATTAAGga > 2:167637/1‑141 (MQ=255) aaCGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTTTTTTTTTTTTATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTATTTTTTGAGAACCTCCGCAATTAAGgaa > 2:213617/1‑140 (MQ=11) aaCGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTATTTTATGAGTACACGCTAAATTAAGgag > 1:214839/1‑141 (MQ=255) ttggCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTATTTTATGAGTACACTCTAAATTAAGgaga > 1:414523/3‑141 (MQ=255) ttggCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTAGTTATTGAGTACACTCTAAATTAAGgaga > 2:646114/3‑141 (MQ=255) aCGGCTACAGTGATAACATCCTTTTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTATTTTATGAGTACACTCTAAATTAAGgaga < 2:536685/141‑1 (MQ=255) aCGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTATTTTATGAGTACACTCTAAATTAAGgaga < 2:707941/141‑1 (MQ=255) aCGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTATTTTATGAGTACACTCTAAATTAAGgaga < 1:654944/141‑1 (MQ=255) aCGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTATTTTATGAGTACACTCTAAATTAAGgaga < 2:429792/141‑1 (MQ=255) aCGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTATTTTATGAGCACACTCTAAATTAAGgaga < 1:506611/141‑1 (MQ=255) aCGGCTACAGTGATAACATCCTTGGTAAATTGTTTAGATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAATTTTTCAACAGAACCGTATTTTATGAGTACACTCTAAATTAAGgaga < 1:775428/141‑1 (MQ=255) cGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTTTAAGATGAGTACACTCTAAACTAAGGAGAt < 1:677830/141‑1 (MQ=14) cGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTATTTTATGAGTACACTCTAAATTAAGGAGAt > 1:414340/1‑141 (MQ=255) ggCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTATTTTATGAGTACACTCTAAATTAAGGAGAta > 2:76809/1‑140 (MQ=255) ggCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTATTTTATGAGTACACTCTAAATTAAGGAGATg < 2:73047/141‑1 (MQ=255) ggCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTATTTTATGAGTACACTCTAAATTAAGGAGATg > 1:233119/1‑141 (MQ=255) ggCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTATTTTATGAGTACACTCTAAATTAAGGAGATg > 1:722947/1‑141 (MQ=255) ggCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTATTTTATGAGTACACTCTAAATTAAGGAGATg > 1:117032/1‑141 (MQ=255) | TAGCTCAATGCATATCTTAGATAGTAGCCAACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATATTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTATTTTATGAGTACACTCTAAATTAAGGAGATG > CP000731/20988‑21160 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |