| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000731 | 21020 = | 135 (0.240) | 5 (0.020) | 4/268 | 8.6 | 4.9% | coding (51/675 nt) | USA300HOU_pUSA300HOUMR0027 | IS431mec transposase |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 36498 = | 63 (0.840) | coding (54/675 nt) | USA300HOU_RS00140 | hypothetical protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
TCTTCCAAATTTGATACAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGACCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCCCTTAATATTTCAGATATATCACGATAACTCAATGTATATCTTAGATAGTAGCC‑AACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATACTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTATTATGGAATAGAGATGTTGGTAACAT > USA300TCH1516_ALE/36362‑36636 | tcttcCAAATTTGATACAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGACCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCCCTTAATATTTCAGATATATCACGATAACTCAATGTATATCTTAGATAGTAGCC‑AAAgg > 2:365563/1‑141 (MQ=25) cttcCAAATTTGATACAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGACCGTTGAATGATGAACGTTTACCCCACGTTCCCTTAATATTTCAGATATATCACGATAACTCAATGTATATCTTAGATAGTAGCC‑AACGGc > 1:31531/1‑141 (MQ=25) ccAAATTTGCGACAAAATTGGGGCGTATTCTTGAACCCAACGGTAGACCGGTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCCCTTAATATTTCAGATATATCACGATAACTCAATGTGTATCTTAGATAGTAGCC‑AACGGCtgc > 1:675654/1‑139 (MQ=11) ccAAATTTGATACAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGACCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCCCTTAATATTTCAGATATATCACGATAACTCAATGTATATCTTAGATAGTAGCC‑AACGGCTAc > 2:582482/1‑141 (MQ=35) ccAAATTTGATACAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGACCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCCCTTAATATTTCAGATATATCACGATAACTCAATGTATATCTTAGATAGTAGCC‑AACGGCTAc > 2:782970/1‑141 (MQ=35) cAAATTTGATACAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGACCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCCCTTAATATTTCAGATATATCACGATAACTCAATGTATATCTTAGATAGTAGCC‑AACGGCTACa > 1:571913/1‑141 (MQ=35) aTACAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGACCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCCCTTAATATTTCAGATATATCACGATAACTCAATGTATATCTTAGATAGTAGCC‑AACGGCTACAGTGATAAc < 2:260556/141‑1 (MQ=34) tgtgggCCTTTTATTGGACCCAACGGTAGACCGTTGAATGCTGAACGTTTGCACCACGTTCCCTTAATATTTCAGATATATCACGATAACTCAATGTATATCTTAGATAGTAGCC‑AACGGCTACAGTGATAACATGCtttt < 2:109460/138‑3 (MQ=11) tGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGACCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCCCTTAATATTTCAGATATATCACGATAACTCAATGTATATCTTAGATAGTAGCC‑AACGGCTACAGTGATAACATCCTTGtt > 1:161814/1‑141 (MQ=32) ggggCATATTCTTGAACCCAACGGTAGACCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCCCTTAATATTTCAGATATATCACGATAACTCAATGTATATCTTAGATAGTAGCC‑AACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTa < 2:571913/141‑1 (MQ=32) gCATATTCTTGAACCCAACGGTAGACCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCCCTTAATATTTCAGATATATCACGATAACTCAATGTATATCTTAGATAGTAGCC‑AACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAAt > 1:870403/1‑141 (MQ=32) tatTCTTGAACCCAACGGTAGACCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCCCTTAATATTTCAGATATATCACGATAACTCAATGTATATCTTAGATAGTAGCC‑AACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGt < 1:830104/141‑1 (MQ=32) ttGAACCCAACGGTAGACCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCCCTTAATATTTCAGATATATCACGATAACTCAATGTATATCTTAGATAGTAGCC‑AACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTtata > 1:742686/1‑141 (MQ=32) accccAACGGTAGACCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCCCTTAATATTTCAGATATATCACGATAACTCAATGTATATCTTAGATAGTAGCC‑AACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCt < 2:37512/139‑1 (MQ=17) aaCCCAACGGTAGACCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCCCTTAATATTTCAGATATATCACGATAACTCAATGTATATCTTAGATAGTAGCC‑AACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCt > 2:138451/1‑141 (MQ=32) cccAACGGTAGACCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCCCTTAATATTTCAGATATATCACGATAACTCAATGTATATCTTAGATAGTAGCC‑AACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGa < 2:414485/141‑1 (MQ=32) aCGGTAGACCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCCCTTAATATTTCAGATATATCACGATAACTCAATGTATATCTTAGATAGTAGCC‑AACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATa > 1:155807/1‑141 (MQ=32) ggTAGACCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCCCTTAATATTTCAGATATATCACGATAACTCAATGTATATCTTAGATAGTAGCC‑AACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGt < 2:122296/141‑1 (MQ=32) gACCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCCCTTAATATTTCAGATATATCACGATAACTCAATGTATATCTTAGATAGTAGCC‑AACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCAt > 1:137085/1‑141 (MQ=32) cGTTGAATGATGACCGTTTACACCACGTCCCCTTAATATTTCAGATATATCACGATAACTCAATGTATATCTTAGATAGTAGCC‑AACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACa < 1:730614/141‑1 (MQ=17) cGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCCCTTAATATTTCAGATATATCACGATAACTCAATGTATATCTTAGATAGTAGCC‑AACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACa < 1:91086/141‑1 (MQ=32) ttGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCCCTTAATATTTCAGATATATCACGATAACTCAATGTATATCTTAGATAGTAGCC‑AACGGCTACAGTGATAACATCCTGGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACaga > 1:781053/1‑141 (MQ=17) gAATGATGAACGTTTACACCACGTTCCCTTAATATTTCAGATATATCACGATAACTCAATGTATATCTTAGATAGTAGCC‑AACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACagaag < 2:742686/141‑1 (MQ=32) gAATGATGAACGTTTACACCACGTTCCCTTAATATTTCAGATATATCACGATAACTCAATGTATATCTTAGATAGTAGCC‑AACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACaaaag > 1:847365/1‑141 (MQ=17) gatgaACGTTTACACCACGTTCCCTTAATATTTCAGATATATCACGATAACTCAATGTATATCTTAGATAGTAGCC‑AACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTc < 1:586389/141‑1 (MQ=32) gaACGTTTACACCACGTTCCATTAATATTTCAGATATATCACGATAACTCAATGTATATCTTAGATAGTAGCC‑AACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCtt > 1:556552/1‑141 (MQ=17) tttACACCCCGTTCCCTTAATATTTCAGATATATCACGATAACTCAATGTATATCTTAGATAGTAGCC‑AACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGt < 1:431500/141‑1 (MQ=17) ttACACCACGTTCCCTTCATATTCCCGATATATCACGACACCTCGTAGTATAGCTTAGATAGTCGCCGTACCGAT‑GATGGATCCCCTCTCCTCTGAATTGGTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGtt < 1:910484/141‑1 (MQ=2) acacCACGTTCCCTTAATATTTCAGATATATCACGATAACTCAATGTATATCTTAGATAGTAGCC‑AACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTaa < 2:582165/141‑1 (MQ=32) acacCACGTTCCCTTAATATTTCAGATATATCACGATAACTCAATGTATATCTTAGATAGTAGCC‑AACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTaa < 2:567852/141‑1 (MQ=32) tCCCTTAATATTTCAGATATATCACGATAACTCAATGTATATCTTAGATAGTAGCC‑AACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATACt > 1:237146/1‑141 (MQ=32) cccTTAATATTTCAGATATATCACGATAACTCAATGTATATCTTAGATAGTAGCC‑AACGGCGACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCGTACAGAAGACTCCTTTGTGTTGATATTTTGCta > 1:294670/1‑141 (MQ=11) ttAATATTTCAGATATATCACGATAACTCAATGTATATCTTAGATAGTAGCC‑AACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAACTAGTTCGTACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATACTATaa > 1:859433/1‑141 (MQ=18) ttAATATTTCAGATATATCACGATAACTCAATGTATATCTTAGATAGTAGCC‑AACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATACTATaa > 1:55838/1‑141 (MQ=33) atatTGCAGATATATCACGATAACTCAATGTATATCTTAGATAGTAGCC‑TCCGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATACTATAAAtt < 1:25905/141‑1 (MQ=255) tCAGATATATCACGATAACTCAATGTATATCTTAGATAGTAGCC‑AACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATACTATAAATTCaaat > 1:95159/1‑139 (MQ=21) aGATATATCACGATAACTCAATGTATATCTTAGATAGTAGCC‑AACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATACTATAAATTCAACttt < 2:52433/141‑1 (MQ=35) atatatCACGATAACTCAATGTATATCTTAGATAGTAGCC‑AACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGGCGCCTTTGTGTTAGAATTATACTATAAATTCAACTTTGc < 1:138451/141‑1 (MQ=255) atatatCACAATAACTCAATGTATATCTTAGATAGTAGCC‑AACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATACTATAAATTCAACTTTGc < 1:273971/141‑1 (MQ=21) aatatCACGATAACTCAATGTATATCTTAGATAGTAGCC‑AACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATACTATAAATTCAACTTTGCa < 2:68584/140‑1 (MQ=21) atCACGATAACTCAATGTATATCTTAGATAGTAGCC‑AACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATACTATAAATTCAACTTTGCAACa < 2:540028/141‑1 (MQ=35) atCACGATAACTCAATGTATATCGTAGATAGTAGCC‑AACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATACTATAAATTCAACTTTGCAACa < 2:27605/141‑1 (MQ=21) tCACGATAACTCAATGTATATCTTAGATAGTAGCC‑AACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATACTATAAATTCAACTTTGCAACAg < 2:576110/141‑1 (MQ=34) tCACGATAACTCAATGTATATCTTAGATAGTAGCC‑AACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATACTATAAATTCAACTTTGCAACAg < 1:244902/141‑1 (MQ=34) tCACGATAACTCAACGTATATCTTAGATAGTAGCC‑AACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATACTATAAATTCAACTTTGCAACAg < 1:447938/141‑1 (MQ=21) cACGATAACTCAATGTATATCTTAGATAGTAGCC‑AACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATACTATAAATTCAACTTTGCAACAGa > 1:787490/1‑141 (MQ=35) cGATAACTCAATGTATCTCATAGATAGTAGCC‑AACGGCCACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATGCAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATACTATAAATTCAACTTTGCAACAGAAc > 1:514394/1‑141 (MQ=255) tAACTCAATGTATATCTTAGATAGTAGCC‑AACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATACTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGt < 1:57595/141‑1 (MQ=37) aaCTCAATGTATATCTTAGATAGTAGCC‑AACGCCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGCCGACTCCTTTTTGTTAAAATTATACTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGta < 1:616440/141‑1 (MQ=255) aCTCAATGTATATCTTAGATAGTAGCC‑AACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATACTATAAATTCAACTTTGCCACCGAACCGtat > 2:743333/1‑141 (MQ=25) cTCAATGTATATCTTAGATCGTAGCC‑AACGGCTACAGAGATAACATCCTTGTTAAATTGCTTATATATGAAATAATTCCTACAGAACACTCATTTTTGTTAGAATTATACTATAACTTCAACTTTGCAACAGAACCGtatt > 2:550193/1‑141 (MQ=11) cTCAATGTATATCTTAGATAGTAGCC‑AACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTTTTTATATTATACTATAAATTCAACTTTACAACAGAACCGtatt > 2:149258/1‑141 (MQ=255) cTCAATGTATATCTTAGATAGTAGCC‑AACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATACTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGtatt > 2:673680/1‑141 (MQ=35) aTGTATATCTTAGATAGTAGCC‑AACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATACTATAAATTCAACTTTGAAACAGAACCGTATTATgg > 2:85010/1‑141 (MQ=38) gtatCTTAGATAGTAGCC‑AACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATACTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTATTATGGAATa < 2:921587/140‑1 (MQ=39) atatCTTAGATAGTAGCC‑AACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATACTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTATTATGGAATa < 1:317818/141‑1 (MQ=38) tatCTTAGATAGTAGCC‑AACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATACTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTATTATGGAATag > 2:639170/1‑141 (MQ=40) tatCTTAGATAGTAGCC‑AACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATACTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTATTATGGAATag < 2:847365/141‑1 (MQ=40) ttAGATAGTCGCC‑AACGGCTACAGTGATAACATTCTTTTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTGCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATACTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTATTATGGAATAGAGAt < 1:622994/141‑1 (MQ=255) ttAGATAGTAACC‑TACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTATATTTTTTTTATCTGAAATAGTTCATACCGAAGACTCCTTTTTGTTAAACTTATACTATACATTCATCTTTGCAACAGAACCGTAGTATGGAATAGAGAt < 2:781053/141‑1 (MQ=14) aGATAGTAGCC‑AACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATACTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTATTATGGAATAGAGATGt > 2:431759/1‑141 (MQ=255) gATAGTAGCC‑AACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATACTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTATTATGGAATAGAGATGtt > 1:397966/1‑141 (MQ=255) tagtagCC‑AACGGCTACAGTGATAACAGCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATACTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTATTATGGAATAGAGATGTTgg < 1:436043/141‑1 (MQ=255) gtagCC‑AACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATACTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTATTATGGAATAGAGATGATGGTa > 1:871537/1‑141 (MQ=255) agCC‑AACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATACTTTAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTATTATGGAATAGAGATGTTGGTAAc > 2:754275/1‑141 (MQ=255) agCC‑AACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATACTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTATTATGGAATAGAGATGTTGGTAAc > 1:535236/1‑141 (MQ=255) gCC‑AACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATACTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTATTATGGAATAGAGATGTTGGTAACa < 2:155807/141‑1 (MQ=255) cc‑AACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATACTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTATTATGGAATAGAGATGTTGGTAACAt > 1:593061/1‑141 (MQ=255) cc‑AACGGCTACAGTGATAACATCCTTCTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATACTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTATTATGGAATAGAGCTGTTTGTAACAt > 2:550812/1‑141 (MQ=255) | TCTTCCAAATTTGATACAAAATTGGGGCATATTCTTGAACCCAACGGTAGACCGTTGAATGATGAACGTTTACACCACGTTCCCTTAATATTTCAGATATATCACGATAACTCAATGTATATCTTAGATAGTAGCC‑AACGGCTACAGTGATAACATCCTTGTTAAATTGTTTATATCTGAAATAGTTCATACAGAAGACTCCTTTTTGTTAAAATTATACTATAAATTCAACTTTGCAACAGAACCGTATTATGGAATAGAGATGTTGGTAACAT > USA300TCH1516_ALE/36362‑36636 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |