| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 1262909 | 79 (0.890) | 3 (0.040) | 3/258 | 11.0 | 3.8% | intergenic (+34/‑193) | sucD/lytN_1 | Succinate‑‑CoA ligase [ADP‑forming] subunit alpha/putative cell wall hydrolase LytN |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 1262932 | 80 (0.970) | intergenic (+57/‑170) | sucD/lytN_1 | Succinate‑‑CoA ligase [ADP‑forming] subunit alpha/putative cell wall hydrolase LytN | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
TGGTGTGAAAACAGCGGCAACACCTTCAGAAATTGGTTCAACATTA‑ATTGAAGCTGCTAAAGAAGCAGGTATTTATGAATCATTATTAACTGTTAATAAATAAAGTTAAAAGATGATATAAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTATTTGTCGTGCGATGAATTTTAGTACACTTTTCATATTTTGGAAAGACAAGTTAATTATTTTACCTCCTACAATAGCTTTATAAAACAAAGAAAATTTTAATTAA > USA300TCH1516_ALE/1262773‑1263045 | tggtgTGAAAACAGCGGCAACACCTTCAGAAATTGGTTCAACATTA‑ATTGAAGCTGCTAAAGAAGCAGGTATTTATGAATCATCATTAACCGTTAATAAATAAAGTTAAAAGATGATATAAATGGCTATAGCCCATTCCa > 1:940695/1‑140 (MQ=255) tgtgGAAACAGCAGCAACACCTTCAGAAATTGGTTCAACATTA‑ATTTAAGCTGCTAAAGAAGCAGGTATTTATGAATCATTATTAACTGTTAATAAACAAAGTCAAAAGATGATATAAATGGCTAGAGCCCATTCCATAc > 1:708179/1‑140 (MQ=255) tgtgAAAACAGCGGCAACACCTTCAGAAATTGGTTCAACATTA‑ATTGAAGCTGCTAAAGAAGCAGGTATTTATGAATCATTATTAACTGTTAATAAATAAAGTTAAAAGATGATATAAATGGCTATAGCCCATTCCATAc < 2:201002/140‑1 (MQ=255) tgtgAAAACAGCCGCAACACCTTCAGAAATTGGTTCAACATTA‑ATTGAAGCTGCTAAAGAAGCAGGTATTTATGAATCATTATTAACTGTTAATAAAGAAAGTGAAAAGATGATATAAATGGCTAGAGCCCATTCCATAc > 1:708503/1‑140 (MQ=255) tgAAAACAGCGGCAACACCTTCAGAAATTGGTTCAACATTA‑ATTGAAGCTGCTAAAGAAGCAGGTATTTATGAATCATTATTAACTGTTAATAAATAAAGTTAAAAGATGATATAAATGGCTATAGCCCATTCCATACtt > 1:508467/1‑140 (MQ=255) aaaaCAGCGGCAACACCTTCAGAAATTGGTTCAACATTA‑ATTGAAGCTGCTAAAGAAGCAGGTATTTATGAATCATTATTAACTGTTAATAAATAAAGTTAAAAGATGATATAAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTta < 1:456416/140‑1 (MQ=255) aaaaCAGCGGCAACACCTTCAGAAATTGGTTCAACAATA‑ATTGAAGCTGCTAAAGAAGCAGGTATTTATGAATCATTATTAACTGTTAATAAATAAAGTTAAAAGATGATATAAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTta < 2:980259/140‑1 (MQ=255) aaaCAGCGGCAACACCTTCAGAAATTGGTTCAACATTA‑ATTGAAGCTGCTAAAGAAGCAGGTATTTATGAATCATTATTAACTGTTAATAAATAAAGTTAAAAGATGATATAAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTtat > 1:297498/1‑140 (MQ=255) aaaCAGCGGCAACACCTTCAGAAATTAGTCCAA‑ATTATAATGAAGCTGCTAAAGAAGCAGGTATTTATGAATCATTATTAACTGTTAATAAATAAAGTTAAAAGATGATATAAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTtat < 1:430924/140‑1 (MQ=255) cAGCGGCAACACCTTCAGAAATTGGTTCAACATTA‑ATTGAAGCTGCTAAAGAAGCAGGTATTTATGAATCATTATTAACTGTTAATAAATAAAGTTAAAAGATGATATAAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATaaa > 1:911584/1‑140 (MQ=255) aGCGGCAACACCTTCAGAAATTGGTTCAACATTA‑ATTGAAGCTGCTAAAGAAGCAGGTATTTATGAATCATTATTAACTGTTAATAAATAAAGTTAAAAGATGATATAAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATaaaa > 2:763091/1‑140 (MQ=255) cGGCAACACCTTCAGAAATTGGTTCAACATTA‑ATTGAAGCTGCTAAAGAAGCAGGTATTTATGAATCATTATTAACTGTTAATAAATAAAGTTAAAAGATGATATAAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGt > 1:109938/1‑140 (MQ=255) cacCTTCAGAAATTGGTTCAACATTA‑ATTGAAGCTGCTAAAGAAGCAGGTATTTATGAATCATTATTAACTGTTAATAAATAAAGTTAAAAGATGATATAAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGa < 2:109938/140‑1 (MQ=255) acCTTCAGAAATTGGTTCAACATTA‑AGTGAAGCTGCTAAAGAAGCAGGTATTTATGAATCATTATTAACTGTTAATAAATAAAGTTAAAAGATGATATAAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGaa < 1:447525/140‑1 (MQ=255) tCAGAAATTTGTTCAACATTA‑ATTGAAGCTGCTAAAGAAGCAGGTATTTAAGAATCATTATTAACTGTTAATAAATAAAGTTAAAAGATGATATAAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGAAATgg < 1:354498/140‑1 (MQ=255) cAGAAATTGGTTCAACATTA‑ATTGAAGCTGCTAAAGAAGCAGGTATTTATGAATCATTATTAACTGTTAATAAATAAAGTTAAAAGATGATATAAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGAAATggg < 2:577325/140‑1 (MQ=255) cgAAATTGGTTTAACATTA‑ATTGAAGCTGCTAAAGAAGCAGGTATTTATGAATCATTATTAACTGTTAATAAATAAAGTTAAAAGATGATATAAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGc < 1:438234/139‑1 (MQ=255) aaTTGGTTCAACATTA‑ATTGAAGCTGCTAAAGAAGCAGGTATTTATGAATCATTATTAATTGTTAATAAATAAAGTTAAAAGATGATATAAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATTAAAGCATCGGAAATGGGCTAt < 1:516792/140‑1 (MQ=255) aaTTGGTTCAACATTA‑ATTGAAGCTGCTAAAGAAGCAGGTATTTATGAATCATTATTAACTGTTAATAAATAAAGTTAAAAGATGATATAAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTAt < 2:666947/140‑1 (MQ=255) aaTTGGTTCAACATTA‑ATTGAAGCTGCTAAAGAAGCAGGTATTTATGAATCATTATTAACTGTTAATAAATAAAGTTAAAAGATGATATAAATGGCTATAGCCCATACCATACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTAt < 2:664279/140‑1 (MQ=255) tGGTTCAACATTA‑ATTGAAGCTGCTAAAGAAGCAGGTATTTATGAATCATTATTAACTGTTAATAAATAAAGTTAAAAGATGATATAAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTATTTg < 2:848506/140‑1 (MQ=255) cATTA‑ATTGAAGCTGCTAAAGAAGCAGGTATTTATGAATCATTATTAACTGTTAATAAATAAAGTTAAAAGATGATATAAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTATTTGTCGTGCGa < 1:95000/140‑1 (MQ=255) ttGAAGCTGCTAAAGAAGCAGGTATTTATGAATCATTATTAACTGTTAATAAATAAAGTTAAAAGATGATATAAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTATTTGTCGTGCGATGAAtt > 2:390623/1‑140 (MQ=255) ttGAAGCTGCTAAAGAAGCACGTATTTATGAATCATTATTAACTGTTAATAAATAAAGTTAAAAGATGATATAAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTATTTGTCGGGCGATGAAtt < 2:243749/140‑1 (MQ=255) ctAAAGAAGCAGGTATTTATGAATCATTATTAACTGTTAATAAATAAAGTTAAAAGATGATATAAATGGCTATAGCCCATTCAATACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTATTTCTCGTGCGATGGATTTTAGttaac > 1:829677/1‑136 (MQ=255) aaaGAAGCAGGTATTTATGAATCATTATTAACTGTTAATAAATAAAGTTAAAAGATGATATAAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTATTTGTCGTGCGATGAATTTTAGTACACtt < 2:354928/140‑1 (MQ=255) aGGTATTTATGAATCATTATTAACTGTTAATAAATAAAGTTAAAAGATGATATAAATGGCTATATCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGAACTCGGCTAATTCTTATTCGATGAATTTTAGTACAATTTTCATAtt > 2:454571/1‑140 (MQ=255) aGGTATTTATGAATCATTATTAACTGTTAATAAATAAAGTTAAAAGATGATATAAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTATTTGTCGTGCGATGAATTTTAGTACACTTTTCATAtt > 1:388203/1‑140 (MQ=255) aGGTATTTATGAATCATTATTAACTGTTAATAAATAAAGTTAAAAGATGATATAAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTATTTGTCGTGCGATGAATTTTAGTACACTTTTCATAtt > 1:351735/1‑140 (MQ=255) gTATTTATGAATCATTATTAACTGTTAATAAATAAAGTTAAAAGATGATATAAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTTACTAAAATGGGCTATTTTTCGTGCGATGAATTTTAGTACACTTTTCATAtttt > 1:188892/1‑140 (MQ=255) tATTTATGAATCATTATTAACTGTTAATAAATAAAGTTAAAAGATGATATAAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTATTTGTCGTGCGATGAATTTTAGTACACTTTTCATATTTTg > 1:760922/1‑140 (MQ=255) aTTTATGAATCATTATTAACTGTTAATAAATAAAGTTAAAAGATGATATAAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTATTTGTCGTGCGATGAATTTTAGTACACTTTTCATATTTTgg < 2:938212/140‑1 (MQ=255) aTTTATGAATCATTATTAACTGTTAATAAATAAAGTTAAAAGATGATATAAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTATTTGTCGTGCGATGAATTTTAGTACACTTTTCATATTTTgg > 1:988778/1‑140 (MQ=255) tATGAATCATTATTAACTGTTAATAAATAAAGTTAAAAGATGATATAAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTATTTGTCGTGCGATGAATTTTAGTACCCTTTTCATATCTTGGaca > 2:936390/1‑138 (MQ=255) aTGAATCATTATTAACTGTTAATAAATAAAGTTAAAAGATGATATAAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTATTTGTCGTGCGATGAATTTTAGTACACTTTTCATATTTTGGGAAg > 1:107159/1‑140 (MQ=255) aTGAATCATTATTAACTGTTAATAAATAAAGTTAAAAGATGATATAAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTATTTGTCGTGAGACAAATCGTAGTACACTTTTCATATTTTGGAAAg < 1:738332/140‑1 (MQ=255) aaactatatgaACTCTTAACAAATAAAATTAAAAGATGATATAAATGGCTATTTCCCATTCCATATTTTATAAAAGTATCGGATATTGGCTATTTGTCGTGAGATGATTTTTAGTACACTTTTCATATTTTGGAAAGACa < 2:8385/134‑1 (MQ=255) aaTCATTATTAACTGTTAATAAATAAAGTTAAAAGATGATATAAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTATTTGTCGTGCGGTGGATTTTAGTACTCTTTTGATATTTTGGAAAGGCa > 1:17092/1‑140 (MQ=255) aaTCATTATTAACTGTTAATAAATAAAGTTAAAAGATGATATAAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTATTTGTCGTGCGATGAATTTTAGTACACTTTTCATATTTTGGAAAGACa < 2:359156/140‑1 (MQ=255) aagtattaACTGTTAATAAATAAAGTTAAAAGACGATATAAATGGCTATAGCCCAATCCATACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTATTTGTTGTGCGATGAATTTTAGTTCACTTTTCATATTTTGGAAAGACAAGt < 1:349894/137‑1 (MQ=255) ttattaACTGTTAATAAATAAAGTTAAAAGATGATATAAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTATTTGTCGTGCGATGACTTTTAGTACACTTTTCATATTTTGGAAAGACAAGTTa > 2:527623/1‑140 (MQ=255) taACTGTTAATAAATAAAGTTAAAAGATGATATAAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTATTTGTCGTGCGATGAATTTTAGTACACTTTTCATATTTTGGAAAGACAAGTTAatta > 1:181609/1‑140 (MQ=255) taACTGTTAATAAATAAAGTTAAAAGATGATATAAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTATTTGTCGTGCGATGAATTTTAGTACACTTTTCATATTTTGGAAAGACAAGTTAatta > 1:787633/1‑140 (MQ=255) taACTGTTAATAAATAAAGTTAAAAGATGATATAAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTATTTGTCGTGCGATGAATTTTAGTACACTTTTCATATTTTGGAAAGACAAGTTAatta > 1:969588/1‑140 (MQ=255) aaCTGTTAATAAATAAAGTTAAAAGATGATATAAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTATTTGTCGTGCGATGAATTTTAGTACACTTTTCATATTTTGGAAAGACAAGTTAattat 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aaaGATGATCTAAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATCGAAAATGGCCCAATGGTCGTGCGATGAATCTAAGTACACTTTTCACATTTTGCGAAGCCAAGTTAATTATTTTACTTCCTACAATAGCttc > 2:302391/1‑139 (MQ=255) aaaGATGATATAAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTATTTGTCGTGCGATGAATTTTAGTACACTTTTCATATTTTGGAAAGACAAGTTAATTATTTTACCTCCTACAATAGCttt > 2:304309/1‑140 (MQ=255) aaaGATGATATAAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTATTTGTCGTGCGATGAATTTTAGTACACTTTTCATATTTTGGAAAGACAAGTTAATTATTTTACCTCCTACAATAGCttt > 1:877942/1‑140 (MQ=255) aaaGATGATATAAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTATTTGTCGTGCGATGAATTTTAGTACACTTTTCATATTTTGGAAAGACAAGTTAATTATTTTACCTACTACAATAGCttt > 2:966351/1‑140 (MQ=255) aGATGATATAAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTATTTGTCGTGCGATGAATTTTAGTACACTTTTCATATTTTGGAAAGACAAGTTAATTATTTTACCTCCTACAATAGCTatat > 2:422123/1‑140 (MQ=255) gatgatATAAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTATTTGTCGTGCGATGAATTTTAGTACACTTTTCATATTTTGGAAAGACAAGTTACTTATTTTACCTCCTACAATAGCTTtata > 2:360603/1‑140 (MQ=255) gatgatATAAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTATTTGTCGTGCGATGAATTTTAGTACACTTTTCATATTTTGGAAAGACAAGTTAATTATTTTACCTCCTACAATAGCTTtata > 2:733037/1‑140 (MQ=255) gatgatATAAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATAGGAAATGGGCTATTTGTCGTGCGATGAATTTTAGTACACTTTTCATATTTTGGAAAGACAAGTTAATTATTTTACATACTACTATAGCTTtata > 2:683544/1‑140 (MQ=255) gatgatATAAATGGCTATAGCCCATTCCATACTGTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTATGTGTCGTGCGATGAATTTTAGTACACTTTTCATATTTTGGAAAGACAAGTTAATTATTTTACCTACTACAATAGCTTtatg > 2:884396/1‑139 (MQ=255) tgatATAAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTATTTGTCGTGCGATGAATTTTAGTACACTTTTCATATTTTGGAAAGACAAGTTAATTATTTTACTTCCTACAATAGCTTTATaaa > 1:653323/1‑140 (MQ=255) gatATAAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTATTTGTCGTGCGATGAATTTTAGTACACTTTTCATATTTTGGAAAGACAAGTTAATTATTTTACCTCCTCCAATATCTTTATaaaa > 1:375594/1‑140 (MQ=255) tataAATGGCTATAGTCGTGTCCCTACGTTAGAAAAGTTTCGGAAATGGGCCATTTGTCGTGCGATGAATTTTAGTACACTTTTCATATTTTGGAAAGACAAGTTAATTATTTTACCTCCTACAATAGCTTTATAAAACa < 2:999075/140‑1 (MQ=255) tataAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGTCTATTTGTCGTGCGATGAATTTTAGTACACTTTTCATATTTTGGAAAGACAAGTTCATTATTTTGACTCCTACAATAGCTTTATAAAAcc > 1:675918/1‑139 (MQ=255) tataAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTATTTGTCGTGCGATGAATTTTAGTACACTTTTCATATTTTGGAAAGACAAGTTAATTATTTTCCATCCTACACTTGCTTTATaaacaa > 2:976954/1‑137 (MQ=255) tataAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTATTTGTCGTGCGATGAATTTTAGTACACTTTTCATATTTTGGAAAGACAAGTTAATTATTTTACCTCCTACAATAGCTTTATAAAACa < 1:460863/140‑1 (MQ=255) ataAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTATTTGTCGTGCGATGAATTTTAGTACACTTTTCATATTTTGGAAAGACAAGTTGAGTATTTTACCTCCTACAATAGCTTTATAAAACaa > 1:174003/1‑140 (MQ=255) aaaTGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTATTTGTCGTGCGATGAATTTTAGTACACTTTTCATATTTTGGAAAGACAAGTTAATTATTTTACCTCCTACAATAGCTTTATAAAACAAAg < 1:763091/140‑1 (MQ=255) aTGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATGGGAAATGGGCTATTTGTCGTGCGATGAATTTTAGTACACTTTTCATATTTTGGAAAGACAAGGTAATTATTTTACCTCCTACAACAGCTTTATAAAACAAAGaa < 1:562206/140‑1 (MQ=255) tGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTATTTGTCGTGCGATGAATTTTAGTACACTTTTCATATTTTGGAAAGACAAGTTAATTATTTTACCTCCTACAATAGCTTTATAAAACAAAGaaa < 1:802328/140‑1 (MQ=255) aGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTATTTGTCGTGCGATGAATTTTAGTACACTTTTCATATTTTGGAAAGACAAGTTAATTATTTTACCTCCTACAATAGCTTTATAAAACAAAGAAAATTttaa > 2:136501/1‑140 (MQ=255) gCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTATTTGGCGTGCGATGAATTTTAGTACACTTTTCATATTTTGGAAAGACAAGTTAATTATTTTACCTCCTACAATAGCTTTATAAAACAAAGAAAATTttaat > 1:691179/1‑140 (MQ=255) cATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTATTTGTCGTGCGATGAATTTTAGTACACTTTTCATATTTTGGAAAGACAAGTTAATTATTTTACCTCCTACAATAGCTTTATAAAACACAGAAAATTttaattaa < 1:497707/140‑1 (MQ=255) cATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTATTTGTCGTGCGATGAATTTTAGTACACTTTTCATATTTTGGAAAGACAAGTTAATTATTTTACCTCCTACAATAGCTTTATAAAACAAAGAAAATTttaattaa > 1:822008/1‑140 (MQ=255) | TGGTGTGAAAACAGCGGCAACACCTTCAGAAATTGGTTCAACATTA‑ATTGAAGCTGCTAAAGAAGCAGGTATTTATGAATCATTATTAACTGTTAATAAATAAAGTTAAAAGATGATATAAATGGCTATAGCCCATTCCATACTTTATAAAAGTATCGGAAATGGGCTATTTGTCGTGCGATGAATTTTAGTACACTTTTCATATTTTGGAAAGACAAGTTAATTATTTTACCTCCTACAATAGCTTTATAAAACAAAGAAAATTTTAATTAA > USA300TCH1516_ALE/1262773‑1263045 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |